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芥菜MAPK基因家族成员鉴定及其响应根肿菌侵染的表达分析
2025年
芸薹属根肿菌(Plasmodiophora brassica)侵染引起的根肿病蔓延会严重影响芥菜[Brassica juncea(L.)Czern.]的产量和品质。丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPK)级联作为一种高度保守的信号通路,在植物的生物和非生物胁迫中发挥重要作用。为了挖掘芥菜抗根肿病相关的MAPK基因,本研究对芥菜进行全基因组鉴定,并对芥菜MAPK基因家族的系统进化以及基因结构等进行生物信息学分析。筛选鉴定的66个BjuMAPK基因不均匀分布在17条染色体上。在基因组尺度上,发现基因的串联重复导致了芥菜MAPK基因数目增多。同一亚族成员之间具有相似的基因结构,不同亚族间差异较大。预测的顺式作用元件与植物激素、抗逆性以及植物的生长发育相关,表达分析显示BjuMAPK02、BjuMAPK15、BjuMAPK17和BjuMAPK19等基因在根肿菌侵染芥菜后具有不同的响应模式。以上结果为进一步研究BjuMAPK基因在芥菜应对根肿病生物胁迫中的功能奠定了理论基础。
徐楚王海平宋江萍张晓辉贾会霞韩嘉琪李芝洁李森阳文龙
关键词:芥菜丝裂原活化蛋白激酶根肿病
陆地棉CDPK和MAPK基因家族分析及抗虫功能挖掘
棉花是人类纤维、油份和饲料的重要来源,为世界的发展做出了突出贡献。在棉花的整个生育期内,会遭受各种植食性昆虫的侵扰,严重影响了棉花的产量和纤维质量,虫害已经成为限制棉花产业发展的重要因素。传统的抗虫分子育种策略主要是在棉...
王福秋
关键词:突变体库抗虫机制
MAPK基因及其在抗杨树真菌感染中的应用
本发明属于植物生物技术领域,尤其涉及一种MAPK基因及其在抗杨树真菌感染中的应用,本发明通过生物信息学分析,发现PtMAPK3‑1基因是杨树MAPK级联基因家族成员,在杨树的抗逆、抗病过程中扮演了重要的角色。本发明通过构...
严涵薇吴静孙文项艳
MAPK基因及其在抗杨树真菌感染中的应用
本发明属于植物生物技术领域,尤其涉及一种MAPK基因及其在抗杨树真菌感染中的应用,本发明通过生物信息学分析,发现PtMAPK3‑1基因是杨树MAPK级联基因家族成员,在杨树的抗逆、抗病过程中扮演了重要的角色。本发明通过构...
严涵薇吴静孙文项艳
褪黑素对百合种球膨大的影响及百合MAPK基因促进生长的应用
百合(Lilium spp.)是一种广受大众喜爱的球根花卉,常用于盆花和切花生产。然而我国百合种球基本上依赖进口,严重阻碍了百合产业的发展,研发促进百合种球膨大的技术和阐述鳞茎发育的机制,有助于促进百合种球国产化。本文探...
程灵韵
关键词:百合组培褪黑素栽培MAPK
茭白MAPK基因家族鉴定及ZlMPK3功能初探
茭白是禾本科菰属多年生浅水宿根草本植物,是我国仅次于莲藕的第二大水生蔬菜。茭白肉质茎的形成与其内生真菌菰黑粉菌的侵染密切相关。目前,茭白响应黑粉菌侵染的机制尚不清楚。丝裂原活化蛋白激酶位于MAPK级联途径的最下游,当接收...
郭鹏飞
关键词:茭白MAPK基因农杆菌介导法
纳米氧化铈暴露下大型溞MAPK基因家族的表达分析
2023年
MAPK基因家族广泛参与生物体细胞内的各种生命过程,与生物对环境胁迫的应答相关。然而,在纳米氧化铈(Nano cerium dioxide, nCeO2)暴露下大型溞MAPK基因家族成员的作用机制还不清楚。本文利用BLAST、HMM和SMART等方法在大型溞基因组中鉴定MAPK基因家族成员,分析大型溞各个MAPK基因的理化性质、染色体定位、结构域、保守基序、系统发生关系等,并利用qPCR分析不同浓度、不同时间nCeO2暴露下各个MAPK基因家族成员的表达模式。结果鉴定出14个大型溞的MAPK基因,分布于8条染色体上。MAPK基因家族编码的蛋白质序列长度为361~1546 aa,分子量为38.93~77.02 kDa,等电点在5.3~9.51。12个MAPK蛋白具有S_TKc结构域,4个保守基序。系统发生分析显示,大型溞的14个MAPK基因分别属于4个亚家族,基因序列在进化过程中具有较高的保守性。在50和150 mg/L nCeO2暴露48 h后,大型溞的7个MAPK基因DmMAPK-p38b、DmMAPK4、DmMAP2K4、DmMAP3K4、DmMAP3K7、DmMAP3K11、DmMAP4K5的转录表达水平与对照组相比,极显著上调。结果提示,MAPK基因家族成员与大型溞对nCeO2的胁迫应答调控相关。本研究为评估纳米材料对水生生物的潜在毒性提供科学参考。
张园雯周妍刘琪康欣怡陈晶魏杰
关键词:纳米氧化铈大型溞结构域
水曲柳MAPKK、MAPK基因家族鉴定及MPK6功能研究
水曲柳(Fraxinus mandshurica)系木犀科(Oleaceae)白蜡树属(Fraxinus)乔木,是东北地区珍贵用材树种和国家储备林计划中重要的大径级用材树种,应用场景广泛,例如制造家具和园林美化等。促分裂...
