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- 辐射敏感基因标记物及在检测射线辐射中的应用
- 本发明提供了辐射敏感基因标记物及在检测射线辐射中的应用,该辐射敏感基因标记为BAX基因、DDB2基因以及FDXR基因,通过使用不同类型的射线照射离体外周静脉血,对辐射敏感基因BAX基因、DDB2基因以及FDXR基因的表达...
- 原雅艺柴栋静党旭红董娟聪张忠新刘红艳张睿凤程娇
- 一种与肉鸽生长和屠宰性能相关的LCORL基因标记及其应用
- 本发明提供了一种与肉鸽生长和屠宰性能相关的LCORL基因标记及其应用,属于分子标记技术领域。本发明提供的与肉鸽生长和屠宰性能相关的LCORL基因SNP标记,是在所述LCORL基因的exon7上的一个单碱基插入移码突变,所...
- 侯浩宾姚俊峰杨长锁丁卫星涂盈盈
- 一种翅果油树单拷贝核基因标记、引物对及其应用
- 本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及一种翅果油树单拷贝核基因标记、引物对及其应用。所述翅果油树单拷贝核基因标记包括翅果油树单拷贝核基因标记1、2、3、4、5、6和7中的任意一种或多种;所述翅果油树单拷贝核基因标记的核苷...
- 杜淑辉胡晓艳时刘军王升级冯宇奇李昊炀
- CD8^(+)T细胞免疫相关基因标记有效预测胃癌预后和治疗反应性
- 2025年
- 目的探索CD8^(+)T细胞免疫相关基因与胃癌免疫治疗及患者预后的关系。方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载胃癌相关转录组测序数据和对应的患者临床资料,并将TCGA数据集的数据(n=407)和基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据集的数据(n=433)分别作为训练集和验证集,2个数据集合并作为总体样本(n=840)。基于单因素Cox回归、Lasoo回归分析构建CD8+T细胞免疫相关基因的风险评分模型并进行各数据集的验证。根据训练集的中位风险评分,将训练集、验证集和总体样本分别划分为高风险和低风险。Kaplan-Meier生存分析和受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)被用于验证模型的预测性能。通过单因素和多因素Cox回归分析评估风险评分等临床指标的预后价值。结合风险评分、年龄和肿瘤TNM分期构建预测胃癌患者总生存率的列线图,ROC曲线与校准曲线被用于评估列线图的预测准确性。借助风险评分进行免疫细胞浸润分析、基因突变分析和免疫治疗疗效预测。使用IMvigor210数据集验证风险评分模型用于预测其他肿瘤患者对免疫治疗反应的效能。收集2023年8月至2024年4月中山大学附属第七医院收治的15例胃癌患者的胃癌组织样本和匹配的癌旁组织样本,采用荧光定量聚合酶链反应检测CD8+T细胞免疫相关基因在胃癌组织中的差异表达。结果共鉴定出10个具有预后价值的CD8^(+)T细胞免疫相关基因。风险评分是胃癌患者预后的独立影响因素(HR=3.495,95%CI2.072~5.894,P<0.001)。Kaplan-Meier生存曲线显示高风险患者的总生存率低于低风险患者(P<0.05)。构建的列线图预测胃癌患者的1年、3年和5年总生存率与实际总生存率相接近。高风险患者具有较差的预后,且伴有免疫抑制、低频基因突变和较低的免疫检查点分子表达。风险评分模型在IMvigor210数�
- 孙学增苏日顺李文超王小群尹松成陈景耀
- 关键词:胃癌免疫特征
- 基于ADME相关基因标记构建和验证子宫内膜癌预后风险评分模型
- 2024年
- 目的基于控制药物吸收、分布、代谢和排泄(ADME)过程的ADME基因,构建子宫内膜癌(UCEC)预后模型,为预测UCEC的预后及肿瘤治疗提供参考。方法从TCGA数据库和ICGC数据库中收集UCEC患者的基因表达谱以及临床数据。使用单因素Cox回归分析确定与UCEC预后相关的ADME基因,使用最小绝对收缩与选择算子(LASSO)回归筛选出最佳预后基因并构建风险评分模型。采用Kaplan-Meier生存分析和受试者工作特征曲线(ROC)评估其预测能力,以R软件筛选差异表达基因并进行功能富集分析。结果筛选出9个ADME基因(DHRS7B、CYP46A1、SLCO4C1、NR1I2、SLC16A1、SLCO3A1、ARSA、ABCC5、MGST2)用于构建UCEC预后风险评分模型。生存分析显示,低风险评分组患者的生存时间明显长于高风险评分组患者(训练集:P<0.001;验证集P=0.032)。训练集ROC曲线显示1、3和5年的曲线下面积分别为0.792、0.724和0.712,验证集分别为0.651、0.620和0.677,提示该预后风险评分模型对UCEC患者的生存状态具有良好的预测能力。单因素和多因素Cox回归分析显示,风险评分可作为UCEC潜在的独立预后因素(HR=1.77,P=0.035)。高风险评分组和低风险评分组在miRNA介导的基因沉默、调控血管内皮细胞增殖与新生血管生成和萌芽血管生成的生物学过程中存在差异。结论该研究筛选出的9个ADME基因所构建的预后风险评分模型可用于评估UCEC患者的预后。
