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2019-2023年青海省手足口病病原谱及CVA16和EV-A71基因特征分析: 2025年; 为了解2019-2023年青海省手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原构成以及柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CVA16)和肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)的基因特征,本研究对青海省2019-2023年实验室确诊的2028名HFMD病例的核酸检测结果进行统计分析,利用RT-PCR方法对CVA16和EV-A71病毒毒株扩增VP1编码区并进行基因序列测定,使用MEGA、BioEdit等软件对CVA16和EV-A71进行分型与进化关系分析。结果发现,2021年开始,青海省HFMD病原构成的优势血清型别由CVA16和EV-A71转变成其他肠道病毒,在每年检出的病原体中占比均超过50.0%。对2019-2023年全省上送的CVA16及EV-A71阳性标本进行病毒分离,共收获122株CVA16毒株和36株EV-A71毒株。122株CVA16毒株均属于B1基因亚型,其中B1b亚型100株,B1a亚型22株。B1b亚型毒株VP1区的核苷酸同源性为92.8%~100%,氨基酸同源性为97.9%~100%,B1a亚型毒株VP1区的核苷酸同源性为95.9%~100%,氨基酸同源性为97.9%~100%。36株EV-A71分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支,VP1区核苷酸序列同源性为95.8%~100%,氨基酸序列同源性为97.6%~100%。氨基酸置换熵值分析发现,2019-2023年青海省CVA16分离株的VP1编码区无易突变氨基酸位点;EV-A71分离株的VP1编码区存在3个高度可变的氨基酸位点为VP1-164、VP1-241和VP1-262。VP1-164位点在2021年出现N突变,并在2023年取代D成为此位点优势氨基酸;VP1-241位点上,2020年开始出现T突变,并在2021年取代S成为优势突变(94.12%),2023年此位点又完全替换为S;VP1-262位点上,2020年开始I取代V成为此位点优势氨基酸(94.12%),2023年此位点又完全替换为V。本研究揭示了2019-2023年青海省HFMD病原谱的变化情况,探究了CVA16和EV-A71的分子遗传进化特征,为青海地区制定HFMD的预防控制策略提供了理论依据。; 李倩兰赵生仓韩志萍李崇亥王晓彤周蕾于力恒张华一严冬梅范丽霞; 关键词：手足口病柯萨奇病毒A组16型基因特征

乌鲁木齐市秋、冬、春季某医院社区获得性肺炎患儿病原谱特征分析: 2025年; 目的探讨乌鲁木齐市秋、冬、春季某医院住院社区获得性肺炎(CAP)患儿呼吸道感染病原谱特征。方法采集2023年10月至2024年4月在该院住院的1446例CAP患儿的鼻咽拭子标本,采用聚合酶链反应荧光探针法对常见的6种呼吸道病原体核酸进行检测,结合相关临床资料,分析呼吸道病原谱特征。结果1446例CAP患儿呼吸道病原体总检出率为65.01%,其中肺炎支原体(MP)检出率最高(32.23%);混合感染率为6.43%,以双重病原体感染最常见。病原体检出率呈现2个高峰:冬季(11月底)为82.35%,春季(2月中旬)为84.48%;CAP患儿病原谱中不同病原体存在错峰感染现象,其中MP检出率出现2个高峰(春季的2月底和4月中旬)。CAP患儿年龄主要集中在>6~12岁。结论乌鲁木齐市秋、冬、春季CAP患儿病原谱存在各病原体错峰感染现象,以MP感染为主,冬、春季为高发时段,>6~12岁患儿为高发群体,需密切关注。; 梁梦洁李永鑫蔺豪杰张新邓朝晖; 关键词：呼吸道感染性疾病社区获得性肺炎病原谱

2019—2024年天水市流感样病例监测病原谱特征分析: 2025年; 目的:评估2019年1月—2024年2月天水市流感样病例病毒流行趋势的变化,为疾病防控提供参考。方法:以2019年1月—2024年2月8 126例于哨点医院门诊就诊及住院的流感样病例患者为研究对象,对其进行常见流感病毒检测。对不同季节、年份、年龄段的结果进行统计分析。结果:8 126例流感样病例中流感病毒的阳性检出率为9.97%(810例,810/8 126)。2019年流感病毒的阳性检出率最高,阳性构成比为39.75%。各月病例数存在较大差距,3月、4月、12月的病例数较多。3~5岁组和6~12岁组是流感病毒感染的高发人群,阳性病例数达396例,阳性构成比达48.89%。春季和冬季的阳性检出率分别为18.39%和11.47%,阳性构成比分别为50.39%和40.31%,是流感病毒感染的高峰季节。阳性检出率最高的病毒为乙型Victoria,阳性构成比为39.01%。甲型H3N2、新甲型H1N1也有较高的阳性构成比。结论:2019—2024年天水市流感病毒分布以乙型Victoria、甲型H3N2和新甲型H1N1为主,不同年份、年龄段、季节的病原体构成有所差异,其分布及流行特征为流感防治提供了依据。; 雷成江马星宇赵婧伊雷涵钰; 关键词：流感样病例流感病毒

