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基于生信分析评价前列腺癌TP53表达和第10号染色体上缺失与张力蛋白同源的磷酸酯酶基因相关性
2024年
目的基于生信分析评价前列腺癌(PCa)中TP53及第10号染色体上缺失与张力蛋白同源的磷酸酯酶基因(PTEN)的表达水平及相关性。方法利用生物信息学方法, 挖掘公开数据库, 分析TP53基因在前列腺癌中的表达并分析其可能的调控机制。收集徐州医科大学附属医院泌尿科2022年3月至2022年8月间诊治的PCa 79例, 复阅病理切片并整理相关临床资料, 采用免疫组织化学SP染色法检测79例PCa中PTEN及TP53的蛋白表达水平。分类资料的组间比较采用卡方检验和Mann-WhitneyU检验, 应用Pearson相关分析前列腺癌患者中PTEN和TP53的相关性。结果通过TCGA数据库分析, TP53在前列腺癌组织中的表达水平明显高于正常组织(501个比52个, Z=8 874.5, P<0.05);TP53表达水平(低表达250例比高表达251例)与前列腺癌患者临床病理参数关系表明, TP53与患者年龄(χ^(2)=6.079, P>0.05)、T分期(χ^(2)=0.338, P>0.05)、N分期(χ^(2)=0.176, P>0.05)、PSA水平(χ^(2)=0.016, P>0.05)和Gleason评分(χ^(2)=3.999, P>0.05)在内的临床特征之间均无统计学意义;建立前列腺癌总体生存期(OS)预测列线图, 分析得出TP53不能作为OS的独立预后因素, PSA值与Gleason评分在前列腺有预后作用;免疫组织化学染色PTEN蛋白阳性(完整)者占73%, 阴性(缺失)者占27%;TP53蛋白染色呈野生型突变模式者占81%, 突变型表达模式者占19%。Pearson统计学分析, PTEN缺失与TP53突变型显著相关性(r=0.653, P<0.05)。结论 TP53联合PTEN对前列腺癌的进展有一定预测作用, 且为临床前列腺癌治疗提供参考。
刘参军彭阳张洁琳徐琪卿杨春华
关键词:前列腺癌TP53免疫组织化学
红景天苷对类风湿关节炎患者血清脯氨酸羟化2及蛋白磷酸酯酶2A和丝裂原活化蛋白激表达水平的影响
2024年
目的分析红景天苷对类风湿关节炎(RA)患者血清脯氨酸羟化2(PHD2)及蛋白磷酸酯酶2A(PP2A)和丝裂原活化蛋白激(MAPK)表达水平的影响。方法选取青海省中医院2022年12月至2023年7月收治的RA患者96例。采用随机数字表法分为对照组和观察组,各48例。对照组采用常规西医治疗,观察组在常规西医治疗的同时予以红景天苷治疗,2组均治疗3个月。比较治疗前后2组中医证候评分、临床症状与体征、实验室检查指标[包括红细胞沉降率(ESR)、C反应蛋白(CRP)、类风湿因子(RF)、抗环瓜氨酸肽抗体(anti-CCP)]、临床疗效,健康状况评定量表(HAQ)与28个关节疾病活动度评估(DAS28)评分,血清PHD2、PP2A、MAPK水平与基因表达,不良反应。结果治疗后2组主症、次症评分均低于治疗前且观察组均低于对照组(均P<0.05)。治疗后观察组临床症状与体征均轻于对照组,ESR、CRP、RF和anti-CCP水平均低于对照组(均P<0.05)。观察组总有效率高于对照组[95.8%(46/48)比80.4%(37/46)](P=0.020)。治疗后观察组HAQ与DAS28评分均低于对照组[(5.0±1.0)分比(7.2±1.2)分、(3.1±0.5)分比(4.1±0.7)分](t=9.528、7.444,均P<0.001)。治疗后观察组PHD2、MAPK水平及基因表达均低于对照组,PP2A水平及基因表达均高于对照组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。2组不良反应发生率差异无统计学意义(P=0.528)。结论红景天苷治疗RA可增强临床效果、减轻患者症状、改善实验室指标且安全。推测与降低PHD2和MAPK表达、增加PP2A表达有关。
