国家自然科学基金(30901285)
- 作品数：7 被引量：60H指数：3
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- 相关机构：江苏省疾病预防控制中心东南大学中国动物卫生与流行病学中心更多>>
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- 相关领域：生物学医药卫生农业科学更多>>
- 全伸展DNA链折叠过程中三种非线性作用的布朗动力学模拟
- 2011年
- 脱氧核精核酸(DNA)单分子链从完全拉伸状态折叠到平衡状态的动力学过程是溶液中DNA单分子力学的重要特征之一.通过构建全参数化的珠子-弹簧分子链模型,并运用一种高效平衡的半隐式预测——校验积分算法,系统研究了体积排斥作用、有限伸长弹性作用和涨落流体动力学作用等三种非线性作用对稀溶液中DNA分子链折叠过程朾对回旋半径和驰豫时间的影响程度和变化趋势.模拟结果发现:体积排斥作用不影响分子链的折叠驰豫时间,但能显著碱小平衡时的相对回旋半径;流体动力学作用不影响分子链的相对回旋半径,但明显缩短折叠过程的驰豫时间;有限伸长弹性作用能明显减小短链的相对回旋半径,能显著延长长链的折叠驰豫时间.模拟数据进步表明:完全伸展的DNA分子链在折叠过程中的相对回旋半径随时间平滑变化,且折叠驰豫时间随长度的标度指数对上述三种非线性作用都具有两种不同的长度依赖性.
- 张勇张勇
- 关键词：折叠过程
- 甲型H1N1流感重症病例的危险因素研究
- 目的分析甲型H1N1流感患者发生重症临床表现的危险因素,为科学防控提供依据。方法调查江苏省2009年6～12月间甲型H1N1流感确诊病例,利用统一设计的调查表收集信息,应用SAS 9.1.3软件进行单因素和多因素非条件L...
- 汤奋扬霍翔李亮祖荣强许可祁贤吴斌嵇红朱凤才
- 关键词：甲型H1N1流感重症病例
- 文献传递
- 含肠道病毒5'端非编码区部分核糖核酸序列病毒样颗粒的构建
- 2010年
- 目的构建含有肠道病毒(EV)5'端非编码区(5'-UTR)部分RNA序列的耐核糖核酸酶(RNase)病毒样颗粒。方法利用PCR技术扩增大肠杆菌MS2噬菌体的外壳蛋白和成熟酶蛋白基因,将其克隆到pET32a中构建中间载体pET32a-MS2。将肠道病毒5'-UTR基因片段连接到中间载体的下游,构建原核表达载体pET32a-MS2-EV。将其转化宿主菌,IPTG诱导表达,并进行RT-PCR检测和稳定性实验。结果表达载体pET32a-MS2-EV经PCR、双酶切鉴定和测序分析后证实构建成功。RT-PCR和稳定性实验结果表明,诱导产生的病毒样颗粒内含肠道病毒5'-UTR部分RNA序列,并且稳定性良好。结论成功构建了含肠道病毒5'-UTR部分RNA序列的病毒样颗粒,可作为肠道病毒检测时的标准品和质控品使用。
- 单军葛以跃戚宇华张文帅李显崔仑标
- 关键词：核糖核酸核糖核酸酶病毒样颗粒
- 南京市首例甲型H1N1(2009)流感病毒分离及其血凝素基因遗传变异分析
- 2011年
- 对南京市首例甲型H1N1(2009)病毒进行细胞分离,获得一株具有较高血凝活性的病毒,命名为A/Nanjing/1/2009。在全基因组测序的基础上,对分离株的血凝素基因(haemagglutinin,HA)的遗传特征进行了详细研究。分离株HA蛋白不具有多碱基HA裂解位点,具有低致病性流感病毒特点。与参考株A/California/04/2009相比,分离株A/Nanjing/1/2009HA蛋白的有5个氨基酸发生了突变,其中一个位于Ca抗原位点208位氨基酸(R→K),这一突变虽然还不会影响抗原性的改变,但预示了新甲型H1N1(2009)抗原漂移的启动。分离株有5个潜在糖基化位点,这与近年来古典猪H1N1和北美三源重配猪H1病毒完全一致,保留了古典猪H1病毒的特点。与禽H1病毒相比,分离株HA蛋白受体结合位点上的190(E→D)和225(G→D)位点发生突变,这可能成为新甲型H1N1(2009)在人际间传播的一个重要分子基础。此外,其它受体结合位点上相关氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点。本研究对南京市早期流行的甲型H1N1(2009)流感病毒的HA蛋白的分子遗传特征进行了详细研究,对进一步监测病原变异具有重要指导意义。
- 梁立敏邵卫星范伟兴祁贤崔仑标吴斌邓斐付建光秦圆方王慎骄
- 关键词：病毒分离血凝素
- 新甲型H1N1(2009)流感病毒的早期分子特征被引量：42
- 2010年