我国奶牛子宫内膜炎发生率、病原谱和主要病原菌耐药特征被引量：1: 2024年; 子宫内膜炎是奶牛养殖过程中的常见疾病,其病原菌种类多样,流行分布呈一定季节性和地域性特征,病原菌耐药特征差别较大。为系统了解我国各地牧场奶牛子宫内膜炎发生率、病原谱和主要病原菌耐药特征,本文梳理了近十年在我国各地区牧场开展的相关研究,结果发现,奶牛子宫内膜炎在我国各地牧场的发生率普遍较高;各地区奶牛子宫内膜炎病原谱存在差异,以大肠埃希菌、葡萄球菌、链球菌和芽孢杆菌为主;主要病原菌对青霉素类、四环素类、氨基糖苷类和磺胺类等药物表现出较高的耐药率,对喹诺酮类药物的耐药率相对较低;各地有关奶牛子宫内膜炎病原谱和主要病原菌耐药特征的研究在流行病学设计、疾病诊断、病原菌分离培养和数据统计等层面存在一定的局限性。建议未来加强流行病学调查,并在全国范围内系统开展奶牛子宫内膜炎病原菌耐药性监测,为指导临床兽医科学用药和制定我国奶牛子宫内膜炎防控策略提供数据支持。; 曹玥宋世豪倪婉仪赵恪邓昭举汪洋吴聪明孙城涛; 关键词：奶牛子宫内膜炎病原谱

2020—2021年武汉市596例急性呼吸道感染患者病原谱研究被引量：1: 2024年; 目的在新冠感染疫情暴发一年后,明确非药物干预措施下武汉冬季呼吸道感染患者病原谱的构成,为呼吸道感染性疾病的防治提供病原学依据。方法收集2020年12月28日—2021年2月14日武汉8家大型医院发热门诊急性呼吸道感染(acute respiratory tract infection,ARTI)病例咽拭子样本,经全自动核酸提取仪提取核酸后,采用实时荧光定量PCR技术进行23种常见呼吸道病原体检测。采用Excel 2016软件对数据进行录入、整理,建立数据库,用SPSS 20.0软件进行统计学分析。结果共收集596例ARTI病例,其中男性335例,女性261例,男女比例1.28∶1。年龄最小患者为5月龄,最大为91岁。23种呼吸道病原体中共13种病原体检出阳性,总阳性率86.24%(514/596),排在前3位的病原体分别为肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,SPN)占比30.47%(323/1060)、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KPN)占比24.25%(257/1060)和流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae,HIN)占比19.43%(206/1060)。514例检测阳性的病例中混合感染共331例,占比64.40%(331/514),其中细菌之间的混合感染占比54.68%(181/331)高于细菌和病毒的混合感染45.01%(149/331)。331例混合感染病例中,仅检出1例病毒之间的混合感染,占比0.30%(1/331),为人偏肺病毒(human metapneumovirus,HMPV)和呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)共感染。HIN、KPN、SPN、HMPV、RSV、呼吸道腺病毒(respiratory adenovirus,RA)、人博卡病毒(human bocavirus,HBoV)和肠道病毒(human enterovirus,HEV)在不同年龄段的患者中检出率差异有统计学意义,HIN、KPN、SPN、HMPV和RSV在不同体温患者中的检出率差异有统计学意义,不同性别患者之间所有病原体的检出率差异无统计学意义。国家级和非国家级流感监测哨点医院之间A族链球菌(group A streptococcus,GAS)和RSV的检出率差异有统计学意义。结论非药物干预措施下武汉冬季呼吸道病原以SPN、KPN、HIN、HMPV和金黄色�; 吴奕璇李瑶孔雯骅张祎婕刘满清; 关键词：急性呼吸道感染呼吸道病原体病原谱

