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2016-2023年湖北省荆门市H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析: 2025年; 目的了解2016—2023监测年度湖北省荆门市H3N2亚型流行性感冒(流感)病毒血凝素(HA)基因特征及抗原漂移情况。方法对2016—2023监测年度湖北省荆门市分离到的60株H3N2流感毒株进行全基因组测序,利用MEGA 11、UCSF Chimera1.18等软件对HA基因序列进行抗原变异分析和三维建模分析。结果2016—2023监测年度共计5个监测年度有H3N2亚型流感病毒检出,共有3C.2a1、3C.2a2、3C.2a3、3C.2a1b.1b、3C.2a1b.2a.1a、3C.2a1b.2a.2a.3a.1共计6个进化簇流行,优势毒株从2016年的3C.2a2簇逐步变更为2023年的3C.2a1b.2a.2a.3a.1簇,两者在HA蛋白抗原表位上存在差异的氨基酸突变位点达21个,有I140K等13处氨基酸突变位点在表面模式结构图中差异明显。结论2016—2023监测年度湖北省荆门市H3N2亚型流感病毒不断进化,发生了抗原漂移,应持续加强对H3N2亚型流感病毒的分子变异监测。; 邓先群李冰清李雯严小雪杨芸; 关键词：H3N2亚型流感病毒血凝素基因

我国乙型流感病毒血凝素基因的分子流行病学特征初步探讨: 2024年; 目的初步探讨我国乙型流感病毒(IBV)血凝素(HA)基因的分子进化及基因特征,为IBV疫苗的研发提供参考价值。方法从GenBank公共数据库中获取我国完整的IBV HA基因序列,利用生物信息学软件分析其进化变异与基因特征。结果我国1996—2018年B/Victoria系流感毒株主要属于V1A分支,2019—2022年属于V1A.3分支,少数属于V1A.1分支,B/Yamagata系相同年份流行株多聚集成一分支进化。Victoria系和Yamagata系的HA基因与同期疫苗株相比,其氨基酸同源性分别>92.6%和92.8%。两谱系与参考株相比,流行株在HA蛋白的120环、150环、160环及190螺旋等关键的抗原决定簇部位发生了多个氨基酸位点改变。结论我国IBV的流行株含有B/Victoria系和B/Yamagata系,且HA已发生抗原突变积累,这可能会导致IBV疫苗保护效果下降,需密切监测IBV谱系及变异情况,为疫苗株的更新提供可靠的数据。; 倪群琴何付勤何君君李娟江春顾秀玉沈冬; 关键词：乙型流感病毒血凝素基因特征进化

2009-2024年山东省甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析: 2024年; 目的描述并分析山东省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因的多样性,探讨其遗传变异规律,为流感监测、疫情防控和疫苗株匹配度提供科学参考。方法从GISAID流感数据平台下载2009—2024年流感疫苗推荐株和各分支代表株的HA基因序列,与山东省分离的298株甲型H1N1流感病毒株HA基因序列进行系统发育分析和氨基酸位点变异分析。利用IQ-TREE在线工具的最大似然法(maximum likelihood,ML)构建系统进化树,利用MegAlign软件查看氨基酸位点变异,同时采用NetNGlyc 1.0在线软件预测HA基因潜在的糖基化位点。结果298株山东省甲型H1N1流感病毒的HA基因同源性为91.2%~100.0%,序列进化分支随时间推移亲缘关系渐远,但进化方向与其他省份大致相同。HA基因氨基酸变异在各年度均有发生,抗原决定簇是其主要变异区域。结论山东省2009—2024年流感病毒分离株的HA基因仍处于不断进化过程,持续监测流感病毒流行趋势和进化方向对预警流感病毒大流行至关重要。; 赵志红何玉洁吴巨龙宋绍霞孙林李忠王显军寇增强温红玲刘倜; 关键词：血凝素基因遗传进化

