甘肃省科技重大专项计划(1102NKDA027)
- 作品数：10 被引量：49H指数：4
- 相关作者：阎萍梁春年郭宪吴晓云裴杰更多>>
- 相关机构：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所兰州大学甘肃农业大学更多>>
- 发文基金：甘肃省科技重大专项计划公益性行业(农业)科研专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 牦牛HORMAD1基因的克隆及生物信息学分析
- 2012年
- 利用分子克隆技术获得了牦牛HORMAD1基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛HORMAD1基因包含一个长度为1 182 bp的开放阅读框,编码393个氨基酸;其编码蛋白属于亲水性蛋白,无明显的信号肽,含有很多个磷酸化位点。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。HORMAD1基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛HORMAD1与黄牛、马和猪等物种的HORMAD1氨基酸遗传距离较近,具有高度相似性。
- 金帅齐社宁阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰褚敏丁学智刘文博吴晓云刘建
- 关键词：牦牛克隆生物信息学分析
- 甘南牦牛GDF-10基因多态与生产性状的相关性分析被引量：10
- 2014年
- 【目的】GDF-10基因又称作骨形成蛋白3b,最早通过骨形成蛋白寡聚核苷酸序列的PCR扩增所得,与骨骼的形成和发育有关。很多研究已经表明GDF-10基因在骨骼的形态变化过程中发挥着重要作用。本实验通过研究甘南牦牛GDF-10基因多态性与生产性状间的相关性,证明GDF-10基因与骨骼发育的相关性,发现与牦牛生产性状相关的分子标记,为加快牦牛选育进程,提高牦牛生产性能提供参考。【方法】以298头甘南牦牛血样为材料,随机选取其中的30个DNA样混合组成DNA池,设计9对引物对GDF-10基因外显子1,2和3进行扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶回收后测序。运用BLAST和Chromas软件通过测序峰图找出突变位点,然后采用高分辨率熔解曲线分析技术(high resolution melting curve,HRM)进行基因型分型和统计等位基因频率。采用SHEsis和PHASE软件对GDF-10基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS17.0进行基因多态位点与生产性状关联性分析。【结果】检测到甘南牦牛GDF-10基因外显子3的3个多态位点12116(G/A)、12152(C/T)、和13041(T/C)。群体遗传学分析显示,3个多态位点均表现为低度多态(PIC<0.25);2检验表明牦牛群体在13041(T/C)位点未达到Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),其它两个多态位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);多态位点配对连锁不平衡分析发现,三个突变位点之间存在弱连锁平衡;关联分析表明,甘南牦牛GDF-10基因不同突变位点的基因型与体斜长、体高、胸围、体重差异显著或极显著(P<0.05或P<0.001),与管围差异不显著(P>0.05);单倍型分析后在群体中发现了7种单倍型组合,其中ATC和ATT组合与牦牛的体尺性状和体重显著相关。【结论】甘南牦牛GDF-10基因3个多态位点和两个单倍型组合与牦牛的体高、体长、体重和胸围显著相关,可以尝试作为牦牛生产性状的候选分子标记,为牦牛遗传资源的保护、开
- 李天科梁春年郎侠裴杰吴晓云褚敏秦文阎萍
- 关键词：牦牛单倍型生产性状
- 天祝白牦牛GDF-10基因CDS区的多态性及生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 采用DNA混合池测序法检测天祝白牦牛生长分化因子-10(Growth differentiation factor 10,GDF-10)基因编码区的多态性,应用生物信息学方法分析天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质特性。结果表明,天祝白牦牛生长分化因子-10基因编码区序列存在8个突变位点,其中90C→G、124C→G、1005G→A和1232G→C为错义突变,导致了编码氨基酸的改变,132T→C、822A→G、873G→T和888T→C为同义突变;天祝白牦牛生长分化因子-10编码蛋白质的氨基酸序列没有明显的疏水性区域和跨膜螺旋区;其存在信号肽,说明可能在细胞质中发挥生物学作用;天祝白牦牛生长分化因子-10编码产物二级结构是以α-螺旋和β-折叠为主;氨基酸序列与普通牛的同源性为99.4%,与人、小鼠、大鼠4个物种间同源性较高。
- 李天科梁春年郎侠裴杰吴晓云刘建秦文阎萍
- 关键词：天祝白牦牛多态性生物信息学分析
- 甘南玛曲夏季牧场欧拉型藏羊牧食行为的研究
- 为了研究夏季牧场草地状况对欧拉型藏羊牧食行为的影响,本试验选取甘肃甘南藏族自治州玛曲县作为研究地点,研究夏季牧场状况对欧拉型藏羊的牧食行为,从理论上探讨欧拉型藏羊牧食行为的变化规律.根据草地植被特征,通过野外调查,调查了...