儿童社区获得性肺炎病原谱流行趋势研究进展: 2024年; 儿童社区获得性肺炎是全球最常见的呼吸系统疾病,也是儿童死亡的主要原因,占全世界5岁以下儿童死亡人数的五分之一。几十年来,发展中国家的肺炎病死率大于发达国家10倍以上。肺炎患儿中近75%的患儿年龄 Community-acquired pneumonia is the most prevalent respiratory illness among children globally and is the leading cause of mortality in this age group, responsible for one-fifth of all deaths in children under five. For many years, the mortality rate of pneumonia in developing nations has been over ten times higher than in developed countries. Approximately 75% of children with pneumonia are under five years old, with infants under one year making up about one-third of hospitalized cases, highlighting a concerning situation for pediatric healthcare in China. The increasing incidence of pneumonia in young children is attributed to its complex causes, a variety of pathogens, and changes in children’s living conditions, which can lead to chronic respiratory issues and allergic diseases. Recently, the COVID-19 pandemic has significantly altered the trends of respiratory pathogens, with Mycoplasma pneumoniae and various viral infections emerging as the primary causes of community-acquired pneumonia in children. This paper analyzes and summarizes the main pathogens, co-infections, and characteristics of pneumonia in children caused by community-acquired pneumonia in recent years, aiming to assess the epidemiological trends of pneumonia pathogens in children and provide a theoretical foundation for accurate clinical diagnosis, treatment, and early warning of pathogen epidemic trends.; 赵慧丹贾鲲鹏; 关键词：儿童社区获得性肺炎呼吸道感染病原体

2016—2022年银川市手足口病病原谱及基因特征分析: 2024年; 目的分析2016—2022年银川市手足口病(HFMD)肠道病毒的病原构成,了解主要流行株柯萨奇病毒(CV)A组4型(CV-A4)、6型(CV-A6)、10型(CV-A10)和16型(CV-A16)分子病原学进化特征。方法收集2016—2022年银川市HFMD监测病例标本,采用RT-qPCR鉴定肠道病毒型别,病毒分离获得的毒株采用RT-PCR扩增其VP1区,通过测序和比对进行序列分析,使用DNASTAR Lasergene软件进行序列拼接整理,用MEGA 7.0软件构建系统进化树。结果2016—2022年共检测手足口病例标本2492份,检出肠道病毒核酸阳性标本1923份,总阳性率为77.2%。共检出肠道病毒型别12种,不同年份病原分布差异有统计学意义(P<0.001)。银川市CV-A4、CV-A6、CV-A10和CV-A16分离株分别属于C2(ClusterⅢ分支)、D3a、C、B1a/B1b基因组。与原型株VP1区序列比较,分别出现了8、32、24和26个氨基酸位点的变异。结论2016—2022年银川市HFMD病原存在多种肠道病毒共流行的模式,以EV-A71、CV-A16和CV-A6为优势病原动态变化,交替流行。应使用更加全面的肠道病毒基因分型方法持续监测病原谱的改变。; 张伟宏李萍王彦海纳玮杜学婷樊瑞军; 关键词：手足口病病原学进化分析

蚌埠市6~15岁儿童急性呼吸道感染病原谱检测分析: 2024年; 目的:分析蚌埠市6~15岁儿童急性呼吸道感染病原谱特征,为制定有效防控措施提供依据。方法:2022年1—8月,采集蚌埠市流感监测哨点医院流感样病例咽拭子标本1 625份,其中6~15岁儿童标本233份,每月抽取10例左右6~15岁儿童病例标本,共抽取80例。使用荧光定量PCR法进行流感病毒和新冠病毒核酸检测,应用FilmArray多重巢式PCR检测技术检测22种病原体。分析流感、新冠病毒实时荧光定量PCR检测结果,以及蚌埠市6~15岁儿童急性呼吸道感染病原体种类、不同月份急性呼吸道感染病原体构成、不同年龄段及性别急性呼吸道感染病原体检出情况、病原体检出特征。结果:1 625份送检标本,新冠检测全部阴性;流感检出阳性242例(14.89%),其中甲型季节性H3亚型阳性133例(8.18%),B型Victoria系阳性109例(6.71%)。233份6~15岁儿童标本,流感检出阳性23例(9.87%),其中甲型季节性H3亚型阳性4例(1.72%),B型Victoria系阳性19例(8.15%)。6~15岁儿童与全部人群的流感及亚型检出率比较差异无统计学意义(P>0.05)。80份呼吸道咽拭子标本中检出病原体28份(35.00%);检出7种病原体共32株,其中人鼻病毒/肠道病毒(37.50%)、B型流感病毒(34.38%)占比较高。2022年1—2月是B型流感流行高峰,其他病原体检测阳性率不同月份间比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。不同年龄段、性别急性呼吸道感染病原体检出阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。28例检测阳性病例标本中,单一感染25例(89.29%),双重感染2例(7.14%),三重感染1例(3.57%),单一感染占比最高(P<0.001);检出病毒感染26例(92.86%),细菌2例(7.14%)。结论:人鼻病毒/肠道病毒和流感病毒是蚌埠市6~15岁儿童主要的急性呼吸道感染病原体,除流感病毒外,人鼻病毒等其他病原体不同时期检测阳性率比较,差异均无统计学意义。; 付广林许静茹董娟钱青文梁寅生吴珊珊; 关键词：呼吸道感染病原体流感病毒

