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广东省自然科学基金(037148): 作品数：13 被引量：125H指数：8; 相关作者：喻达辉郭奕惠黄桂菊王小玉龚世园更多>>; 相关机构：中国水产科学研究院南海水产研究所华中农业大学海南大学更多>>; 发文基金：广东省自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目国家高技术研究发展计划更多>>; 相关领域：生物学农业科学更多>>

合浦珠母贝DNA的抽提和RAPD反应体系的优化被引量：19: 2006年; 分别从保存于-70℃和95%乙醇的合浦珠母贝组织提取总DNA。结果表明,乙醇保存标本用双蒸馏水预处理后所提的DNA与-70℃保存的标本所提的DNA质量均较好。用抽提的DNA为模板优化RAPD条件,得到适合于合浦珠母贝的RAPDPCR反应条件为:20μL反应体系中包括20ngDNA模板,1×PCRBuffer,0.1mmol·L-1dNTPs,2.5mmol·L-1MgCl2,0.2μmol·L-1引物,1UTaqDNA聚合酶。最佳退火温度40℃。PCR产物用非变性PAGE银染和琼脂糖EB染色检测所得到的主要带型相同,但PAGE能检测到更多的多态带。; 郭奕惠黄桂菊喻达辉; 关键词：合浦珠母贝 DNA提取

合浦珠母贝印度家系F_1代的AFLP分析被引量：17: 2007年; 用AFLP标记对合浦珠母贝(Pinctada fucata)印度家系的亲本及其子一代(F1)进行了遗传分析。27对引物共扩增出1 013个位点,其中835个位点在F1代分离,178个位点不分离,多态位点比例82.4%。分离位点中,符合孟德尔分离规律的位点458个,占分离位点数的54.9%。偏孟德尔分离规律的位点377个,占分离位点数的45.1%。分离比为3∶1的位点共有482个,占分离位点数的57.7%,符合孟德尔分离规律的位点251个,占52.1%(占分离位点数的30.1%);分离比为1∶1的位点共有353个,占分离位点数的42.3%,符合孟德尔规律的位点207个,占58.6%(占分离位点数的24.8%)。半数以上的标记符合孟德尔遗传规律。表明AFLP标记适合于合浦珠母贝的遗传图谱构建。[中国水产科学,2007,14(1):52-58]; 王小玉喻达辉黄桂菊郭奕惠龚世园王爱民; 关键词：AFLP标记合浦珠母贝家系

中国、日本和澳大利亚珍珠贝的ITS2序列特征分析被引量：22: 2005年; 对中国、日本和澳大利亚的珍珠贝核糖体DNA第二内部转录间隔子(ITS2)的序列特征进行了分析。PCR扩增产物包括5.8S基因部分序列、ITS2基因和28S基因部分序列。去除引物序列后5.8S基因片段长64bp,ITS2长230～237bp,28S基因片段长249bp。共分析了16个基因型的序列特征,结果表明,5.8S和28S基因片段高度保守,仅28S有1个碱基位点突变;而ITS2变异大,237个比对位点中有20个位点发生突变,其中12个位点为缺失/插入突变,4个简约信息位点。在碱基组成中,5.8S和28S的GC含量(58.1%～59.4%)高于AT含量,也高于ITS2的GC含量(51.3%～52.0%),ITS2的GC含量与AT含量相差不大。碱基组成中5.8S的A碱基含量较低,28S的T碱基含量较低,存在较大的碱基偏倚性。3个地理群体内和群体间的遗传距离都很小(0.010～0.013),且相互重叠。从基因型数据看,3个群体既有各自独立的基因型,也有共享基因型。但从序列的碱基变异数据看,3个群体没有各自独有的突变位点。上述结果表明,3个地理群体既具有丰富的遗传多样性,又具有高度的遗传一致性,即亲缘关系近,可能存在基因交流,或者分化时间不长。丰富的遗传多样性有利于合浦珠母贝的遗传选育。; 喻达辉李有宁吴开畅; 关键词：合浦珠母贝 DNA序列分析

RAPD标记在合浦珠母贝家系F1代的分离方式被引量：12: 2005年; 对RAPD标记在合浦珠母贝F1代全同胞家系共27个样品中的分离方式进行了研究。从21条RAPD随机引物中筛选了8条引物用于扩增分析,结果共扩增出49个位点,其中正常位点47个(95.9%),异常位点2个(4.1%),即子代有扩增带而双亲无。47个正常位点中3个位点在F1中不分离(6.4%),44个位点发生分离(93.6%,即多态位点)。卡方检验表明,44个分离位点中32个符合孟德尔分离规律(72.7%),12个位点发生偏分离(27.3%)。符合孟德尔分离位点中按11分离位点占43.8%,31分离位点占56.2%,其中,父本特有标记、母本特有标记和双亲共有标记分别占28.2%,15.6%和56.2%,父本特有标记略多于母本特有标记。根据“双假测交”理论,11分离位点是构建F1代家系的作图位点。较高的11分离位点表明,利用RAPD标记构建合浦珠母贝遗传连锁图谱是可行的。; 喻达辉王小玉郭奕惠黄桂菊王爱民; 关键词：全同胞家系 F1代基因型多态性

