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淮安市H3{2}2亚型流感病毒全基因组序列的遗传特征分析
2024年
目的了解江苏省淮安市H3{2}2亚型流感病毒的生物学特性和变异情况,为流感疫情防控与疫苗研发提供参考依据。方法选取4株2022年淮安市流感监测网络实验室分离的流感毒株,通过全基因组核酸提取、文库构建,应用{2}anopore三代测序平台对H3{2}2亚型毒株进行全基因组序列测定,利用生物信息学软件比对基因组序列相似性、构建系统发育树,解析氨基酸变异特征。结果8个基因节段之间的核苷酸相似性为97.1%~100.0%,相似性差异最大的是HA基因(97.1%~99.9%),差异最小的是MP基因(98.6%~99.9%)。核苷酸位点变异频率最高和最低的节段分别是HA基因(3.06%)和MP基因(1.43%),不同基因节段核苷酸变异率有统计学意义(χ^(2)=14.293,P=0.046)。HA和{2}A基因发育树拓扑结构基本一致,3株隶属3C.2a1b.2a.1a进化簇,1株独立属于3C.2a1b.1b进化分支且糖基化位点相较于另外3株在HA1蛋白142{2}WT、149{2}GT和{2}A蛋白436{2}LS位点发生丢失。4株淮安株均对{2}A抑制剂和金刚烷胺类药物敏感。结论1株淮安株抗原性发生了改变,与当年疫苗株匹配性较低,建议持续加强H3{2}2流感病毒的基因监测,为流感防控及流感疫苗筛选提供科学依据。
杨鹏飞何芳阴万利高彤张旺魏明月熊成龙胡伟
关键词:流感病毒H3N2全基因组分析遗传进化
2019年昆明市A型流感病毒H3{2}2亚型基因特征分析
2024年
目的分析昆明市暴发流感疫情A(H3{2}2)亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)及神经氨酸酶(neuraminidase,{2}A)基因特征,为流感防控提供科学依据。方法选取2019年1—12月昆明市暴发的7起疫情病例及哨点医院监测病例分离得到的19株A(H3{2}2)亚型流感毒株进行测序,采用MegAlign分析同源性,采用Jmodeltest、PhyML 3.1构建系统进化树,采用MEGA X分析突变位点。结果2019年昆明市流感暴发疫情集中在冬春季节的学校,来源于疫情和哨点医院的毒株均高度同源,同位于3C.2a1b.1b分支,与位于3C.3a1分支的2019年疫苗株A/Kansas/14/2017偏离。从疫情病例分离得到的13株毒株与从哨点医院监测病例分离得到的5株毒株分别在HA1抗原决定簇A区与B区增加T135K、S137F、K144S与S159Y、K160T突变位点,其中2株从疫情病例分离得到的毒株在抗原决定簇A区额外增加I140M突变位点,可能逃逸抗体识别,其中T135K、S137F位于130环,可能改变病毒与受体细胞的结合特性。在抗原决定簇B区增加158 {2}YTY糖基化位点,可能阻挡抗体识别病毒。所有分离株在{2}A抗原决定簇增加T329S突变位点。结论昆明市流感防控应该加强冬春季人员集中场所的监测,及时发现免疫逃逸和毒力增强的变异株,更新疫苗组分。
简千棋马丽波朱心杨瑶刘艳艳刘如锦侯敏李文龙
关键词:神经氨酸酶系统进化树
H1N1和H3N2亚型流感病毒HA1双价亚单位疫苗的设计及免疫评估
韩菲
一种H3{2}2亚型流感病毒抗原逃逸株及其筛选方法和应用
本发明公开了一种H3{2}2亚型流感病毒抗原逃逸株及其筛选方法和应用,属于疾病防治技术领域。本发明将A/swine/Guangdong/9/2005(简称GD9/05)与HA蛋白单克隆抗体2F10在MDCK细胞中连续传代共培...
