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一种能够识别单碱基甲基化状态的检测方法
本文提供了一种能够识别单碱基甲基化状态的检测方法,包括:1)利用所述样品中DNA分子构建DNA文库,经转化后获得甲基化文库;2)对所述甲基化文库进行杂交捕获,以构建靶向甲基化文库;以及3)对所述靶向甲基化文库进行测序,并...
余丽萍储俊东吴强
用于检测BRCA1基因启动子区域甲基化状态的组合物及其用途
本申请提供了一种用于体外检测BRCA1基因启动子区域甲基化状态或体外检测BRCA1基因启动子区域甲基化导致的癌症的组合物及其用途,所述组合物包括:用于检测BRCA1基因启动子区域甲基化状态的核酸。本申请还提供了包括所述组...
古双臻汪亚林吴振
用于检测前列腺癌EV DNA中GSTP1启动子甲基化状态的试剂组合、试剂盒
本发明涉及通过PCR检测GSTP1启动子甲基化程度,具体涉及一种用于检测前列腺癌EV DNA中GSTP1启动子甲基化程度的试剂组合、试剂盒,用于解决用于前列腺癌检测的PSA对前列腺癌组织特异性差,难以鉴别良性病变和肿瘤病...
丁汀刁艳君郝晓柯
同时检测SEPT9、SDC2、SFRP2和RNF180甲基化状态的试剂组合、试剂盒及方法
本发明提供了一种同时检测SEPT9、SDC2、SFRP2和RNF180甲基化状态的试剂组合、试剂盒及方法,属于生物检测技术领域。所述的试剂组合包括SEQ ID NO.1‑17所示的引物、SEQ ID NO.18‑30所示...
黄丽婷
一种检测MGMT甲基化状态的检测体系及其应用
本发明公开了一种检测MGMT甲基化状态的引物探针组,含有核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的MGMT‑ms‑F引物、SEQ ID NO:2所示的MGMT‑ms‑R引物和SEQ ID NO:3所示的MGMT‑ms‑P探...
张晓妮沈焕明许明炎林婵周仲春
循环肿瘤DNA甲基化状态在胃癌筛查和诊治中的研究进展
2024年
循环肿瘤DNA是由肿瘤或循环肿瘤细胞释放的游离DNA,含有大量的肿瘤特征信息,这些特征可作为癌症早筛、监测、预后及预测治疗反应的生物标记物。目前还没有优质的筛查、监测及预测方法的胃癌领域极具吸引力。胃癌具有极大的肿瘤异质性,不同的胃癌亚组遗传特征和表观遗传特征差异性大,甲基化循环肿瘤DNA的敏感性和特异性高,有助于明确肿瘤基因分型,便于制定精确的诊治策略。此外,大量研究也证实了甲基化DNA在预测治疗反应、辅助治疗及耐药性评估上具有独特优势,在未来可以用于增强化疗方案的疗效和改善患者的化疗反应,甚至治疗多药耐药等。但甲基化循环肿瘤DNA也面临着诸多问题,如在单靶点的敏感性和特异性不高,部分胃癌亚型与循环肿瘤DNA关联有限、有脱靶风险、大样本及高质量临床研究证据缺乏等不足。本综述主要总结了目前对胃癌循环肿瘤DNA甲基化状态的研究,并将这些发现与胃癌早筛、复发监测和潜在的治疗机会联系起来,随着技术的进步和医工交叉研究的深入,循环肿瘤DNA检测将揭示更多疾病信息,成为胃癌领域和精准医学治疗的重要基础。
曹钦兴严力侯能易陈锦锋余松陆河江旦真甲庞明辉
关键词:胃肿瘤DNA甲基化生物标志物早期筛查
MRI影像组学无创预测脑胶质母细胞瘤MGMT启动子甲基化状态的价值被引量:1
2024年
目的:探讨MRI影像组学模型术前预测脑胶质母细胞瘤(GBM)O 6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶启动子甲基化(MGMT-PM)状态的价值。方法:回顾性分析2018年1月-2021年10月在本院经病理证实的130例脑GBM患者的临床资料和MRI图像(ADC和对比增强3D-T 1WI)。其中,MGMT-PM阳性组(PM率≥8%)58例,MGMT-PM阴性组(PM率<8%)72例。按7:3的比例将所有患者随机分为训练集(91例)和验证集(39例)。由2位放射科医师独立在ADC和CE-3D-T 1WI图像上逐层勾画ROI,获得病灶的全域容积感兴趣区(VOI),分别提取851个组学特征。然后,采用最小绝对收缩和选择算法(LASSO)进行特征降维,将保留下来的特征与其对应的系数进行线性组合,构建影像组学模型并计算每例患者的影像组学评分(Radscore),得到Radscore ADC、Radscore CE-T 1WI和Radscore联合三组评分。采用ROC曲线评估各组学模型的诊断效能,将最优模型的Radscore和临床特征(年龄、性别)纳入logistic回归分析构建预测MGMT-PM状态的临床-组学综合模型,并绘制其诺模图。采用ROC曲线评价综合模型的预测效能,并采用校准曲线和决策曲线分别评估此模型的校准度和临床实用价值。结果:在训练集中,Radscore联合预测MGMT-PM状态的AUC为0.872,优于单一序列(Radscore ADC:AUC=0.798,P<0.05;Radscore CE-T 1WI:AUC=0.840,P<0.05);在验证集中得到了一致的结论。在影像组学模型中加入临床特征后,可提高预测效能,临床-组学综合模型的AUC、敏感度和特异度分别为0.904、92.50%和78.43%。校准曲线显示临床-组学综合预测模型在训练集和验证集中预测概率与实际概率之间的差异均无统计学意义(P=0.051、0.284)。决策曲线分析表明综合预测模型具有一定的临床实用价值。结论:MRI影像组学模型有助于术前无创性预测GBM的MGMT启动子甲基化状态,多序列结合及引入临床特征能提高模型的预测效能。
马千昂卢俊董亚锋曲金荣
关键词:胶质母细胞瘤
基于Septin9基因甲基化状态的结直肠腺瘤转录组分析及中医证型分布规律研究
目的:(1)对不同Septin9基因甲基化(mSEPT9)状态下的结直肠腺瘤(CRA)及瘤旁正常组织进行转录组测序,筛选出mSEPT9阴性CRA的潜在生物标志物,用于联合mSEPT9检测提高CRA的检出率。(2)对CRA...
