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疏肝益肾方对乳腺癌肺转移微环境基因表达谱及免疫相关基因表达的影响: 2025年; 目的通过研究疏肝益肾方对乳腺癌小鼠肺部微环境基因表达的影响,探讨疏肝益肾方抑制乳腺癌肺转移的作用机制。方法构建乳腺癌原位移植瘤高转移模型,随机分为生理盐水组,疏肝益肾低、中、高(0.5、1、2 g·kg^(-1))剂量以及多西他赛组(5 mg·kg^(-1)),干预28 d。HE染色观察肺组织结构情况;对转移灶进行转录组分析,通过生物信息学分析基因表达谱的GO和KEGG通路特点,筛选关键差异基因表达情况,采用qPCR和Western blot分析关键免疫基因的表达。流式细胞术检测髓源抑制细胞(Myeloid suppressor cells,MDSCs)表达情况;ELISA法检测细胞因子和趋化因子Cxcl2、GM-CSF的表达。结果与生理盐水组相比,疏肝益肾方中、高剂量组与多西他赛组肺组织转移结节数量均有相应减少;HE染色提示肺部病理程度有所改善。疏肝益肾方高剂量组与生理盐水组的肺组织微环境有814个差异表达基因,其中713个基因下调,101个基因上调;筛选疏肝益肾组中关键炎性介质基因Nfkbiz、Tnfaip3、Maff、Hspa1a、Hspb1、Cxcl2,与生理盐水组相比,疏肝益肾方组炎性基因显著下调(P<0.05,P<0.01),最终其结果与转录组结果趋势相符。采用Western blot在蛋白质层面进行验证,发现与生理盐水组相比,疏肝益肾方组Nfkbiz、Tnfaip3、Maff、Hspa1a和Cxcl2蛋白表达水平下降(P<0.05,P<0.01),但Hspb1蛋白表达上调(P<0.01)。疏肝益肾方组和多西他赛组能够抑制MDSCs表达(P<0.001),一定程度降低Cxcl2、GM-CSF的表达(P<0.05,P<0.01)。结论疏肝益肾方能抑制乳腺癌肺转移,并且调控肺部免疫微环境基因,其调控范围较广。; 李心怡崔闯陈皖晴朱为康; 关键词：乳腺癌基因表达谱炎性介质

蒙古马两个类群肌纤维发育表型及基因表达谱比较研究: 2025年; 为探究不同类群蒙古马肌肉生长差异,本研究对生长环境差异最大、距离最远的蒙古马类群(巴尔虎马、乌审马)的肌肉表型与肌肉分子层面的差异进行了比较研究。本研究的试验动物分别是3匹生长在陈巴尔虎旗的巴尔虎马和3匹生长在乌审旗的乌审马,均为在野外自由放养采食的健康种公马。每个类群的平均年龄为5岁,同一类群马匹体况相近。其中巴尔虎马宰前活重为(303.10±14.10)kg、胴体重为(148.29±15.43)kg,乌审马宰前活重为(287.90±37.5)kg、胴体重为(140.83±5.04)kg。将试验动物按类群分为2个组,每组3个重复,对所有试验动物进行屠宰并取其臀中肌,将采集的肌肉样本石蜡包埋后进行HE和免疫组化染色,对肌纤维面积以及慢肌纤维占比进行统计;同时对所采集的肌肉样本进行转录组测序,测序结果使用DESeq2软件进行差异基因的筛选,使用David在线软件对差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,最后通过qRT-PCR对测序结果进行验证。本试验通过HE染色和免疫组化染色发现,巴尔虎马臀中肌的肌纤维平均面积为(2592±180.92)μm^(2),乌审马臀中肌肌纤维面积为(1997±73.39)μm^(2),二者差异显著(P<0.05);巴尔虎马臀中肌慢肌纤维占比为(10.34±0.59)%,乌审马臀中肌中慢肌纤维占比为(8.14±0.81)%,二者差异差异不显著(P>0.05)。本研究在巴尔虎马和乌审马的臀中肌中共鉴定出1103个差异基因,其中有460个上调基因和643个下调基因在乌审马的臀中肌中表达。研究发现,MYH15、MYOZ 2、多个谷氨酸受体基因和多个GABAA型受体基因在巴尔虎马臀中肌中高表达;MYH 6和FOXO 1基因在乌审马臀中肌中高表达。对差异基因进行富集分析发现,GO分析富集到了208个条目,KEGG分析富集到了65个通路,所富集到的条目与通路主要和谷氨酸信号传导、GABA信号传导以及肌肉生长发育有关。本试验对巴尔虎马和乌审马的臀中肌进行�; 胡瀚文图格琴任秀娟丁文淇宫文典贾紫洁史琳马木仁宝日格乐芒来白东义; 关键词：转录组

