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新疆达坂城盐湖土壤中可培养放线菌多样性及其活性筛选: 2024年; 【背景】近年来,新疆的一些盐湖和盐碱地如艾比湖、七角井盐湖和罗布泊等地不断有新的放线菌菌株被发现,而达坂城盐湖土壤分离放线菌的相关报道较少。【目的】研究新疆达坂城盐湖土壤中可培养放线菌的多样性并进行酶活性筛选,以期发现新的药用微生物资源,为新抗生素的发现奠定基础。【方法】采用纯培养分离技术和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析研究达坂城盐湖土壤中可培养放线菌的多样性;采用PCR检测分析pksI、pksII、nrps和aph这4种抗生素合成相关基因的分布;利用琼脂块扩散法进行抗菌活性初筛;以9种酶活底物为指示物,结合琼脂块扩散法对可培养的放线菌进行功能酶活性筛选。【结果】从达坂城盐湖的14份土壤中共分离到65株放线菌,隶属于5个目5个科9个属,其中2株放线菌为潜在新种,优势菌属为链霉菌属(Streptomyces)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis);抗生素功能基因筛选出较为丰富的与抗生素合成相关的基因;筛选到一株对革兰氏阳性、革兰氏阴性及真菌都有拮抗效果的菌株D21E05;达坂城盐湖土壤中含丰富的产蛋白酶、脂酶、过氧化氢酶、纤维素酶和淀粉酶等生物活性酶的菌株。【结论】达坂城盐湖土壤中含有较为丰富的药用放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种和新抗生素的潜力。; 秦培钢冯华玺魏圆圆毕心怡迪丽孜巴·阿迪力马文静; 关键词：放线菌多样性

基于高通量测序和纯培养技术解析海南东寨港红树植物老鼠簕根际放线菌多样性及其潜在的功能: 2024年; 根际是土壤-植物根系-微生物进行物质交换的活跃地带。根际放线菌是根系放线菌的重要组成部分,是生物活性物质的主要来源之一。本研究从海南东寨港红树林自然保护区采集了5份红树植物老鼠簕根际土壤样品,采用高通量测序和传统纯培养相结合的策略探究样品中根际放线菌的多样性和产生生物活性物质的潜力。利用Illumina Novaseq6000测序平台对老鼠簕根际样品细菌的16SrRNA基因的V3~V4区域进行测序与分析,结果显示:(1)老鼠簕根际细菌共注释到32个门(包括25个有效鉴定的门),其中优势门是变形菌门;α多样性分析表明老鼠簕根际细菌群落多样性非常丰富;(2)对放线菌门的微生物群落进行分析,注释到33个有效鉴定的属、4个暂定的属和28个未培养的新放线菌属,KEGG功能预测分析显示老鼠簕根际放线菌主要参与次级代谢产物的生物合成。同时,利用传统纯培养方法分离放线菌,经形态特征分群和排重,通过PCR扩增、测序并比对16SrRNA基因序列后进行放线菌多样性分析,利用琼脂扩散法筛选抑菌活性,通过基于PCR的基因筛选技术检测代表菌株可能存在的PKS-Ⅰ、PKS-Ⅱ和NRPS抗生素生物合成基因,结果显示:(1)共得到4个属的33株放线菌代表菌株,其中链霉菌属为优势菌属,有2个属未被高通量测序分析结果注释到;(2)代表菌株的NRPS和PKS-Ⅱ基因阳性率很高(90%以上),24.24%根际放线菌具有抗1种及以上指示菌的活性。本研究利用高通量测序和纯培养方法得出东寨港红树植物老鼠簕的根际放线菌多样性非常丰富,并具有较好的合成次生代谢产物的潜力,因此,该研究结果可为具有生物活性化合物的筛选提供丰富的菌种资源,同时也为后续新药的开发提供重要参考依据。; 刘顺卿何小稳吴金燕易国辉陈芊芊谢欣宜隋金蕾; 关键词：老鼠簕根际放线菌多样性高通量测序纯培养

库姆塔格沙漠可培养放线菌多样性及抑菌潜力评估被引量：1: 2024年; 沙漠土壤蕴藏丰富的放线菌资源,尤其是稀有放线菌类群,是挖掘新放线菌资源的理想生境。本研究开展库姆塔格沙漠可培养放线菌抑菌活性筛选,以期为该地区放线菌资源开发和利用提供菌株资源。根据分离菌株的16S rRNA基因序列分析放线菌多样性;从库姆塔格沙漠4份土样中分离纯化到370株放线菌,分布于11个目12个科的22个属,其中链霉菌属和糖丝菌属为优势菌属,分别占分离放线菌菌株的63%和13.8%。对14株放线菌潜在新种(16S rRNA基因序列相似性低于98.65%)进行高氏一号、ISP2、TSB培养基液体发酵,获得提取浓缩物样品进行抑菌活性筛选,发现11株潜在新种的发酵产物有广谱抗菌活性。本研究表明,库姆塔格沙漠中含有丰富的放线菌资源,具有从中发现放线菌新菌种和抗生素的潜力。; 李佳慧汶瑛田茂刘光琇张威章高森薛林贵; 关键词：库姆塔格沙漠放线菌抑菌活性

