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基于宏基因组学技术的天祝藏酒大曲生物群落多样性及功能解析
2025年
为深入研究天祝藏酒大曲的特性及其在白酒酿造过程中发挥的作用,采用宏基因组学技术分析其生物群落多样性,并对其功能基因进行注释。结果表明:从天祝藏酒大曲中鉴定出的生物分别属于53个门和835个属,其中优势菌门包括厚壁菌门、放线菌门和毛霉菌门,优势菌属包括糖多孢菌属、枝芽孢杆菌属、慢生芽胞杆菌属、横梗霉属、Desmospora、海洋芽孢杆菌属、芽孢杆菌属、Syncephalastrum和链霉菌属。在KEGG二级水平上共注释到22条代谢通路,其中碳水化合物代谢和氨基酸代谢功能较突出,且糖酵解/糖异生及甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢最旺盛;糖基转移酶和糖苷水解酶被CAZy数据库注释到的基因较多,分别占总基因数目的40.49%和39.09%。
李亚萍乔海军贾志龙汪月张忠明刘琦温得林张卫兵
关键词:微生物群落多样性功能基因
不同比例麸皮和玉米粉对白酒糟发酵营养成分、发酵品质及生物群落多样性的影响
2025年
文章旨在探究不同比例麸皮和玉米粉对白酒糟发酵营养成分、发酵品质及生物群落多样性的影响。参照2因素×3水平试验设计,玉米粉添加量分别为0%、2.5%和5%,麸皮添加量分别为0%、4%和8%,共计9个处理组,每组5个重复,各处理组均添加含量一致的乳酸菌(0.15%)及氯化钠(0.25%),试验为期180 d。结果表明,试验5和8组粗蛋白质含量显著上调(P<0.05),试验4、5组粗纤维含量较其他各组显著降低(P<0.05),试验8组酸性洗涤纤维含量显著降低(P<0.05),试验8和9组中性洗涤纤维含量显著下降(P<0.05),试验4、5、6组木质素含量显著降低(P<0.05)。试验5、8、9组NH3-N含量较其他各组显著下调(P<0.05),试验6、8、9组乙酸含量显著下调(P<0.05),试验4、5、8组丙酸含量显著下调(P<0.05),试验2~9组丁酸含量显著下调(P<0.05),本试验未观察到组间p H及乳酸含量有显著变化(P>0.05)。试验5、6、8组ACE指数显著提升(P<0.05),试验5和8组Chao1及PD指数显著提升(P<0.05),不同麸皮及玉米粉比例对白酒糟发酵Simpson、Shannon及CR指数均未产生显著影响(P>0.05)。本试验结果显示,试验5(4%麸皮+2.5玉米粉)及8(8%麸皮+2.5玉米粉)组添加比例对白酒糟发酵品质具有显著的提升作用。
何飞燕蒋治国张润霞范吉辉
关键词:麸皮玉米粉白酒糟发酵品质微生物多样性
生草对滇中苹果园土壤酶活性和生物群落多样性的影响
2025年
为探究不同生草处理对滇中苹果园土壤酶活性和生物群落多样性的影响。本研究选取南方果园常见的光叶紫花苕(Vicia villosa),菊苣(Cichorium intybus)和鼠茅草(Vulpia myuros)3种牧草,以自然生草(CK1)和清耕(每月人工除草一次,CK2)处理为对照,测定0~30 cm耕层土壤酶活性及生物群落多样性。结果表明,与清耕相比,人工生草改善了土壤理化性状。光叶紫花苕处理土壤过氧化氢酶,蔗糖酶和脲酶活性显著提高,增幅分别为12.70%,45.30%,45.45%。土壤生物群落数量以菊苣处理提升显著,细菌数量增幅为42.76%(较CK1),49.02%(较CK2);真菌数量增幅为49.76%(较CK1),42.28%(较CK2)。土壤生物中变形菌门(Proteobacteria)和子囊菌门(Ascomycota)占据主导地位,放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteriota)主导了酶活性对土壤酸碱度的响应。此外,土壤含水量、pH、全氮及全钾含量是影响滇中苹果园土壤养分及酶活性的重要因子。
杨金鹏牟兰仇嘉悦吴宗烨张鑫亮张美艳蔡明黄必志
关键词:果园生草土壤理化性状土壤酶活性
江淮区域大曲培养过程中生物群落多样性分析
2025年