- 王宏博郎侠丁学智梁春年刘文博阎萍
- 关键词：欧拉型藏羊牧食行为
- 甘南牧区不同处理秸秆饲料营养价值分析被引量：4
- 2015年
- 为了探索甘肃省甘南牧区秸秆饲料最合理的调制方法,尽可能提高秸秆饲料的营养利用价值,针对燕麦草和青稞秸秆两种甘南州利用率不高但又广泛存在的秸秆资源,采用青贮、微贮和氨化等不同的加工方式,研究不同加工方式下秸秆饲料的营养价值变化。结果表明:采用微生物饲料包装袋封装的青贮、氨化和微贮秸秆饲料均有较好的适口性。青贮、氨化和微贮均可提高饲料的粗蛋白含量和饲料的营养利用价值。而采用微生物饲料包装袋封存所加工的秸秆饲料使得加工过程简易化,后续运输饲喂方便化,值得在甘南牧区大力推广。
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- 关键词：氨化微贮
- 牦牛的繁殖特性
- 了解和掌握牦牛生殖生理和繁殖性能，是提高牦牛生产力的重要途径。耗牛在青藏高原严酷的生态地理条件下繁衍，经过漫长的自然和人工选择，形成了不同于其他畜种的独有形态特性、生理特性和遗传特性。
- 阎萍
- 关键词：牦牛生殖生理发情期繁殖性能生理特性
- 南德温杂交肉牛生长分化因子10基因多态性与体尺性状的关联分析被引量：7
- 2014年
- 以98头南德温杂交肉牛血样为材料,随机抽样构建混合DNA池,利用高分辨率熔解曲线分析技术和直接测序法检测生长分化因子10(growth differentiation factor 10,GDF10)基因的序列变异,研究分析GDF10基因的多态性。采用SHEsis和PHASE软件对GDF10基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS 17.0进行基因多态位点和单倍型组合与体尺性状关联性分析。结果显示,南德温杂交肉牛GDF10基因检测到3个多态位点1113(G/A)、9569(G/A)和9628(G/A);关联分析表明,南德温杂交肉牛GDF10基因不同突变位点的基因型与体斜长、体高、胸围和管围差异显著(P<0.05);单倍型分析后在群体中发现8种单倍型组合,其中AAA、GGA与南德温杂交肉牛的体高、体斜长、胸围和管围显著相关(P<0.05)。由此推断,南德温杂交肉牛GDF10基因3个多态位点和2个单倍型组合与体斜长、体高、胸围和管围显著相关,可以作为肉牛生产性状的候选分子标记,为肉牛遗传资源开发与利用提供科学依据。
- 郭宪李天科裴杰包鹏甲秦文阎萍
- 关键词：多态性单倍型体尺性状
- 甘南牦牛繁育技术体系的建立与优化被引量：4
- 2014年
- 为了提高甘南牦牛繁殖效率与供种能力,应用品种选育技术从体形外貌、体质类型、生长发育、繁殖性能、性状遗传和种用价值等方面开展甘南牦牛系统选育,采用优良基因的选优提纯、科学选种选配、纯种繁育、定向培育、科学饲养等措施,建立由甘南牦牛核心群、扩繁群、商品生产群组成的三级繁育技术体系。结果表明:通过甘南牦牛繁育技术体系的建立与优化,选育核心群成年公牦牛平均体高、体斜长、胸围和体重分别增加了5.2 cm、7.4 cm、16.3 cm、19.2 kg,成年母牦牛平均体高、体斜长、胸围和体重分别增加了3.9 cm、5.8 cm、13.7 cm、14.5 kg,犊牛繁殖成活率提高了9.5%。
