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眼斑芫菁在斑蝥素合成期的抑制性消减杂交文库构建及分析
2020年
斑蝥素是芫菁科昆虫合成的一种倍半萜类物质,对于治疗肿瘤和其他疾病有特别的疗效.通过构建抑制性消减杂交文库(SSH),筛选眼斑芫菁在斑蝥素合成期的差异表达基因.用斑点杂交消减文库中的1 500个克隆进行筛查,130条特异表达序列标签(ESTs)进行分析. 34条(26%)ESTs与NCBI中标注的假设基因有很高的同源;45条(35%)ESTs与NR数据库中的序列没有同源,可能代表新的基因;51条(39%)ESTs与已知基因的序列同源很高,这些基因参与了生物调控、应激反应和解毒、信号转导、代谢与合成.最后通过实时定量逆转录PCR对文库中的9个上调表达基因进行验证.对眼斑芫菁在斑蝥素合成期的表达进行研究,为最终阐明斑蝥素的生物合成提供帮助.
王宇张利萍殷幼平
关键词:斑蝥素抑制性消减杂交QRT-PCR
抑制性消减杂交技术(SSH)在动物免疫相关基因方面的研究进展
抑制性消减杂交技术(SSH)以抑制PCR方法为基础结合消减杂交,是新兴的一种用于高效分离差异基因的手段,因其具有敏感度高、假阳率低、操作简便等优点,广泛应用于动物免疫领域。本文综述了SSH技术原理、应用概况,SSH技术...
谷笑笑张娇王振华潘康成
关键词:免疫相关基因
文献传递
抑制性消减杂交技术(SSH)在动物免疫相关基因方面的研究进展被引量:1
2018年
对于一个生物个体来讲,尽管所有细胞的基因组成是相同的,但在不同的细胞、同一细胞不同的分化阶段或受到外界的不同刺激时,相关基因的表达及蛋白质的功能都会有所差异([1])。基因的差异表达是调控生物生命活动的核心机制,个体的生长发育和衰老死亡,以及对各种环境因子的应答,本质上都离不开差异基因的表达。为了阐明各种生命过程的分子机制,必须对差异表达基因进行分离、克隆并进一步研究,抑制性消减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)应运而生,
谷笑笑张娇王振华潘康成
关键词:动物免疫免疫相关抑制性消减杂交技术SSH相关基因
黄河鲤卵巢发育抑制性消减杂交文库的构建和相关基因的结构及功能分析
生物在其生命周期中,基因按时间和空间的顺序有序地进行表达,从而也决定了生命活动的多样和复杂。在鱼类腺发育过程中,基因的时空表达方式也受到严格而精确的调控,不同的发育阶段,其表达基因各不相同。通过比较卵巢不同发育时期...
张弯弯
关键词:黄河鲤鱼卵巢发育消减杂交基因表达
滞育七星瓢虫抑制性消减杂交文库的构建及分析被引量:1
2016年
七星瓢虫是优良的天敌昆虫,可凭滞育特抵御逆境胁迫,提高种群生存能力。为研究七星瓢虫的滞育分子机制,构建抑制性消减杂交文库,经反向Northern斑点杂交技术进一步筛选,得到231个差异点。blastx/n比对后,正、反向文库分别得到差异表达基因64和54个,GO分类和PATHWAY分析表明,差异表达基因参与的生物过程涉及滞育的信号传导、生物合成、初级代谢和次级代谢等。文库中发现多种基因,为进一步筛选、克隆、分析滞育相关基因提供线索。着重讨论了与抗寒相关的28 k D抗干燥应激蛋白、卵巢发育相关的Cullin 3蛋白,能量代谢相关的异柠檬酸脱氢酶的生物学功能,进而推测其与七星瓢虫滞育的相关
蒋莎黄凤霞齐晓阳任小云陈红印黄建张礼生
关键词:七星瓢虫抑制性消减杂交差异表达基因滞育
抑制性消减杂交法筛选炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素合成相关基因被引量:2
2016年
为了筛选炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素合成相关基因,本研究以培养36 h(抗生素分泌前)的炭样小单孢菌JXNU-1菌体所合成c DNA为Driver,以培养108 h(抗生素分泌后)的菌体所合成的c DNA为Tester,构建炭样小单孢菌JXNU-1分泌抗生素前后的差异c DNA消减文库,筛选差异表达基因,荧光定量PCR验证其表达量,生物信息学方法分析其功能。研究结果表明,经抑制性消减杂交筛选得到5个与抗生素合成相关的差异表达基因;比照炭样小单孢菌JXNU-1全基因组序列,将所获5个基因定位到4个生物合成基因簇中,最后确定了炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素生物合成相关的基因簇。本研究为阐明炭样小单孢菌JXNU-1中抗生素的生物合成机制提供了实验依据。
江云黄运红李非龙中儿
关键词:抑制性消减杂交
三唑磷作用下翡翠贻贝抑制性消减杂交文库构建与分析被引量:2
2016年
采用抑制性差减杂交技术,构建了三唑磷农药急胁迫下翡翠贻贝雌贝腺正反向消减杂交c DNA文库.正反向文库共有117个表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)与NCBI数据库中已知功能蛋白具较高同源,假定蛋白12种,另有195个ESTs未检索到同源序列.正向文库中含有细胞周期蛋白、激素合成蛋白、DNA修复蛋白、能量代谢相关蛋白等一系列与生殖、应激适应和代谢相关的转录本信息,而反向文库中的差异ESTs主要涉及DNA复制、转录和翻译调控基因以及骨架蛋白.结果表明三唑磷对翡翠贻贝的毒涉及到生殖调控、能量代谢、应激适应、转录翻译调控等生理代谢的多个方面,正向文库中发现的几种生殖调控基因(细胞周期蛋白、周期蛋白依赖蛋白激酶、合子DNA复制许可因子、精子特异蛋白、雌激素硫酸转移酶和卵黄膜卵透明带域蛋白)可能是三唑磷生殖干扰毒作用过程中的关键基因,这为有机磷农药的生殖毒探索提供了基础数据.
