四川省应用基础研究计划项目(2013JY0182)
- 作品数：10 被引量：120H指数：4
- 相关作者：胡尚连曹颖徐刚卢学琴龙治坚更多>>
- 相关机构：西南科技大学重庆市农业科学院更多>>
- 发文基金：四川省应用基础研究计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- SCoT分子标记在植物研究中的应用进展被引量：51
- 2015年
- SCo T是一种新型的目的基因分子标记,该标记不仅能获得与性状联系紧密的目的基因,而且能对性状进行跟踪,已被广泛应用于多种植物的研究。本文概述了SCo T标记的原理、引物设计方法及特点,并从PCR反应体系建立与优化、种质资源遗传多样性与亲缘关系分析、种质鉴定与指纹图谱构建、基因差异表达与分子遗传连锁图谱构建等方面总结了SCo T标记的应用进展。同时,对其存在的问题进行了讨论,并展望了该标记的发展应用前景。
- 龙治坚范理璋徐刚胡尚连韩国辉
- 关键词：种质鉴定基因差异表达
- 冷冻胁迫对毛竹幼苗生理代谢及抗寒相关转录因子表达的影响被引量：3
- 2014年
- 试验以萌发90 d的毛竹幼苗为材料,研究冷冻胁迫(4℃和-10℃)下毛竹叶片抗氧化物酶(CAT、POD、APX和CAT)活性和渗透调节物质的变化及对抗寒相关转录因子表达的影响。结果表明,4℃和-10℃处理下,与对照相比,毛竹幼苗SOD和CAT酶活性下降,而POD及APX酶活性升高;可溶性糖和游离脯氨酸含量下降,但可溶性蛋白含量和MDA含量变化不明显。抗寒相关转录因子CBF1和DREB1表达量下降,而MYB和WRKY表达量上升。对胁迫下的毛竹幼苗生理代谢指标及抗寒相关转录因子表达量进行相关性分析,结果表明,只有WRKY表达量与POD和APX酶活性呈显著正相关关系,与可溶性蛋白含量呈极显著负相关关系。
- 冯芳敏史世京曹颖曹颖胡尚连卢学琴
- 关键词：毛竹渗透调节物质转录因子
- 梁山慈竹UGP基因克隆与生物信息学分析
- 2016年
- 以梁山慈竹笋为材料,采用RT-PCR方法克隆梁山慈竹UGP基因,对梁山慈竹UGP基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。获得1个梁山慈竹UGP基因,命名为Df UGP（Genebank：KJ525752）。测序结果显示该序列全长1561 bp,包含一个完整的ORF框,长度为1422 bp,编码473个氨基酸。梁山慈竹UGP基因与巨龙竹、绿竹、水稻、大麦、玉米、甘蔗的具有高度的同源相似性,编码的蛋白结构较为相似,均含有N端区域、中心区域和C端区域,且蛋白三级结构中都具有NBloop环和l-loop环。Df UGP具有N端的UDPGP功能域,其位于第90-379氨基酸,证明Df UGP属于尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因家族。
- 廖倩黄艳胡尚连曹颖卢学琴徐刚
- 关键词：梁山慈竹克隆生物信息学
- 慈竹生长过程纤维素、木质素及灰分动态积累被引量：2
- 2015年
- 以当年生不同生长高度的慈竹为研究对象,探讨慈竹生长过程中纤维素、木质素和灰分含量的积累规律。结果表明：慈竹不同生长高度纤维素含量顶、中部变化趋势均以对数方式增长;基部纤维素含量和茎秆纤维素总含量变化趋势都呈＂S型＂曲线;各部位木质素含量变化趋势总体呈倒＂S型＂曲线,且不同高度间的木质素含量的差异达显著水平;随着生长高度的增高,茎秆顶部、基部灰分含量以及茎秆灰分总含量总体呈倒＂S型＂曲线变化,中部灰分含量总体呈＂S型＂曲线变化。纤维素总含量、木质素总含量的积累分别集中在茎秆高度为150~800、30~800 cm这个生长时期;灰分总量在300~800 cm保持较高的水平。
- 冯芳敏胡尚连周振华曹颖卢学琴徐刚龙志坚任鹏
- 关键词：慈竹纤维素木质素灰分
- 青杨4CL基因的克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2016年
- 4CL是木质素合成途径中的关键酶，对其进行生物信息学分析，为深入研究4CL的作用奠定基础并为进一步改良青杨提供理论支撑。以青杨嫩茎为试材，采用RT—PCR方法克隆膏杨4CL基因，使用NCBI、DNAMAN及ExPASy等一系列在线软件及工具，对青杨4CL基因的编码区、氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行生物信息学分析。克隆了青杨4CL基因，命名为Pe4CL（GenBank注册号：KJ490636）。该基因全长1623bp，开放阅读框为1—1611bp，编码536个氨基酸，含有4CL的保守域SSGTTGLPKGV和GEICIRG及催化活性残基His-234。Pe4CL与PtCACL同源性最高达97．95％。
- 姜勇胡尚连曹颖卢学琴徐刚龙治坚黄艳
- 关键词：青杨克隆生物信息学分析
- 基于慈竹转录组MYB基因的克隆及胁迫诱导表达被引量：4
- 2015年
