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置于发生学与现象学论域的“情—声”关系讨论
2024年
文章以“情—声”关系为中心,进一步勾连与牵扯感性结构力问题,并置于发生学与现象学论域,分别就“原始情感的纯粹音调”“原始美学规范想像”“有声信号传递超生物经验”“心理能量的物理释放”“现象学结构转换”“音乐作品的二重存在方式”“始端终端、他律自律、立美审美互动”“思—诗关系”“事—诗关系”“直观本质洞察”“相即”等问题进行讨论。
韩锺恩
关键词:发生学现象学
文学文本的系统发生分析:历史、现状和反思
2024年
系统发生分析是进化研究中的重要计算方法,被广泛用于确立物种谱系。20世纪80年代以来,该方法先被引入语言和文化谱系研究,继而被引入民间文学研究。在民间故事的系统发生分析中,文本的母题序列被视作遗传信息。对这些序列进行系统发生分析,最终可得到民间故事谱系,进而揭示故事所对应民族在历史上存在的联系。本文在考察文学文本系统发生分析的原理、历史和现状的基础上发现:首先,国内民间文学母题研究虽卓有大成,但仍停留在分类阶段,母题数据未被充分利用,而引入系统发生分析为国内民间文学母题研究开辟了新途径;其次,确定同源母题是近十年来母题研究的重点,但当前对同源母题的确定仍偏主观,而系统发生分析中的同源性算法可为同源母题确定提供更科学的依据;第三,系统发生分析目前主要用于民间文学研究,但鉴于母题分析同样适用于其他文学文本,本文主张系统发生分析可向更广泛的文本拓展,揭示其内在演变规律及其投射的思想文化变迁。
程弋洋袁陈杰
关键词:叙事母题同源性
火炬花叶绿体基因组特征及系统发育
2024年
火炬花(Kniphofia uvaria(L.)Oken)为阿福花科(Asphodelaceae)火把莲属药用植物。通过组装火炬花完整的叶绿体基因组,并对其结构特征与系统发育进行分析。结果表明:火炬花叶绿体基因组全长163227 bp,为典型的四分体结构,其由一个长84414 bp的大单拷贝(LSC)和一个长17871 bp的小单拷贝(SSC)组成,由一对长30471 bp的反向重复序列(IRs)将大单拷贝区与小单拷贝区分开。火炬花基因组包含130个基因,其中蛋白质编码基因、tRNA基因、rRNA基因数量分别为84、38、8个。共鉴定简单序列重复位点75个,且以单碱基重复A、T类型为主。火炬花叶绿体基因组的58个编码序列中共有24841个密码子参与翻译蛋白表达,编码20种氨基酸,其中,亮氨酸是基因组中占比最高的氨基酸。火炬花叶绿体基因组中相对同义密码子使用率(RSCU)大于1的28种密码子均以A或U结尾。依据叶绿体基因组的系统发育分析结构可以看出,火炬花与阿福花科的14种植物亲缘关系更加密切。
张琰汪成忠岳建华
关键词:叶绿体基因组系统发育
大赤隐翅虫的线粒体基因组研究及系统发育分析被引量:1
2023年
【目的】探究大赤隐翅虫Philonthus spinipes(Sharp,1874)的线粒体基因组结构特征及隐翅虫亚科的系统发育关系。【方法】利用高通量测序技术获得大赤隐翅虫线粒体基因组的全序列。在系统发育分析中,选择隐翅虫亚科的21个物种和毒隐翅虫亚科的8个物种作为内群,并选择2个蚁甲亚科Pselaphinae的物种作为外群,利用最大似然法和贝叶斯法重建隐翅虫亚科的系统发育关系。【结果】大赤隐翅虫的线粒体基因组包含37个基因(13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因)和一段非编码控制区。整个线粒体基因组全长为16219 bp(GenBank登录号:OL998729)。大赤隐翅虫线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的起始密码子除nad6和nad1利用ATC和TTG开头外,其余蛋白质编码基因都是以ATT、ATA和ATG开头。4个蛋白质编码基因(cox1、cox2、cox3和nad5)以不完整的终止密码子T或TA结尾,其余9个蛋白质编码基因以完整的终止密码子TAA或TAG结尾。除trnS1因缺少DHU臂而形成一个简单的环,无法形成稳定的三叶草结构外,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。rrnL基因的全长为1275 bp,A+T含量为79.84%。rrnS基因全长为765 bp,A+T含量为76.47%。【结论】两种不同的系统发育分析方法构建的隐翅虫亚科的系统发育关系是基本一致的,均表明隐翅虫亚科为非单系群;毒隐翅虫亚科为单系群;毒隐翅虫亚科嵌套在隐翅虫亚科中。
林兴雨刘向阳宋南
关键词:鞘翅目隐翅虫亚科线粒体基因组系统发育
陈醉云《导演学》:发生缘起、译述路径与特性建构
2023年
1924年昌明电影函授学校《导演学》讲义是中国第一部电影导演理论教材。执笔人陈醉云贯彻昌明同人伸张电影学理的追求,以突破电影导演观念与实践的互动局限为初衷,译述并重构了美国彼得·密恩《电影导演》文本和徐卓呆《影戏学》译述文本。基于总结、提升本土经验,《导演学》完善了此时期中国电影导演的创作机制与原理方法,是电影导演中心制话语的先导,预示了“中国式导演作者论”的诞生。这份民族化转译文本,在导演的电影文体意识阐释中以表演指导特性为重心,重点解决导演对于表演材料的一级加工问题,极大偏离了外国原始文本,没有把握住为早期“影戏”本体论系统下“导演”理论开辟更深入视角的机会。
