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基于基质辅助激光解析/电离-飞行时间质质量指纹图微生物分类鉴定算法研究与应用
微生物分类鉴定技术在临床、CDC、食品、药品、出入境检验检疫等领域广泛应用。其中,临床微生物鉴定检验在感染性疾病诊断、用药指导、医院感染控制、抗菌药物管理等多方面均扮演着重要角色;肉类、蔬菜等食品中的大肠杆菌O157:H...
冯彬
关键词:肽质量指纹图谱
液相色-串联质法分析新红细胞生成刺激蛋白的质量指纹图和糖结构被引量:2
2018年
新红细胞生成刺激蛋白(NESP)是一种复杂的糖蛋白类药物,主要用于治疗慢性肾衰引起的贫血,含有5个N-连接和1个O-连接的糖基化位点。本研究建立了液相色-串联质法分析NESP的质量指纹图和糖结构。采用胰蛋白酶将所有糖基化位点酶解成段,分别采用高效液相色(HPLC)及两性离子亲水相互作用色(ZIC-HILIC)分析。与HPLC相比,ZIC-HILIC对O-糖的分离效果较理想,质信号响应也更强。在此基础上,尝试采用ZIC-HILIC对非特异性蛋白酶链霉蛋白酶E(Pronase E)酶解段进行分析。根据MS/MS碎片信息,一共鉴定了3种类型的O-糖,其糖链组成为GalNAcGal(Neu Ac)_2、GalNAcGal(NeuAc)_1和GalNAcGal。
李凤张艳梅何金娇霍燕燕
关键词:糖基化质谱
基于飞行时间质原理的微生物质量指纹图库的构建方法
本发明公开了一种基于飞行时间质原理的微生物质量指纹图库的构建方法:将获得的菌株依据其生理习性进行纯培养,依次获得对数期的菌株;并通过形态学、分类学、方法学对其进行鉴定;然后对确认的菌株进行预处理,干燥后采用乙醇/甲...
温庆仕蔡克亚曹洁茹崔爽爽封松利刘美丽赵高岭王则宇付光宇吴学炜
文献传递
王浆高产蜜蜂工蜂幼虫发育期质量指纹图的建立
2013年
【目的】研究王浆高产蜜蜂(Apis mellifera L.)工蜂幼虫发育期蛋白质的组成及功能,以探明其发育机理,为阐明该蜂种王浆高产机理提供理论依据。【方法】采用双向电泳法对王浆高产蜜蜂2,4,6日龄的工蜂幼虫进行蛋白质组分析,获得中蛋白质的种类、表达量、等电点和分子质量等信息,并通过质分析、数据库检索,鉴定部分蛋白。【结果】在2,4和6日龄的浆蜂工蜂幼虫中分别检测到262,418,194个蛋白,利用质技术鉴定的48个浆蜂工蜂幼虫发育期高丰度蛋白中有22个蛋白被鉴定出来,它们均属于蜜蜂数据库。与营养相关的蛋白有5个MRJP2、3个MRJP3和1个LSP2,与物质能量代谢相关的蛋白包括Arginine kinase、Aldehyde dehydrogenase、Eno-lase、Phosphoglycerate mutase、ATP synthase alpha subunit和ATP synthase,3个热激蛋白分别是HSP 60、HSC 70-3和HSP 8,4个与氨基酸、脂肪酸、幼虫生长和细胞周期相关的蛋白分别是Fatty acid binding protein、imaginal discgrowth factor、lethal Band-7-prohibitin和Ornithine aminotransferase。【结论】王浆高产蜜蜂幼虫的发育过程有大量基因参与表达和调控,是一个复杂而动态有序的过程;在王浆高产蜜蜂幼虫发育期,与物质能量代谢及脂肪酸、氨基酸代谢相关的蛋白表达上调,说明幼虫在整个发育过程中需要大量能量,新陈代谢逐渐旺盛;持续表达的热激蛋白对减轻逆境胁迫引起的伤害起到一定作用,保证了王浆高产蜜蜂幼虫发育的正常进行。
李华玮何金环郑鸣
关键词:王浆高产蜜蜂蛋白质组工蜂幼虫
南方水牛奶酪蛋白分离纯化及与非乳源蛋白质量指纹图差异性研究
本研究以南方水牛奶为原料,钙尿素沉淀法和离子交换法对南方水牛奶酪蛋白的主要组分进行分离,聚丙烯酰胺凝胶电泳法(SDS-PAGE),反相高效液相色法(RP-HPLC)和LTQ Orbitrap质法对其组分进行分析。这些...
