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国家林业公益性行业科研专项(201204403): 作品数：24 被引量：177H指数：8; 相关作者：谭晓风龙洪旭李泽张琳刘美兰更多>>; 相关机构：中南林业科技大学中国林业科学研究院湖北省林业科学研究院更多>>; 发文基金：国家林业公益性行业科研专项引进国际先进农业科技计划高层次人才科研启动基金更多>>; 相关领域：农业科学生物学更多>>

油桐种子脂肪酸延长代谢的转录表达与代谢调控机理研究被引量：2: 2014年; 油桐是我国四大木本油料植物之一,当前对油桐的研究主要集中在栽培选优及低产林改造方面,而对油桐脂肪酸延长代谢的分子机理研究尚未见报道。本研究以油桐果实膨大期、油脂转化初期和油脂转化高峰期的种子为材料,采用高通量RNA测序技术对油桐种子脂肪酸延长代谢的3个不同时期转录组进行比较,以nr、Swiss-Prot、KEGG和COG 4个蛋白数据库为参考,对油桐种子脂肪酸延长代谢进行了综合性分析。研究结果表明,参与油桐种子脂肪酸延长代谢途径的非冗余基因序列共37条,涉及的主要酶功能基因有9种;在果实膨大期、油脂转化初期和油脂转化高峰期中,调控脂肪酸延长代谢途径的基因存在明显的表达差异。综合分析结果绘制了油桐种子脂肪酸延长代谢途径,揭示了调控油桐种子脂肪酸延长代谢过程的基因作用规律。这些研究结果为油脂合成的遗传改良提供了资源和技术基础,同时为油桐分子设计育种提供了一定的科学依据。; 刘美兰谭晓风龙洪旭; 关键词：油桐转录组

油桐VfFATB1基因的克隆及其功能的初步分析被引量：3: 2016年; 以油桐转录组数据中FATB1基因的cDNA片段为模板,通过RACE技术克隆获得该基因的CDS,命名为Vf FATB1,并进行了生物信息学分析,同时通过Real-time PCR和亚细胞定位对该基因的表达模式和表达部位进行了研究分析。结果表明Vf FATB1是一个由8个α-螺旋和10个β-折叠组成"hot-dog"折叠结构的二聚体,与JcFATB1相似度高达92%;该基因有FAT重要催化作用的半胱氨酸活性位点Cys320和3个保守的组氨酸位点His140/285/345;该基因在油脂合成后期种仁中的表达量最高,是幼根的30倍左右,且在油脂合成过程中一直是上调状态;该基因定位于叶绿体中。综上所述,Vf FATB1是一个位于叶绿体中且含有多个催化功能结构的蛋白,表达模式与油脂积累相同,因此它可能与油脂合成有着密切的关系,这为油桐的遗传改良提供了潜在的基因资源。; 刘美兰龙洪旭谭晓风; 关键词：油桐生物信息学亚细胞定位

油桐种仁不饱和脂肪酸合成途径解析被引量：3: 2016年; 油桐是我国重要的木本油料植物,过去对油桐的研究主要集中于栽培和常规育种,与油桐种仁油脂合成相关的分子机理研究还未见报道。本研究在油桐种仁油脂合成期的转录组数据基础上,通过生物信息学方法,将不饱和脂肪酸生物合成途径中的45条Unigene序列在KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库中进行比对,获得了12个关键酶的同源蛋白质并对编码这些同源蛋白质的基因在油桐种仁油脂合成期的表达模式进行了分析。通过数据分析,本研究初步推导了油桐种仁不饱和脂肪酸合成途径,这将为油桐油脂合成,尤其是α-桐酸形成机理的解析奠定基础,并为进一步的理论研究和油桐的遗传改良提供潜在的基因资源。; 陈昊谭晓风; 关键词：RNA-SEQ 不饱和脂肪酸基因挖掘代谢途径

油桐种子脂肪酸代谢途径基因调控分析被引量：1: 2014年; 为了探明油桐脂肪酸代谢机理的理论基础,以油桐优良品种葡萄桐的种子为试材,构建其转录组数据库,综合分析了转录组和表达谱的数据库,得到了与油桐脂肪酸代谢相关的非冗余基因序列共83条,涉及主要酶基因10种;同时以KEGG数据库为参考,对油桐脂肪酸代谢途径进行了分析,绘制了油桐脂肪酸代谢的路径图,揭示了油桐脂肪酸代谢途径中关键酶基因调控及催化脂肪酸代谢的基本规律。; 周乃富谭晓风黄丽媛龙洪旭; 关键词：油桐转录组脂肪酸代谢基因表达

油桐种胚再生体系的建立被引量：6: 2012年; 为了建立快速有效的油桐再生体系,以"葡萄桐"种胚为试材,研究了贮藏方式、消毒时间、培养基及培养条件对油桐种胚成苗的影响。结果表明:种子沙藏与在自然条件下贮藏对油桐种胚成苗的影响无明显差异;种胚的最佳消毒处理为0.1%的升汞浸泡3 min;将种胚接种在1/2MS+IAA 0.5 mg/L的培养基中成苗率最高,为98%;在培养基中加入6-BA易使种胚产生大量的愈伤组织,不利于油桐胚再生体系的建立;培养基的最适pH值为5.5;与遮光处理相比,光照能缩短种胚再生体系建立的周期。; 李泽谭晓风张琳龙洪旭袁军范晓明曾艳玲; 关键词：油桐种胚成苗率

