广州市医药卫生科技项目(20131A01110)
- 作品数：1 被引量：22H指数：1
- 相关作者：耿进妹狄飚王鸣张颖谢华萍更多>>
- 相关机构：广州市疾病预防控制中心中山大学更多>>
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 2010-2012年广州市柯萨奇病毒A4、A10型VP1基因特征分析被引量：22
- 2014年
- 目的 检测广州市2010-2012年手足口病（HFMD）病例粪便样本中的肠道病毒,并对其中的柯萨奇病毒A4型（CoxA4）和柯萨奇病毒A10型（CoxA10） VP1基因核苷酸序列进行进化分析.方法 收集2010-2012年广州市HFMD疑似病例粪便样本5 484份,采用RT-PCR进行肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A16型（CoxA16）、CoxA4、CoxA10和其他肠道病毒阳性检测,阳性样本共4 111份.对其中的CoxA4及CoxA10阳性样本分别进行巢式RT-PCR,扩增肠道病毒VP1基因片段,并对VP1基因片段进行测序,利用生物信息学分析序列,构建系统进化树,进行进化分析.结果 在4 111份肠道病毒阳性样本中,EV71、CoxA16、CoxA10、CoxA4的阳性率分别为35.1％（1443/4111）、30.7％（1261/4 111）、2.0％（82/4 111）、0.8％（31/4 111）,不同肠道病毒阳性率差异有统计学意义（x2=148.34,P＜0.05）.CoxA4样本以3岁组阳性率最高,为1.3％ （7/534）,CoxA10样本以0岁组阳性率最高,为3.7％（34/914）;CoxA4样本阳性率4月份达到高峰,为2.6％（12/460）,CoxA10样本阳性率8月份达到高峰,为4.3％（12/278）.VP1基因核苷酸遗传进化分析显示,CoxA4阳性样本VP1基因核苷酸序列可分为A、B2个亚型,Cox A10阳性样本VP1基因核苷酸序列可分为A、B、C3个亚型,广州市2010-2012年CoxA4和CoxA10阳性样本VP1基因核苷酸序列均属于A亚型.结论 广州市2010-2012年HFMD病例粪便样本中CoxA4和CoxA10阳性样本VP1基因核苷酸序列均属于A亚型.
- 甄若楠张颖谢华萍陈纯耿进妹和鹏狄飚王鸣
- 关键词：柯萨奇病毒感染
