广东省自然科学基金(036606)
- 作品数：3 被引量：10H指数：2
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 利用PCR技术检测阴道毛滴虫体内的人型支原体被引量：6
- 2006年
- 采用人型支原体16SrDNA的特异引物,对从广州市多所医院门诊患者分离到的28株阴道毛滴虫进行PCR检测,结果有12株感染了人型支原体,感染率为42.9%。这显示了阴道毛滴虫和人型支原体之间的共生关系在中国具有普遍性。
- 方顺丽肖建春伦照荣
- 关键词：阴道毛滴虫人型支原体PCR检测
- 阴道毛滴虫半胱氨酸蛋白酶基因变异分析被引量：2
- 2008年
- 目的研究阴道毛滴虫半胱氨酸蛋白酶(TvCP)基因变异特点,为分子种系发生和遗传进化等提供参考资料。方法利用PCR扩增TvCP基因,用pBS-T或pET28b载体构建重组质粒,转化大肠埃希菌,筛选阳性克隆,测定目的基因序列。通过以序列相似性为基础的数据库搜索方法检索同源序列,利用Clustal X、DNAstar等软件分析TvCP基因核苷酸和氨基酸序列多态性、遗传变异和进化规律。结果克隆的TvCP2和TvCP3基因与数据库中相应参考序列在核苷酸和氨基酸水平上的相似性均为99%以上,高度保守。克隆的TvCP4基因与TvCP4参考序列在核苷酸和氨基酸水平上的相似性为97.5%以上,属于TvCP4基因家族的两个不同成员。根据阴道毛滴虫基因组数据库信息,经分析表明TvCP4酶前体由305个氨基酸残基组成,共有大小一致的TvCP4同源分子9个和N-末端缺少部分氨基酸残基的同源分子2个,它们之间的氨基酸序列相似性为62.3%～96.7%。TvCP4、TvCP1-3、TvCP12、TvCP25和半胱氨酸蛋白酶65(CP65)之间也有同源性,氨基酸序列相似性约为61%～88.2%。此外,阴道毛滴虫还拥有为数众多的其他组织蛋白酶L样成员,TvCP构成呈高度多样性。序列联配和聚类分析表明TvCP酶活性位点、酶前体结构中ERFNIN样基序和形成二硫键的半胱氨酸残基数目和位置非常保守,进化树分析也表明它们可能由共同的祖先分子通过基因复制和不断突变进化而来。结论TvCP组成一蛋白酶家族,家族内各成员酶活性位点上残基高度保守,但其他位点上的序列呈现高度多态性;推测TvCP家族各成员可能由一个共同的祖先基因分子进化而来,在保持酶基本功能的同时又赋予多样的功能。
- 贾万忠李志赵亮伦照荣
- 关键词：阴道毛滴虫进化树
- 利用MGE-PCR技术研究锥虫亚属种间与亚种间的分子特性被引量：2
- 2005年
- 目的分析锥虫亚属布氏锥虫、伊氏锥虫和马媾疫锥虫3个种以及布氏锥虫:指名亚种、冈比亚亚种、罗得西亚3个亚种间的遗传变异与进化关系。方法利用移动遗传因子(MGE)-PCR技术对26个锥虫虫株基因组进行扩增,同时利用邻位相连(NJ)法对扩增产物进行聚类分析。结果锥虫亚属的种间及亚种间的遗传差异明显,遗传距离在0到100%间均有分布(平均遗传距离为41.2%);布氏锥虫种内遗传变异度最大,遗传相似系数只有41.15%,伊氏锥虫和布氏锥虫的同源性最高,相似系数为62.94%;布氏锥虫指名亚种和罗得西亚亚种明显高于冈比亚亚种的遗传变异程度。结论锥虫亚属的种及亚种间的遗传变异程度较高;中国与南美洲的伊氏锥虫及中国与南美的马媾疫锥虫均应为同一起源。
- 李凤军郑嘉瑜贾万忠伦照荣
- 关键词：伊氏锥虫聚类分析