合浦珠母贝3个家系的AFLP标记分离与遗传多样性研究被引量：7: 2007年; 对AFLP标记在合浦珠母贝（Pinctada fucata）印度家系（印度贝♀×印度贝♂，PII）、杂交家系（三亚贝♀×印度贝♂，PSI）和三亚家系（三亚贝♀×三亚贝♂，PSS）的遗传分离及3个家系的遗传多样性进行了分析。3对引物共产生57个位点，分离位点比例为57．4％～87．7％，符合孟德尔规律的分离位点为70．0％～71．0％；1：1分离位点占总分离位点的24．0％～45．2％，其中杂交家系的比例最高。3个家系的多态位点比例为93．0％～100．0％，总基因多样性为0．460。家系内的基因多样性为PII0．434，PSI0．331，PSS0．366，平均为0．377±0．030。家系间的遗传分化显著（GST=0．180）。遗传距离分析表明，PSI与PSS之间的遗传距离最大（0．157），PII与PSS之间的遗传距离最小（0．121）。UPGMA系统树表明，PII和PSS的亲缘关系较近，而PSI与这2个家系较远。上述结果表明，第一代家系的遗传多样性仍很高，但家系之间的遗传分化较大。该研究结果对育种过程中遗传资源管理具有一定指导作用。; 王小玉喻达辉黄桂菊郭奕惠杜博龚世园王爱民; 关键词：AFLP分子标记基因多样性遗传分化

珠母贝属的系统发育:核rDNA ITS序列证据被引量：19: 2005年; 珠母贝属(Pinctada)的一些种类是生产海水珍珠的重要母贝,个别种类已濒临灭绝。本文利用核糖体DNA内部转录间隔区1(ITS1)和2(ITS2)序列对珠母贝属常见种类的系统发育和分类地位进行了分析。结果表明:ITS1长410–482bp,其中Pinctadamaxima最长,P.fucata,P.fucatamartensii,P.imbricata和P.nigra最短。ITS2长210–249bp,其中P.albina和P.nigra最长,P.maxima和P.margaritifera最短。碱基替换的同质性检测发现,P.maxima、P.margaritifera和P.chemnitzi的碱基替换格局存在显著性差异,前二者的GC含量显著高于其他种,在进化上可能比较原始;而P.chemnitzi可能发生过染色体重排事件,可能是新近形成的种。系统发育分析表明,所研究的种类可分成3个类群:类群I包含P.fucata、P.fucatamartensii和P.imbricata;类群II包含P.albina、P.nigra、P.chemnitzi和P.radiata;类群III包含P.maxima和P.margaritifera。在类群I中,我国的P.fucata、日本的P.fucatamartensii和澳大利亚的P.imbricata的种间遗传分化不明显,可能为同种,根据命名优先原则应以P.imbricata命名该种为宜。类群II中P.albina和P.nigra可能是两个亚种,而GenBank中的P.radiata(AY144603)可能是P.chemnitzi的误定。类群III(P.maxima和P.margaritifera)分化较早,与碱基替换格局的检测结果相符。; 喻达辉朱嘉濠; 关键词：进化关系珠母贝核RDNA GENBANK 核糖体DNA

利用ITS和AFLP标记探讨中国、日本和澳大利亚3种珠母贝的亲缘关系被引量：3: 2006年; 我国合浦珠母贝 Pinctada fucata 的命名较混乱,与日本的 P.fucata martensii 和澳大利亚的 P.imbricata 的分类关系存在争议。用 ITSs 序列和 AFLP 标记对这3个种的遗传关系进行了分析。结果表明这3个地理种的遗传分化很低,种内和种间的遗传距离相互重叠,AFLP 数据的聚类分析表明澳大利亚种群大部分个体单独聚合成一支,主成分分析结果相似。种问的遗传距离与分化程度与其地理距离呈正相关。分子方差结果也表明种间的差异较小,低于6%。这些结果表明这3个种实际上是同一物种。由于大西洋的 P.imbricata 与澳大利亚的不同,因此根据分类命名的优先原则,正确的种名应为 P.fucata。; 喻达辉朱嘉濠; 关键词：合浦珠母贝分子分类遗传分化

基因组微卫星DNA位点的分离方法及其在水产动物中的应用被引量：7: 2006年; 微卫星 DNA 是分布于基因组的1～6个碱基组成的串联重复序列,或简单序列重复。微卫星 DNA 具有多态性高、数量丰富、共显性遗传和分析简单等特点,应用越来越广泛,已成为最受青睐的分子标记之一。微卫星分子标记的获得首次必须从实验生物中分离。分离微卫星 DNA 位点的方法有多种。文章对几种微卫星 DNA 位点分离技术进行介绍和分析比较,为选择合适的分离方法提供参考。; 李莉好喻达辉; 关键词：微卫星DNA 多态性磁珠富集

微卫星DNA标记在水产养殖中的应用被引量：7: 2007年; 微卫星具有多态性高、数量丰富、共显性遗传和分析简单等优点,已成为最受青睐的分子标记之一;并在农业动植物的遗传多样性、遗传结构和遗传育种研究和生产上得到广泛的应用,但在水产养殖中的应用还处于初始阶段。简要介绍了微卫星DNA标记在水产养殖中的应用及发展前景。; 李莉好喻达辉; 关键词：微卫星DNA 水产养殖

7种珍珠贝RAPD鉴别标记的初步研究被引量：21: 2006年; 采用RAPD分子标记技术对珠母贝属的大珠母贝、珠母贝、黑珠母贝、白珠母贝、合浦珠母贝、长耳珠母贝和珍珠贝属的企鹅珍珠贝的基因组DNA的特异性遗传标记进行分析。从21个OPM和S系列中筛选出4个引物，共扩增出57个位点，每条引物平均产生14．3个位点。扩增片段大小在250-2000bp间，平均每种贝每条引物产生4．9条带。其中引物S10对7种珍珠贝的RAPD产物呈现出物种的特异性，可同时将7种珍珠贝分开，其余引物可以将2种或2种以上的珍珠贝区别开来。引物S10可以作为种间鉴定的标记。; 王小玉喻达辉郭奕惠黄桂菊龚世园; 关键词：分子标记随机扩增多态DNA

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