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搜索到381篇“ 微卫星序列“的相关文章

伊犁郁金香叶绿体基因组微卫星序列特征分析被引量：1: 2023年; 为明确伊犁郁金香叶绿体微卫星特征,为后续伊犁郁金香及郁金香属的系统发育、比较基因组学及遗传改良研究提供参考,同时也为郁金香属的物种分类提供新的依据,以伊犁郁金香叶绿体基因组为研究对象,运用MISA、REPuter、SPSS相关软件,对其叶绿体微卫星序列分布特征和规律进行了全面分析。结果表明,在伊犁郁金香151744 bp的叶绿体全基因组序列上共确定224个SSR位点,平均每677.43 bp出现1个微卫星位点,相对丰度和相对密度分别为1568.43 loci/Mb和15433.89 loci/Mb,其分布范围主要集中在大单拷贝区;伊犁郁金香叶绿体基因组微卫星重复序列共有6种类型,其中单碱基重复序列最多,为114个(47.90%),其次是三碱基重复序列,为96个(40.34%)、二碱基重复序列,为17个(7.14%)、四碱基重复序列,为7个(2.94%)、六碱基重复序列,为3个(1.26%),而五碱基重复序列仅有1个(0.42%);叶绿体基因组微卫星的长度区间为8~32 bp,从整个重复长度区间来看主要集中分布在8~10 bp,共计174个(占总SSR的77.67%),长度分布在20~32 bp的有11个,微卫星重复序列的数量与序列长度、相对丰度和相对密度均呈极显著相关。伊犁郁金香叶绿体基因组上的微卫星位点大多数具有多态性的潜能,可为其遗传多样性研究、多态性叶绿体基因组微卫星分子标记开发及应用、野生种质资源的保护和开发利用等提供科学依据。; 秦斗文么玉龙冯伊玲刘伟强田吉婷巨秀婷; 关键词：叶绿体基因组微卫星

SjTR1微卫星序列用于制备检测血吸虫病的试剂的用途: 本发明属于分子生物学检测领域，具体地，涉及血吸虫的检测，更具体地，涉及SjTR1微卫星序列用于制备检测血吸虫病的试剂的用途。本发明提供一种日本血吸虫SjTR1微卫星序列用于制备检测血吸虫病的试剂的用途，使用本发明发现的新...; 明英姿刘让蛟程星马洪昌鲍文娟杨悦李俊辉张宇周杰戴立忠

‘京红久’忍冬叶绿体基因组微卫星序列特征分析被引量：1: 2023年; ‘京红久’忍冬(Lonicera×heckrottii’Gold Flame’)是一种极具观赏价值的优良藤本,被誉为“最帅的攀援植物”。本研究利用前期测定的‘京红久’忍冬叶绿体基因组序列结果,应用生物信息学软件对其微卫星的分布特征进行了全面分析。结果发现:‘京红久’忍冬叶绿体基因组共有168个微卫星位点,相对丰度和相对密度分别为1 080.82 loci/Mb和10 280.69 loci/Mb,主要分布于大单拷贝区(large single copy regions, LSC)。在微卫星的碱基组成中,以单碱基微卫星为主(占总数的63.10%),其次是三碱基微卫星(占总数的29.17%),二碱基微卫星的数量最少(占总数的2.98%),未检测到五碱基重复序列和六碱基重复序列。同时,以A/T重复为主,占单碱基微卫星的61.90%。在微卫星重复次数中,单碱基微卫星位点序列的重复次数集中在8~17之间,三碱基微卫星的重复次数分布在4~5之间。相关性分析结果表明,微卫星重复序列的数量与长度、相对丰度和相对密度呈极显著正相关。不同物种的叶绿体基因组微卫星重复类型相差较大。本研究结果为‘京红久’忍冬的物种鉴定、系统分类、微卫星标记的开发以及引物筛选提供了理论依据。; 张加强史小华刘慧春许雯婷周江华朱开元; 关键词：叶绿体基因组微卫星

