国家高技术研究发展计划(2003AA62Z030)
- 作品数:1 被引量:3H指数:1
- 相关作者:闫秀英洪旭光吴谡琦吴淑勤张进兴更多>>
- 相关机构:中国海洋大学国家海洋局第一海洋研究所中国水产科学研究院珠江水产研究所更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 军曹鱼淋巴囊肿病毒的系统关系研究及基因型分析被引量:3
- 2007年
- 从患淋巴囊肿病的养殖军曹鱼肿瘤中分离到一种虹彩病毒,命名为淋巴囊肿病毒军曹鱼分离株(LCDV-rc)。为探讨LCDV-rc的系统地位,从DNA水平上分析了该病毒株与淋巴囊肿病毒中国牙鲆分离株(LCDV-cn)、淋巴囊肿病毒韩国鲈鱼分离株(LCDV-sb)、淋巴囊肿病毒日本牙鲆分离株(LCDV-jf)、淋巴囊肿病毒欧洲分离株(LCDV-1)和淋巴囊肿病毒日本岩鱼分离株(LCDV-rf)的系统关系。以核衣壳蛋白(MCP)基因为分子标记,通过PCR扩增和克隆测序获得了长度为1356bp的含178个信息位点的mcp基因序列;用最大简约法、最大似然法、邻接法和Bayesian法构建了分子系统树并进行了置信度检验。结果表明,构建的淋巴囊肿病毒ML、NJ、MP和Bayesian系统树的拓扑结构一致,LCDV-rc和LCDV-sb聚为一支,LCDV-cn和LCDV-jf聚为一支,LCDV-1和LCDV-rf分别各为一支。在35种虹彩病毒的系统关系分析中,LCDV-rc与另5株淋巴囊肿病毒在系统树上聚为一大支,说明LCDV-rc与淋巴囊肿病毒的关系近于其他虹彩病毒。根据遗传距离和系统关系分析认为,LCDV-rc属于一种新的基因型,称其为淋巴囊肿病毒Ⅳ型基因型。
- 闫秀英孙修勤吴淑勤吴谡琦张进兴洪旭光郑凤荣曲凌云
- 关键词:虹彩病毒基因型