2013-2020年潍坊市A(H1N1)pdm09流感病毒血凝素基因特征分析: 2024年; 目的分析2013-2020年山东省潍坊市A(H1N1)pdm09流感病毒血凝素(HA)基因遗传进化特征,了解潍坊市A(H1N1)pdm09亚型变异情况,为及早发现新变异株以及精准防控提供科学依据。方法收集2013-2020监测年度山东省潍坊市A(H1N1)pdm09流感病毒阳性样本,进行病毒分离,于阳性毒株中按年度共挑选18株流感毒株,采用二代测序方法获得HA基因序列信息后,使用RAxML软件,采用最大似然法(ML)构建系统进化树,使用BioEdit软件分析氨基酸位点变异情况,使用NetNGlyc 1.0 Server在线软件进行HA糖基化位点分析,使用datamonkey在线软件进行选择性压力分析,选用模型为单似然祖先计数(SLAC)模型、固定效应似然(FEL)模型。结果潍坊市18株A(H1N1)pdm09亚型分离株HA基因分属于6B、6B.1、6B.2等分支,大部分毒株(17/18)与对应年份疫苗株分属相同分支,且与对应年份疫苗株相比,HA基因序列的核苷酸同源性均>97.3%。氨基酸序列分析显示,HA蛋白有12~22个氨基酸突变不等,且均发生了位于抗原决定簇的突变,包括Sa区L161I、S162N、K163Q、S164T位,Sb区S185T、T185I位,Ca区H138Y、S203T位及Cb区S74R位,83.3%病毒发生了两个及以上抗原决定性突变;发现位于受体结合部位220环的Q223R突变及受体结合部位附近的S183P和I216T突变;自2016年开始潍坊分离株的糖基化位点改变较为频繁,包括11NSTD缺失、162NQSY增加,变异糖基化位点162NQTY增加及162NQTY缺失。选择性压力分析显示,dN/dS值分别为0.65与0.279,均未发现正向选择性压力位点。结论2013-2020年山东省潍坊市A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因总体与当年疫苗株比较接近,但HA基因及其编码氨基酸仍存在持续变异,需加强监测。; 田蒙蒙刘德辉胡林陈莹莹李东英张媛媛刘淑慧聂清; 关键词：甲型H1N1病毒流感病毒 HA基因基因进化

宁夏地区2017—2023流感监测年乙型流感病毒血凝素基因变异状况及序列分析: 2024年; 目的了解近年宁夏地区乙型流感病毒的病原学检测情况和血凝素(hemagglutinin,HA)基因变异情况。方法采用时空分布抽样方法选取2017—2023年自治区疾控中心分离的乙型流感毒株44株,提取RNA,通过RT-PCR反应扩增HA片段并测序,测序结果利用生物信息软件进行分析。结果对分离的44株乙型流感分离株进行全基因组测序分析,对比疫苗株B/California/12/2015,15株BY系中有7个毒株发生抗原位点改变,涉及120环抗原表位的R136G和L137H的改变,均涉及受体结合位点改变;对比疫苗株B/Colorado/06/2017,29株BV系毒株有26株发生了抗原位点变异,涉及4个抗原表位的11个受体结合位点。涉及受体结合位点2个的3个位点发生改变;未检出潜在糖基化位点发生改变。本次研究中的所有BY系的毒株均隶属于Clade 3分支,所有BV系的毒株全部属于Clade 1A分支。结论2017—2023流感监测年,乙型流感在宁夏地区持续流行,其抗原位点发生了一定程度的变异,未来应加强监测。; 孙晓强穆婷袁芳李龙山张薇马学平; 关键词：乙型流感病毒血凝素基因变异抗原位点