三叶木通微卫星序列分析及其在核心种质构建中的应用: 人类社会的发展伴随着野生植物资源的开发和利用。我国生物多样性位居世界第二,约有33,000种高等植物,且多数是特有物种,具有广阔的应用前景。三叶木通(Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.)是木通...; 陈巍; 关键词：三叶木通种质资源微卫星核心种质

濒危植物黑黄檀基因组微卫星序列特征分析被引量：1: 2022年; 黑黄檀(Dalbergia fusca)是云南省濒危珍贵乡土树种,为分析其基因组中微卫星序列的特征,本研究通过Illumina高通量测序技术对黑黄檀全基因组进行测序,利用MISA软件进行分析。获得了12962个微卫星序列,共7种类型,其中以单核苷酸重复类型最多,其次是二核苷酸类型。在各种类型中,AT含量显著高于GC含量。微卫星长度主要在10~20 bp,且在不同重复类型中,二核苷酸和单核苷酸长度变化较大,分别有20和18种。本研究揭示了黑黄檀基因组SSR分布规律,为其SSR引物的筛选及其种质资源遗传多样性研究提供理论依据。; 刘世男王兵益; 关键词：基因组微卫星

基于rDNA及微卫星序列的分子细胞遗传技术比较研究42份中国樱桃及近缘种: 中国樱桃[Cerasus pseudocerasus（Lindl.）G.Don]隶属蔷薇科（Rosaceae）李亚科（Prunoideae）樱属（Cerasus Mill.）。中国樱桃花朵靓丽,具有很高的观赏价值;其果实...; 冯燕; 关键词：中国樱桃近缘种 RDNA 荧光原位杂交

一种基于转录组中相邻微卫星序列的植物鉴别方法: 本发明公开了一种基于转录组中相邻微卫星序列的植物鉴别方法，包括以下步骤：提取待鉴定植物组织样本的RNA，使用高通量测序的方法对转录组进行测序，将测得的原始序列Raw data经过去掉接头序列，过滤掉不合格的序列后得到有效...; 刘广达王启周国庆孙艺卓李焱; 文献传递

微型月季抗逆性基因表达与微卫星序列连锁分析: 2021年; 使用转录组学的方法研究水杨酸和茉莉酸甲酯处理微型月季的基因表达,发现2种处理的植物-病原菌相互关系通路均有数量较多的差异表达基因,并对该通路中差异表达基因连锁的微卫星序列进行了统计。该研究有助于进一步理解水杨酸和茉莉酸甲酯提升微型月季抗逆性的机理。筛选与抗逆基因连锁的微卫星序列可为今后的育种研究提供帮助。; 王建婷刘广达吴归安天琪李娜; 关键词：微型月季微卫星序列水杨酸茉莉酸甲酯

人类基因组1Kbp分辨率微卫星序列分布特征分析: 微卫星序列（Microsatellites）是以1-6个碱基对（base pair,bp）为重复单元组成的一类短串联重复序列（Short Tandem Repeats,STRs）,在真核、原核生物甚至是病毒基因组的各个位...; 李都悦; 关键词：微卫星序列

铁皮石斛转录组微卫星序列统计分析被引量：7: 2020年; 为揭示铁皮石斛全基因组SSRs序列分布规律,采用微卫星序列搜索和统计软件MSDB v2.4对铁皮石斛全基因组中完整型微卫星序列及其特征进行生物信息学分析。结果表明:铁皮石斛微卫星序列总数量为215661个位点,微卫星序列长度为4.07 Mb,占全基因组总长度的比率为0.44%,其总丰度为213.84个·Mb^-1,总密度为4031.927 bp·Mb^-1。铁皮石斛全基因组SSRs各重复类型中,单核苷酸SSRs序列出现频率最高(47.49%),其次是二核苷酸SSRs序列>三核苷酸SSRs序列>四核苷酸SSRs序列>五核苷酸SSRs序列>六核苷酸SSRs序列,微卫星重复类型中,富含A和T,而富含G和C碱基的微卫星出现频率较少。研究结果可为后续铁皮石斛遗传多样性的研究及SSR引物筛选提供依据。; 石汝杰张元媛蒋雪梅戚文华; 关键词：铁皮石斛基因组微卫星生物信息学

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