- 郭宪阎萍杨勤梁春年喻传林
- 关键词：甘南牦牛核心群
- 牦牛卵母细胞及体外受精胚胎早期发育基因差异表达的研究被引量：2
- 2013年
- 旨在了解牦牛卵母细胞、早期胚胎不同发育阶段相关基因mRNA表达规律,为早期胚胎发育基因表达的调控机制提供分子依据。应用mRNA差异显示技术选取表达量存在差异的基因条带,进行测序和同源性分析,并利用RT-PCR技术检测差异基因在卵母细胞、2-细胞、8-细胞和囊胚中的相对表达水平。结果表明:4条差异条带中,除桑椹胚期1个基因在GenBank中未检测到同源性外,其余3个基因分别与锌指MYND11(ZMYND11)、核小体组装蛋白1样1(NAP1L1)、核糖体蛋白L27(RPL27A)高度同源。ZMYND11基因在成熟卵母细胞、2-细胞、8-细胞、囊胚阶段其表达量呈上升趋势,但无显著性差异。NAP1L1基因在成熟卵母细胞、2-细胞、囊胚阶段其表达量相对较低,而在8-细胞表达量急剧升高(P<0.05)。RPL27A基因从成熟卵母细胞经2-细胞到8-细胞随胚胎发育进程表达量逐渐降低,到囊胚期表达量显著升高(P<0.05)。基因ZMYND11、RPL27A和NAP1L1在牦牛卵母细胞和早期胚胎发育过程中mRNA表达量存在时间性差异,可能与早期胚胎的正常发育及不同的生理活动有关。
- 郭宪丁学智王宏博包鹏甲阎萍
- 关键词：牦牛早期胚胎
- 牦牛Ihh基因组织表达分析、SNP检测及其基因型组合与生产性状的关联分析被引量：7
- 2015年
- 为了研究牦牛Ihh基因多态位点基因型组合与生产性状间的相关性,发现与牦牛生产性状相关的分子标记,同时进一步研究Ihh基因在牦牛和黄牛各个组织的分布和表达,试验采用高分辨率熔解曲线分析技术(High resolution melting curve,HRM)进行基因型分型和统计等位基因频率,同时,运用荧光定量PCR分析Ihh基因在牦牛和黄牛不同器官的表达差异。试验结果表明,Ihh基因在牦牛和黄牛的所有组织中均表达。然后采用SHEsis和PHASE软件对Ihh基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS17.0进行多态位点单倍型组合与生产性状关联性分析。结果检测到牦牛Ihh基因外显子3的2个多态位点5855(C/T)和6383(G/A)。群体遗传学分析显示,2个多态位点均表现为高度多态(PIC>0.25);χ2检验表明,甘南牦牛和大通牦牛群体在两个突变位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而天祝牦牛在2个突变位点处未达到Hardy-Weinberg平衡(P<0.05);多态位点配对连锁不平衡分析发现,2个突变位点之间存在强连锁平衡,有4种单倍型组合;基因型组合主要发现了3种。关联分析表明,Ihh基因2个突变位点的3种基因型组合对牦牛体斜长、体高、胸围、管围和体重有显著差异(P<0.05),具有CTGA基因型组合的牦牛个体在体斜长、体高、胸围、管围和体重方面显著高于CCGG和TTAA型(P<0.05)。因此,综上推断Ihh基因基因型组合与牦牛体斜长、体高、胸围、管围和体重存在相关性。
- 李天科赵娟花裴杰梁春年郭宪秦文阎萍
- 关键词：牦牛高分辨率熔解曲线生产性状荧光定量