向明霞
关键词:酪蛋白离子交换色谱反相高效液相色谱
文献传递
质量指纹图鉴别诊断IgA肾病和非IgA肾病的可行性分析被引量:2
2011年
目的探索质量指纹图(PMF)在IgA肾病和非IgA肾病的分类中是否可行。方法采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质技术(MALDI-TOF MS)分析IgA肾病和非IgA肾病患者的血清质量指纹图。结果 IgA肾病和非IgA肾病的血清质量指纹图具有9个差异多;其中,最显著的两个多峰是4476.46和1968.10,ROC曲线下面积分别为86.18%和79.77%;主因素分析(PCA)表明前8个因素(差异峰)的累积解释变异量超过95%,说明该模型的鉴别诊断能力较MA好L。DI比-T对OF蛋质白质技数术据在库Ig,A多肾病53和3非8.0I8gA为肾粘病蛋的白分4类同中工,型具的有片可段行;性而,此多技术20在82系.7统7为疾α病1-的Ⅱ亚型类胶分原类同中工具型有的广片阔段的。前景结。
高静王涌温新宇鲁鸿昊董振南田亚平
关键词:IGA肾病肽质量指纹图谱基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
质量指纹图中实验因素引起的氨基酸修饰以及相应段的质量变化被引量:2
2006年
目的:质量指纹图是蛋白质组研究中最重要的蛋白鉴定手段之一,而氨基酸残基的化学修饰会导致质量的改变。本文对实验性因素可能引起的这种质量改变进行了较为系统的观察和小结。方法:本文分析了多个标准蛋白基于SDS-PAGE分离的质量指纹图的实验结果,综合报道由各种实验因素引起的氨基酸残基体外化学修饰以及相应的质量变化。结果:这些化学修饰至少包括:①半胱氨酸残基丙烯酰胺加合物生成或乙酰基烷基化修饰,相应的质量数分别增加71.04和57.02;②甲硫氨酸残基的氧化修饰,相应质量数增加15.99(单甲硫氨酸氧化)或其倍数(多甲硫氨酸氧化);③酸性氨基酸残基的成盐反应,相应质量数增加21.98(加钠盐)或37.95(加钾盐);④酸性氨基酸残基的酯化反应,相应质量数增加14.03(甲醇固定)或28.03(乙醇固定);⑤碱性氨基酸(赖氨酸)残基与甲醛发生西佛碱反应,相应质量数增加27.99。以上各种氨基酸的体外修饰,以甲硫氨酸的氧化修饰最为常见;酸性氨基酸的酯化反应通常发生在蛋白固定步骤;碱性氨基酸(赖氨酸)的西佛碱反应是由于蛋白质银染时增色剂甲醛的引入。特别注意的是,某些段可以同时发生多种化学修饰,使得质量指纹图的解析复杂化。结论:以上实验因素引起的氨基酸修饰以及相应的质量变化在蛋白质数据库检索和蛋白质鉴定时必须加以考虑。
丁勤学熊少祥刘进赵馨阙海萍刘少君
关键词:肽质量指纹图谱化学修饰体外
皮肤细胞蛋白质组质分析方法的建立及质量指纹图的构建被引量:2
2006年
目的建立人皮肤细胞蛋白质组学研究所需的质分析方法,并获得皮肤细胞蛋白质质量指纹图。方法体外培养人皮肤成纤维细胞与角质形成细胞,采用固相pH梯度双向凝胶电泳分离其总蛋白质,凝胶经染色后,在上选取2个角质形成细胞蛋白点与1个成纤维细胞蛋白点,进行胶内酶切、基质辅助激光解吸电离飞行时间(MALDI-TOF)质分析鉴定。结果获得3个点的质量指纹图,经Mascot软件搜索人非冗余蛋白质数据库后,鉴定为细胞骨架Actingamma1、tubulinα2及热休克蛋白HSP70。结论皮肤细胞基质辅助激光解吸电离飞行时间(MALDI-TOF)质分析技术的建立为皮肤蛋白质组学的进一步研究提供手段。