单超然
关键词:水曲柳促分裂原活化蛋白激酶干旱胁迫低温胁迫生物学功能
葡萄MAPK基因家族鉴定及逆境胁迫下的表达分析被引量:1
2022年
探究葡萄MAPK家族成员的特性及潜在功能,为葡萄抗逆基因资源的挖掘和利用提供理论依据。本研究克隆获得葡萄MAPK基因家族成员并对其进行生物信息学分析,根据基因芯片数据分析各成员的组织表达特征,结合qRT-PCR明确其对非生物胁迫的响应情况。结果表明,葡萄中共获得43个MAPK成员,分别命名为VvMAPK1~VvMAPK43,分布于15条染色体上,其中有6个成员集中分布于18号染色体上,5个分布于5号染色体上。氨基酸大小为114~1520aa,VvMAPK15编码的氨基酸序列最长,为1520个氨基酸残基,VvMAPK23编码的氨基酸序列最短,为114个。相对分子量集中为12.26~16.70ku,等电点为4.94~10.01。芯片数据分析发现,经ABA处理后,VvMAPK5、VvMAPK7和VvAMAPK13的表达量明显下调,在盐、PEG和低温处理下,VvMAPK6、VvMAPK9和VvMAPK13的表达量明显上调;不同成员在不同组织以及同一组织的不同生长阶段表达水平差异显著。qRT-PCR分析发现,大多数VvMAPK家族成员受到200mmol·L^(-1) NaCl的诱导,表达水平较对照上调显著,VvMAPK9、VvMAPK27、VvMAPK29和VvMAPK38在500μmol·L^(-1) ABA、200mmol·L^(-1) NaCl和10%PEG处理后均上调表达显著,对3种非生物胁迫的响应强烈。研究结果表明,葡萄MAPK家族成员在不同非生物胁迫下存在不同的潜在功能,为葡萄基因改良和遗传育种提供理论基础。
马宗桓黄青勇李艳梅李文芳毛娟陈佰鸿
关键词:葡萄MAPK生物信息学分析逆境胁迫QRT-PCR
食管癌高发人群血浆游离DNA中的p38MAPK基因检测研究被引量:1
2022年
目的:检测食管癌高发人群哈萨克族食管癌患者血浆游离DNA(cfDNA)中的p38MAPK基因并结合食管癌组织样本中p38MAPK蛋白的表达情况,探讨cfDNA中p38MAPK基因作为食管癌诊断新型分子标志物的意义。方法:收集20例哈萨克族食管癌患者手术治疗前、后的清晨空腹外周静脉血各10 mL及相对应患者术后组织的石蜡切片标本,10例健康哈萨克族人群的外周静脉血10 mL。离心柱吸附法提取cfDNA,直接PCR法检测cfDNA中的p38MAPK基因。免疫组织化学法检测患者术后组织中p38MAPK蛋白的表达情况并根据患者年龄、性别、分化程度、肿瘤最大径、T分期进行分组比较。结果:哈萨克族食管癌患者手术治疗前、后血液中cfDNA浓度均高于健康哈萨克族人群(P<0.05);患者手术治疗前cfDNA中p38MAPK基因检出率显著高于健康人群组(P<0.05),手术后cfDNA中p38MAPK基因检出率与健康人群组差异无统计学意义(P>0.05);患者术后免疫组化检测结果显示p38MAPK蛋白在高、中分化组中的阳性表达率高于低分化组(χ^(2)=13.939,P<0.05),在肿瘤最大径≤2.5 cm组中的阳性表达率高于>2.5 cm组(χ^(2)=0.014,P<0.05),p38MAPK蛋白的阳性表达率在不同年龄、性别、T分期患者肿瘤组织之间的表达差异无统计学意义(P>0.05)。结论:食管癌高发人群血液中cfDNA浓度显著高于健康人群,提示cfDNA浓度可能用于早期食管癌筛查。哈萨克族食管癌患者血液cfDNA中p38MAPK基因检出率显著高于健康人群组,又提示cfDNA中p38MAPK基因可能作为诊断食管癌的非侵入性新型分子标志物。
冯志寅吴怡娴哈晓丹陈邬锦李秀梅董娟娟
关键词:食管癌哈萨克族血浆游离DNAP38MAPK

相关作者

董金皋
作品数:713被引量:2,397H指数:26
供职机构:河北农业大学
研究主题:玉米大斑病菌 玉米 灰葡萄孢 拟南芥 除草活性
谷守芹
作品数:117被引量:262H指数:10
供职机构:河北农业大学生命科学学院
研究主题:玉米大斑病菌 玉米 玉米大斑病 MAPK 转录因子
范永山
作品数:128被引量:514H指数:13
供职机构:唐山师范学院生命科学系
研究主题:玉米大斑病菌 玉米 大斑病菌 平菇 MAPK
唐纪良
作品数:204被引量:445H指数:11
供职机构:广西大学
研究主题:基因 黄单胞菌 野油菜黄单胞菌 黑腐病菌 十字花科黑腐病菌
严涵薇
作品数:17被引量:12H指数:2
供职机构:安徽农业大学
研究主题:杨树 内参基因 真菌感染 基因 杨树品种