国家自然科学基金(30970133)
- 作品数：4 被引量：9H指数：2
- 相关作者：吴云锋李正男张磊颜永杰武科科更多>>
- 相关机构：西北农林科技大学西北大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金高等学校学科创新引智计划国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 三叶草绿变病植原体的分子鉴定被引量：1
- 2011年
- 三叶草(Trifolium pratense Linn.)为车轴草属,蝶形花科多年生草本植物,原产亚洲南部和欧洲东南部,是一种世界性分布与栽培的优良牧草。因其花叶兼优、草姿美、绿期长而具有较高的观赏价值,近几年作为草坪用草被广泛种植。在自然条件下,三叶草很容易受到不同种植原体的侵染,国外已报道的侵染三叶草的植原体有:三叶草绿变植原体(Clover phyllody phytoplasma,CPh)
- 李正男刘萍吴云锋
- 关键词：三叶草植原体分子鉴定
- 丁香卷叶病植原体的分子鉴定被引量：4
- 2012年
- 通过透射电子显微镜,在表现卷叶、褪绿症状的丁香(Syringa oblata)样品的叶脉韧皮部筛管细胞内观察到大量植原体粒子。应用植原体16S rRNA基因通用引物对P1/P7和R16F2n/R16R2对表症丁香植株总DNA进行巢式PCR扩增,得到了约1.2 kb的目标片段,通过对扩增片段进行测序、系统发育分析和同源性分析,结果表明,该片段长度为1 246 bp,在系统发育进化树上与翠菊黄化组(Candidatus Phytoplasma asteris)成员是聚集在一起的,与该组成员同源性均在98%以上。用16Sr RNAⅠ组和Ⅴ组特异引物确定了该病害非混合侵染所致,相似性系数和RFLP分析表明该植原体属于16SrⅠ-B亚组。这是国内关于翠菊黄化组植原体在丁香上感染的首次报道。
- 李正男张磊吴云锋
- 关键词：植原体RRNA基因RFLP
- 小麦蓝矮病植原体核糖体蛋白rpl22和rps3的生物信息学分析被引量：3
- 2010年
- 【目的】将生物信息学方法应用于小麦蓝矮病植原体(WBD)的分类研究,确定了小麦蓝矮病植原体的分类地位。【方法】应用植原体核糖体蛋白(rp)基因通用引物对rpF1/rpR1,对WBD进行PCR扩增并得到特异片段,对特异片段进行测定及同源性分析。【结果】序列测定结果表明,WBDrp基因片段长1 240 bp,包含部分rps19基因和全部的rpl22和rps3基因,且后2个基因为重叠基因,分别编码129和252个氨基酸,rpl22和rps3蛋白的等电点分别为12.605和11.755。【结论】WBD与16SrⅠ-C亚组中三叶草绿变病(Clover phyllody)的KVE、KVG、CPh株系亲缘关系最近,核苷酸同源性依次为99.7%,99.6%和99.0%,WBD与KVE株系的rpl22和rps3基因编码的氨基酸同源性分别为100%和98%,因此将小麦蓝矮病植原体划归到16SrⅠ-C亚组。
- 吴宽颜永杰李蓓武科科
- 关键词：小麦蓝矮病植原体生物信息学核糖体蛋白
- 小麦蓝矮植原体染色体DNA的分离被引量：2
- 2013年
- 【目的】分离小麦蓝矮(WBD)植原体染色体DNA,并建立WBD植原体染色体分离纯化体系。【方法】采用差速离心和脉冲电泳(PFGE)方法富集纯化WBD植原体染色体DNA,并通过PCR和Southern blot进行检测验证,实时荧光定量PCR方法对分离纯化效果进行定量检测。【结果】脉冲电泳凝胶中出现一条大小约为650 kb的条带,经PCR检测和Southern blot分析表明该条带为WBD植原体的染色体DNA。实时荧光定量PCR检测结果表明采用差速离心与脉冲电泳结合的方法可以将WBD植原体基因组的相对拷贝数提高436.5倍。【结论】采用差速离心与脉冲电泳法结合可以有效地从感染WBD长春花中分离到纯的WBD植原体染色体DNA,WBD植原体染色体DNA大小约为650 kb。
- 陈旺李艳吴云锋
- 关键词：染色体DNA分离纯化脉冲电泳