李琴朱光昭庄志毅星媛严婕方璐
关键词:类风湿关节炎红景天苷丝裂原活化蛋白激酶
第10号染色体上缺失与张力蛋白同源的磷酸酯酶基因在前列腺癌组织中的表达及荷载该基因的溶瘤腺病毒的构建
2024年
目的构建荷载第10号染色体上缺失与张力蛋白同源的磷酸酯酶(PTEN)基因的溶瘤腺病毒验证其在前列腺癌中表达水平及靶向抗肿瘤效果。方法挖掘公开数据库和利用Galaxy在线工具处理本中心去势抵抗性前列腺癌(CRPC)标本基因测序数据, 分析PTEN基因在前列腺癌组织中的表达差异。收集2019年3月至2022年8月徐州医科大学附属医院79例前列腺癌患者的病理样本和临床信息, 免疫组织化学法检测前列腺癌组织及癌旁组织中PTEN蛋白的表达。同源重组法构建溶瘤腺病毒ZD55-PTEN, 细胞计数试剂盒(CCK-8)法、Hoechst-33258和划痕实验检测其靶向抗肿瘤效果。分别采用卡方检验和t检验对定性资料和定量资料进行统计分析, 不满足正态分布的数据采用Mann-WhitneyU检验;Spearman分析PTEN表达水平与临床病理特征的关系。结果前列腺癌组织中PTEN表达水平明显低于癌旁组织, 差异有统计学意义(501例比52例, Z=-19.25, P<0.05);PTEN的mRNA表达水平与淋巴结转移(n=425, r_(s)=-0.98, P<0.05)和Gleason评分(n=497, r_(s)=-1.25, P<0.05)呈负相关。CRPC阶段PTEN缺失明显高于激素敏感性前列腺癌(HSPC)阶段(79例比125例, Z=-0.89, P<0.05)。前列腺癌组织的PTEN蛋白缺失率高于癌旁组织(45.6%比16.5%, t=10.98, P<0.01), 术前血清PSA水平(n=79, r_(s)=-0.47, P<0.01)和术后Gleason评分(n=79, r_(s)=-0.31, P<0.05)与PTEN的表达呈负相关。PTEN缺失的前列腺癌患者, 确诊时PSA水平(36例比43例, χ^(2)=12.22, P<0.05)和根治术后Gleason评分(36例比43例, χ^(2)=6.92, P<0.05)显著高于PTEN蛋白完整患者。成功构建溶瘤腺病毒ZD55-PTEN, ZD55-PTEN组细胞存活率低于对照组[ZD55-EGFP组(49.67±4.19)%、ZD55-PTEN组(29.33±3.84)%, t=8.68, P<0.05];细胞凋亡率高于对照组[PBS组(12.86±5.23)%、ZD55-EGFP组(48.18±4.22)%、ZD55-PTEN组(68.93±5.88)%, t=5.90, P<0.05];划痕愈合率低于对照组[PBS组(79.13±3.98)%、ZD55-EGFP组(61.02±4.73)%、ZD55
万子衿刘刚黄金叶张洁琳徐琪卿杨春华
关键词:溶瘤腺病毒前列腺癌生物信息学
微小RNA-29a通过第10号染色体上缺失与张力蛋白同源的磷酸酯酶基因-磷脂酰肌醇3激/蛋白激B/雷帕霉素靶蛋白信号通路调节人神经母细胞瘤细胞的增殖和轴突生长被引量:1
2024年