采用高通量测序技术对江淮区域大曲制曲不同阶段生物多样性进行分析。结果表明,厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)在8份大曲样品中均为优势细菌门;M_3d、M_13d、M_18d、M_25d、M_31d、M_G和M_D样品中真菌组成相似,主要优势真菌门为子囊菌门(Ascomycota)。而M_7d样品中优势真菌门为担子菌门(Basidiomycota),与其他阶段样品组成差异较大。在属水平下,升温期水分、温度和酸度适宜,细菌和酵母菌生长迅速,多样性和丰富度提高,霉菌较少。进入高温期,营养物质较丰富,水分适宜,温度、酸度较高,不耐热细菌和酵母菌生长被抑制,耐高温的生物能生长繁殖,以嗜热子囊菌属(Thermoascus)和高温放线菌属(Thermoactinomyces)为主。在随后的降温过程中,营养成分逐渐减少,水分流失,耐干燥能力差的生物生长被抑制。出房时,各类生物占比趋于均衡。最终乳杆菌属(Lactobacillus)、泛菌属(Pantoea)、克罗彭斯特菌属(Kroppenstedtia)、曲霉菌属(Aspergillus)和嗜热子囊菌属(Thermoascus)等成为成品曲中的优势菌属。
丁峰张克萍付启海常少健张磊杜全全郭小东李觅陈心雨
关键词:高通量测序浓香型白酒大曲群落多样性
四种红鳍东方鲀养殖系统的生物群落多样性研究
2025年
为了查明红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)池塘养殖系统生物群落特征,本研究采用16S rRNA高通量测序技术,设置了红鳍东方鲀单养系统、红鳍东方鲀-美洲帘蛤(Mercenaria mercenaria)二元混养系统、红鳍东方鲀-日本对虾(Penaeus japonicus)-美洲帘蛤三元混养系统和红鳍东方鲀-日本对虾传统混养系统四种红鳍东方鲀养殖系统,对这四种养殖系统的红鳍东方鲀肠道生物、水体生物和沉积物生物群落结构和多样性进行了比较研究。研究表明,弯曲杆菌门(Campilobacterota)、变形菌门(Proteobacteria)、螺旋菌门(Spirochaetota)和厚壁菌门(Firmicutes)是红鳍东方鲀肠道生物群落中优势菌门,其中弯曲杆菌门是其特有的优势菌门。变形菌门、脱硫杆菌门(Desulfobacterota)、拟杆菌门(Bacteroidota)、厚壁菌门和绿弯菌门(Chloroflexi)为沉积物生物群落中优势菌门;变形菌门、蓝细菌门(Cyanobacteria)、拟杆菌门和放线菌门(Actinobacteriota)为水体生物群落中优势菌门。不同养殖系统的红鳍东方鲀肠道生物α多样性未见显著差异,但不同系统的红鳍东方鲀肠道、沉积物和水体的生物群落结构存在显著差异。红鳍东方鲀肠道生物与环境生物相似性较低,表明肠道生物组成受环境生物的影响较小。冗余分析表明,环境生物群落结构和多样性受沉积物和水体环境因子的影响,其中盐度、氨氮、亚硝氮、硝氮和总氮与水体菌群群落结构显著相关,而亚硝氮、硝氮和总氮则与沉积物菌群群落结构显著相关。研究结果表明,不同混养模式显著影响红鳍东方鲀肠道及环境的生物群落结构,养殖模式不同导致的环境理化因子变化可能是导致环境生物群落结构差异的重要原因。
郑昕元田相利王润泽泮淼军王龙斌张海恩李卫东
关键词:微生物多样性细菌群落结构红鳍东方鲀
不同季节及层级浓香型白酒窖泥生物群落多样性与风味物质的比较及相关性分析
2025年
以浓香型白酒春秋季节不同层级的窖泥为研究对象,采用高通量测序技术、顶空固相萃取-气相色谱-质谱联用技术和Spearman相关性分析等方法分析生物群落结构、风味物质的相对含量以及优势生物属与风味物质的相关性。结果表明:秋季窖泥原核生物和真核生物多样性整体高于春季窖泥。所有样本中,原核生物共检测出21个门、45个纲、82个目、128个科、241个属,其中优势菌门7个,优势菌属43个;真核生物共检测出7个门、19个纲、33个目、81个科、134个属,其中优势菌门5个,优势菌属34个。风味物质测定结果显示,不同季节及层级之间风味物质种类和相对含量差异显著,春季中层窖泥中风味物质种类多且相对含量高。相关性结果显示,Caproiciproducens、Aspergillus与多种风味物质的产生具有相关性,且在不同季节及层级的窖泥中与关键风味物质己酸和己酸乙酯呈正相关的生物存在明显差异。这些结果从时间、空间的维度揭示了窖泥生物组成以及与风味物质的相关性,为窖泥中产香生物的挖掘提供了理论参考。
王依文田瑶瑶张克粉张宿义高洁唐红杰宋川宋川孙铭君左勇李琦
关键词:窖泥微生物群落浓香型白酒风味物质
辣椒疫病不同抗性品种内生生物群落多样性、结构及功能分析
