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基于机器学习筛选鼻咽癌相关基因及其表达意义研究: 目的:利用机器学习的方法筛选鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)相关基因。通过生物信息学的方法分析筛选出的相关基因在NPC中的表达情况,免疫浸润情况,参与的分子功能与信号通路,预后情况等。通...; 董国辉; 关键词：NPC 相关基因预后

鼻咽癌相关基因TP53、COL1A1、FN1的表达及意义被引量：1: 2022年; 鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是我国发病率较高的头颈部恶性肿瘤,但其发病机制仍不清楚。本文采用生物信息学方法筛选NPC差异基因,通过免疫组化进一步分析其在NPC组织和慢性鼻咽炎(chronic nasopharyngitis,CN)组织中的表达及意义。首先,使用R语言从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)和人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)中筛选出NPC差异基因,对这些基因进行基因本体论(gene ontology,GO)分析、京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析及蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,利用免疫组化实验检测相关基因在NPC组织和CN组织中的表达情况。结果显示,从GEO数据库中共筛选出257个NPC差异表达基因,其中上调基因50个,下调基因207个;从OMIM数据库检索到了21个NPC遗传相关基因,NPC组织中表达上调的基因主要富集在cAMP代谢的正调控过程、胶原三聚体及CXCR3趋化因子受体结合的调控等方面。下调基因主要富集于外动力蛋白臂、纤毛运动、乙醇脱氢酶活性和视黄醛脱氢酶活性的调控等方面。上调基因富集最显著的通路是细胞外基质受体相互作用途径,下调基因富集最显著的通路是药物代谢-细胞色素P450代谢途径。蛋白相互作用分析获得了10个相关基因和1个最强子网络。免疫组化结果证实TP53、COL1A1、FN1在NPC组织中均为高表达。上述研究结果提示,3个相关基因TP53、COL1A1、FN1可能与鼻咽癌的发生发展密切相关,这为今后NPC的发病机制研究和基因治疗提供了一定的理论基础和新的线索。; 谢慧芬张庆丰张楠楠钟颖谢民强; 关键词：鼻咽癌差异表达基因生物信息学

鼻咽癌相关基因DACT1、NFAT1、SHISA3甲基化检测试剂盒: 本发明提供了一种鼻咽癌相关基因DACT1、NFAT1和SHISA3甲基化检测试剂盒，所述试剂盒包括碱性溶液、荧光PCR反应液，所述碱性溶液和所述荧光PCR反应液被热熔材料分层包装在同一PCR扩增管内；所述碱性溶液为pH值...; 许嘉森吴诗扬彭璨璨刘志明刘芳

二代测序技术检测鼻咽癌相关基因突变与临床病理特征关系分析被引量：1: 2021年; 目的:以二代测序(NGS)为基础分析鼻咽癌相关基因突变及突变功能区域,探讨突变基因与临床特征之间的关系及临床应用价值。方法:收集2018年2月-2018年11月中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院/湖南省肿瘤医院头颈放疗二科28例初治鼻咽癌患者,采用基因测序平台Illumina NextSeqCN500进行全基因测序,描述基因检测结果,统计分析高频突变基因与临床病理特征之间的关系。结果:本研究共检测到93个基因及115个突变功能区域,因部分基因突变频率较低未纳入统计,纳入统计共20个突变基因及14个突变功能区域,其中泛素羧基末端水解酶1(BAP1)和肿瘤抑制因子(CYLD)基因的突变频率均为9.8%(5/51),肿瘤蛋白p53(TP53)基因突变频率为7.8%(4/51)。结论:Illumina NextSeqCN500测序平台可作为鼻咽癌多基因突变检测手段,BAP1、CYLD及TP53在鼻咽癌中突变频率较高,对深入研究鼻咽癌发病机制及靶向药物治疗方面具有一定的指导意义。; 陈彦竹何倩马宏志刘林张琳韩亚骞刘峰; 关键词：鼻咽癌 TP53

鼻咽癌相关基因DACT1、NFAT1、SHISA3甲基化检测试剂盒: 本发明提供了一种鼻咽癌相关基因DACT1、NFAT1和SHISA3甲基化检测试剂盒，所述试剂盒包括碱性溶液、荧光PCR反应液，所述碱性溶液和所述荧光PCR反应液被热熔材料分层包装在同一PCR扩增管内；所述碱性溶液为pH值...; 许嘉森吴诗扬彭璨璨刘志明刘芳; 文献传递