陈斌毕志刚
关键词:蛋白质组双向凝胶电泳角质形成细胞基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
致病性弧菌检测新技术研究进展被引量:1
2024年
随着人们对水产品需求的增加及致病性弧菌引发的食源性疾病的流行,致病性弧菌对水产养殖业及人类健康造成了巨大威胁,基于此,致病性弧菌检测新技术的开发变得尤为迫切。本文介绍了包括免疫学方法、核酸检测方法、基于生物芯片的检测方法、基于核酸适配体的检测方法、基于质量指纹图技术的检测方法、基于生物传感器技术的检测方法在内的6项检测技术,分析了其优缺点及其在致病性弧菌中的应用。最后,总结了致病性弧菌检测新技术的研究现状,结合新兴技术指出未来研究方向,为致病性弧菌的快速检测提供参考。
王殿夫丁宁刘洪伟徐文英刘俊李扬麻丽丹田卓
关键词:致病性弧菌免疫学生物芯片核酸适配体肽质量指纹图谱生物传感器
皱纹盘鲍副肌球蛋白的分离纯化及初步性质研究被引量:1
2017年
为了研究鲍鱼肌原纤维中副肌球蛋白(PM)的性质,以皱纹盘鲍为原料,采用硫酸铵盐析和羟基磷灰石柱层析相结合的方法,从肌肉中纯化得到PM。利用质量指纹图测定其内部片段氨基酸序列;采用双向电泳测定其等电点;用圆二色研究其二级结构特征,进一步利用红外光对其官能团进行表征。SDS-PAGE结果显示,PM分子量约为97.0 ku。质量指纹图分析获得36条段共403个氨基酸残基,与盘鲍和太平洋牡蛎PM的一致性分别为99.7%和72.0%,表明纯化蛋白确为PM。双向电泳测得PM等电点约为5.4,证明其为一种酸性蛋白。圆二色结果显示,PM溶液在192 nm处有一正吸收峰,在208和223 nm处各有一负吸收峰,具有典型α-螺旋结构的特征峰型;其热变性温度为58.1°C。红外光分析结果进一步证实,PM具有完整的α螺旋结构。对鲍鱼PM理化特性进行研究,可为鲍鱼质构相关研究及鲍鱼制品深加工提供一定的理论基础。
游银川张凌晶颜龙杰翁凌刘光明曹敏杰
关键词:皱纹盘鲍副肌球蛋白肽质量指纹图谱双向电泳圆二色谱

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蒋文晖
作品数:39被引量:74H指数:5
供职机构:南京市口腔医院
研究主题:双向凝胶电泳 白斑 口腔白斑 蛋白质组 鳞癌
熊建平
作品数:8被引量:5H指数:1
供职机构:广东石油化工学院
研究主题:水稻种子 高压静电场 强电场 常压 生理指标
夏庆友
作品数:555被引量:1,231H指数:19
供职机构:西南大学
研究主题:家蚕 丝胶 基因 转基因家蚕 蚕丝
胡勤刚
作品数:241被引量:576H指数:10
供职机构:南京市口腔医院
研究主题:口腔鳞癌 口腔鳞状细胞癌 口腔肿瘤 平阳霉素 股前外侧皮瓣
刘炳玉
作品数:73被引量:210H指数:9
供职机构:军事医学科学院国家生物医学分析中心
研究主题:蛋白质组学 ESI 二硫键 多肽 红外光谱