库姆塔格沙漠放线菌多样性特征及抑菌潜力评估: 沙漠是地球上最大的陆地生态系统之一,微生物是沙漠生态系统中最重要的组成成分,其种类丰富多样,尤其是放线菌资源。已有研究证实,放线菌是产抗生素的重要来源。库姆塔格沙漠位于塔里木盆地东南的阿尔金山北麓,区域降水极为稀少,年均...; 李佳慧; 关键词：库姆塔格沙漠细菌多样性放线菌抑菌活性全基因组测序

西伯利亚Gudzhirganskoe盐湖土壤放线菌多样性、新颖性及抗菌活性研究被引量：1: 2023年; 目的探究西伯利亚Gudzhirganskoe盐湖土壤放线菌多样性、新颖性和活性菌株的次级代谢产物,为放线菌新物种和新抗生素的发现储备菌种资源。方法采用10种分离培养基,利用稀释涂布法进行放线菌的分离纯化;通过PCR扩增和测序,比对16S rRNA序列进行放线菌多样性和新颖性分析;采用纸片扩散法对潜在放线菌新物种发酵液的酯相萃取物、水相和菌体相进行抗菌活性筛选;采用反相柱层析、葡聚糖凝胶Sephadex LH-20和半制备HPLC方法分离纯化菌株Hoyosella sp.S15b3-3粗提物的活性成分,通过ESI-MS、NMR波谱数据,并结合文献确定化合物的结构;采用微量稀释法评价化合物1和2的抗菌活性。结果从15份样品中分离获得1343株放线菌,分属于10目23科42属,其中涅斯捷连科菌属、拟诺卡菌属和链霉菌属为优势菌属;15株放线菌与近缘菌株的16S rRNA基因的最高相似度≤98.65%;5株潜在新物种对至少1株检定菌表现出抗菌活性;从Hoyosella sp.S15b3-3中分离鉴定2个已知化合物1(3-吲哚甲醛)和2(2-羟基-1-(3-吲哚)乙酮),化合物1对2株鲍曼不动杆菌(2799和ATCC19606)有一定的抑制作用,MIC值分别为64和32μg/mL。结论西伯利亚Gudzhirganskoe盐湖土壤含有丰富的放线菌资源,且新颖性较高,具有从中发现放线菌新物种和新抗生素的潜力,值得深入研究。; 杨芹郭普宇Elena Y.Abidueva刘少伟李飞娜薛春梅孙承航; 关键词：放线菌多样性次级代谢产物

雷州半岛红树林根际土放线菌多样性、新颖性、抗菌抗肿瘤活性及新种分类学研究: 【目的】　　1.从采集自广东湛江雷州半岛沿海红树林的根际土样品中分离菌株，并纯化培养其中的放线菌。　　2.通过系统发育分析对所分离放线菌的物种多样性、新颖性进行研究。　　3.对放线菌发酵粗提物对2种肿瘤细胞的抗肿瘤作用、...; 李俊杰; 关键词：红树林抗肿瘤活性

腾冲热海地热土壤放线菌多样性及生物活性研究: 王娟

四种中草药内生放线菌多样性及次生代谢产物研究: 孙慧冰

涠洲岛5个样区放线菌多样性及两种活性筛选: 陈雪梅

云南金铁锁根可培养放线菌多样性及其抗菌活性研究被引量：2: 2022年; 【目的】探索云南金铁锁根部可培养放线菌资源及筛选高抗病原菌活性菌株。【方法】以云南4个地方金铁锁的根为研究对象,采用不同温度预处理及14种分离培养基对其进行放线菌分离;选用74株内生放线菌菌株,以5种病原菌为指示菌,使用倒置法测定供试放线菌的抗菌活性。【结果】从金铁锁根部分离获得121株内生放线菌,基于16S rRNA基因序列比对和系统发育分析,将其归属于10个目、15个科和24个属,其中链霉菌(Streptomyces)为绝对优势菌群,其后依次为诺卡氏菌属(Nocardia)、小单孢菌属(Micromonospora)和分枝菌酸小杆菌属(Mycolicibacterium)。分离效果最好的培养基为D4(酵母粉0.3 g,干酪素0.3 g,葡萄糖0.3 g,骨粉0.3 g);最优的预处理温度为80℃;74株内生放线菌中的37株对至少一种指示病原菌具有抑制活性,且活性强的主要类群为链霉菌属。【结论】金铁锁根部蕴藏着丰富的放线菌种质资源,且蕴含着具有产次级代谢产物能力的菌株,这将为后续的医药及农业生产提供了丰富的菌种资源,同时为其栽植、保护、开发及应用提供了一定的基础数据和理论依据。; 王梦雨黄美娟李茜李珊辉肖敏黄海泉李文均; 关键词：金铁锁内生放线菌多样性抗菌活性

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