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基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法: 本发明公开了一种基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法，包括：1、使用Node2Vec方法获取酿酒酵母菌基因调控网络的拓扑信息；2、对于酿酒酵母菌因调控网络使用图数据增强手段，获得更高效的信息表达；3、对于酿酒酵...; 魏丕静丁正丁云曹瑞芬郑春厚

基于TCGA数据库筛选与三阴型乳腺癌预后相关的miRNAs及其基因网络: 2024年; 目的:筛选与三阴型乳腺癌(TNBC)预后相关的关键微小RNA(miRNAs)及其靶基因,探讨其参与调控的生物学功能和信号通路,为TNBC患者预后标志物的筛选提供理论依据。方法:基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选TNBC患者与非TNBC患者差异表达miRNAs,通过生存分析明确与患者预后相关的miRNAs。利用miRDB和miRWalk3.0在线数据库筛选miRNAs的靶基因,Cytoscape 3.8.2软件明确miRNA-信使核糖核酸(mRNA)调控网络,利用R软件limma数据包筛选TNBC患者与非TNBC患者差异表达miRNAs,利用R软件clusterProfiler包分析靶基因参与的生物学功能和通路。结果:生存分析,miR-9、miR-17、miR-31、miR-146a、miR-188和miR-190b与TNBC患者的预后有关,且上述miRNAs表达量越低,TNBC患者预后越差。筛选出受这6种miRNAs调控的靶基因224个。基因本体论(GO)功能富集分析,靶基因主要参与乳腺腺泡的发育、DNA转录的正向调控以及血管生成等功能;京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,靶基因主要富集在细胞因子-细胞因子受体相互作用以及胰岛素分泌信号等通路。网络分析,miR-9、miR-17、溶质载体家族24成员2(SLC24A2)、vav鸟苷酸交换因子3(VAV3)、三部结构域含有36(TRIM36)、突触标记素1(SYT1)、富勒林和Sec7结构域含有3(PSD3)、过氧化物酶体增殖物活化受体α(PPARA)、RNA聚合酶Ⅲ亚基G(POLR3G)、多形性腺瘤基因1(PLAG1)、泛素相关和SH3结构域含有B(UBASH3B)及SH3结构域和四重肽重复2(SH3TC2)是调控网络中的关键基因,其中miR-9-SYT1、miR-9-KIF13B、miR-9-KITLG、miR-17-SLC24A2、miR-31-SLC24A2、miR-146a-SYT1、miR-146a-KIF13B、miR-188-SLC24A2和miR-188-SLC24A2的miRNA-mRNA相互作用最为密切。结论:miR-9、miR-17、miR-31、miR-146a、miR-188和miR-190b及其靶基因参与乳腺腺泡发育和血管生成等生理过程,与TNBC患者的不良预后密切相关。; 宋玥莹高超陈文俊邵艾彧乔乙春李卓林; 关键词：微小核糖核酸预后调控网络靶基因

基因国度基因网络如何改变生活: 本书以基因检测为线索，深入浅出地介绍了遗传学知识，探讨了基因检测对人们生活和社会的各个方面的影响。本书还涵盖了多个有趣的主题，如遗传混血儿、身份游戏、云端基因、遗传自拍、尽享美食、极客之美、天生跑者等。每一章都以生动的案...; （意大利）塞尔吉奥·皮斯托伊作

疾病全基因网络的控制骨干挖掘方法研究: 郑筠儒

基于ChIP-seq技术分析心肌成纤维细胞中KDM5A调控的下游靶基因网络: 魏婷

一种基因网络数量性状定位检测方法和系统: 本发明公开了一种基因网络数量性状定位检测方法和系统，克服现有的表达数量性状基因座方法存在的忽略基因相互作用的不足。其技术方案为：本发明的nQTL模型是检测级联关联为基因型→基因网络→表型，而非传统eQTL方法的基因型→基...; 曾涛袁铠陈洛南

一种基因网络表达状态的二值化观测方法及系统: 本发明公开一种基因网络表达状态的二值化观测方法及系统，涉及生命科学领域的细胞基因表达量测定技术领域，方法包括：根据基因字典和被测细胞的基因维度确定随机测量矩阵，进而确定随机测量矩阵对应的多组基因名称组；针对所述随机测量矩...; 高会军杜奕辉佟明斯姜蒙

一种治疗恶性肿瘤且具备特异性与灵敏度的合成基因网络系统: 本发明属于基因治疗技术领域，尤其涉及一种治疗恶性肿瘤且具备特异性与灵敏度的合成基因网络系统，该基因网络系统能够治疗卵巢癌、乳腺癌等多种癌症，分别包括信号识别模块、信号输出模块、信号放大模块。信号识别模块中两条并行通路中的...; 汪宏波董科均章伟

一种融合基因网络关系的抗癌细胞敏感性预测方法、系统、设备及介质: 一种融合基因网络关系的抗癌细胞敏感性预测方法、系统、设备及介质，方法包括：将细胞系各基因的表达量构成的向量作为细胞系的原始基因表达特征，利用自编码器压缩低维隐向量作为细胞系的基因表达特征，对基因相互作用网络进行图自编码得...; 李朋勇姜政祥

CMFP基因网络模型驱动的蜡染产品设计被引量：2: 2023年; 为了促进蜡染文化与现代设计的有机结合。利用可拓学构建基因表征模型,识别CMFP基因。并根据基因工程理论提出CMFP基因网络模型构建方法,析出宏观知识辅助设计规划。以加湿器为研究对象,通过CMFP基因网络析出节点知识,根据集群系数法挖掘关键基因组,以此快速实现方案优化。最终通过建立CMFP基因网络模型能够有效解决设计过程中CMFP组合参数爆炸以及蜡染意象与现代设计的有机结合两个问题。; 梁焕超潘伟杰刘婷婷; 关键词：关键基因蜡染

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