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利用RNA-seq技术筛选药用野生稻抗白叶枯病相关基因: 2024年; 【目的】药用野生稻(Oryza officinalis)属于稻属CC染色体组,在长期的自然生存过程中,积累了大量适应恶劣环境的抗性基因。利用转录组测序(RNA-seq)挖掘植物抗病相关基因,为开展基因功能与调控机制研究等奠定基础。【方法】对云南省6个居群(Ⅰ~Ⅵ)的38份药用野生稻进行白叶枯病菌CX28-3和PXO99的抗性评价,以PXO99人工接种处理筛选到的药用野生稻36号(抗病)与37号(感病)植株为对象,于0、24、48 h取其叶片进行转录组测序分析,并预测药用野生稻抗白叶枯病相关基因。【结果】6个居群38份云南药用野生稻材料对2个菌株(CX28-3和PXO99)表现为不同的抗病性,总体为中抗至抗以上,其中抗病率最高的是Ⅴ居群、为93.50%,最低的是Ⅲ居群、为62.50%。38份药用野生稻对CX28-3菌株感病的植株有5份,感病率为13.15%;对PXO99菌株的感病率为42.10%,表明PXO99的致病力强。此外,抗2个菌株的药用野生稻材料有20份,占全部材料的66.67%,37号材料对2个菌株均表现为中感,36号材料对2个菌株都表现为抗。转录组测序共鉴定到75650个差异表达基因(DEGs)。GO功能富集分析显示,PXO99处理后共包含45个显著富集的生物进程GO类别,其中富集DEGs数量最多的集中在细胞过程、代谢过程、细胞解剖实体、绑定、催化活性等。KEGG富集分析表明,抗病和感病野生稻材料共显著富集到19个KEGG通路,其中与抗病相关的蛋白等KEGG通路显著富集上升,进一步明确抗病药用野生稻36号的抗病性受白叶枯病菌激发显著。筛选到共同DEGs 256个,11个基因可能与野生稻白叶枯病抗性密切相关;Unigene1184、Unigene15669、CL1239、CL1421、CL4899、CL660、CL74637个基因在抗病材料中上调表达,在感病材料中下调表达;Unigene18206、CL210、CL3554、CL92485个基因在抗病材料中下调表达,在感病材料中上调表达。【结论】6个居群38份云南药用野生稻材料对CX-28和PXO; 杨雅云张斐斐张发美阿新祥董超汤翠凤杨春云戴陆园; 关键词：药用野生稻白叶枯病抗性代谢通路抗病相关基因

药用野生稻基因组DNA提取方法比较被引量：2: 2023年; 以药用野生稻为试验材料,分别选用传统的CTAB提取法、CTAB改良方法、碱裂解法、磁珠法、吸附柱法、尿素提取法及酶消化法7种方法提取水稻叶片组织DNA,7种方法分别标记为A~G。通过比较这些方法提取出DNA的浓度和纯度,分析这些方法的优劣势。7种方法均能获得较好的基因组,按获得DNA浓度表现为A>B>F>C>G>E>D,纯度表现为D>E>C>G>B>F>A。综合考量DNA的纯度、浓度、提取时间、成本、安全无毒等方面因素,若对基因组的质量要求不高,只是做简单的检测且考虑成本问题,可以选择CTAB提取法、CTAB改良方法和尿素提取法;若需要高纯度基因组,可以选择磁珠法、吸附柱法、碱裂解法;若考虑安全无毒、快速提取及成本可控,可以选择磁珠法、吸附柱法;若样品稀有,可以选用CTAB提取法和CTAB改良法。; 毕继安王芳张国芳朱宏芬沈岚郑红英严成其; 关键词：药用野生稻叶片基因组有利基因

一种药用野生稻内生真菌YYA21及其应用: 本发明公开了一种药用野生稻内生真菌YYA21及其应用，属于微生物应用技术领域。所述药用野生稻内生真菌YYA21保藏号为CCTCC NO:M 2022102，其分类命名为Acrocalymma vagum。本发明提供了一株...; 梁世伟林福呈苏珍珠曾宇兰

药用野生稻拮抗稻瘟病内生细菌的筛选、鉴定及发酵条件优化被引量：3: 2023年; 【背景】稻瘟病是水稻的三大重要病害之一,每年对水稻生产都会造成较大的损失,生物防治稻瘟病已成防治该病害的重要手段,而目前鲜少有报道从药用野生稻中分离内生菌用以防治稻瘟病。【目的】从药用野生稻内生菌中挖掘对稻瘟病具有拮抗作用的微生物资源。【方法】采用分离法从勐遮药用野生稻中先分离出内生菌,再通过平板对峙法筛选对稻瘟病菌具有拮抗作用的菌株,通过形态学和16S rRNA基因序列分析对菌株进行鉴定,同时筛选该菌株的最适培养基、pH、培养温度和摇床转速。【结果】筛选得到拮抗菌株Z5,在LB培养基上对稻瘟病菌菌丝生长的抑制率达到96.43%,经形态学和16S rRNA基因序列分析,初步鉴定为短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)。在NYBD、CM、LB、NA和YSP这5种培养基中,菌株Z5的最适培养基为NYBD培养基、最适pH值为8.0-9.0、最适培养温度为35℃、最适摇床转速为250 r/min。【结论】短小芽孢杆菌Z5对稻瘟病菌的生长具有较好的抑制作用,且该菌株耐高温、较耐酸碱,作为稻瘟病生防制剂研发具有一定的价值。; 雷凌云钟巧芳熊子璇杨得正刘丽殷富有陈玲程在全肖素勤; 关键词：药用野生稻稻瘟病内生菌