- 【目的】本世纪首次流感大流行的病原属于甲型H1N1流感病毒,在遗传特性和抗原性等方面都有别于人群中流行多年的季节性H1N1流感病毒。为了深入了解病毒的遗传特性,跟踪病毒的演化趋势,及时发现具有流行病学意义的变异株,本研究对早期分离的甲型H1N1(2009)病毒的分子特性进行了详细分析。【方法】通过GenBank的流感资源中心下载相关毒株的基因组信息,序列分析采用DNAStar软件包的EditSeq和MegAlign,比较与病毒致病性和宿主特异性相关的氨基酸变化情况。以A/California/07/2009(H1N1)作为新甲型H1N1(2009)的早期代表株进行详细的分子特征分析。【结果】A/California/07/2009不具备高致病性流感病毒的分子特征;病毒编码的11个蛋白大部分保留有猪流感病毒的分子特征,同时也具有一些禽和人流感病毒的特征;PB1-F2在11aa,57aa和87aa后发生断裂,具有古典猪H1N1和人H1N1双重特点,这是甲型H1N1(2009)病毒一个特有的分子特征。【结论】首次详细分析了新甲型H1N1(2009)病毒的分子特征。随着病毒在人群中的进一步适应和持续存在,这些分子特征将发生变化,应该特别关注这些变化对病毒的传播力和致病性的影响。
- 祁贤汤奋扬李亮崔仑标吴斌祖荣强朱凤才羊海涛汪华
- 关键词：甲型流感病毒H1N1流感大流行分子特征
- 手足口病病原液相芯片检测方法的建立被引量：4
- 2010年
- 目的:建立检测手足口病病原的液相芯片方法。方法:设计、合成并修饰基因特异性引物和寡核苷酸探针,将寡核苷酸探针和荧光编码微球进行偶联,制备液相芯片;将样本核酸多重PCR扩增产物与液相芯片进行杂交,并通过液相芯片检测仪读取检测结果。结果:同时检测多种肠道病毒(EV),肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CAV16)的病毒核酸最低检出量均为1pg,检测特异性高。与参照方法相比,EV、EV71、CAV16的检测灵敏度分别为:91.4%、92.9%、100.0%,检测特异度分别为100.0%、97.1%、98.2%,检测准确度分别为:100.0%、96.3%、87.5%。结论:构建的检测手足口病病原的液相芯片方法,具有高通量、灵敏度高、特异性强和检测时间短等优点,为手足口病的快速诊断奠定了基础。
- 崔仑标葛以跃史智扬祁贤戚宇华单军单云峰汪华
- 关键词：手足口病液相芯片肠道病毒
- 血清／血浆microRNA及其应用被引量：3
- 2010年
- 微小核糖核酸（microRNA，miRNA）在生物体的生长、发育及疾病的发生发展等过程中起着十分重要的作用。目前，人们关注的主要是miRNA在组织细胞内的功能。然而，最近的研究发现血清／血浆中存在一些循环的miRNA，血清／血浆miRNA在肿瘤、糖尿病等多种疾病中呈特异性表达，提示血清miRNA可作为潜在的生物标记物用于疾病的诊断和治疗。
- 赵康辰崔仑标史智扬
- 关键词：微小核糖核酸
- 江苏首例甲型H1N1(2009)流感病毒分离及其血凝素分子遗传特征分析被引量：13
- 2010年
- 2009年6月12日,江苏确诊首例甲型H1N1(2009)病例。通过细胞和鸡胚分离系统,我们分离到一株具有较高血凝活性的病毒,命名为A/Jiangsu/1/2009。为了跟踪病毒的变异情况,我们开展了病毒的全基因组测序工作,在此基础上对其血凝素基因(Haemagglutinin,HA)的遗传特性进行了详细研究。分离株HA蛋白不具有多碱基HA裂解位点,具有低致病性流感病毒特点。与参考株A/California/04/2009相比,分离株A/Jiangsu/1/2009HA蛋白的有4个氨基酸发生了突变,但都不在已知的抗原位点上。分离株有5个潜在糖基化位点,这与近年来古典猪H1N1和北美三源重配猪H1病毒完全一致,保留了古典猪H1的特点。与禽流感H1病毒相比,分离株HA蛋白受体结合位点上的E190D和G225D发生突变,这可能成为新甲型H1N1(2009)在人际间传播的一个重要分子基础。此外,其它受体结合位点上相关氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点。本研究首次对早期流行的甲型H1N1(2009)流感病毒的HA蛋白的分子遗传特征进行了详细研究,对进一步监测病原变异具有重要指导意义。
- 祁贤崔仑标李亮汤奋扬郭喜玲焦永军单军吴斌祖荣强邓斐付建光秦圆方王慎骄霍翔许可朱凤才史智扬羊海涛汪华
- 关键词：甲型流感病毒H1N1病毒分离血凝素
- 新流感大流行甲型H1N1（2009）病毒的早期分子特征
- 【目的】本世纪首次流感大流行的病原属于甲型H1N1流感病毒,在遗传特性和抗原等方面都有别于人群中流行多年的季节性H1N1流感病毒。为了深入了解病毒的遗传特性,跟踪病毒的演化趋势,及时发现具有流行病学意义的变异株,本研究对...
- 祁贤汤奋扬李亮崔仑标吴斌祖荣强朱凤才羊海涛汪华
- 关键词：甲型流感病毒H1N1流感大流行分子特征
- 文献传递
- 江苏首例甲型H1N1(2009)流感病毒血凝素分子遗传特征分析
- 目的探讨甲型H1N1流感病毒的遗传特征。方法 2009年6月12日,江苏确诊首例甲型H1N1病例。通过细胞和鸡胚分离系统,分离到一株具有较高血凝活性的病毒,命名为A/Jiangsu/1/2009。为了跟踪病毒的变异情况,...
- 祁贤崔仑标李亮汤奋扬郭喜玲焦永军单军吴斌祖荣强邓斐付建光秦圆方王慎骄霍翔许可朱凤才史智扬羊海涛汪华
- 关键词：甲型流感病毒H1N1病毒分离血凝素
- 文献传递