2022—2023年北京市通州区甲型H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析: 2024年; 目的分析2022—2023年北京市通州区流感病原学监测中甲型H3N2亚型流感病毒的血凝素(hemagglutinin,HA)基因特性,为流感防控提供科学依据。方法对通州区2022—2023年流感病原学监测结果进行统计分析,选取不同时间分离到的34株甲型H3N2亚型流感毒株,进行HA基因扩增和测序,应用MEGA11进行HA基因的核苷酸和氨基酸变异分析,采用邻接法构建HA基因遗传进化树,在线预测N-糖基化位点,分析其基因变异和进化特征。结果2022—2023年共检测流感病原学监测样本3660件,流感病毒核酸阳性率为21.50%,其中甲型H3N2亚型流感病毒占比为57.81%。发热疫情样本共计4855件,流感病毒核酸阳性率为54.25%,其中甲型H3N2亚型流感病毒占比为61.50%。34株甲型H3N2亚型流感病毒的HA基因序列与疫苗株A/Darwin/9/2021相比,核苷酸相似度为97.00%~98.50%,氨基酸相似度为97.40%~98.10%。基因进化分析显示,2022—2023均分布在3c.2a1b.2a分支,2022年8—11月分离的14株毒株分布在1a.1亚分支,2023年2—3月分离的20株毒株则分布在2a.3a.1亚分支。与疫苗株相比,2022—2023年的34株毒株在4个抗原决定簇上(B、C、D和E)发生了多位点氨基酸变异,且在186和225位点上均发生了替换。2022年的14株毒株,增加了158NYTY位点,存在13个潜在糖基化位点,2023年的20株分离株122NESF糖基化位点丢失,共有12个潜在糖基化位点存在。结论2022—2023年,北京市通州区人群中流行的甲型H3N2亚型流感病毒分布在2个进化分支上,2023年3C.2a1b.2a.2a.3a.1分支取代了2022年3C.2a1b.2a.1a.1分支,成为流行株。及时分析流感病毒基因特性和进化趋势,对流感的防控有重要意义。; 张冲邹林佟玲刘肖杨丽丽高翔王芳张猛; 关键词：血凝素基因特征

2023-2024年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒血凝素基因特性和抗原性分析: 2024年; 目的了解2023-2024年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒(BV)的血凝素(hemagglutinin,HA)基因特性、抗原性及与流感疫苗组分株的匹配性。方法采集2023—2024年流感监测季流感样病例(influenza like-illness,ILI)咽拭子样本,经MDCK细胞或鸡胚培养分离流感病毒,提取病毒核酸后测序。应用Mega5.0进行病毒HA基因的核苷酸和氨基酸变异分析,采用maximum likelihood方法构建HA基因的遗传进化树,在线预测N-糖基化位点。SWISS-MODEL同源建模,建立BV毒株HA的蛋白质三维空间模拟图。通过血凝抑制(hemagglutination inhibition,HI)试验,进行毒株的抗原性分析。结果随机抽取本年度BV分离毒株54株,提取核酸后测序获得HA基因全长序列。与本年度的疫苗组分BV株(B/Austria/1359417/2021)HA基因相比较,这54株均有3个氨基酸序列替换,涉及2个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示:所有毒株均位于Clade 1A.3a.2分支,与2023—2024年度疫苗组分BV株在同一分支。抗原性分析结果显示:54株均为疫苗组分BV株的类似株。结论2023—2024年流感监测季北京市人群中BV流行毒株以Clade 1A.3a.2进化分支为主要流行株。本监测季BV流行株与疫苗BV组分的抗原匹配性较高。; 卢桂兰赵佳琛石伟先张莉刘医萌冯兆民孙瑛张代涛彭晓旻; 关键词：乙型流感病毒血凝素基因抗原性分析

