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贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析: 2024年; 【目的】克隆贵州白山羊肌细胞生成素(myogenin)基因并对其结构特性进行生物信息学分析,为进一步探索该基因调控山羊肌肉发育的分子机制提供重要参考依据。【方法】以贵州白山羊血液基因组DNA为模板,设计4对特异性引物,运用PCR扩增、Sanger直接测序及序列拼接方法获得贵州白山羊myogenin基因完整编码区核苷酸序列,应用BioEdit 7.0、NetPhos 3.1、Conserved Domains Search、SMART、Motif Scan等生物信息学软件分别分析该基因核苷酸与氨基酸序列的组成、编码蛋白磷酸化位点、关键结构域和功能模体等结构特性,通过DNAStar Lasergene、DNAMAN 8.0和Mega 5.0软件分别进行15个偶蹄目物种myogenin基因编码氨基酸序列相似性比对及系统进化树构建。【结果】贵州白山羊myogenin基因序列全长2424 bp(获得GenBank登录号:HZ53289),由3个外显子、2个内含子、部分5′-UTR和3′-UTR构成,长度分别为471、82、122、765、589、135和260 bp,编码区长度为675 bp,共编码224个氨基酸。贵州白山羊myogenin蛋白第1—86位氨基酸为生肌决定因子(myogenic determining factors,MyoD)家族特有碱性结构域(Basic domain),第81—139位氨基酸为螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix,H-L-H)结构域,第160—170位氨基酸为低复杂度结构域,存在21个磷酸化位点和核定位信号蛋白等功能模体结构。氨基酸序列比对表明,6个半胱氨酸残基、1个核定位信号和1个低复杂度结构域在15个偶蹄目物种完全保守。myogenin基因编码氨基酸序列相似性与系统进化分析均显示,贵州白山羊与波尔山羊、湖羊和马可波罗盘羊的亲缘关系最近。【结论】本研究成功克隆得到贵州白山羊myogenin基因全长序列,大小为2424 bp,编码224个氨基酸,myogenin蛋白包含Basic domain和H-L-H结构域。该结果可为myogenin基因调控山羊肌肉发育的分子机制研究提供理论参考。; 宋兴超孟金柱赵园园吴震洋安清明; 关键词：贵州白山羊克隆分子系统进化生物信息学

黄颡鱼肌细胞生成素基因cDNA克隆及其在雌雄个体中的差异表达: 2016年; 为了探究黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)肌细胞生成素(Myogenin,MyoG)基因的组成结构、功能特性以及在雌雄个体组织中的表达差异,本研究利用RT-PCR和RACE技术克隆获得黄颡鱼MyoG基因1346 bp全长cDNA序列,其中序列包括63 bp的5′非翻译区、521 bp的3′非翻译区和762 bp的开放阅读框(ORF),ORF编码253个氨基酸。氨基酸序列包含MRFs基因家族的Basic结构域和螺旋–环–螺旋(HLH)结构域,不含信号肽,没有跨膜结构,定位于细胞核内。氨基酸序列与蓝鲇(Ictalurus furcatus)同源性高达94.1%,基于氨基酸序列构建的NJ进化树显示黄颡鱼MyoG基因与同属鲇科鱼类关系最近,表明MyoG基因在物种间比较保守。实时荧光定量PCR检测显示,MyoG基因在雌雄个体心脏、肌肉等8种组织中均有表达,但在肌肉中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),且在雄性中的表达量显著高于雌性(P<0.05);Western blot检测MyoG蛋白在雄性肌肉中的表达量高于雌性,推测其可能是造成黄颡鱼雌雄生长差异的因素之一。本研究不仅为黄颡鱼雌雄生长差异和肌肉发育调控提供了研究基础,也为黄颡鱼快速生长新品种(系)选育提供理论参考。; 梁宏伟李忠邹桂伟; 关键词：黄颡鱼肌细胞生成素基因克隆雌雄差异