鼻咽癌相关基因6在结肠癌组织中的表达及临床意义被引量：3: 2016年; 目的探讨鼻咽癌相关基因6(NGX6)在结肠癌组织中的表达及其与结肠癌临床病理特征之间的关系。方法应用实时定量聚合酶链反应和免疫组织化学方法检测26例结肠癌组织及对应癌旁正常组织中NGX6的表达,并分析NGX6表达与结肠癌临床病理特征的关系。结果 NGX6蛋白在结肠癌组织和正常结肠组织中的阳性表达率分别为15.4%(4/26)和100.0%(26/26),结肠癌组织中NGX6蛋白的阳性表达率显著低于正常结肠组织(P<0.01)。NGX6蛋白在结肠癌组织中的表达与患者的性别、年龄、肿瘤组织类型、Ducks分期、淋巴结转移无相关性(P>0.05),而与肿瘤分化程度有关(P<0.01),分化程度越高,NGX6的表达水平越高。NGX6 mRNA在结肠癌组织和正常结肠组织中的表达分别为1.983±0.479和2.741±1.245,NGX6 mRNA在结肠癌组织中的表达显著低于正常结肠组织(P<0.05)。结论 NGX6与结肠癌的发生发展有关,NGX6可以作为评估结肠癌进展程度的一种指标。; 张翠姬明丽; 关键词：结肠癌免疫组织化学实时定量聚合酶链反应

鼻咽癌相关基因研究进展被引量：4: 2013年; 鼻咽癌的发生是一个多基因参与、多步骤的复杂过程，其中抑癌基因失活和癌基因活化是其发生的重要机制。与鼻咽癌相关的癌基因有Bcl-2、肝细胞生长因子（HGF）、环氧合酶-2（COX-2）、潜伏膜蛋白1（LMP-1），抑癌基因有p53、p16、Nm23-H1、PTEN。随着基因研究的深入，除上述基因外，鼻咽癌还与PECAM-1、MMP-9、RECK等基因相关。这些基因在鼻咽癌的发生、发展过程中有重要作用并可能成为鼻咽癌治疗的新靶点。; 程红蕾王若雨; 关键词：鼻咽肿瘤基因

鼻咽癌相关基因单核苷酸多态研究: 第一部分，IL-23/IL-23R(白细胞介素-23/白细胞介素-23受体)在辅助性T细胞17(T-helper17，Th17)介导的免疫反应中起着关键性的作用。Th17细胞是一种最近发现的炎性反应CD4+效应T细胞亚群...; 郑健; 关键词：鼻咽癌遗传多态性细胞应答 DNA损伤修复

应用基因芯片筛选初发、复发鼻咽癌相关基因: 目的：应用基因芯片研究初发鼻咽癌(PrimarynasopharyngealcarcinomapNPC)、复发鼻咽癌(RecurrencenasopharyngealcarcinomarNPC)相关基因的表达和功能，探讨...; 林森; 关键词：基因芯片复发鼻咽癌; 文献传递

鼻咽癌相关基因6在人结肠癌Wnt/β-catenin信号转导通路中的作用: 2011年; 目的:探讨鼻咽癌相关基因6(NGX6)对结肠癌Wnt/β-catenin信号转导通路下游靶分子的影响,明确NGX6与Wnt通路之间是否存在反馈调节。方法:将pCMV-myc-NGX6真核表达载体及pCMV-myc空白载体瞬时转染结肠癌细胞系SW620,Western印迹检测转染NGX6前后Wnt/β-catenin信号转导通路下游靶分子c-Jun,c-myc,细胞周期蛋白D1(cyclin D1)的表达。构建LEF1缺失突变体(缺乏N末端,即β-catenin结合区域)pcDNA3.1(+)-LEF1DN瞬时转染SW620细胞,阻断Wnt通路,并通过Western印迹及T细胞转录因子4(TCF-4)荧光素酶报告质粒检测确定阻断效果。通过RT-PCR检测Wnt通路阻断后NGX6的表达。结果:NGX6基因瞬时转染结肠癌细胞系SW620后,可明显下调Wnt/β-catenin信号转导通路下游靶分子c-Jun,c-myc,cyclin D1的表达。成功构建真核表达载体pcDNA3.1(+)-LEF1DN,Western印迹及TCF-4荧光素酶报告质粒均证实pcDNA3.1(+)-LEF1DN能够下调Wnt通路下游靶分子c-Jun,c-myc,cyclin D1的表达及TCF/LEF的转录活性,对Wnt通路具有阻断作用。瞬时转染pcDNA3.1(+)-LEF1DN抑制Wnt通路后,NGX6在转录水平的表达有上升。结论:NGX6对Wnt/β-catenin信号转导通路下游靶分子具有抑制作用。阻断Wnt通路对NGX6的表达有影响,Wnt通路与NGX6之间可能存在反馈调节作用。; 刘芬沈守荣王晓艳彭娅郭勤肖志明刘劼; 关键词：结肠癌信号转导 WNT/Β-CATENIN

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