孙伟张林宝胡莹蔡文贵贾晓平
关键词:翡翠贻贝性腺三唑磷表达序列标签
滞育七星瓢虫抑制性消减杂交文库的构建与分析
七星瓢虫是优良的天敌昆虫,本研究首次利用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)构建滞育七星瓢虫的抑制性消减杂交文库,发现一批滞育差异表达基因,探讨了滞育相...
蒋莎
关键词:七星瓢虫消减杂交差异表达基因
四种病原菌诱导家蝇幼虫后构建的抑制性消减杂交文库中差异表达基因的分析
对分别以猪致病大肠杆菌、猪肺炎支原体、鸡白痢沙门氏菌及牛多杀巴氏杆菌诱导家蝇幼虫后构建的四个抑制性消减文库中筛选到的差异表达基因进行分析。结果显示,不同病原菌诱导家蝇幼虫后筛选到了大量与家蝇免疫防御、信号传导、及物质...
唐艳裴志花王莹张惠左红梅王东方马红霞
关键词:家蝇幼虫抑制性消减文库差异表达基因
文献传递
抑制性消减杂交技术在昆虫滞育中的利用和展望
2014年
滞育是多数天敌昆虫固有的遗传属,掌握天敌昆虫滞育诱导、维持和解除技术,能及时将扩繁的天敌昆虫以滞育状态进行储存,在释放前再打破滞育使其进入活跃状态以防控害虫。开展天敌昆虫滞育研究,还有助于掌握其发育特点与发生动态,提高害虫防治效率,加深对天敌昆虫发育机制的认识,探寻昆虫对环境适应机制及进化途径。因此,滞育调控及机理研究成为近年来昆虫学研究的一个重要领域。抑制性消减杂交技术(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)是近年来发明的用于挖掘差异调控或特异表达c DNA探针和构建文库的一种方法。本文在总结抑制性消减杂交技术的测试原理及其优越的基础上,归纳了该技术在昆虫滞育研究中的应用,概述了通过构建抑制性消减文库,在鞘翅目、直翅目、鳞翅目、双翅目等昆虫中探明的滞育差异表达基因,进一步探讨了差异表达基因与滞育的关系。随着昆虫全基因组测序和转录组测序的信息增加,抑制性消减杂交技术将更广泛的应用于昆虫学各个领域的差异基因的筛选与挖掘,促进昆虫分子生物学科学体系的发展。
蒋莎张礼生黄建陈红印黄凤霞齐晓阳任小云
关键词:差异表达基因昆虫滞育

相关作者

成军
作品数:1,429被引量:5,859H指数:36
供职机构:中国人民解放军
研究主题:丙型肝炎病毒 乙型肝炎病毒 反式激活基因 肝炎病毒 克隆
刘妍
作品数:609被引量:1,585H指数:29
供职机构:吉林大学
研究主题:乙型肝炎病毒 丙型肝炎病毒 反式激活 反式激活基因 克隆
纪冬
作品数:225被引量:888H指数:14
供职机构:中国人民解放军总医院
研究主题:丙型肝炎病毒 反式激活基因 乙型肝炎病毒 抑制性消减杂交技术 反式激活
郭江
作品数:122被引量:204H指数:7
供职机构:首都医科大学附属北京地坛医院
研究主题:乙型肝炎病毒 抑制性消减杂交技术 反式激活基因 反式调节基因 反式激活
张黎颖
作品数:112被引量:186H指数:7
供职机构:北京地坛医院
研究主题:抑制性消减杂交技术 反式激活基因 反式调节基因 乙型肝炎病毒 丙型肝炎病毒