乔传玲陈化兰陈艳杨焕良王秀荣
一种重组的H3{2}2亚型犬流感病毒样颗粒及其制备方法和应用
本发明涉及一种重组的H3{2}2亚型犬流感病毒样颗粒及其制备方法和应用。其中,H3{2}2亚型犬流感病毒样颗粒含有A/canine/Shanghai/0103/2019(H3{2}2)的血凝集素(HA)蛋白和神经氨酸酶({2}A)蛋白,...
葛菲菲杨德全李鑫沈海潇王建刘健
湖州市2022年甲型H3{2}2亚型流感病毒分子特征分析
2023年
目的了解2022年湖州市甲型流感病毒的流行特点,明确流行株与疫苗株的匹配情况及流感病毒基因组进化特征。方法随机抽取2022年湖州市甲型流感病毒核酸阳性标本进行全基因组测序,采用Bioedit、MEGA 7.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析。结果2022年6月—12月甲型H3{2}2亚型流感病毒是湖州市流感的唯一流行型别。测得15株甲型H3{2}2亚型流感病毒全基因组,序列分析显示均属于3C.2a分支,为同一个进化来源,且与疫苗株A/Darwin/9/2021/H3{2}2关系较近。与疫苗株A/Darwin/9/2021/H3{2}2相比,15株H3{2}2亚型流感序列5个抗原决定簇位点的氨基酸序列与疫苗株成高度一致,HA蛋白上受体结合位点(RBS)的5个保守氨基酸也没有变化;HA蛋白增加了一个糖基化位点,{2}A蛋白糖基化位点没有变化。结论2022年湖州流行的甲型流感未发生具有流行病学意义的变异,接种当年度疫苗对甲型流感有一定的预防效果。需加强流感疫苗接种的宣传教育。
陈莉萍徐德顺吴晓芳纪蕾
关键词:进化特征
1株天鹅源H3{2}2亚型禽流感病毒的全基因序列分析
2023年
为了调查动物园动物禽流感病毒的携带情况,从扬州市动物园采集了106份野禽类新鲜粪便棉拭子样品,进行SPF鸡胚接种、HA/AI试验鉴定、空斑纯化以及HA、{2}A、PB1、PB2、PA、{2}P、M、{2}S共8个片段扩增及测序分析。结果表明,分离到1株H3{2}2{3}禽流感病毒,分离率为0.94%,命名为A/Swan/Yangzhou/YZS1084/2019(H3{2}2)。HA基因裂解位点只有1个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感的特征;携带242Q和244G的HA受体结合位点具有优先结合唾液酸α-2,3受体的能力,具有典型禽源特征。在扬州首次分离到的该病毒的8个基因片段均属于欧亚分支,与猪源和人源的毒株差异较大;8个基因片段来源均不相同,具有明显的遗传多样性。
朱欧文闻亮刘海苏湘杨君徐迅李文斌张雨蓓祝常椿张信军陈素娟陈素娟
关键词:全基因组遗传进化
H3{2}2亚型犬流感病毒实验感染模型的建立
2023年
【目的】建立H3{2}2亚型犬流感病毒(canine influenza virus,CIV)实验感染模型,了解犬流感的发病特征,为疫苗效力评价奠定基础。【方法】6—13月龄CIV血凝抑制(haemagglutination inhibition,HI)抗体阴性(HI<1﹕10)比格犬26只,其中3只鼻腔喷雾PBS作为阴性对照,另23只分5组(10、103、105、106、107 EID50/只),分别为3、5、5、5、5只/组,每只犬各鼻腔喷雾H3{2}2亚型CIV(A/canine/China/Huabei-170607/2017(H3{2}2),简称HB株)病毒液1mL。观察临床症状、肺脏病变和肺脏组织病理学变化,计算肺实变率,检测病毒和HI抗体效价。