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搜索到424篇“ 宏病毒“的相关文章

西宁市越冬夜栖乌鸦粪便宏病毒组分析: 2024年; 为了解西宁市越冬夜栖乌鸦群体携带病毒的本底情况,以市区冬季夜栖秃鼻乌鸦、大嘴乌鸦和小嘴乌鸦的新鲜粪便为试验材料,利用宏病毒组学测序技术分析乌鸦粪便病毒的组成、丰度和基因功能。结果表明:共鉴定出7411条DNA病毒contigs和224条RNA病毒contigs。在数量前10的DNA病毒contigs中注释到9个病毒科,在数量前5的RNA病毒contigs中注释到4个病毒科,涵盖了植物、脊椎动物、节肢动物和原生动物等来源的病毒及噬菌体。从DNA病毒contigs和RNA病毒contigs中分别预测出9226个基因和111个基因。基因数量最多的前5个功能类别分别是遗传信息处理、复制和修复、信号传导和细胞过程、核苷酸代谢和氨基酸代谢。研究结果可为深入探究病毒进化及跨物种传播规律提供数据参考。; 宋嘉慧陈含西郑思思高小龙李季王稳朱丽琳; 关键词：乌鸦粪便病毒宏基因组

丽江金沙江流域烟草病毒电镜观测与宏病毒组分析被引量：1: 2024年; 【目的】明确丽江金沙江流域烟草病毒病的病毒种类及其分布特点,为病害防控提供依据。【方法】采集烟区具有明显病毒病症状的烟株样品53份,采用宏病毒组测序技术分析各病毒属的丰度,并构建遗传进化树;进一步采用扫描电镜观测病毒形态;调查各病毒病在烟区的发生情况。【结果】宏病毒组测序分析结果表明:属水平上,华坪县(S1)样品中马铃薯Y病毒属(Potyvirus)、黄瓜花叶病毒属(Cucumovirus)和正番茄斑萎病毒属(Orthotospovirus)丰度分别为66.08%、20.83%和5.91%;玉龙纳西族自治县(S2)样品中正番茄斑萎病毒属丰度为97.20%;宁蒗彝族自治县(S3)样品中马铃薯Y病毒属和正番茄斑萎病毒属丰度分别为96.29%和2.20%。系统进化树结果显示:S1样品病原为烟草马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)、烟草番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus,TSWV)和烟草黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV),S2样品病原为TSWV,S3样品病原为PVY和TSWV。电镜观察到样品中线状病毒粒体直径10~15 nm,长度700~900 nm;球状病毒粒体包括2种,一种为直径25~30 nm、无包膜,另一种为直径80~120 nm、表面有1层包膜。宏病毒组测序分析、系统进化树和电镜观测结果相吻合。田间调查结果表明:华坪县PVY、TSWV和CMV的发病率分别为42.34%~68.25%、12.59%~26.52%和29.27%~72.31%;玉龙县TSWV的发病率为5.66%~20.34%;宁蒗县PVY和TSWV的发病率分别为19.18%~36.27%和1.08%~4.92%。【结论】危害丽江金沙江流域烟区的烟草病毒种类主要为TSWV、PVY和CMV,其中,TSWV和PVY的检出率最高、发生最普遍。; 矣小鹏周旭东韩天华申云鑫贺彪陈齐斌何永宏杨佩文; 关键词：金沙江流域烟草病毒病

一种宏病毒组分析系统、方法、设备及介质: 本申请公开了宏病毒组分析系统、方法、设备及介质，涉及宏病毒组学技术领域，包括数据处理模块，用于自动化数据处理，得到宏基因组数据；序列组装模块，用于对宏基因组数据序列组装及合并，得到宏基因组组装结果；病毒序列鉴定模块，用于...; 杨明高兆明贺丽生拉姆加内什·塞尔瓦拉扬