油桐β-酮脂酰-ACP合酶Ⅲ基因克隆及序列分析被引量：4: 2013年; β-酮脂酰-ACP合酶——KAS是脂肪酸合成中的一种缩合酶,主要是在缩合反应中起作用。研究以近成熟的油桐种子为材料,根据GenBank中蓖麻等已知的β-酮脂酰-ACP合酶基因KASⅢ的序列设计简并引物,利用PCR、RACE等技术克隆得到了油桐KASⅢ基因的全长cDNA序列。该基因序列全长1 901 bp,开放阅读框为1 209 bp,编码403个氨基酸,通过与其他物种的KASⅢ氨基酸序列比对,油桐KASⅢ基因与麻疯树的同源性最高,达90%。软件预测表明,KASⅢ蛋白等电点为5.78,存在跨膜结构域,整个蛋白质基本上是表现出亲水性的。将该基因命名为vf-kasⅢ。; 严方方谭晓风龙洪旭; 关键词：油桐基因克隆

油桐β-酮脂酰-ACP还原酶(KAR)基因的克隆与序列分析: 2013年; 以葡萄桐近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆获得了2条KAR基因的全长cDNA,分别命名为Vf_KAR1和Vf_KAR2(GenBank登录号:KF025646,KF025647)。生物信息学分析结果表明,Vf_KAR1和Vf_KAR2基因的CDS长度分别为993 bp和900 bp,分别编码331个和300个氨基酸;与其它物种的KAR氨基酸序列具有较高的相似性,Vf_KAR1与蓖麻的相似度最高,达82%;Vf_KAR2基因与花生、辣椒的相似度高达76%;2条KAR基因的多肽都含叶绿体转运肽,但是都没有信号肽;Vf_KAR1有1个明显的跨膜螺旋拓扑结构和1个疑似跨膜螺旋拓扑结构,Vf_KAR2有2个疑似的跨膜螺旋拓扑结构;肽链都表现为疏水性,都有典型的活化中心三联体(Ser-Tyr-Lys);三级结构都有典型的Rossmann折叠特征。因此,初步推测Vf_KAR1和Vf_KAR2是油桐β-酮脂酰-ACP还原酶KAR基因家族的两个成员。; 刘美兰谭晓风龙洪旭张琳周俊琴王建勇; 关键词：油桐生物信息学

油桐花芽2个不同发育时期转录组分析被引量：13: 2014年; 利用RNA-seq技术对油桐2个不同发育时期的花芽的转录组进行比较分析,获得大量差异表达的unigene序列。通过GO分类和Pathway富集性分析,将这些差异表达unigene分别归类于55个GO term和128个代谢途径。unigene中有103个与植物开花相关,涉及4个开花调控途径(光周期途径、春化途径、GA途径和自主途径)。随着花芽发育,越来越多的unigene表达量呈现上调趋势,上调的基因数量超过下调基因数量。研究结果可在一定程度上解析油桐花芽形态分化的分子调控模式与机制。; 孙颖谭晓风罗敏李建安; 关键词：油桐花芽转录组测序开花基因

油桐丙二酰单酰CoA:ACP转酰基酶的克隆与序列分析被引量：8: 2014年; 为了深入了解油桐丙二酰单酰辅酶A酰基载体蛋白转酰基酶(Malonyl Co A:ACP transacylase,MCAT)在油脂合成代谢过程中的作用,利用RT-PCR技术克隆获得了油桐MCAT基因序列,且命名为Vf MCAT,并利用相关生物软件对该基因序列及其相应蛋白质进行了生物信息学分析。结果表明:Vf MCAT的CDS长为1 179 bp,编码392个氨基酸;该蛋白与蓖麻和亚麻的MCAT同源性均达85%,存在"GXSXG"和"GQGXQ"两个高度保守的motif,在系统进化关系上,其与蓖麻和亚麻的亲缘关系最为接近;分析其氨基酸序列后发现,Vf MCAT的分子量约为41.67 KDa,理论等电点p I为8.43,是一个含有一个跨膜结构域的可溶性稳定蛋白;对其二级和三级结构的预测结果表明,该蛋白主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,且最有可能在线粒体中发挥其主要作用,文中由此推测,Vf MCAT在叶绿体中参与了油桐脂肪酸合成代谢。; 刘美兰谭晓风龙洪旭王哲刘璐王僳僳; 关键词：油桐生物信息学分析

油桐二代优树及控制授粉子代光合特性的比较研究被引量：4: 2016年; 为了研究油桐二代优树及控制授粉子代光合效率及其光合特性参数之间的差异情况,从而筛选出高光效的品种,以湖南、湖北、重庆、四川、广西、贵州等省区的不同品系二代优树及控制授粉子代植株为试材,利用Li-6400便携式光合测定系统,对其主要光合性状指标进行了测定与分析。结果表明:(1)油桐二代优树光合效率存在一定差异,利用聚类分析,可将12个不同种源的二代优树划分为3类,其中,‘红岩3号’‘五家铺26号’‘五家铺35号’‘芦溪2号’‘五家铺42号’‘西岐1号’和‘红岩4号’的光合特性均较优;(2)不同优树自交、杂交子代的光合特性之间有所差异,杂交子代具有一定的杂种优势;(3)油桐主要光合特性参数之间存在着一定的相关性,净光合速率(P_n)与气孔导度(G_s)、蒸腾速率(T_r)间均存在显著正相关性,而与胞间二氧化碳浓度(C_i)间却存在显著负相关性;(4)影响油桐净光合速率(P_n)的主要生理指标为蒸腾速率、气孔导度、胞间CO_2浓度。; 吕佳斌谭晓风李泽龙洪旭华园榕; 关键词：油桐蒸腾速率自交

国家林业公益性行业科研专项(201204403)

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