北京市科技计划项目(9550213000)
- 作品数:2 被引量:18H指数:2
- 相关作者:李衍达闻芳更多>>
- 相关机构:清华大学更多>>
- 发文基金:北京市科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 以信息系统的观点了解基因组被引量:12
- 2001年
- 后基因组时代的核心任务是了解基因组与蛋白质组的功能 .由于生物是在遗传信息与外界信息作用下的一个复杂、有序的动态系统 ,基因组包含生命所需的信息 ,包括其产物和调控的信息 ,所以 ,本质上 ,基因组是一个信息系统 .基因组的调控与信息系统的调控具有相同的规律 .据此 ,本文提出将信息与信息结构作为内涵对基因组序列作为整体系统分析的设想 。
- 李衍达
- 关键词:基因组蛋白质组信息结构信息系统
- 基因表达调控与选择性剪接机制研究被引量:7
- 2001年
- 随着人类基因组计划 (HGP)的完成 ,生物信息学的研究进入了后基因组时代 ,用计算方法对基因表达调控和基因功能进行研究成为生物信息学研究的核心内容 .由于在真核基因表达调控中的特殊地位 ,选择性剪接成为研究真核基因表达调控的重要内容之一 .本文从收集选择性剪接基因的数据出发 ,尽可能的收集已知的选择性剪接的基因和它们的各种转录产物 ,并进行了适当的筛选以保证数据的质量和统计分析的可靠性 .对挑选出的 371个人类基因 ,提取各种转录产物的编码区 (codingregions,或简称cds) ,应用一种新的针对选择性剪接的多序列比对程序ASALIGN进行多序列比对来揭示不同cds间的剪接关系 ,提出其中的可变区域与不可变区域 ,并对可变区域与不可变区域的长度分布 ,可变区域在cds中出现的位置 ,由于选择性剪接引起的同一段序列读码框相位的变化以及可变区域与不可变区域及二者边界上的密码子使用频率进行了统计分析 ,得到了一些很有意思的结果 .
- 闻芳李衍达
- 关键词:选择性剪接多序列比对基因结构