2025年
以辣椒感疫病品种(伏地尖和茄门)和抗疫病品种(CM334和SJ-0948)为试验材料,分别提取根、茎、叶部位的DNA,并利用Illumina平台进行细菌16Sr RNA基因v3-v4区域和真菌ITS1区域测序。结果表明,不同抗性品种在自然种植状态下内生生物组成存在明显差异。易感品种伏地尖的根、茎和叶真菌群落多样性、丰富度指数均显著低于抗病品种。门水平,不同抗性品种根、茎、叶的细菌和真菌优势菌门组成一致,但易感品种伏地尖根、茎、叶的子囊菌门(Ascomycota)真菌丰度均远高于抗病品种。属水平,抗病品种CM334根中优势细菌属有分枝杆菌属(Mycobacterium,相对丰度36.96%),茎中有2013Ark19i(15.21%)、发光杆菌属(Photobacterium,5.50%)、甲基杆菌属(Methylobacterium_Methylorubrum,4.11%),叶中有金色单胞菌属(Aureimonas,3.02%)。易感品种伏地尖中存在较多的有害真菌属,其中镰刀菌属(Fusarium)在根、茎中的占比分别为9.50%和4.23%,枝孢菌属(Cladosporium)在茎、叶中的占比分别为45.46%和51.74%,均显著高于抗性品种。真菌属中,只发现抗性品种中异壳二孢属(Neoascochyta)(根、叶)和被孢霉属(Mortierella)(根)的相对丰度稍高于感病品种。此外,通过Funguild数据库对真菌群落营养型进行分析,易感品种伏地尖的茎、叶中病理营养型真菌的相对丰度较抗性品种(SJ-0948和CM334)高。
蔡泽彦张明星周池陶禹杨莎李鑫李雪峰
关键词:辣椒疫病抗性生态位
黄草乌间作玉米对其根际生物群落多样性的影响被引量:4
2024年
为揭示乌头属黄草乌间作对其根际土壤生物群落结构和多样性的影响,本研究分别采集黄草乌单作(S)、黄草乌间作玉米2∶1模式(I1)和4∶2模式(I2)的黄草乌根际土壤,利用Illumina-MiSeq高通量测序技术分析真菌和细菌群落组成及多样性。结果表明:黄草乌间作玉米提高了黄草乌根际土壤中生物群落的丰富度和多样性;黄草乌根际土壤的优势细菌门为芽单胞菌门、变形菌门、酸杆菌门和放线菌门,主要的优势细菌属有12种;优势真菌门为被孢霉门、子囊菌门、和担子菌门,主要的优势真菌属有8种。冗余分析(RDA)显示,有效磷和全钾含量对土壤生物群落结构的影响强度最大;相关性分析也表明,土壤理化指标均与不同优势菌门存在密切的相关关系。本研究通过高通量测序方法,分析黄草乌与玉米间作对根际生物群落结构的影响,这为进一步揭示黄草乌间作优势机理提供一定理论依据。
吴加香刘涛寸梦壵徐志勇罗曌字淑慧
关键词:草乌间作根际土壤微生物群落多样性
一种用于调查植物根系生物群落多样性的土壤DNA提取装置
本发明公开了植物根系生物多样性研究技术领域的一种用于调查植物根系生物群落多样性的土壤DNA提取装置,包括:底座以及安装在底座上的支架,所述底座的顶部转动安装有转盘,所述转盘上设有安装架,所述安装架上设有若干组安装环;...
于赐刚章嫡妮张振华董姗姗马月
藓结皮植物-土壤连续体生物群落多样性季节动态及胞外酶生态化学计量研究
藓结皮作为干旱与半干旱地区生物土壤结皮发育演替的稳定阶段,参与了荒漠生态系统的物质循环和能量流动,为生物多样性的维持提供了生境。藓结皮-土壤连续体不同粒径土壤生物多样性和土壤生物胞外酶活性对于认识藓结皮的生态过程...
段晓敏
关键词:不同粒径微生物群落多样性

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唐雪明
作品数:218被引量:329H指数:10
供职机构:上海海洋大学食品学院
研究主题:猪肉产品 草菇 品系 等位基因频率 等位基因
赵凯
作品数:105被引量:166H指数:7
供职机构:上海市农业科学院
研究主题:猪肉产品 等位基因频率 等位基因 诊断试剂盒 品系
王金斌
作品数:195被引量:278H指数:9
供职机构:上海市农业科学院
研究主题:猪肉产品 等位基因频率 品系 等位基因 草菇
刘华
作品数:102被引量:99H指数:6
供职机构:上海市农业科学院
研究主题:猪肉产品 等位基因频率 杂合度 6号染色体 限制性内切酶
谭芙蓉
作品数:71被引量:146H指数:7
供职机构:上海市农业科学院
研究主题:苏云金芽孢杆菌 诊断试剂盒 戊肝 鳞翅目 猪肉产品