目的通过体外培养人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)观察微小RNA(miRNA)-29a与第10号染色体上缺失与张力蛋白同源的磷酸酯酶基因(PTEN)的调节对神经细胞增殖和轴突生长的作用。方法通过上海中科院细胞库购买的SH-SY5Y细胞经过体外培养(4×10^(4)/ml)分别转染miRNA-29a的激动剂和抑制剂(40 nmol/L),构建miRNA-29a不同表达水平的细胞。通过实时荧光定量聚合链反应(qPCR)检测细胞转染效果(转染24 h)和人第10号染色体缺失的磷酸及张力蛋白同源基因(PTEN)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激(Akt)和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)基因表达水平(转染48 h)。转染72 h后通过蛋白免疫印迹(Western blot)检测不同细胞中PTEN、Akt和mTOR蛋白的表达和磷酸化水平,通过神经形态学和二苯基四氮唑溴盐比色法(MTT)检测细胞的增殖和轴突长度。通过单因素方差分析及LSD-t法检验比较各组数据。结果转染miRNA-29a激动剂组的miRNA-29a表达水平明显高于miRNA-29a抑制组(9.03±0.12比0.31±0.03,t=241.70,P<0.05),而激动组PTEN基因和蛋白的表达水平明显低于抑制组(0.31±0.02比3.26±0.23、0.30±0.06比3.36±0.15,t=45.09、58.79,P<0.05)。miRNA-29a激动组中Akt、mTOR蛋白的磷酸化水平明显高于抑制组(3.26±0.13比0.42±0.03、2.57±0.13比0.31±0.04,t=71.45、51.55,P<0.05)。在miRNA-29a激动组中,SH-SY5Y细胞增殖活性和轴突长度明显高于miRNA-29a抑制组[0.86±0.07比0.44±0.03、(157.56±11.13)μm比(43.48±4.92)μm,t=13.89、31.11,P<0.05]。结论miRNA-29a可以通过干预PTEN表达,调节磷脂酰肌醇3激(PI3K)/Akt/mTOR信号通路中Akt和mTOR蛋白的磷酸化水平,促进SH-SY5Y细胞增殖和轴突生长。
高宛生杨晗兰昌达谢宗蕃李东升杨彦峰
关键词:微小RNA细胞增殖轴突生长
基于酸性磷酸酯酶的生物化学综合性实验设计被引量:2
2023年
本实验以酸性磷酸酯酶为研究对象,分为的提取、活检测、促动力学曲线测定、双倒数作图法测定Vmax和Km值和SDS-PAGE测定蛋白分子量五个部分。学生通过准备实验材料、使用仪器设备和处理化学污染物等过程,培养了职业规范、工程意识和环保意识;通过分析实验数据和优化实验过程,培养了发现和分析问题的能力;通过课堂教师思政引领、案例分析和改进实验方案,加深了对化学知识的理解,提高了运用科学思维和生化知识解决问题的能力。
成骋贾红华陈可泉何冰芳宫长斌
关键词:实验教学酸性磷酸酯酶生物化学实验教学改革
低碱性磷酸酯酶症患者临床表现及基因检测
2023年
目的:探讨低碱性磷酸酯酶症(HPP)患者家系的临床表现和实质病因。方法:采用临床检查和遗传学方法检测1个低碱性磷酸酯酶症家系临床表现,并提取家系成员的基因组DNA行全外显子组测序和分析,筛选基因突变位点。结果:先证者身材矮小,多数乳牙早失伴下颌第二乳磨牙萌出不足,其父母患有轻度慢性牙周炎。家系成员血清碱性磷酸含量均下降。先证者肝/骨/肾型碱性磷酸基因(ALPL)检测出两个错义突变,其他成员各检测出一个错义突变,其中,先证者ALPL基因c.542C>T与其父的ALPL基因错义突变一致,先证者ALPL基因c.644T>C与其母的ALPL基因错义突变一致。结论:经数据库及文献检索c.644T>C为一种新的基因突变型,两个轻型ALPL基因突变c.542C>T和c.644T>C同时存在时,可能是出现多数乳牙早失和个别牙萌出不足等临床表现的影响。