郭家敏
关键词:结直肠腺瘤生物标志物中医证型
一体化^(18)F-FET PET/MR术前评估成人胶质瘤患者MGMT基因启动子甲基化状态
2024年
目的 旨在研究一体化^(18)F-氟乙基酪氨酸(^(18)F-fluoroethyltyrosine, ^(18)F-FET)正电子发射断层成像(positron emission tomography, PET)/MR对成人胶质瘤的O6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(O6-methylguanine DNA methyltransferase, MGMT)基因启动子甲基化状态的鉴别能力。材料与方法 回顾性分析未经活检或治疗的胶质瘤患者资料16例,均完成一体化PET/MR扫描,包括^(18)F-FET PET、常规MRI及体素内不相干运动(intravoxel incoherent motion, IVIM)成像。以靶本比(target-background ratio, TBR)=1.6为阈值对PET图像进行感兴趣体积(volume of interest, VOI)分割,通过刚性配准获得肿瘤VOI对应的IVIM图及其参数表观扩散系数(apparent diffusion coefficient, ADC)、真实扩散系数(true diffusion coefficient, D)、伪扩散系数(pseudo diffusion coefficient, D^(*))、灌注分数(perfusion fraction, f)、分布扩散系数(distributed diffusion coefficient, DDC)和异质性指数(heterogeneity index, α),使用pyradiomics对各参数进行特征提取,获得对应的一阶灰度直方图特征。计算每个IVIM参数图对应的特征值与^(18)F-FET PET参数的关系,并利用组间比较和受试者工作特征(receive operating characteristic, ROC)曲线分析探究PET和IVIM参数对MGMT启动子甲基化的区分能力。结果 IVIM-α的两个特征值90分位值(r=0.526,P<0.05)和最大值(r=0.520, P<0.05)与PET参数平均标准摄取值(meanstandarduptakevalue,SUVmean)呈正相关;IVIM-α和SUVmean在MGMT启动子甲基化状态阳性和阴性两组之间的差异有统计学意义(P<0.05),阳性组的IVIM-α均值和SUVmean显著高于阴性组;融合IVIM-α均值和SUVmean对MGMT启动子甲基化状态进行区分的曲线下面积(area under the curve, AUC)为0.77。结论 基于一体化PET/MR的^(18)F-FET PET和IVIM参数能够有效预测胶质瘤的MGMT启动子甲基化状态
韩青青李拓林增萍李恩慧杨阳刘家惠邢浩王裕程欣霍力
关键词:胶质瘤
子宫内膜癌组织中HOXD10甲基化状态及临床意义
2024年
通过对比实验来分析HOXD10甲基化状态在子宫内膜癌中的作用和地位。方法 在相同的时间(2022年1月至2024年3月)中分别选择出148例子宫内膜癌患者和30例子宫内膜增生患者进行本次对比研究工作。对入组的所有患者都采集了新鲜的组织样本进行病理检测,同时,将两组患者的基础病历资料进行汇总和分析。结果 在两组患者的检测结果的对比中发现,观察组在HOXD10mRNA中的数值表达要明显地低于对照组(P<0.05),与此?,该组患者的HOXD10mRNA启动子高甲基化的癌组织样本中的HOXD10mRNA以及蛋白阳性表达量率也是处于更低的水平之中(P<0.05)。结论 子宫内膜癌组织中的HOXD10mRNA启动子甲基化水平较高,被认为是造成HOXD10蛋白低表达的主要原因之一,提示HOXD10高甲基化状态和子宫内膜癌患者的临床表现以及结局有直接的关系。
王可欣胡金桂张筱雯焦桢
关键词:子宫内膜癌甲基化状态

相关作者

郭炜
作品数:209被引量:525H指数:10
供职机构:中国石油天然气集团公司
研究主题:贲门腺癌 食管鳞状细胞癌 甲基化状态 甲基化 DNA甲基化
董稚明
作品数:186被引量:366H指数:8
供职机构:河北医科大学第四医院
研究主题:贲门腺癌 甲基化状态 食管鳞状细胞癌 甲基化 DNA甲基化
郭艳丽
作品数:104被引量:197H指数:6
供职机构:河北医科大学第四医院
研究主题:贲门腺癌 甲基化状态 食管鳞状细胞癌 甲基化 DNA甲基化
邝钢
作品数:103被引量:243H指数:8
供职机构:河北医科大学第四医院
研究主题:贲门腺癌 甲基化状态 食管鳞状细胞癌 甲基化 DNA甲基化
杨植彬
作品数:70被引量:119H指数:6
供职机构:河北医科大学第四医院
研究主题:贲门腺癌 甲基化状态 甲基化 DNA甲基化 食管鳞状细胞癌