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单菌转录组测序方法: 本发明公开单菌转录组测序方法。首先将微生物和包裹材料混合，凝固形成果冻状半固体，使用溶菌酶对细胞壁进行消化，透化细菌；加入逆转录试剂和随机引物，对细菌内的总RNA进行捕获合成cDNA；将包裹材料溶解，释放出单菌，使用微流...; 陈海德冯畅董灵刘炯

一种单细胞转录组测序的方法: 本发明提供了一种单细胞转录组测序的方法。具体地，本发明的方法采用“一管法”，将样品裂解、逆转录、PCR扩增以及产物纯化步骤在同一个反应容器内完成，提高了对细胞转录组中低丰度RNA以及特殊结构中的RNA扩增的灵敏度，减少了...; 何杰金梦梦汤霞刘志勇

一种基于转录组测序的年龄估算方法: 本发明涉及一种基于转录组测序的年龄估算方法，具体地，本发明涉及一种建立数据集的方法、年龄估算模型的训练方法、年龄估算方法、年龄估算模型或装置、电子设备、非易失性计算机可读存储介质及其用途；本发明还结合单细胞测序技术鉴定了...; 张维绮刘光慧杨运桂陈成水李嘉明熊沐钊叶金林张峰薛勇彪范艳玲孙晓燕程科云傅向红

制备单细胞转录组测序文库的方法及试剂组合: 本申请提供了一种构建用于转录组测序(例如，单细胞转录组测序，单细胞全长转录组测序)的核酸分子文库的方法。此外，还提供了，利用所述方法构建的核酸分子文库，以及用于实施所述方法的试剂组合。; 王利郭立亮曹唱唱

时空转录组测序方法、构建测序文库方法和基因测序系统: 本发明公开了一种时空转录组测序方法、构建测序文库方法和基因测序系统。本发明的时空转录组测序方法包括以下步骤：1)以探针序列3′端与模板RNA 3′端互补结合进行逆转录，并利用逆转录酶在所生成cDNA的末端添加模板转换寡核...; 廖莎陈奥章文蔚徐讯周慧郭晶杨晶

一种基于高通量技术的非模式物种转录组测序结果分析方法: 本发明公开了一种基于高通量技术的非模式物种转录组测序结果分析方法，具体包括如下步骤：(1)使用Fastp软件对高通量测序数据质控；(2)使用Trinity软件进行转录组的De novo组装；(3)使用CD‑HIT软件对组...; 刘松宋微吴刚山梅佳琪陆红飞潘维

一种基于微流控的高通量单细胞转录组测序建库方法: 本发明公开了一种基于微流控的高通量单细胞转录组测序建库方法。所述方法可拓展用于多种转录本的信息获取。将单个细胞和其携带的RNA、单细胞分子标签、反转录试剂、PCR试剂通过一键式自动化仪器被固定在一个分区内，在一个分区内通...; 李元元蔡媛媛朱怡铃范晓娴

一种用于高通量测序的单细胞转录组测序文库的构建方法及应用: 本发明公开了一种用于高通量测序的单细胞转录组测序文库的构建方法及应用，属于单细胞测序技术领域。通过直接离心和烘箱反应，简化了传统复杂步骤，缩短实验时间并降低设备成本，提高实验灵活性；引入自动化储液器和多功能微量分液器，减...; 李汉杰张露莹

基于PacBio平台的扇穗茅全长转录组测序及热激转录因子家族(HSFs)分析: 2025年; 为了明晰扇穗茅(Littledalea racemosa)的转录组特征和热激转录因子家族(HSFs)的功能与系统位置,本研究基于PacBio平台对扇穗茅全长转录组进行了测序和生物信息学分析。结果表明:测序获得高质量的Unigenes 62016条,平均长度为2752 bp,N50长度为2971 bp,蛋白编码区序列(CDS)48127个,简单重复序列(SSR)8858个;扇穗茅Unigenes在5大公共数据库中的注释量分别为27566(NR)、17961(GO)、18300(KOG)、17381(KEGG)和23737(SwissProt),有7663条Unigenes在5个数据库中均得到注释;扇穗茅转录本鉴定到1165个转录因子,隶属于48个转录因子家族,大多与高原极端环境适应有关;其中包含17个热激转录因子(HSF),大部分位于细胞核,为亲水蛋白,cDNA常包含5~10个保守结构域;系统发育研究表明扇穗茅和拟南芥(Arabidopsis thaliana)HSF转录因子聚为9个分支(CladeA-I),扇穗茅的11个HSF与HSFA2聚为一支,彼此具有较近的亲缘关系,可能具有相似的功能。本研究丰富了扇穗茅属物种的遗传信息,为后续关键功能基因的挖掘提供了理论依据。; 曲荣举刘玉萍苏旭富贵靳佳瑞杨倩张朋辉余明君孙成林毛轩睿; 关键词：功能注释转录因子

基于转录组测序分析附子须根成结的分子机制: 2025年; 目的:基于附子栽培基地中出现的须根成结现象,探究其形成的分子机制。方法:本研究针对附子须根成结现象,利用高通量测序技术对附子、须根及根结转录组进行分析,探究附子须根成结的分子机制。结果:本研究共获得119.15 Gb Clean Data,794466条unigenes,共有43899条unigenes在8大数据库得到注释。KEGG富集显示,共有28814条unigenes参与到138条通路中,其中植物-病原菌互作通路注释最为丰富,另有68条基因注释到参与植物防御病菌害的WRKY转录因子家族。通过差异表达基因分析,发现病原微生物通过侵害角质层、细胞壁突破植物防御,3-酮酰基-CoA合成酶和纤维素合成酶在防御过程中发挥重要作用。UTP-葡萄糖-1-磷酸尿苷酰转移酶、1,4-α-葡聚糖分支酶、蔗糖合酶均在膨大根结中表达上调,提示淀粉和蔗糖代谢通路是根结膨大的重要途径。结论:本研究解析了附子须根成结的发生发育机制,为研究附子抗病原微生物提供理论基础。; 章景李永宁袁鑫怡王富华高继海彭成; 关键词：附子须根转录组测序病原微生物

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