2012-2023年淄博市H3N2亚型流感病毒血凝素基因特征分析: 2024年; 了解2012-2023年10个流感监测年度淄博市分离的流感病毒H3N2亚型血凝素(Hemagglutintin,HA)基因及氨基酸变异特征,为流感的防控提供理论依据。对淄博市2012-2023年分离到的39株H3N2流感毒株HA基因进行测序,利用生物信息软件对测序结果进行进化分析和抗原变异分析。2012-2023年淄博市测序H3N2亚型流感分离株A、B、C、E等四个抗原区均有氨基酸发生变异,D区相对保守,未检测到变异;2012-2016年部分毒株受体结合位点左壁发生N225D变异,2016-2023年所有毒株左壁均发生N225D突变,2016-2023年部分毒株前壁发生T131K变异,2019-2020年部分毒株前壁发生T135K、S137F变异,其余位点未发生变异;与WHO推荐的相应年度参考疫苗株相比,各年度的分离株均出现了糖基化位点增加或缺失现象,且多发生于A区抗原位点和受体结合位点前壁;全部分离株均位于3C分支,大部分年度流感流行株分支较为集中,但也存在某年度多分支流行情况;与参考疫苗株比较,2015-2016年度、2019-2020年度分离株与当年推荐疫苗株遗传距离较远。2012-2023年淄博市H3N2亚型流感病毒HA基因表现出遗传多态性,在基因进化上呈现多分支进化特点,部分年度与当年WHO推荐疫苗株在基因水平上有一定遗传距离,提示抗原匹配程度可能降低,应密切关注流感病毒基因变异情况,为流感疫情防控和疫苗的筛选提供科学依据。; 刘超许进张群李蕾桑潇王勤; 关键词：血凝素进化

贵州省2022-2023年流感季A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性和血凝素基因特征: 2024年; 目的了解贵州省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性和血凝素(Hemagglutinin,HA)基因特征。方法选取贵州省流感监测点2022年10月至2023年3月A(H1N1)pdm09亚型流感病毒分离株,采用红细胞凝集抑制试验检测抗原性,测定HA全基因组序列,构建遗传进化树,分析核苷酸同源性和氨基酸位点变异。结果共获得78株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒,均鉴定为疫苗类似株。22株毒株获得HA全基因组序列,与疫苗株的核苷酸同源性为97.28%-99.14%;其中6B.1A.5a.2a、6B.1A.5a进化分支分别为19株、3株;19株发生Sb抗原决定簇的A186T和Q189E氨基酸替换并分布在1个抗原决定簇,3株发生Sa抗原决定簇的K156N和I161L氨基酸替换并分布在1个抗原决定簇。19株发生190位螺旋(184-191)A186T和Q189E以及220位环E224A氨基酸替换,3株发生220位环D222Y氨基酸替换,均发生在HA1区域。未发现糖基化位点变异。结论贵州省2022-2023年流感季A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与疫苗株匹配性良好,但存在部分氨基酸位点变异。需加强流感病毒监测及其抗原性和基因序列分析,以利于流感防控策略制定和流感疫苗株筛选。; 庄丽柯倩郑菊韦小瑜; 关键词：抗原性血凝素基因特征

2016-2024年湖北省麻疹病毒流行株血凝素基因特征: 2024年; 目的分析湖北省麻疹病毒(Measles virus,MV)流行株血凝素(Hemagglutinin,H)基因特征。方法收集2016-2024年湖北省麻疹病例咽拭子MV核酸阳性标本,进行MV分离培养和H基因序列扩增,构建MV的H基因序列系统进化树,分析核苷酸同源性和氨基酸变异。结果共获得32株MV分离株,其中2016-2018年H1a基因型25株、2019年B3基因型3株、2021-2024年A基因型(疫苗株)4株,各基因型分离株的H基因核苷酸同源性分别为99.4%-100%、100%、99.8%-100%,与中国疫苗株S-191相比的同源性分别为94.6%-94.9%、96.1%、99.6%;2016-2019年MV分离株H蛋白存在L131F、R243G、Y481N、N484T和D506G共同氨基酸变异,在238-240位区域缺少1个N-糖基化位点,在主要表位上发生N178T、G211S、S240N、P397L、A400V、H448R、K460R和G546S变异。结论2016-2024年湖北省优势基因型MV流行株从H1a和B3基因型转变为A基因型,分离株H蛋白多个抗原表位发生氨基酸变异。; 张婷邹文菁蔡昆; 关键词：麻疹麻疹病毒血凝素

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