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国家自然科学基金(602340220)
作品数:
3
被引量:7
H指数:2
相关作者:
阮晓钢
王金莲
李晓明
李颖新
刘全金
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相关机构:
北京工业大学
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发文基金:
国家自然科学基金
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刘全金
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李晓明
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北京工业大学...
年份
1篇
2008
1篇
2007
1篇
2004
共
3
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基于肿瘤基因表达谱的基因功能模块识别
2007年
为了揭示肿瘤发生发展的分子机制,结合基因功能分类体系数据库(gene ontology,简称GO),采用网络分解算法对结肠癌基因表达谱数据进行了研究.研究结果表明,与结肠正常组织基因模块相比,结肠癌基因模块与细胞周期调节、抗细胞程序性死亡、信号转导、细胞增殖等功能类相关,由此推论结肠癌基因功能模块结构的改变导致了结肠癌的发生.
阮晓钢
王金莲
关键词:
肿瘤
结肠癌
多发性骨髓瘤基因表达谱分析
被引量:3
2004年
为了依据肿瘤基因表达谱数据提取出其中蕴含的样本分类规则,以多发性骨髓瘤的基因表达谱为例,提出了一种在基因表达数据中提取分类特征规则的方法.该方法从统计学角度出发,以基因与样本类别问的相关系数作为衡量属性包含样本分类信息量的标准,并利用神经网络进行属性规约找出分类特征属性集,最后利用决策树进行知识提取,给出样本分类的产生式规则.实验结果表明,所提取出的3条规则对实验样本正确分类率达到100%.
李颖新
刘全金
阮晓钢
关键词:
神经网络
决策树
基因表达谱
多发性骨髓瘤
边介数聚类算法在肿瘤基因表达谱中的应用
被引量:4
2008年
基于肿瘤基因表达谱研究了肿瘤相关基因及其功能模块的聚类算法,同时利用模块度评价了算法的有效性.通过与层次聚类算法的比较,证明边介数聚类算法在肿瘤基因功能模块聚类方面具有一定的有效性和实用性.以人结肠癌基因表达谱为研究对象,应用边介数聚类算法将158个从2万多个原始数据中提取的特征基因聚成7种功能类.通过GO数据库检索进一步证明这7类基因具有明确的生物学功能和意义.
阮晓钢
李晓明
王金莲
关键词:
聚类算法
模块度
结肠癌
基因表达谱
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