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国家自然科学基金(30760254)

作品数:3 被引量:8H指数:2
相关作者:黄山虎黄路安洪舒勇曹凯更多>>
相关机构:重庆医科大学附属第一医院南昌大学第一附属医院江西省妇幼保健院更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:医药卫生更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇医药卫生

主题

  • 3篇尤文肉瘤
  • 3篇肉瘤
  • 2篇表位
  • 1篇蛋白
  • 1篇原核表达
  • 1篇原核表达质粒
  • 1篇质粒
  • 1篇限制性CTL...
  • 1篇多肽合成
  • 1篇B细胞
  • 1篇B细胞表位
  • 1篇CTL表位
  • 1篇EWS
  • 1篇HLA-A2...
  • 1篇表达质粒

机构

  • 3篇南昌大学第一...
  • 3篇重庆医科大学...
  • 2篇江西省妇幼保...
  • 1篇江西省儿童医...
  • 1篇南昌大学第四...
  • 1篇江西省医学科...

作者

  • 3篇曹凯
  • 3篇舒勇
  • 3篇安洪
  • 3篇黄路
  • 3篇黄山虎
  • 2篇廖翔
  • 2篇陈文昭
  • 2篇韩智敏
  • 1篇袁铿
  • 1篇张战民
  • 1篇赵金华
  • 1篇邓高荣

传媒

  • 1篇中国免疫学杂...
  • 1篇免疫学杂志
  • 1篇重庆医科大学...

年份

  • 2篇2010
  • 1篇2008
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
尤文肉瘤EWS-FLI1基因原核表达质粒的构建及鉴定被引量:2
2010年
目的:构建尤文肉瘤EWS-FLI1基因原核表达质粒。方法:从人尤文肉瘤A673细胞中提取总RNA,以RT-PCR法扩增EWS-FLI1基因序列,目的基因两侧引入SacⅠ和HindⅢ酶切位点,克隆至pMD18-T载体中,转化大肠杆菌JM109,筛选阳性克隆作PCR鉴定、酶切鉴定及测序鉴定。再将EWS-FLI1基因亚克隆至原核表达载体pQE30中,构建重组原核表达质粒pQE30-EWS-FLI1,酶切及测序鉴定。所构建的重组质粒转化JM109,IPTG诱导表达,经SDS-PAGE电泳后转印到NC膜上,进行Western blot鉴定。结果:PCR结果显示扩增片段大小约为1.5kb,双酶切鉴定目的基因片段大小约为1.5kb,阳性克隆测序结果显示目的基因序列与预期相同。所构建重组质粒在大肠杆菌中表达出与预期大小相符的54kD蛋白,经鉴定系EWS-FLI1蛋白。结论:成功构建了pQE30-EWS-FLI1,并进行了原核表达,为进一步研究其生物学功能奠定了基础。
陈文昭黄路黄山虎曹凯舒勇韩智敏安洪
关键词:尤文肉瘤原核表达质粒
尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性CTL表位的预测、筛选及鉴定被引量:5
2010年
目的预测、筛选及合成尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T Lymphocyte,CTL)表位,初步鉴定EWS-FLI1表位肽。方法综合运用BIMAS、SYFPEITHI、Predep和IEDB方案对EWS-FLI1蛋白进行HLA-A^*0201限制性CTL表位的预测,应用多项式方案、量化基序方案对预测的CTL表位进行筛选,并将筛选的CTL表位与HLA-A^*0201分子进行动力学模拟,应用标准Fmoc方案合成CTL表位肽;通过表位多肽刺激CTL释放颗粒溶素的检测,以及靶细胞杀伤实验验证表位多肽的免疫效应。结果综合预测得出了8个可能的表位肽,进一步筛选确定其中4个肽为候选合成表位,应用分子动力模拟初步验证了4个候选表位肽与HLA-A2.1分子的结合力,合成的各条肽经色谱分析纯度均在98%以上,经质谱分析各肽的分子量测定值与理论值相符,颗粒溶素释放实验及靶细胞杀伤实验证实了筛选的表位均能产生刺激效应,其中,表位肽QIQLWQFLL(EWS-FLI1 304)的刺激效应最为显著。结论综合运用多个方案可提高预测效率,分子动力学模拟可初步验证表位肽与HLA-A^*0201的结合力,所合成的多肽为高纯度肽,通过免疫学实验初步鉴定了EWS-FLI1的表位。
赵金华黄路陈文昭曹凯安洪袁铿舒勇黄山虎廖翔张战民邓高荣
关键词:CTL表位多肽合成尤文肉瘤
尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白融合区的二级结构及B细胞表位的预测被引量:4
2008年
目的:预测尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白融合区的二级结构及B细胞表位。方法:采用SOPM/SOPMA法、Chou-Fasman法和Karplus-Schulz法预测EWS-FLI1蛋白的二级结构;综合分析蛋白的柔性结构、亲水性、表面可及性与抗原性,通过预测数据再确定EWS-FLI1蛋白融合区的抗原表位。结果:EWS-FLI1蛋白的二级结构主要为柔性区域,位于EWS-FLI1蛋白N端5,23-30,32,36-49,62,69-100,118-123,128-132,135,137-170,173-179,183-271,276-286,291-301,317-319,328-331,346-353,396-400,407-408,426-438区段;α螺旋位于N端10-15,34,55,106-107,306-316,340-345,359-362,386-392区段;β折叠位于N端20,22,50-52,65-67,102-107,272,274,289-290,323,325-327,371-375,380-384,422-424,446-447区段;B细胞表位位于N端69-79,99-114,128-152,167-171,194-208,248-265,397-406区段,融合区B细胞表位位于N端248-265区段。结论:应用多参数预测EWS-FLI1蛋白融合区的二级结构与B细胞表位,为蛋白特征及复合表位疫苗的进一步研制奠定了基础。
曹凯黄路安洪舒勇韩智敏黄山虎廖翔
关键词:尤文肉瘤B细胞表位
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