韦漪
关键词:翻译史研究
PhyloSuite:生物领域分子系统发育分析新平台
2023年
生物领域的分子系统发生学(molecular phylogeny)是利用生物的DNA、蛋白质序列等各种分子数据构建生物实体之间的起源和演化关系。20世纪80年代后期,随着保守引物PCR扩增和DNA测序技术的应用,系统发生(也称系统发育)研究迎来了分子数据的时代。生物分子序列的同源位点数量远远超过传统的形态数据.
张东张东李文祥
关键词:DNA测序技术分子序列蛋白质序列
43种石斛属植物叶绿体基因组比较及系统发育关系研究
2023年
基于美国国立生物技术信息中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)中下载的43种石斛的全叶绿体组序列,对43个物种间的亲缘关系进行研究。结果显示:(1)叶绿体基因的碱基组成显示T、C、A、G碱基平均含量分别是31.8%、19.0%、30.7%、18.5%;(2)通过遗传距离分析发现,铁皮石斛、黄石斛、始兴石斛和铁皮石斛中科院Ⅳ号的遗传距离最小,为0。说明这4种石斛在遗传上比较近,与其他种之间亲缘关系均较远。(3)系统发育关系显示石斛属植物是一个单系群,其中梳唇石斛是最先分化出来的,其次是竹枝石斛;细茎石斛、霍山石斛、广东石斛具有较近的亲缘关系。
朱涛李蕾蕾郭刘艳叶延欣李涛涛陈艳艳
关键词:石斛属系统发育
多位点序列和比较基因组学分析对盐单胞菌科菌株JSM 104105的系统发育学研究被引量:3
2023年
【目的】为了精准地判定产铁载体嗜盐新菌株JSM 104105在盐单胞菌科(Halomonadaceae)中的系统发育地位。【方法】采用基于16SrRNA基因、DNA促旋酶B亚基基因(DNAgyraseB subunit gene,gyrB)和核糖核酸聚合酶σ因子RpoD基因(RNA polymerase sigma factor RpoD gene,rpoD)序列的多位点序列分析方法(multilocus sequence analysis,MLSA),对菌株JSM 104105的系统发育地位进行初步分析;采用比较基因组学分析(comparative genomics analysis),分析该菌株与其系统发育关系密切的典型菌株之间的GC含量、平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)和数字DNA-DNA杂交值(digital DNA-DNA hybridization,dDDH),并进行基因组系统发育学分析(phylogenomic analysis),更准确地判定菌株JSM 104105在盐单胞菌科中的系统发育地位。【结果】MLSA分析结果表明,无论是单基因序列分析,还是多基因串联序列分析,对盐单胞菌科各分类单元以及菌株JSM104105的系统发育地位都能提供较为一致的结果。分析表明,菌株JSM104105归属于盐单胞菌科盐单胞菌属(Halomonas),与该属的Halomonas gudaonensis、Halomonas azerbaijanica和Halomonas lysinitropha的系统发育关系较密切,它们在系统进化树上形成稳定亚簇(subcluster),其中菌株JSM 104105占据稳定的独立进化分支。尽管它们之间的16S rRNA基因序列相似性较高,为97.3%-98.9%,但菌株JSM104105很难归属于其中任何已知物种。比较基因组学分析结果确认了这一判断。菌株JSM104105与系统发育关系密切的H.gudaonensis CGMCC 1.16133T、H.azerbaijanica TBZ202T和H.lysinitropha 3(2)T的ANI值(78.9%-91.6%)和dDDH值(22.1%-43.7%),均显著低于界定原核生物物种的阈值(ANI,95%-96%;dDDH≥70%)。基因组系统发育分析结果表明,菌株JSM104105明确构成盐单胞菌属独立的亚分支(subclade)。【结论】从分子系统发育学视角精准地判定产铁载体嗜盐细菌JSM104105归属于盐单胞菌科盐单胞菌属,与该属
陈锦华刘细寒刘细寒冯玉周刘祝祥刘祝祥
Molecular phylogenetics and population demographic history of Amphioctopus fangsiao,inferred from mitochondrial and microsatellite DNA markers
2023年