某基层医院与三甲儿童医院儿童呼吸道感染病原谱比较: 2024年; 目的比较分级诊疗下某基层医院和三甲儿童医院的儿童急性呼吸道感染病原谱差异。方法收集2021年11月至2022年3月北京某基层医院及某三甲儿童医院临床诊断为急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本,采用多重逆转录-聚合酶联反应(RT-PCR)与毛细电泳联用技术检测13种呼吸道病原,统计学方法分析两家医院急性呼吸道感染儿童病原谱差异。结果基层医院纳入患儿112例,男女比例为1∶1,呼吸道病原总阳性检出率为71.43%(80/112),单种病原感染72例(64.29%,72/112),混合感染8例(7.14%,8/112,均为2种病原);三甲儿童医院纳入患儿115例,男女比例1.02∶1,呼吸道病原总阳性检出率为70.43%(81/115),单种病原感染66例(57.39%,66/115),混合感染15例(包括2种病原感染12例,10.43%,12/115;3种病原感染3例,2.61%,3/115)。0~3岁婴幼儿中,基层医院与三甲儿童医院HMPV阳性检出率(52.9%,9/17;5.3%,4/75)差异有统计学意义(χ^(2)=38.10,P<0.05);三甲儿童医院儿童RSV阳性检出率(44.0%,33/75)高于基层医院(23.5%,4/17),但差异无统计学意义(χ^(2)=2.415,P>0.05)。4~15岁儿童中,基层医院Flu B阳性检出率为31.58%(30/95),三甲儿童医院为20.0%(8/40),差异有统计学意义(χ^(2)=6.96,P<0.05);三甲儿童医院MP阳性检出率为37.5%(15/40),基层医院未检出,差异有统计学意义(χ^(2)=40.08,P<0.05)。结论 2021-2022年冬春季节北京某基层医院与三甲儿童医院的儿童呼吸道感染病原谱构成存在差异,各年龄段病原谱分布也不同,提示分级诊疗以及基层医院开展核酸检测的必要性。; 黄宇轩贾立平德日赵林清李晓惠; 关键词：儿童急性呼吸道感染病原谱

2017—2022年山东地区不同人群脓液标本病原谱及耐药性变迁分析: 2024年; 目的监测山东地区2017—2022年不同年龄段患者脓液标本病原谱的构成和耐药性及药物敏感性情况,为外科医生早期经验性抗微生物治疗提供参考依据。方法回顾分析山东地区2017—2022年间山东省儿童细菌耐药监测研究协作网(Shandong Province Pediatric Antimicrobial Resistance Surveillance System,SPARSS)成员单位上报的脓液标本分离菌株的临床信息及药物敏感性结果。结果共分离病原菌64302株,新生儿脓液分离的细菌以革兰阳性菌为主,儿童和成人脓液分离的细菌以革兰阴性菌为主。对年龄分层分布发现,新生儿组病原菌分离最多的是金黄色葡萄球菌,儿童组和成人组脓液病原菌分离最多的是大肠埃希菌,3组的菌种分布有较大差异(χ2=245.5,P<0.0001)。肠杆菌科中大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌耐药率较严重,产超广谱β-内酰胺酶(extended spectrumβ-lactamases,ESBLs)和对碳青霉烯类耐药的大肠埃希菌占比分别为41.8%和0.83%;肺炎克雷伯菌占比分别为14.1%和1.14%。铜绿假单胞菌对大多数抗生素成人组耐药率明显高于儿童组。葡萄球菌属中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)检出率为22.6%且在2017—2022年呈下降趋势,其中新生儿MRSA占比显著高于儿童和成人(χ2=12.32,P=0.0021)。结论脓液感染病原菌以大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌为主,不同年龄组的病原谱构成有较大差异,主要分离菌种对抗微生物药物的耐药率较高,故应定期监测脓液来源病原谱及耐药性变迁规律,以提高外科医生感染性疾病的精准诊治能力。; 孙彦蒙张春艳李政李政纪冰满思金纪冰满思金伊茂礼; 关键词：病原菌耐药率成人

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