国家自然科学基金(81373308) 作品数:7 被引量:37 H指数:3 相关作者: 孙承航 刘少伟 李小俊 蒋忠科 吴越 更多>> 相关机构: 中国医学科学院北京协和医学院 桂林医学院 河北北方学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 “重大新药创制”科技重大专项 北京市自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
放线菌R2A14A-1的活性代谢产物分离及菌株鉴定 被引量:3 2014年 目的抗金黄色葡萄球菌化合物FFF-13的分离鉴定及其塔克拉玛干沙漠南麓来源产生菌R2A14A-1的初步鉴别。方法以琼脂平板扩散法和化合物紫外特征追踪R2A14A-1发酵液中抗金黄色葡萄球菌的amicoumacin类化合物,通过大孔吸附树脂和高效液相等色谱法建立空白培养基与菌株发酵液比对指纹图谱,通过比对分离获得活性次级代谢产物FFF-13,根据高分辨质谱、核磁共振氢谱和碳谱数据并结合文献确定化合物FFF-13的结构;综合菌株R2A14A-1的形态特征、培养特征、生理生化特性和16S rRNA基因序列分析对菌株R2A14A-1进行初步鉴定。结果化合物FFF-13为amicoumacin B,菌株R2A14A-1为拟诺卡菌属放线菌。结论菌株R2A14A-1为首个发现产生amicoumacin类抗生素的拟诺卡菌株。 王飞飞 庹利 刘佳萌 刘少伟 董艳萍 蒋忠科 夏曼 李小俊 陈川 戴素娟 许敏 姜蓉 孙承航关键词:RRNA Amicoumacin B异构体及其衍生物的设计合成 <正>Amicoumacin类抗生素是由微生物产生的异香豆素类化合物,其结构主要由氨基酸和二氢异香豆素两个片段组成。Amicoumacin类抗生素具有广泛的生物活性,如抗菌、抗肿瘤、抗疟、抗病毒、抗炎症等。最新研究表明A... 邬钢 刘少伟 王婷 孙承航文献传递 1986-2016年国家自然科学基金红树林及其药物研究领域资助概况 被引量:2 2017年 红树林是热带和亚热带海岸潮间带上独特的生态系统,栖息在该生态系统中的植物和微生物是重要的天然药物资源。国家自然科学基金委员会从1986年成立开始资助与红树林相关的基础与应用基础研究,至今已超过265个项目,经费超过1.13亿元人民币。其中,与药物研究相关项目超过50项,达2282.4万元人民币。这些资助促进了红树林研究各领域人才的培养、队伍的形成和成果的产出。本文简述了红树林的分布与特点,结合本专刊研究进展,概括了国家自然科学基金委员会对红树林,尤其是红树林微生物药学领域资助的情况。 孙承航 李飞娜 蔡铮 吴镭关键词:红树林生态系统 药物发现 放线菌 澳门红树林植物内生放线菌多样性及新颖性研究 被引量:14 2017年 目的研究澳门红树林植物内生放线菌多样性及新颖性,为放线菌新物种及新抗生素发现奠定基础。方法 12份采集自澳门红树林的植物样品,消毒粉碎后,撒在10种分离培养基上分离内生放线菌,采用ISP2培养基进行菌株纯化;通过PCR扩增和测序获得16S r RNA基因序列,并提交到数据库中进行搜索比对,开展内生放线菌多样性和新颖性分析;放线菌潜在新物种经液体发酵、离心后,上清液经乙酸乙酯萃取,菌丝经丙酮浸泡,分别获得发酵液水相样品、发酵液酯相样品和菌丝丙酮浸提液3类样品;样品通过纸片扩散法进行抗菌活性初筛。结果从12份植物样品中得到192株内生放线菌,分布于8个目17个科30个属,其中链霉菌为优势菌属;16S r RNA基因序列相似性低于98.6%的菌株共有22株,其中菌株4Q3S-3和2Q3S-4-2分别为弗莱德门菌属(Friedmanniella)和中村菌属(Nakamurella)的新种,放线菌潜在新物种的鉴定工作正在进行;2株放线菌新种及6株潜在放线菌新种的抗菌活性筛选结果表明,5株具有抗菌活性。结论澳门红树林植物内生放线菌资源丰富多样,新颖性高,具有从中发现放线菌新物种和新抗生素的潜力,值得深入研究。 李飞娜 潘臻 庹利 刘少伟 左璇 雷晨 李铭源 孙承航关键词:红树林 内生放线菌 多样性 抗生素 广西北仑河口红树林植物根际土壤放线菌多样性及抗菌活性研究 被引量:7 2017年 目的勘探广西北仑河口红树林植物根际土壤放线菌资源多样性并进行抗菌活性研究,为新抗生素发现提供药用放线菌资源。方法采用5种分离培养基,以稀释涂布法分离放线菌;通过PCR扩增获得菌株16S r RNA基因并进行同源性比对,分析放线菌多样性;发酵液经乙酸乙酯萃取,菌丝经丙酮浸泡,分别获得发酵液水相、发酵液酯相和菌丝丙酮浸提液3类样品;纸片扩散法进行抗菌活性测试;PCR技术探测抗菌活性菌株是否存在PKS I、PKS II及NRPS生物合成基因。