国家自然科学基金(30970290)
- 作品数：3 被引量：22H指数：3
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- 相关机构：中国科学院中山大学更多>>
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- 相关领域：生物学更多>>
- 细鳞苔科psbA基因的适应性进化分析被引量：8
- 2010年
- 在时间框架下,采用机理式模型（Mechanistic model）和MEC模型（Mechanistic-empirical combination mod-el）以及Datamonkey对细鳞苔科psbA基因的进化式样进行了分析.结果均未检测到统计上显著的正选择位点,显示负选择对细鳞苔科psbA基因起主导作用.另外,基于UCLD分子钟估算出的细鳞苔科各分支分歧时间表明,该科物种丰富度的辐射式增长发生在新生代渐新世.
- 陈晓霞苏应娟王艇
- 关键词：PSBA基因分歧时间正选择负选择
- 凤尾蕨科旱生蕨类rbcL基因的适应性进化和共进化分析被引量：9
- 2011年
- 核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco,EC 4.1.1.39)是植物参与光合作用的关键酶,其大亚基由叶绿体rbcL基因编码。为深入理解凤尾蕨科植物对干旱生境的分子适应机制,本研究以53种凤尾蕨科旱生植物的rbcL基因为对象,展开适应性进化和共进化研究。采用位点间可变ω比值模型以及SLAC、REL和FEL等方法进行的适应性进化分析显示:在氨基酸水平上共有15个正选择位点(66S、84E、139L、235G、245I、252A、273Y、295K、296N、299M、307G、330E、349S、365F、404A),其中位点245I、252A和273Y对维持Rubisco功能起重要作用。共进化分析共鉴定出2组共进化位点,分别由139L、273Y、295K和273Y、295K、349S组成,这些氨基酸位点间的共进化方式与蛋白质的疏水性和分子量都显著相关。以上结果一方面支持基于ω比值检验DNA编码序列发生适应性进化的有效性,另一方面也提示凤尾蕨科植物对干旱生境的适应可能与rbcL基因的适应性进化有关。
- 周媛王博高磊王艇
- 关键词：凤尾蕨科RBCL基因适应性进化