杨晓雪郭晓贺刘安琪李诗洁谷阳轩昆
关键词:乳牙早失
牙型低磷酸酯酶症一例
2023年
磷酸酯酶症(hypophosphatasia,HPP)是一种罕见遗传代谢疾病,以骨骼异常和/或牙齿矿化障碍、血清中组织非特异性碱性磷酸(tissue non-specific alkaline phosphatase,TNSALP)活性降低为主要特征[1],轻度患者可仅有血清碱性磷酸降低和口腔病变,表现为牙齿早失、牙髓腔变大[2],重度患者可出现严重骨骼病变、癫痫等。HPP患者常以乳牙过早脱落或骨骼疼痛为主诉就诊,及时完善检查、确诊HPP可为患者提供有效的治疗。
郭晶段北北孙培音冯春陈玉涵陈仁吉
关键词:骨骼病变牙髓腔血清碱性磷酸酶遗传代谢疾病口腔病变
磷酸酯酶D在肿瘤发生发展中的作用研究进展
2023年
磷酸酯酶D(PLD)作为一种调控机体磷脂代谢的水解,其水解产物磷脂酸和二酰基甘油均为细胞内重要的第二信使,参与多种细胞生理功能。PLD在胃癌、结直肠癌、食管癌、肺癌、甲状腺癌和乳腺癌等多种恶性肿瘤中均高表达,通过肿瘤相关信号通路促进细胞癌变和增殖、促进肿瘤细胞浸润和迁移、加速上皮间充质转化和微血管生成及增强免疫逃逸等进程,而靶向诱导PLD蛋白功能缺失可逆转上述进程。PLD在肿瘤发生发展中的作用机制以及PLD抑制剂的研究目前已成为国内外的研究热点。本文从原位肿瘤发生发展、肿瘤侵袭过程、血管生成和肿瘤细胞微环境等方面综述PLD对肿瘤进展的作用,为靶向PLD治疗肿瘤提供临床依据。
洪星辉黄金玲
关键词:肿瘤增殖信号通路
磷酸酯酶症的口腔表现及基因分析
2023年
目的分析低磷酸酯酶症(HPP)患儿口腔临床表型、基因变异类型,并探讨其口腔表现与基因变异类型的关系,为口腔临床提供参考。方法收集2008年1月至2023年1月就诊于浙江大学医学院附属儿童医院口腔科的8例HPP患儿,其中5例进行致病基因测序,对8例患儿的口腔表现、实验室检查及基因变异类型特点进行回顾性分析。结果8例HPP患儿中男性3例、女性5例,主诉均为乳牙过早脱落。3例为牙型,5例为儿童型(2例同胞姐弟初诊时为牙型,5岁时修改诊断为儿童型)。第一颗乳牙脱落的年龄为9~18个月,诊断年龄为20~104个月。牙型仅表现为乳前牙过早脱落,儿童型波及多颗乳磨牙并伴随不同程度的全身症状。全口曲面体层X线片显示乳恒牙牙髓腔宽大、髓角高耸,根管壁较薄,部分病例伴牙釉质发育不良、牙根短小,乳磨牙牙根吸收,牙槽骨吸收。所有患儿血清碱性磷酸(ALP)值(30~107 U/L)均低于健康同龄人,1~3岁女童ALP值儿童型(30~33 U/L)与牙型(61~107 U/L)差异无统计学意义(P>0.05)。5例患儿及家系检测到8个肝-骨-肾-ALP基因(ALPL)变异位点,均为错义变异,其中c.1334C>G(p.Ser445Cys)和c.1259G>T(p.Gly420Val),为新的变异型;1例杂合变异,符合常染色体显性遗传,其余4例为复合杂合变异,符合常染色体隐性遗传。结论儿童型和牙型HPP常于儿童口腔科最先发现,轻型HPP常被延迟诊断,HPP病情严重程度与血清ALP值和ALPL基因变异位点有关。
李晓静苏吉梅郑琛叶笑味吴志芳吴鼎文
关键词:碱性磷酸酶遗传性疾病先天性基因分析
一种用于检测焦磷酸根和碱性磷酸酯酶的荧光分子探针及其应用
本发明公开了一种用于检测焦磷酸根和碱性磷酸酯酶的荧光分子探针及其应用,所述荧光分子探针的结构式如下式(Ⅰ)所示。将所述荧光分子探针配置成浓度为5mmol/L的分子探针储备液后,可用于定性或定量检测焦磷酸根和碱性磷酸酯酶的...
于丽佳赵树华

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