结果从7份红树林植物根际土壤样品中分离纯化得到110株放线菌,分布于7个目9个科15个属,优势菌属为小单孢菌属和链霉菌属;菌株N04M112、3804M13、Z05M23和Z07M34的16S r RNA基因序列与有效发表菌株Agromyces humatus CD5T(AY618216)、Streptomyces atrovirens NRRLB-16357T(DQ026672)、Streptosporangium jomthongense 30EHST(JQ922513)和Micromonospora wenchangensis 2602GPT1-05T(JQ768361)的相似率最高,分别为97.49%、98.42%、98.58%和98.54%,可能为潜在新物种;抗菌活性检测结果表明,51株放线菌中,46株有抗菌活性,总阳性率为90.20%;对这46株放线菌的抗生素生物合成基因探测发现,10株同时具有PKS I、PKS II及NRPS生物合成基因,42株至少含有其中1种,总阳性率91.30%。结论广西北仑河口红树林植物根际土壤中含有较为丰富的放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种和新抗生素的潜力。 吴越 李小俊 陈建宏 蒋莲秀 何玉林 韦晗宁 乔永超 何义 郑红芸 孙承航 黄大林关键词:红树林 放线菌 耐药菌 芽孢杆菌XZ7产生的amicoumacin类抗生素 被引量:1 2014年 目的发现芽孢杆菌菌株XZ7次级代谢产物中amicoumacin类化合物。方法 16S r RNA鉴定菌株XZ7;菌株XZ7液体发酵,溶剂萃取,UPLC-DAD-MS分析amicoumacin类化合物;中压液相和高压液相色谱对化合物389-1和389-2进行分离纯化;根据核磁共振波谱和高分辨质谱数据对化合物389-1和389-2进行化合物结构鉴定。结果芽孢杆菌XZ7产生的amicoumacin类化合物389-1和389-2为已知化合物AI-77-F和AI-77-H。结论菌株XZ7为潜在新amicoumacin类抗生素的产生菌。 夏曼 刘少伟 周忠会 庹利 凌冰 郭琳 董艳萍 王飞飞 蒋忠科 李小俊 张玉彬 孙承航关键词:MRSA 芽孢杆菌 河北九莲城淖尔可培养放线菌多样性及抗菌活性筛选 被引量:15 2016年 【目的】勘探干涸的九莲城淖尔土壤放线菌多样性并进行活性筛选,以期发现药用微生物资源,为新抗生素的发现奠定基础。【方法】采用15种分离培养基,以稀释涂布法分离放线菌;根据分离菌株的16S rRNA基因序列同源性分析放线菌多样性;发酵液经乙酸乙酯萃取,菌丝体经丙酮浸提,获得提取浓缩物样品;样品通过纸片扩散法进行抗菌活性初筛;抗菌阳性菌株采用PCR技术进行Ⅰ型聚酮合酶(PKS I)KS域、Ⅱ型聚酮合酶(PKS II)KS域和非核糖体多肽合成酶(NRPS)A结构域抗生素生物合成基因的检测。【结果】从11份盐湖土壤样品中分离纯化到251株放线菌,其分布于放线菌纲的10个目15个科31个属,其中优势菌属为链霉菌属和拟诺卡氏菌属;251株放线菌中包括57株耐(嗜)盐放线菌,其优势菌属为拟诺卡氏菌属(22株)和涅斯捷连科氏菌属(15株)。基于16S r RNA基因序列的系统发育分析显示,菌株J11Y309为糖霉菌科潜在新属,菌株J12GA03为分枝杆菌科潜在新种。96株放线菌活性检测结果显示,56株至少对1株检定菌具有抗菌活性,阳性率为58.3%;56株有活性的放线菌中,47株至少含有1种抗生素生物合成基因,其中17株同时具有3种抗生素生物合成基因。【结论】干涸的九莲城淖尔土壤中含有较为丰富的药用放线菌资源,具有从中发现放线菌新物种和新抗生素的潜力。 李小俊 吴越 张伟铭 李静 刘少伟 蒋忠科 黄大林 孙承航关键词:放线菌 多样性 抗菌活性 耐药菌 拟诺卡菌及其次级代谢产物 被引量:2 2016年 为发现新抗生素,在从海洋、盐湖、荒漠等盐碱环境勘探药用放线菌的过程中,不断分离到拟诺卡菌属新物种和该属中有生物活性的菌株,从中发现的次级代谢产物数量和种类也随之增多。截至2015年底,该菌属已有41个典型种和1个亚种,次级代谢产物超过100个,结构可分为9大类,26亚类,分别为由α-吡喃酮和γ-吡喃酮组成的吡喃酮类、二酮哌嗪和多肽组成的肽类、δ-内酯环和大环内酯组成的环内酯类、吡喃萘醌类、由二联吡啶、哌啶、四氢嘧啶、吩嗪、吩噁嗪、吲哚内酯、吲哚咔唑、吲哚核苷、喹啉、喹唑啉、噁唑啉、β-咔啉、苯骈恶唑和氨基咪唑等亚类组成的杂环类、含氯芳香类、三联苯类、由香豆素和异香豆素组成的香豆素类和骈四苯二醌类化合物。它们的生物活性涵盖抗肿瘤、抗菌、神经元细胞保护、细菌群体感应抑制、酶抑制等多个方面。本文调研了几乎所有拟诺卡菌属相关文献,首次对该菌属菌株产生的次级代谢产物及其新化合物进行了全面的综述。 高春燕 庹利 刘少伟 蒋忠科 邬钢 肖建辉 孙承航关键词:次级代谢产物 生物活性 结构类型