【结果】10 EID50剂量感染组,3只犬均未出现明显临床症状,肺脏均无明显眼观病变,肺脏实变率0%,无组织病理学变化,病毒检测均为阴性,HI抗体效价几何平均值(geometric mean titer,GMT)为1﹕15.9;103 EID50剂量感染组,5只犬中有4只喘息、流鼻汁和咳嗽,1只犬未表现出临床症状,2只犬肺脏出现轻微实变,实变率平均为1.4%,4只犬病毒分离阳性,HI抗体效价GMT为1﹕320;105 EID50剂量感染组,5只犬在攻毒后5 d开始出现流鼻汁和咳嗽等临床症状,肺脏均有实变,实变率平均为4.2%,肺泡间隔增宽,病毒分离均为阳性,HI抗体效价GMT为1﹕2940.7;106 EID50剂量感染组,5只犬在攻毒后4 d体温升高、流鼻汁、咳嗽,临床症状出现较105 EID50剂量感染组早1 d,肺脏实变程度增加,实变率平均为17.9%,肺泡间隔增宽,病毒分离均为阳性,HI抗体效价GMT为1﹕2228.7;107 EID50剂量感染组,5只犬在攻毒后3 d表现出体温升高、流鼻汁、咳嗽等严重的临床症状,症状出现较106 EID50剂量感染组早1 d,肺脏严重实变,实变率平均为29.0%,肺泡间隔增宽,病毒分离均为阳性,HI抗体效价GMT为1﹕2940.7;对照犬均未出现明显临床症状,肺脏均无明显眼观病变,无组织病理学变化,病毒检测均为阴性,HI抗体效价均<1﹕10。【结论】106 EID50剂量病毒是能引起犬明显发病的最小病毒接种剂�
黄程杨龙峰孙鹏程慧敏杨志远林健祝洪伟刘立新孙厚民李加凤赵际成段会娟潘洁刘月焕
关键词:比格犬H3N2亚型肺脏
贵州省2017-2019年H3{2}2亚型流感病毒HA基因遗传特征分析
2023年
目的分析贵州省2017-2019年H3{2}2亚型流感病毒HA基因特征,了解变异规律。方法由贵州省10家网络实验室分离的H3{2}2亚型流感毒株中随机选取20株提取R{2}A,进行逆转录酶聚合酶链反应和测序,采用生物信息软件分析。结果20株毒株HA基因核苷酸同源性为97.7%~100.0%,与世界卫生组织推荐的疫苗株A/Ho{12}g-Ko{12}g/4801/2014(2017年)和A/Si{12}gapore-I{2}FIMH/16-0019/2016(2018年)同源性高,而与2019年世界卫生组织推荐的疫苗株A/Ka{12}sas/14/2017(2019年)差异较大。遗传分析显示,20株病毒株主要分为2个分支,2019年流行的毒株处于不同的分支,遗传差距较大。关键位点分析显示,抗原决定族A、B、C和E存在突变;受体结合位点前壁和后壁存在突变;与当年度疫苗株相比,存在糖基化位点的增加。2017-2018年毒株在遗传距离、抗原位点和糖基化位点变异情况与2019年毒株略有不同。结论贵州省2017-2019年H3{2}2亚型流感病毒HA基因发生基因突变,2019年的毒株变异最为严重,应密切监测H3{2}2亚型流感病毒遗传进化的变化情况。
郑勤妮任丽娟庄丽付成忠万永虎
H3{2}2亚型流感报告病毒的构建及其在中药筛选中的应用
目的:  构建带有HiBiT标签的H{2}N2亚型流感报告病毒A/NY-HiBiT,建立H{2}N2流感药物高通量筛选体系,筛选中药提取物及中成药,为抗病毒药物研发提供依据。  方法:  1.报告病毒A/NY-HiBiT的构建及...
张成成
关键词:中药筛选H3N2亚型流感病毒抗病毒作用

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赵翔
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研究主题:流感病毒 流感 基因 特性分析 H3N2亚型流感病毒
黄维娟
作品数:47被引量:441H指数:13
供职机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
研究主题:流感病毒 B型流感病毒 H3N2亚型 特性分析 流感
王大燕
作品数:201被引量:1,503H指数:23
供职机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
研究主题:流感病毒 流感 禽流感病毒 流感疫苗 B型流感病毒