一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物组合及其应用: 本发明涉及一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物组合及其应用，开发了72对扩增引物，其对应的72个InDel分子标记均匀分布在水稻12条染色体上，每条染色体有6个InDel分子标记。本发明可为检测药用...; 陈玲程在全肖素勤王波张云王玲仙殷富有钟巧芳张敦宇柯学刘丽李金璐卢源达余腾琼蒋聪

一种同时检测药用野生稻和栽培稻的SSR分子标记扩增引物组合及其应用: 本发明涉及一种同时检测药用野生稻和栽培稻的SSR分子标记扩增引物组合及其应用，所述引物组合在药用野生稻和栽培稻中可扩增出相应的SSR分子标记，克服了现有药用野生稻中SSR分子标记获取困难的缺陷，可为检测药用野生稻或药用野...; 陈玲殷富有程在全钟巧芳王波张敦宇张云王玲仙肖素勤柯学蒋聪余腾琼刘丽李金璐卢源达

药用野生稻芒长基因OoAn1的图位克隆: 李双香

一种药用野生稻内生真菌YYA21及其应用: 本发明公开了一种药用野生稻内生真菌YYA21及其应用，属于微生物应用技术领域。所述药用野生稻内生真菌YYA21保藏号为CCTCC NO:M 2022102，其分类命名为Acrocalymma vagum。本发明提供了一株...; 梁世伟林福呈苏珍珠曾宇兰

广东省药用野生稻的调查收集与保护被引量：3: 2022年; 为了全面了解广东药用野生稻自然生存现状,为我国野生稻资源的保护提供决策依据,2006、2012-2018年对广东药用野生稻生存状况进行了调查。结果查明,截至2018年12月,广东8个县市17个乡镇尚存药用野生稻,共有分布点21个,其中3个点为首次发现。现有分布点中,47.6%的分布点分布范围小于67 m2或只有零星几丛甚至1丛,38.1%的分布点分布范围在67~666 m2之间,只有14.3%的分布点分布范围在2000 m2以上。根据历史资料统计,广东原有11个县市35个乡镇有药用野生稻,共有分布点79个。本次实地调查了其中47个点,只有18个点尚有药用野生稻。按实地调查的分布点计算,分布点丧失率为61.7%,呈现濒危趋势。调查发现,造成药用野生稻消失的主要原因有城镇化建设、开垦种植果树和经济林、除草剂的使用以及伴生植物禾本科杂草的快速生长等。调查的同时,抢救性收集了94份药用野生稻种茎样本进行异位保存,并对其主要性状进行了鉴定评价,初步鉴定出10份抗褐稻虱、11份中抗白叶枯病种质。同时还繁种入中期库保存,丰富了保存的药用野生稻资源,提高了保存种质的安全性。; 范芝兰陈文丰陈雨张静李晨孙炳蕊江立群吕树伟吴柔贤潘大建; 关键词：药用野生稻

转化药用野生稻TAC克隆的水稻芽期耐盐性分析: 2022年; 为了解转药用野生稻TAC(Transformation-competent artificial chromosome)基因克隆的水稻株系芽期耐盐性,本研究分别以TAC载体插入片段两端的抗性标记Hpt和SacB检测T_(4)代16个转化株系,并利用0.3%和0.6%的NaCl溶液处理转化TAC克隆的阳性株系及其受体的种子,研究盐胁迫对转基因株系种子萌发相关性状的影响。结果表明,Hpt和SacB均从16个转基因株系中扩增出目的片段。在盐胁迫下,16个转基因株系和受体亲本的发芽势、发芽率、芽长、主根长和根数等性状都显著下降,其中根数和主根长的下降程度最大,减少达72.0%和69.6%。相对发芽势、相对发芽率、相对芽长、相对主根长和相对根数等指标,以‘华粳籼74’(HJX74)为受体的7个转基因株系与其受体亲本相比,全部或大部分株系无显著差异;而以‘日本晴’为受体的9个转基因株系与其受体亲本相比,部分株系与受体相比差异显著,其中TR6-1-6-1、TR19-3-5-6、NAC3-2-4-2、NAC17-1-6-3、STK2-1-2-2和STK33-5-3-1等株系在0.3%或0.6%盐浓度胁迫下的相对发芽率(相对盐害率)显著低于受体‘日本晴’。结合相对盐害率和5个性状的隶属函数值评价表明,TR19-3-5-6和NAC3-2-4-2的耐盐性显著优于其受体亲本。; 许飘赖芯茹戴诗琦黄永相陈志雄刘向东李伟郭建夫; 关键词：药用野生稻转基因水稻耐盐性盐胁迫

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