陆川猪肌细胞生成素基因的克隆及序列分析: 2016年; 为了获得广西陆川猪肌细胞生成素(MyoG)基因编码区序列(CDS),试验采集11月龄陆川猪背最长肌,提取其总RNA并反转录c DNA,通过RT-PCR方法扩增出MyoG基因CDS,纯化、回收扩增产物,与p MD18-T载体进行连接,并与大肠杆菌DH5α感受态细胞进行转化,将含有重组质粒的菌液送到生物公司测定序列,最后用生物软件进行序列分析。结果表明:成功扩增获得了广西陆川猪MyoG基因CDS长度675 bp,与Gen Bank报道的野猪同源性达到99.9%,与藏猪同源性为99.6%,与五指山猪、延安猪、荣昌猪、梅山猪的同源性为99.6%以上。与其他猪CDS相比较发现,陆川猪MyoG基因CDS第642位点存在T→C,并发现碱基C是其特有的,但是没有导致氨基酸突变。构建MyoG基因系统进化树,与陆川猪遗传距离最近的是藏猪,最远是褐家鼠。陆川猪MyoG蛋白质二级结构包含1个环、2个螺旋。说明猪MyoG基因高度保守,今后在进行陆川猪肌肉生长发育的研究中,可将MyoG基因作为主要候选基因之一。; 黄艳娜蔡卓权蒋钦杨; 关键词：陆川猪克隆蛋白质二级结构

肌细胞生成素基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联研究被引量：3: 2015年; 本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与泸宁鸡生长性状的关联性。采用PCRSSCP和DNA测序技术,对泸宁鸡MyoG基因5′调控区的多态性进行检测。结果表明,泸宁鸡MyoG基因5′调控区存在4个多态位点(A153G、A267G、A446G和C612T)。在153bp处存在A/G突变,形成3种基因型(AA、AG和GG),其中AA基因型肝脏重显著高于AG、GG基因型(P<0.05)。在446bp处存在的A/G突变,形成3种基因型(AA、AG和GG),该位点GG基因型屠宰率显著高于AA、AG基因型(P<0.05),AG、GG基因型胸肌率显著高于AA基因型(P<0.05)。以上结果显示,MyoG基因5′调控区的多态性与泸宁鸡肝脏重、屠宰率、胸肌率有一定的关联性,可作为泸宁鸡相应生长性状的候选基因。; 刘红丽徐亚欧熊斌胡卫民梅寒石浩左斌聂晓庆王海; 关键词：MYOG基因 PCR-SSCP 生长性状

肌细胞生成素基因多态性对京海黄鸡繁殖性状的遗传效应研究被引量：1: 2014年; 本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与鸡繁殖性状间的相关性。以378只京海黄鸡为研究对象,采用PCR-SSCP技术研究MyoG基因外显子的多态性。运用最小二乘法分析这些突变位点形成的基因型与京海黄鸡繁殖性状间的相关性。结果表明,MyoG基因外显子1上存在1个G102A突变,外显子3上存在1个T36C突变,分别形成基因型AA、AB、BB和CC、CD、DD。关联分析结果显示,基因型AA、AB和BB在京海黄鸡繁殖性状上无显著差异(P>0.05);基因型CC和DD在京海黄鸡开产体重上存在显著差异(P<0.05),在其余性状上各基因型差异均不显著(P>0.05)。因此,推测MyoG基因对京海黄鸡的繁殖性状无显著影响,为探索鸡育种过程中的标记辅助选择提供参考资料。; 唐莹王金玉张跟喜葛莹薛倩王亚男王永娟; 关键词：肌细胞生成素基因多态性京海黄鸡繁殖性状

猪肌肉生长抑制素基因和肌细胞生成素基因多态性对早期生长性状的影响被引量：6: 2014年; 为了分析肌肉生长抑制素(MSTN)和肌细胞生成素(MyoG)2个基因对猪生长性状的影响,采用PCR-RFLP方法检测沈阳地区3个引进猪种(长白、大白和杜洛克)MSTN和MyoG基因的多态性。结果显示:在3个种群内MSTN和MyoG基因都存在AA、AB和BB 3种基因型,各基因均处于遗传平衡状态,3个种群处于中度多态,具有较丰富的遗传多态性;单基因分析表明:MSTN基因长白猪、大白猪BB基因型的初生重显著高于AB型(P<0.05);而对杜洛克猪初生重无显著影响(P>0.05);MyoG基因大白猪BB基因型的初生重显著高于AA型(P<0.05);而对长白猪、杜洛克猪初生重无显著影响(P>0.05),2个基因初生重的优良基因型是BB型。2个基因合并分析表明:合并基因型对长白猪、杜洛克猪的初生重有显著影响(P<0.05),对大白猪的初生重有极显著影响(P<0.01),合并后BBBB为猪初生重的有利基因型,合并基因型的遗传效应显著高于单基因型效应。单基因及合并基因分析均表明2个基因对3个种群的断奶重无显著影响(P>0.05)。综上所述,2个基因的多态性对猪的初生重有着显著的影响,合并效应高于单基因效应之和。; 王立辛苏玉虹刘海东范正征王雷; 关键词：肌肉生长抑制素基因肌细胞生成素基因合并基因型早期生长性状