一种宏病毒处理方法、装置和存储介质: 本发明实施例公开了一种宏病毒处理方法、装置和存储介质；本发明实施例在获取待处理宏病毒，对所述待处理宏病毒中的宏代码进行识别，根据识别结果确定所述宏代码中的特征码，根据所述宏代码中的特征码生成宏病毒特征，基于所述宏病毒特征...; 申金娟毕磊于涛郭晓龙苏蒙姜澎吴彬屈亚鑫张友旭崔精兵郭长宇赵子云

中国东北地区蜱传病毒的宏病毒组分析及新型白纤病毒的流行病学调查: 胡振宇

一种宏病毒组流程的优化分析方法: 本发明公开了一种宏病毒组流程的优化分析方法，1)序列质控，2)序列拼接，3)病毒序列预测，4)病毒序列聚类处理，5)物种注释，本发明分析数据更为准确,能拼接出长度较长的contig，从而提高比对结果的准确性和注释结果的可...; 薛正晟李鸿毅寇文伯孙子奎

A组轮状病毒宏病毒组测序的靶向核酸捕获引物组、试剂盒和建库方法: 本发明提供了A组轮状病毒宏病毒组测序的靶向核酸捕获引物组、试剂盒和建库方法，属于微生物安全检测技术领域。本发明设计得到适用于分子多样性高、保守区域少、病毒载量低的A组轮状病毒的靶向核酸捕获引物组，并提供了用于A组轮状病毒...; 刘丹蕾张子龙王祉怡田相廷田桢干张子蕾李深伟陆晔郑华军

基于宏病毒组学技术挖掘猪腹泻粪便的病毒群落组成: 2023年; 为系统鉴定现阶段上海地区仔猪腹泻样品中的病毒群落组成,本研究利用宏病毒组学技术对临床采集的猪腹泻粪便进行了宏病毒高通量测序。结果显示,测序获得了1,676,726个RNAcontig和95,111个DNAcontig,RNA病毒和DNA病毒序列分别占比38.58%和3.10%。其中星状病毒科、杯状病毒科和小RNA病毒科是病毒总群落中占比最高的前3个科。虽然DNA病毒在病毒总群落中的占比较低,但其单组分环状DNA(CRESS-DNA)病毒种类丰富多样,包含有18种CRESS-DNA病毒。经基因组序列深度拼接,共获得了46条病毒全基因组序列,包括2株猪星状病毒和3株类似星状病毒、2株札幌病毒、16株小双节RNA病毒和23株CRESS-DNA病毒。其中1株札幌病毒归属于GII/3亚型,与人札幌病毒亲缘性较近。16株小双节RNA病毒中有4株归属于GGI亚型,其余12株归属于GGII亚型。23株CRESS-DNA病毒中有1株归属于类双生病毒科、12株CRESS-DNA病毒归属于小环状DNA病毒科,另外10株CRESS-DNA病毒未分类。本研究揭示现阶段猪腹泻粪便中以RNA病毒为主导,且存在宿主多样性,提示可能存在种间基因重组,病原潜在危害性需进一步挖掘和验证。研究数据将为临床猪腹泻病防控提供参考和借鉴。; 陶洁李本强李本强石迎程靖华何桂霞徐伟杰刘佩红; 关键词：仔猪腹泻病全基因组序列

一种宏病毒组数据的分析方法: 本发明公开了一种宏病毒组数据的分析方法，属于宏病毒组学技术领域。所述方法包括：序列质控、序列组装、序列聚类、病毒序列识别、病毒序列检查、病毒丰度计算、物种注释、病毒生活方式判断、病毒宿主预测和病毒辅助代谢基因分析。本发明...; 徐岩张华东张红霞

一种U盘隔离器隔离宏病毒的方法: 本发明提供一种U盘隔离器隔离宏病毒的方法，属于计算机病毒隔离技术领域，隔离器处理器采用ARM架构处理芯片，定制化Linux操作系统，U盘与主机之间存在物理隔离，主机无法直接访问U盘设备，主机要获取U盘中的内容，需要通过U...; 刘桂新乔国凯黄正茂

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