重庆市卫生局科研项目(2008-2-253)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 相关作者：杨明聪范小平向学熔更多>>
- 相关机构：重庆医科大学附属口腔医院更多>>
- 发文基金：重庆市卫生局科研项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 人牙髓细胞中差异表达miRNA的筛选及靶基因预测被引量：4
- 2011年
- 目的筛选人牙髓细胞(human dental pulp cells,HDPCs)在未分化状态及在矿化诱导液中差异表达的miRNA并预测其靶基因。方法体外分离培养临床就诊患者来源的人牙髓细胞并鉴定后,分别在普通培养基和矿化诱导培养基中培养,用矿化诱导液诱导细胞向成牙本质细胞方向分化,对细胞结节形成情况进行观察并用Vonkossa染色确定HDPCs分化情况。取培养21 d的细胞用miRNA芯片检测差异表达的miRNA,并通过miRGen数据库预测其靶基因,通过GO和KEGG Pathway进行靶基因功能富积分析。结果矿化诱导的HDPCs较未诱导的HDPCs,有72种miRNA发生1.5倍以上表达上调,61种miRNA发生1.5倍以上表达下调。通过miRNA靶标预测工具分析发现,带有靶标基因的miRNA有35个,35个miRNA的靶标基因总和1 327个,miRNA和靶标基因关系对总共2158个。结论成功筛选出HDPCs miRNAs表达谱,预测到部分靶基因。
- 杨明聪向学熔范小平
- 关键词：MIRNAS牙髓细胞微阵列分析
