国家重点基础研究发展计划(2009ZX09301-010)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 相关作者：樊宁宁王孝伟刘俊义盛涛曹源源更多>>
- 相关机构：北京大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- S-DABO类非核苷类逆转录酶抑制剂分子对接及Field-Based QSAR研究（英文）被引量：1
- 2017年
- HIV-1逆转录酶抑制剂是鸡尾酒疗法,即高效抗逆转录病毒治疗的主要组成成分,S-DABO系列化合物及其类似骨架对HIV-1逆转录酶表现出良好的抑制活性。本文基于公共骨架叠合的方法生成了基于场的三维定量构效关系模型(Field-based QSAR model),并通过高斯立体场、静电场、疏水场、氢键供体场、氢键受体场和芳环场来表征。对应的统计学参数训练集交叉验证相关系数R_(CV)~2为0.5949,相关系数R^2为0.8421,测试集Q^2为0.5486,测试集相关系数Pearson-r为0.7460。通过分子对接,分子结合口袋分析以及三维等势图分析,我们得到了关键的药效基团与相互作用:(i)化合物与氨基酸残基Tyr181,Tyr188,Trp229存在π-π相互作用,与His236之间存在σ-π相互作用;(ii)化合物与Lys101之间存在氢键,与Tyr188之间存在卤键。对接分析和Field-based QSAR模型可以为新型HIV-1逆转录酶抑制剂的设计提供借鉴和帮助。
- 樊宁宁刘振明王孝伟刘俊义
- 关键词：HIV-1逆转录酶分子对接
- 新型吡啶酮类HIV-1双靶点(RT/IN)抑制剂的设计、合成及生物活性评估（英文）被引量：1
- 2017年
- 本文以吡啶酮类逆转录酶抑制剂和二酮酸类(DKA)整合酶抑制剂为先导化合物,选取必要的药效团进行高度整合并对其进行合理优化,设计出的三个系列的HIV-1 RT/IN双靶点抑制剂。采用表面等离子共振(SPR)技术及酶联免疫吸附法对目标化合物分别进行了体外抗HIV-1 RT和IN的生物活性测定。实验结果表明,化合物A2对逆转录酶和整合酶都表现出较好的抑制活性,为深入研究该类化合物作为HIV-1双靶点抑制剂提供了相关信息。
- 杨全志盛涛樊宁宁郝亚萌曹源源郭莹张志丽田超刘俊义王孝伟
- 关键词：逆转录酶整合酶