基于生成对抗网络的药物作用后基因表达谱预测方法: 本发明公开了一种基于生成对抗网络的药物作用基因表达谱预测方法，主要解决现有生物技术成本高，时间周期长的问题。其方案是：从基因表达谱数据库中下载某种药物作用后的基因表达谱数据；构建由编码器和解码器组成的自编码器并压缩药物作...; 鱼亮董达

不同平台单细胞基因表达谱数据的处理方法及装置: 本公开公开了不同平台单细胞基因表达谱数据的处理方法及装置、电子设备和存储介质，将不同平台的单细胞基因表达谱数据转换为单个样本的基因表达矩阵文件，其中，基因表达矩阵文件中的第一列为基因名称读取单个样本的基因表达矩阵文件，并...; 刘传军方晓东梅俊谱陈柔汐

基于基因表达谱识别组织样本中细胞类型及组分的方法: 本发明涉及一种基于基因表达谱识别组织样本中细胞类型及组分的方法，包括1）获得基因表达矩阵中所有基因的特异性得分；2）利用获取得到的基因表达矩阵中所有基因的特异性得分并结合统计检验框架识别潜在的标记基因；3）利用互线性策略...; 李华梅赵小粼刘宏德

抗感两种魔芋材料不同Pcc侵染阶段基因表达谱构建方法: 本发明属于基因表达谱构建技术领域，公开了一种抗感两种魔芋材料不同Pcc侵染阶段基因表达谱构建方法，所述抗感两种魔芋材料不同Pcc侵染阶段基因表达谱构建方法包括Pcc接种魔芋与样本采集；魔芋总RNA的提取、cDNA文库构建...; 余磊郭建伟黄飞燕齐颖赵永腾杨敏高鹏华李丽芳刘佳妮陈泽斌余亚军林登智寸德馨

融合药分子图结构和细胞基因表达谱的协同药物预测方法: 本发明公开了一种融合药分子图结构和细胞基因表达谱的协同药物预测方法，属于药物协同组合预测技术领域。该方法包括如下步骤：将细胞的基因特征作为节点嵌入药物的分子结构图中，得到融合后的结构图；通过拓扑自适应图卷积网络和多层感知...; 闫仕宇于钢杨娇星陈灵娜

一种利用斑马鱼基因表达谱筛选的差异基因控制心可舒质量的方法: 本发明提供了一种利用斑马鱼基因表达谱筛选的差异基因控制心可舒质量的方法，具体属于中成药质量控制技术领域，本发明首次发现斑马鱼中fosab基因和/或serpinh1b基因表达量的变化在控制心可舒质量中的应用；所述fosab...; 夏青刘可春张云庄开颜孙晨

一种基于扩散模型的抑郁症基因表达谱的识别方法及装置: 本公开涉及基因表达谱识别分类技术领域，特别涉及一种基于扩散模型的抑郁症基因表达谱的识别方法及装置。本公开通过使用深度学习技术，能够对大规模的基因表达数据进行快速、高效的处理和分析，加快识别和分类抑郁症患者的速度，从而提高...; 徐天馥袁亚美俞磊朱才丰贺成功

一种基于扩散模型的抑郁症基因表达谱的识别方法及装置: 本公开涉及基因表达谱识别分类技术领域，特别涉及一种基于扩散模型的抑郁症基因表达谱的识别方法及装置。本公开通过使用深度学习技术，能够对大规模的基因表达数据进行快速、高效的处理和分析，加快识别和分类抑郁症患者的速度，从而提高...; 徐天馥袁亚美俞磊朱才丰贺成功

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