国家自然科学基金(30901512)
- 作品数:6 被引量:29H指数:2
- 相关作者:张瑗李立奇周跃王开发匡红更多>>
- 相关机构:第三军医大学新桥医院第三军医大学解放军第452医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金四川省卫生厅研究基金更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 基于支持向量机的类风湿性关节炎诊断模型被引量:1
- 2010年
- 目的:建立类风湿性关节炎诊断的数学模型。方法:采用支持向量机的最优二分类方法,构建类风湿性关节炎诊断的支持向量机模型,对100例类风湿性关节炎患者和50例非类风湿性关节炎其他风湿免疫病患者的类风湿因子和抗环瓜氨酸肽抗体2项指标进行检验和仿真诊断。结果:jackknife检验法和5维交叉验证法检测样本的诊断正确率均为86%。结论:可以用支持向量机建立类风湿性关节炎的诊断系统。
- 李立奇张瑗周跃王开发
- 关键词:类风湿性关节炎支持向量机类风湿因子抗环瓜氨酸肽抗体
- 纤连蛋白途径的仿生界面与骨修复
- 2010年
- 一、界面仿生修饰概述
创伤、肿瘤、感染等导致骨缺损的修复是长期困扰骨科医生的难题之一。传统采用的自体骨和异体骨移植由于来源、成本、可控性等方面的原因,难以达到规模化和标准化应用,因此,寻找可替代的人工修复材料成为最终趋势。目前,可用的修复基材主要有金属/合金、生物陶瓷、高分子聚合物、复合材料等,
- 张瑗匡红向强周跃
- 关键词:骨修复纤连蛋白高分子聚合物异体骨移植骨科医生生物陶瓷
- 蛋白质的二级结构预测研究进展被引量:26
- 2013年
- 认识蛋白质的二级结构是了解蛋白质的折叠模式和三级结构的基础,并为研究蛋白质的功能以及它们之间的相互作用模式提供结构基础,同时还可以为新药研发提供帮助。故研究蛋白质的二级结构具有重要的意义。随着后基因组时代的到来,越来越多的蛋白质序列不断被发现,给蛋白质的二级结构研究带来巨大的挑战和研究空间。而依靠传统的实验方法很难获取大规模蛋白质的二级结构信息。目前,采用生物信息学手段仍然是获得大部分蛋白质二级结构的途径。近年来,许多研究者通过构建用于二级结构预测的蛋白质数据集,计算、提取蛋白质的各种特征信息,并采用不同的预测算法预测蛋白质的二级结构得到了快速的发展。本文拟从蛋白质的特征信息的提取与筛选、预测算法以及预测效果的检验方法等方面进行综述,介绍蛋白质二级结构预测领域的研究进展。相信随着基因组学、蛋白质组学和生物信息学的不断发展,蛋白质二级结构预测会不断取得新突破。
- 唐媛李春花张瑗尚进邹凌云李立奇
- 关键词:蛋白质
- KNN法在含纤连蛋白域蛋白质亚细胞定位中的应用被引量:2
- 2011年
- 目的探讨K最近邻(KNN)法在含纤连蛋白(FN)域蛋白质亚细胞定位中的应用价值。方法选取含FN域蛋白质80个(40个细胞外蛋白质和40个细胞内蛋白质),采用KNN法进行蛋白质亚细胞定位,并采用jack-knife检验法和5维交叉验证法检验样本的定位的准确率。结果 KNN法定位细胞内蛋白36个,细胞外蛋白35个。jackknife法检验KNN法蛋白质定位准确率为88.75%,5维交叉法验证其定位准确率为82.5%。结论利用KNN法可较准确的预测含FN域蛋白质的亚细胞位置。
- 李立奇张瑗周跃王开发
- 关键词:纤连蛋白亚细胞定位氨基酸组成
- 一种仿生修饰分子rFN/CAD的设计、制备及初步应用
- 2012年
- 目的制备一种具有黏附和成骨双重功能的仿生分子,为种子细胞在支架材料界面的高效黏附和靶向分化提供新途径。方法筛选纤维连接蛋白和钙黏附蛋白前体分子,通过分子模拟、基因克隆、蛋白表达纯化等技术设计并进行制备。通过离心促黏附实验和成骨诱导分化实验检测其体外活性。结果成功获得长1954bp的FNⅢ7-10/CAD11 EC1-2重组基因和由641个氨基酸组成的融合蛋白。体外功能研究发现聚苯乙烯表面的融合蛋白涂层可显著提高人骨髓间质干细胞的黏附和成骨分化能力。结论 rFN/CAD具有促黏附和促成骨的双重生物活性,可作为一种理想的仿生修饰分子用于生物界面的构建。
- 匡红张瑗张聪贾淑芳孙薏李静呼永河
- 关键词:仿生材料钙黏着糖蛋白类分子模拟
- 基于K最近邻法的类风湿关节炎诊断模型
- 2011年
- 目的构建类风湿关节炎(RA)诊断的数学模型。方法基于K最近邻法的最优二分类方法,建立RA诊断的KNN模型。对100例RA患者和50例非RA的风湿免疫病患者的抗环瓜氨酸肽抗体(anti-CCP)和类风湿因子(RF)两项指标进行训练和模拟诊断。结果利用5维交叉验证法和Jackknife检验法检测样本的诊断准确率分别为92%和91.3%。结论可以用KNN法建立RA的诊断系统。
- 李立奇张瑗周跃何仁颖王开发
- 关键词:类风湿关节炎抗环瓜氨酸肽抗体类风湿因子