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基于转录组测序技术研究叶酸对神经管畸形细胞模型凋亡途径的影响
2024年
目的探讨叶酸防治神经管畸形(NTDs)的作用机制。方法PC12细胞随机分为对照组、模型组及叶酸组。采用全反式维甲酸(atRA)干预PC12细胞构建NTDs细胞损伤模型。采用CCK-8法测定PC12细胞活力;流式细胞术检测细胞凋亡率;转录组测序(RNA-seq)技术进行细胞总RNA测序,筛选差异表达基因,并对差异表达基因集进行基因本体论(GO)功能及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路显著性富集分析,筛选凋亡相关基因;RT-qPCR法检测凋亡相关基因含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(caspase)-4、caspase-12、内质网核心信号1(Ern1)和吞噬细胞糖蛋白I(CD44)mRNA表达水平的变化。结果与对照组比较,模型组PC12细胞活力显著下降(P<0.05),细胞凋亡率显著升高(P<0.01);与模型组比较,叶酸组细胞活力显著增强(P<0.05),细胞凋亡率显著降低(P<0.01)。差异表达基因集GO功能分析显著富集到内质网应激介导细胞凋亡相关“内质网应激反应的内在凋亡信号通路”等GO条目,KEGG通路分析显著富集到“细胞周期”和“DNA复制”等通路;与对照组比较,模型组凋亡相关基因caspase-12、caspase-4、Ern1、CD44上调,与模型组比较,叶酸组凋亡相关基因下调。RT-qPCR结果显示,与对照组比较,模型组caspase-12、caspase-4、CD44、Ern1 mRNA表达水平明显增高(P<0.05,P<0.01),而与模型组比较,叶酸组caspase-12、caspase-4、Ern1、CD44 mRNA表达水平显著降低(P<0.05,P<0.01)。结论叶酸抑制atRA诱导的PC12细胞凋亡,保护神经元样细胞,其机制可能与下调凋亡相关基因caspase-12、caspase-4、Ern1、CD44的表达有关,是通过抑制内质网应激介导的细胞凋亡实现的。
牛思翔茹意李瑞雪谢良骐于子洋徐磊秦劭晨樊慧杰马存根柴智
关键词:叶酸PC12细胞全反式维甲酸神经管畸形
一种菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶抑制剂及其应用
本发明公开了一种菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶抑制剂及其应用。本发明克隆了一个菜蛾盘绒茧蜂丝氨酸蛋白酶抑制剂CvT‑SPN‑bacteriostat基因,该CvT‑SPN‑bacteriostat基因体外原核表达获得的...
王知知吴志伟陈学新黄健华叶熹骞
菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶抑制剂Cv-serpin2
本发明公开了菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶抑制剂Cv‑serpin2。本发明克隆了一个菜蛾盘绒茧蜂丝氨酸蛋白酶抑制剂Cv‑serpin2基因,该菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶Cv‑serpin2基因体外原核表达获得的...
陈学新吴志伟王知知黄健华叶熹骞
平阳霉素对静脉畸形细胞增殖及凋亡的作用研究被引量:2
2020年
目的:探讨平阳霉素对静脉畸形细胞增殖及凋亡的影响。方法:在人脐静脉内皮细胞(human umbilical vein endothelial cell,HUVEC)中过表达TIE2-L914F与TIE2-WT基因从而构建静脉畸形细胞模型和野生型细胞模型组,HUVEC为Control组。采用CCK-8检测平阳霉素对静脉畸形细胞增殖活性的影响。Hoechst 33342染色及流式细胞计数法检测平阳霉素对静脉畸形细胞凋亡的影响。Western Blot检测凋亡相关蛋白Caspase-3、Caspase-9、Bax、Bcl-2及P53的表达水平。结果:CCK-8结果显示平阳霉素可以明显抑制静脉畸形细胞的增殖活性,且呈时间依赖性与剂量依赖性(P<0.05)。Hoechst 33342染色及流式细胞计数结果显示平阳霉素可明显促进静脉畸形细胞凋亡(P<0.05)。Western Blot结果显示经平阳霉素处理后,促凋亡蛋白Caspase-3与Caspase-9的活化水平上调,Bax及P53表达上调,抑凋亡蛋白Bcl-2表达下调(P<0.05)。结论:平阳霉素可明显抑制静脉畸形细胞的增殖活性,可能通过线粒体途径促进凋亡,从而发挥治疗作用。
周婷茹杨静段瑞娄慧全李永生
关键词:TIE2平阳霉素细胞活性凋亡
人静脉畸形细胞模型的建立及平阳霉素对其作用机制的实验研究
[目的]建立静脉畸形细胞模型;观察平阳霉素对静脉畸形细胞增殖及凋亡的影响,探讨平阳霉素诱导静脉畸形细胞凋亡的潜在作用机制。[方法]1.静脉畸形细胞模型及野生型细胞模型的构建:通过慢病毒转染的方法在人脐静脉内皮细胞(hum...