Amphioctopus fangsiao(Cephalopoda:Octopodidae)is an important commercial species in the coastal waters of China.In recent years,however,the resource of A.fangsiao have declined because of habitat destruction and overfishing.To analyze the genetic variations of A.fangsiao caused by the fluctuation of resources,the population genetic structure of nine sampling locations collected from the Bohai Sea to the South China Sea were investigated,using mtDNA COI fragments and microsatellite DNA.The results of F-statistics,AMOVA,STRUCTURE and PCA analyses showed three phylogeographic clades(Clades A,B and C),revealing limited genetic exchange between north and south populations.These clades diverged in 2.23(Clades A and B)and 3.67(Clades A,B and C)million years ago,during the dramatic environmental fluctuations,such as sea level and temperature changes,have exerted great influence on the survival distribution pattern of global organisms.Our results for low genetic connectivity among A.fangsiao populations provide insights into the development of management strategies,that is,to manage this species as separate management unit.
Jian ZhengYan TangRan XuXiaoying ZhangXiaodong Zheng
Contribution of phylogenetics to understanding the evolution and epidemiology of dengue virus被引量:1
2022年
Dengue virus(DENV)is one of the most important arboviral pathogens in the tropics and subtropics,and nearly one-third of the world's population is at risk of infection.The transmission of DENV involves a sylvatic cycle between nonhuman primates(NHP)and Aedes genus mosquitoes,and an endemic cycle between human hosts and predominantly Aedes aegypti.DENV belongs to the genus Flavivirus of the family Flaviviridae and consists of four antigenically distinct serotypes(DENV-1-4).Phylogenetic analyses of DENV have revealed its origin,epidemiology,and the drivers that determine its molecular evolution in nature.This review discusses how phyloge-netic research has improved our understanding of DENV evolution and how it affects viral ecology and improved our ability to analyze and predict future DENV emergence.
Xi YuGong Cheng
关键词:EVOLUTIONFLAVIVIRUSPHYLOGENETICS

相关作者

许凤华
作品数:3被引量:4H指数:1
供职机构:云南农业大学植物保护学院
研究主题:分子标记 基因定位 抗稻瘟病基因 稻瘟病 CHITINASE
范成明
作品数:78被引量:399H指数:11
供职机构:中国科学院遗传与发育生物学研究所
研究主题:基因 椭圆小球藻 蛋白序列 植物 大豆
何月秋
作品数:433被引量:2,245H指数:24
供职机构:宁波城市职业技术学院
研究主题:玉米 稻瘟病菌 解淀粉芽孢杆菌 水稻 生物防治
陈争
作品数:60被引量:252H指数:8
供职机构:中山大学
研究主题:产前诊断 染色体 染色体异常 胎儿 荧光原位杂交
林瑞庆
作品数:325被引量:821H指数:16
供职机构:华南农业大学兽医学院
研究主题:PCR PCR扩增 艾美耳球虫 内转录间隔区 ITS