猪肌肉生长抑制素基因和肌细胞生成素基因多态性对早期生长性状的影响: 究采用PCR-RFLP方法检测沈阳地区长白、大白和杜洛克3个品种肌肉生长抑制素(MSTN)基因和肌细胞生成素(MyoG)基因的多态性,分析2个基因对各品种生长性状的影响.单基因分析表明:MSTN不同基因型对长白猪、大白猪...; 王立辛苏玉虹; 关键词：肌肉生长抑制素基因肌细胞生成素基因基因多态性生长性状

山西黑猪肌细胞生成素基因部分序列的扩增被引量：1: 2014年; 肌细胞生成素在肌细胞的分化过程中起着关键的正向调节作用。根据猪的肌细胞生成素的基因序列设计特异性的扩增引物,以山西黑猪为研究对象,通过PCR扩增,获得长度为1 493 bp的序列,经测序和基因的同源性比对得出山西黑猪的基因序列与家猪等动物有较高的同源性。结果表明:肌细胞生成素基因可能在山西黑猪肌肉组织发育过程中发挥重要的调控作用。为今后改良黑猪的肌肉品质奠定理论基础。; 刘勇; 关键词：肌细胞生成素扩增

母体日粮蛋白水平对仔猪肌细胞生成素基因表达量及初生质量的影响被引量：1: 2014年; 试验选择30头长白后备母猪,采用实时荧光定量PCR技术,研究妊娠期母体不同蛋白水平日粮对仔猪肌细胞生成素(MyoG)基因表达量及初生质量的影响。结果表明:母体日粮蛋白水平的调控对仔猪的初生质量具有显著的影响(P<0.01),母体日粮蛋白水平缺乏时会降低仔猪初生质量,提高母体日粮的蛋白水平,仔猪的初生质量随之增加,但蛋白水平过高,反而会降低仔猪的初生质量;母体日粮蛋白水平对仔猪MyoG基因的表达量影响显著(P<0.05),高蛋白水平有促进仔猪MyoG基因表达的趋势;MyoG基因表达量与初生质量呈显著正相关(P<0.05)。综上所述,母体日粮蛋白水平对MyoG基因表达量及仔猪初生质量有显著的影响(P<0.05)。; 王立辛李立山刘海东范正征王雷; 关键词：肌细胞生成素基因表达量

京海黄鸡肌细胞生成素基因的克隆和生物信息学分析: 2014年; 本试验根据GenBank中公布的原鸡肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因序列设计1对引物,采用RT-PCR方法,从京海黄鸡肌肉组织中克隆MyoG基因的编码区序列,并使用多种生物软件和在线工具对目的序列进行生物信息学分析,分析MyoG基因与其他物种的同源性、蛋白质的理化性质、蛋白质序列的跨膜区、亚细胞定位、亲水性、潜在的磷酸化位点、保守结构域及该基因编码蛋白的二级结构和三级结构。最终获得了包括编码区在内的长754bp的MyoG基因序列,生物信息学分析显示,京海黄鸡MyoG基因的保守性较低,与GenBank中原鸡、火鸡、鹌鹑、马、人、野猪、牛、山羊、大鼠、绵羊的同源性分别为99.7%、94.4%、92.0%、70.0%、70.0%、73.3%、69.0%、67.9%、67.8%、73.5%;氨基酸分析发现,MyoG蛋白为水溶性蛋白,分子质量为25854u,理论等电点为5.46,不属于跨膜蛋白;亚细胞定位显示,大部分蛋白位于细胞质内,不属于分泌蛋白;预测含有6个潜在的磷酸化位点,1段碱性序列,1段HLH序列,1段低复杂度序列;二级结构以无规则卷曲为主,三级结构显示MyoG蛋白的结构域呈螺旋状。; 张涛张跟喜王金玉樊庆灿王文浩魏岳陈学森唐莹王永娟; 关键词：京海黄鸡肌细胞生成素克隆生物信息学分析

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