周婷茹
关键词:TIE2平阳霉素细胞活性凋亡
文献传递
五子衍宗丸对神经管畸形细胞模型凋亡途径的影响被引量:11
2019年
目的探讨五子衍宗丸防治神经管畸形(NTDs)的可能作用机制。方法 PC12细胞随机分为空白组、模型组及五子衍宗丸低、中、高剂量组。除空白组外,其余各组采用全反式维甲酸(atRA)干预PC12细胞构建NTDs模型。五子衍宗丸低、中、高剂量组分别给予含五子衍宗丸的RPMI-1640培养基并使其最终浓度分别为125、250、500μg/ml进行预处理,模型组和空白组加入RPMI-1640培养基。测定各组PC12细胞活力及细胞凋亡率,并提取空白组、模型组及经细胞活力、细胞凋亡率实验确定的最佳剂量五子衍宗丸组细胞总RNA测序,筛选差异表达基因,运用维恩图得到目的差异表达基因集,并进行GO功能和KEGG通路显著性富集分析,对与细胞凋亡相关的差异基因进行共表达网络分析。结果模型组PC12细胞活力显著下降,细胞凋亡率显著增加,五子衍宗丸各剂量组细胞活力增强、细胞凋亡率降低,且以五子衍宗丸低剂量组效果最佳(P<0.05或P<0.01)。目的差异表达基因集GO功能分析显著富集到内质网应激介导细胞凋亡相关和细胞增殖生长相关的GO条目,KEGG通路分析显著富集到细胞生长和死亡相关的信号通路。与模型组比较,五子衍宗丸低剂量组内质网应激相关基因Em1、Casp12、Creb3l1下调,抗凋亡基因Birc5上调,与模型组较空白组这些基因上下调方向正好相反。结论五子衍宗丸可抑制细胞凋亡,保护神经元样细胞,其机制与调控内质网应激相关的基因表达,与染色体分离、细胞核分裂、细胞周期等细胞增殖、生长和死亡等生物过程或信号通路相关。
李瑞雪樊慧杰柴智李艳荣孙梦瀛肖午帅尉杰忠李艳花张波马存根周然
关键词:五子衍宗丸神经管畸形细胞凋亡凋亡途径细胞增殖
菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶抑制剂CvT-SPI基因及应用
本发明涉及分子生物学、基因工程以及蛋白工程领域,旨在提供一种菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶抑制剂CvT‑SPI基因及应用。该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,由该基因编码的蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID ...
陈学新谷启娟时敏黄健华
文献传递
菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶抑制剂CvT‑SPI基因及应用
本发明涉及分子生物学、基因工程以及蛋白工程领域,旨在提供一种菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞丝氨酸蛋白酶抑制剂CvT‑SPI基因及应用。该基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,由该基因编码的蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID ...
陈学新谷启娟时敏黄健华
菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞防卫素CvT-Def基因及编码的抗菌多肽
本发明涉及分子生物学领域,旨在提供一种菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞防卫素CvT-Def基因及编码的抗菌多肽。该基因的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示,抗菌多肽的氨基酸序列如SEQ?ID?NO.2所示。本发明所提供的菜蛾盘绒...
陈学新谷启娟时敏
文献传递
菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞TATA结合蛋白基因的克隆与序列分析被引量:5
2014年
TATA结合蛋白(TATA-binding protein,TBP)及其相关因子是转录起始复合物TFIID的重要组分,能识别TATA元件并与之特异性结合,进而指导RNA聚合酶和其它转录因子有序装配,形成稳定的转录起始复合物。本文采用RT-PCR和RACE技术克隆获得了菜蛾盘绒茧蜂Cotesia vestalis畸形细胞TATA结合蛋白(CvT-TBP)基因的cDNA序列(GenBank No.JX984954),序列全长6105 bp,开放阅读框5784 bp,编码1927个氨基酸,预测分子量213.8 kDa,理论等电点6.82。氨基酸序列分析表明,CvT-TBP与其他膜翅目昆虫的TBP有很高的同源性,其中与切叶蜂Megachile rotundata、小蜜蜂Apis florea和佛罗里达弓背蚁Camponotus floridanus的相似性均为72%。本研究克隆得到的畸形细胞TATA box结合蛋白cDNA序列,为进一步研究该基因功能以及畸形细胞的作用机理提供了基础数据。
潘璟谷启娟时敏陈学新
关键词:菜蛾盘绒茧蜂畸形细胞基因克隆

相关作者

陈学新
作品数:280被引量:1,338H指数:21
供职机构:浙江大学
研究主题:寄生蜂 膜翅目 菜蛾盘绒茧蜂 小菜蛾 绒茧蜂
白素芬
作品数:91被引量:190H指数:9
供职机构:河南农业大学植物保护学院
研究主题:寄生蜂 小菜蛾 菜蛾盘绒茧蜂 寄主 棉铃虫齿唇姬蜂
程家安
作品数:373被引量:4,222H指数:35
供职机构:浙江大学
研究主题:褐飞虱 白背飞虱 水稻 二化螟 稻水象甲
何俊华
作品数:228被引量:710H指数:15
供职机构:浙江大学农业与生物技术学院昆虫科学研究所
研究主题:膜翅目 新种记述 茧蜂科 螯蜂科 小腹茧蜂亚科
王方海
作品数:98被引量:347H指数:11
供职机构:中山大学生命科学学院
研究主题:蜕皮激素 滞育 寄生蜂 白背飞虱 棉铃虫