- 禚映辰张素雅宋鹏飞封卫毅
- 关键词:子宫内膜癌基因标记
- 一种用于脑动脉瘤破裂早期诊断或检测的RNA甲基化相关炎症基因标记物及其应用
- 本发明公开了一种用于脑动脉瘤破裂早期诊断或检测的RNA甲基化相关炎症基因标记物及其应用,特点是RNA甲基化相关炎症基因标记物为OSM基因和/或TYMP基因标记物,OSM基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,TYM...
- 黄毅 周圣军高翔孙杰 聂晟 武亦文
- 不同146S含量FMD基因标记疫苗免疫效力的研究
- 本研究通过悬浮培养工艺培养FMD基因标记O/rV-1株、A/rV-2株病毒,对病毒液连续流离心机离心、深层过滤和超滤浓缩方式初次纯化与浓缩,病毒液灭活、灭活检验和二次纯化获得高纯度抗原制备水相,与201佐剂乳化制备146...
- 吴涵
- 关键词:FMD抗体免疫
- 长牡蛎抗病相关大防御素基因标记及其应用
- 本发明属于水产生物技术领域,具体来讲是一种长牡蛎抗病相关大防御素基因标记及其在鉴定抗细菌病个体中的应用。长牡蛎大防御素基因N端结构域编码区基因标记为序列表SEQ ID No.1碱基序列所示,起始密码子下游+163C、+1...
- 杨传燕柳天保宋林生王玲玲孔宁
- 兼容多平台的玉米糯质基因标记开发及应用
- 糯玉米是一种胚乳突变型玉米,由隐性waxy基因控制,起源于中国,种质资源丰富。育种过程中为保证非轮回亲本的糯质基因不丢失,需要回交与自交分离交替进行,这种方式回交代数多、工作量大、育种进程长,限制了糯玉米产业的高质量发展...
- 朱维佳
- 关键词:糯玉米种质资源
- 甘蓝BoFLCs基因标记开发及优异单倍型聚合
- 2024年
- 开花抑制因子FLOWERING LOCUS C(FLC)编码MADS-box家族蛋白,在拟南芥的春化途径中起关键作用。为了探究甘蓝BoFLCs在春化过程中的作用,利用CRISPR/Cas9技术对甘蓝自交系GL的BoFLCs基因进行编辑,显著提早了其开花时间,明确了BoFLCs的基因功能。以晚花甘蓝自交系20-2221(P_(1),BoFLCs-w)和中早花甘蓝自交系20-2229(P_(2),BoFLCs-z)为亲本,构建BC_(1-2)P_(2)和BC_(2)F_(1)分离群体。通过序列比对分析,发现BoFLC_(1)、BoFLC3和BoFLC5在双亲间均存在序列差异,并根据这些差异序列开发了其特异性分子标记。利用BoFLCs特异性分子标记对BC_(2)F_(1)群体进行筛选,最终获得1个包含BoFLC_(1)-w/w、BoFLC5-w/w纯合单倍型以及BoFLC3-w/z杂合单倍型的植株(BC_(2)F_(1)-29),其抽薹时间和开花时间分别比回交亲本20-2229晚8.00 d和13.00 d;4个包含BoFLC_(1)-w/w、BoFLC3-w/w纯合单倍型以及BoFLC5-w/z杂合单倍型的植株(BC_(2)F_(1)-55、BC_(2)F_(1)-119、BC_(2)F_(1)-121和BC_(2)F_(1)-163),平均抽薹时间和开花时间比20-2229分别晚9.75 d和(13.50 d;3个包含BoFLC_(1)-w/w、BoFLC3-w/w)和BoFLC5-w/w纯合单倍型的植株(BC_(2)F_(1)-82、BC_(2)F_(1)-106和BC_(2)F_(1)-192),平均抽薹时间和开花时间分别比20-2229晚11.33 d和15.67 d。本研究开发了BoFLCs特异性分子标记,并实现了BoFLCs优异基因型的高效聚合,改良了亲本20-2229的抽薹性。
- 王娇张斌吴元康杨丽梅庄木吕红豪王勇季家磊闫超张扬勇
- 关键词:甘蓝FLC
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- 宋林生

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- 夏先春

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- 何中虎

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- 研究主题:小麦 普通小麦 引物 小麦品种 分子标记
- 梁声强

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