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张田雷
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- 所属机构:陕西理工大学化学与环境科学学院
- 所在地区:陕西省 汉中市
- 研究方向:理学
- 发文基金:国家自然科学基金
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- 张田雷贾子龙王炳楠
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- 邱莹梁犇杨骏鹏丁超张立珺穆承谦王嘉伟郭少波宋凤敏史娟史娟
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- 使用多特征预测蛋白质棕榈化位点
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- 采用改进的氨基酸组成、SARAH1疏水尺度值、改进的二肽频率特征、间隔氨基酸对组成特征、蛋白质物理化学性质的自相关函数特征值表征给定的蛋白质序列段,然后用小波频谱来提取特征参数值,用支持向量机来预测棕榈酰化位点。模型查准率为0.880,查全率为0.859,F值为0.869,ROC曲线的面积为0.87。研究结果表明,使用多特征预测蛋白质棕榈化位点方法达到了现有预测算法的水平,能够较准确地预测蛋白质棕榈化位点。
- 张田雷王睿徐晖
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