广州市医药卫生科技项目(2006YB137)
- 作品数：5 被引量：15H指数：2
- 相关作者：胡玉山刘俊华邓志爱庞杏林陈守义更多>>
- 相关机构：广州市疾病预防控制中心中山大学南方医科大学更多>>
- 发文基金：广州市医药卫生科技项目广州市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 猪链球菌2型多重PCR鉴定方法建立被引量：4
- 2009年
- 目的建立猪链球菌2型多重PCR鉴定方法。方法根据猪链球菌种特异基因16S rRNA序列和猪链球菌2型特异性荚膜多糖编码基因cps2 J基因序列,设计和合成2对特异引物,通过条件和体系优化,建立多重PCR检测方法。结果猪链球菌2型参考株及18株分离株均扩增到清晰的目的条带,而6株非猪链球菌2型参考菌株不能扩增出目的条带。结论多重PCR可以用于猪链球菌2型检测,特异性和敏感性好,为该病的快速诊断和分子流行病学调查提供了新的技术方法。
- 胡玉山刘俊华庞杏林候水平邓志爱陈守义
- 关键词：猪链球菌2型多重PCR
- 沙门菌grOEL基因序列在系统发育分析和PCR-限制性片段多态性分析鉴定中的应用
- 2009年
- 目的探讨grOEL基因序列在沙门菌进化分析和分型鉴定中的应用。方法对8种血清群的沙门菌菌株进行PCR扩增、测序,然后用分子生物学软件Bioedit与DNAstar进行序列分析,同时用PCR-限制性片段多态性分析(RFLP)技术进行分型鉴定。结果8种沙门菌血清群grOEL基因保守序列与变异序列呈锯齿状排列,其grOEL氨基酸系统发育树与grOEL基因系统发育树结果不完全相同,但O8、O9、O10之间亲缘关系最近,PCR-RFLP分析有5种模式图。结论grOEL基因序列在沙门菌系统发育中可作为遗传标记,同时也可作为分型鉴定的靶序列。
- 胡玉山刘俊华庞杏林陈守义陈晓光
- 关键词：GROEL系统发育
- PCR-RFLP与特异引物PCR对副溶血性弧菌进行分型鉴定探讨被引量：2
- 2008年
- 目的:探讨在流行病学溯源方面,运用PCR-RFLP与特异引物PCR对副溶血性弧菌进行分型鉴定的可行性。方法:选择副溶血性弧菌核糖体基因16SrRNA序列进行PCR-RFLP分析、保守核糖体基因间隔序列16-23SrRNA(RS)和肠道细菌重复内显子保守序列(ERIC)进行特异引物PCR分析。结果:16SrRNA PCR-RFLP分析有4种模式图,RS-PCR分析有3种模式图,ERIC-PCR分析有10种模式图。结论:PCR-RFLP与特异引物PCR可以对副溶血性弧菌进行快速分子分型鉴定,有利于流行病学溯源。
- 胡玉山郑桂丽胡肖娟刘俊华庞杏林邓志爱陈守义
- 关键词：副溶血性弧菌
- 沙门菌invA基因荧光定量PCR检测被引量：7
- 2009年
- 胡玉山胡肖娟刘俊华庞杏林邓志爱陈守义
- 关键词：沙门菌探针荧光定量PCR
- hsp60基因序列分析及其在病原菌鉴定中的应用被引量：2
- 2007年
- 目的研究致病菌hsp60基因序列的差异性,为建立致病菌快速鉴定方法及为其他研究提供科学依据。方法在GenBank中查找所需hsp60基因序列,运用分子生物学软件Primer5.0和Oligo6.0设计合适的通用简并引物,采用合适的扩增条件扩增常见致病菌hsp60基因片段。利用分子生物信息学分析hspp60基因序列的保守性、变异性及菌株间种系进化关系。结果可扩增出常见致病菌hsp60基因片段,序列比较研究显示hsp60基因序列保守与变异并存,保守区与变异区呈"锯齿状"分布。种系进化关系同16S rRNA、23S rRNA分析结果一致。结论hsp60基因序列分布特点为建立致病菌的分子生物学快速鉴别诊断方法如基因芯片研制等提供了可靠的科学依据和重要的实验基础。
- 胡玉山王鸣杜琳莫自耀邓志爱刘俊华林云万江丽芳
- 关键词：HSP60同源性系统发育