- 从慈竹笋转录组数据库中克隆出2个MYB基因(Be MYB1、Be MYB2)进行生物信息学分析,探讨其响应脱落酸(ABA)、Na Cl、聚乙二醇6000(PEG 6000)胁迫的机制。结果表明,Be MYB1与Be MYB2基因分别编码632个和338个氨基酸;Be MYB1蛋白属于MYB相关蛋白,与小麦Ta MYB48蛋白聚为一枝,具有2个序列模体(motif);Be MYB2蛋白属于R2R3-MYB蛋白,与毛竹Pe MYB2蛋白、水稻Os MYB18蛋白聚为一枝,具有3个motif。Be MYB1和Be MYB2基因均响应了ABA、Na Cl和PEG 6000,但Be MYB2基因对胁迫的响应能力更强,Be MYB1和Be MYB2基因在响应非生物胁迫时发挥重要作用。
- 杨传凤曹颖胡尚连徐刚黄艳龙治坚
- 关键词：慈竹MYB基因生物信息学分析
- 梁山慈竹体细胞突变体特性及分子水平变化被引量：4
- 2015年
- 以同期生长的梁山慈竹体细胞突变体No.29植株和实生植株(对照)为材料,对其茎秆化学成分和光合生理相关指标进行测定,并基于RNA高通量转录组测序结果,对No.29植株的纤维素、木质素等合成有关的基因差异表达进行分析。结果表明,与实生植株相比,No.29植株具有较高的株高、胸径、茎秆的鲜重和干重以及纤维素含量、纤维长度和宽度;纤维素含量比实生植株高12.89%;外方和内方纤维股明显增大;灰分含量、卷曲指数和扭结指数明显降低;但发笋量、木质素含量和细小纤维含量没有明显差异。No.29植株中的Ces A、Su Sy、UDPase基因分别比实生植株上调了117%、205%、115%,转录因子MYB基因表达上调了214%,驱动蛋白基因表达上调了10倍,动力蛋白基因表达上调了760%。No.29植株纤维素含量与纤维形态上明显的改变有其遗传基础,为No.29的进一步研究与利用奠定了基础。
- 周振华胡尚连徐刚曹颖卢学琴龙治坚
- 关键词：梁山慈竹体细胞突变体木质素纤维素基因表达分析
- 低温胁迫下梁山慈竹再生植株叶绿素荧光特性和耐寒转录因子的表达被引量：8
- 2014年
- 以生长期一致的梁山慈竹实生苗(SS)和梁山慈竹种子成熟胚离体诱导愈伤组织获得的再生植株(No.101-1c、No.42-1-B、No.90-3)为材料,分析不同低温胁迫下其叶绿素荧光参数和耐寒相关转录因子表达量的变化,研究低温胁迫对梁山慈竹再生植株耐寒性的影响。结果表明:SS可耐受0℃低温处理,No.90-3仅能耐受4℃低温处理,而No.101-1c和No.42-1-B可以耐受-10℃低温处理,表明不同再生植株对低温胁迫的耐受能力不同,且与实生苗也有明显差异。低温胁迫条件下,SS、No.101-1c与No.90-3的Fv/Fm、Y(Ⅱ)和qP值均下降;No.42-1-B的Y(Ⅱ)值先上升后下降,其Fv/Fm、NPQ和qP则随温度降低而下降。实生苗的WRKY与CBF1基因的表达量降低,MYB基因的表达量上升;再生植株No.90-3和No.42-1-B的MYB、WRKY和CBF1基因的表达量均随温度降低而升高;No.101-1c的WRKY和CBF1基因表达量上升,而MYB表达量下降。相关性分析结果表明:实生苗中WRKY和CBF1的表达量与Y(Ⅱ)的值呈显著的正相关关系;No.101-1c中MYB的表达量与Y(Ⅱ)的值呈显著的正相关关系,而WRKY和CBF1的表达量与NPQ的值呈显著的负相关关系;No.42-1-B中WRKY的表达量与qP的值呈显著的负相关关系。
- 陈容张丽曹颖卢学琴胡尚连段宁
- 关键词：梁山慈竹再生植株低温胁迫叶绿素荧光参数转录因子
- 梁山慈竹(Dendrocalamus farinosus)体细胞突变体No.30生物量及品质特性分析被引量：4
- 2015年
- 本试验对梁山慈竹体细胞突变体No.30的生物量以及品质特性,如纤维素含量、木质素含量和纤维形态等相关指标进行了研究。结果表明,与同龄的实生苗相比,No.30突变体具有生物量大、纤维素含量高、纤维长和长宽比大等特性。尽管No.30突变体中木质素含量也有升高,但木质素组成S/G值并没有明显改变,表明木质素脱除的难易程度并未受影响。基因表达分析表明,在No.30突变体中,纤维素生物合成途径中的Ces A和木质素生物合成途径中的Prx基因明显上调,可能与其纤维素和木质素含量的增加密切相关。
- 王身昌胡尚连曹颖徐刚
- 关键词：梁山慈竹体细胞突变体生物量基因表达
- 毛竹NAC转录因子家族生物信息学分析被引量：43
- 2015年
- NAC转录因子是植物特有的一类转录因子,在植物对非生物胁迫、激素信号应答以及器官形成中发挥重要作用。到目前为止,毛竹NAC转录因子很少被研究,为进一步研究毛竹NAC转录因子家族,本研究利用生物信息学方法,对125条毛竹NAC蛋白序列的系统发生、氨基酸组成、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析。系统进化树分析结果表明,125条毛竹NAC蛋白被划分为17个亚族,毛竹NAC结构域中包含8个保守的NAM基序,主要分布在N端的。不同亚族的毛竹NAC蛋白在氨基酸数目以及氨基酸序列间的疏水性存在一定的差异,二级结构主要由随机卷曲构成,α-螺旋和β-转角在所有毛竹NAC蛋白中均有分布,且在各亚族中没有明显的差异。125条毛竹NAC蛋白的三级结构绝大部分相似。本研究结果为毛竹NAC基因家族功能的进一步研究提供了理论依据。
- 黎帮勇胡尚连曹颖徐刚
- 关键词：毛竹生物信息学
