湖北省教育厅优秀中青年人才项目(Q200626001) 作品数:11 被引量:29 H指数:4 相关作者: 李建华 杨明生 徐宁迎 母昌考 吕帮玉 更多>> 相关机构: 孝感学院 浙江大学 四川农业大学 更多>> 发文基金: 湖北省教育厅优秀中青年人才项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
猪ME1基因3'UTR单核苷酸多态性对肉质性状的影响 被引量:7 2008年 采用PCR-SSCP技术分析了猪苹果酸酶1(ME1)基因3′UTR在杜洛克(Duroc)、长白猪(Lan-drace)、皮特兰(Pietrain)、金华猪(Jianhua)和野猪(wild boar)中的多态性,在猪苹果酸酶1基因3′UTR长298bp的序列中发现3处突变(C138T、G194T和A239C),它们组成3种基因型(CC GG AA、CT GT AC和TT TT CC),2χ独立性检验结果表明这3种基因型在各品种间差异显著(P<0.05)。对金华×皮特兰F2资源家系猪进行了该多态片段的基因型鉴定,并分析了不同基因型对猪肉质性状的遗传效应。结果显示,在眼肌pH45、腿臀肌肉pH45以及肌内脂肪含量这3个指标上,TT TT CC基因型猪分别比CC GGAA基因型猪高0.19%、0.17%和0.79%,差异显著(P<0.05)。 李建华 胡衍刚 徐宁迎关键词:PCR-SSCP 肉质性状 Polymorphism of Intron 14 of Porcine CACNA2D1 Gene and Effects on Muscular pH_(45) 2009年 [ Objective] To detect polymorphism of intron 14 of porcine CACNA2Dt gene and thus provide conditions for the marker-assisted selec- tion of pork quality traits. [Method] The polymorphism of the exon 14 and intron 14 of porcine CACNA2D1 gene was detected in six breeds by PCR- SSCP. The genetic effects of different genotypes on the pH45 value of eye muscle and ham joint muscle were also analyzed. I-Result] There were three kinds of genotypes, namely, AA, AG and GG, in the intron 14 of porcine CACNA2 DI gene. The polymorphic locus ( G --~ A) was at the 1 145 nt of the sequence (GenBank Accepted No. FJ156361 ). The results of X2 test showed that the distribution of these three kinds of genotypes was significantly different in the six breeds (P〈0.05). The pH45 values of eye muscle and ham joint muscle were significantly different between geno- type AA and genotype AG of pigs in F2 generation from the Jianhua x Pietrain resource family ( P 〈 0.05). [Conclusion ] The polymorphism of the in- tron 14 of porcine CACNA2D1 gene has effects on the pH45 values of eye muscle and ham joint muscle. 李建华 吕帮玉 杨明生关键词:PIG PCR-SSCP CACNA2D1基因第14内含子的多态性及其对猪肌肉pH_(45)的影响 2009年 [目的]检测猪CACNA2D1基因第14内含子的多态性,为猪肉质性状的分子标记辅助选择提供条件。[方法]采用PCR-SSCP检测猪CACNA2D1基因第14外显子和内含子在6个猪群中的DNA多态性,并分析不同基因型对猪眼肌和腿臀肌肉pH45的遗传效应。[结果]猪CACNA2D1基因第14内含子有3种基因型,即AA、AG和GG,在其序列(GenBank接受号:FJ156361)的1 145位碱基存在1个多态位点(G→A)。2χ独立性检验结果表明,这3种基因型在各猪群间的分布差异显著(P<0.05)。AA基因型金华×皮特兰F2资源家系猪与AG基因型猪在眼肌和腿臀肌肉pH45值上的差异显著(P<0.05)。[结论]猪CACNA2D1基因第14内含子的多态性影响猪眼肌和腿臀肌pH45值。 李建华 吕帮玉 杨明生雌禽就巢行为的调控 2009年 阐述了雌禽就巢行为产生的机理,介绍了调控雌禽就巢行为的4种方法:遗传调控法、环境调控法、免疫调控法和药物调控法,并展望了雌禽就巢行为研究的前景。 李建华关键词:就巢行为 动物CACNA2D1基因进化遗传研究 2008年 [目的]评估该基因在进化遗传中所受到的选择作用,揭示该基因的结构特征和保守性,为进一步研究该基因的功能奠定基础。[方法]参照NCBI数据库上发表的6种动物CACNA2D1基因编码序列,利用常规生物学软件,对动物CACNA2D1基因进行进化遗传分析。[结果]这6个动物的CACNA2D1基因序列核苷酸组成基本相同,其平均GC含量为42%,偏倚不严重,这6条同源序列的ENC值在50.319-53.624,CACNA2D1基因在密码子的使用上存在轻度偏倚,该基因各同源基因间的同义和非同义替换率之比不同,且变化范围较大,该基因在进化过程中极为保守且经历了净化选择。[结论]CACNA2D1基因可能是影响动物生长发育的重要候选基因,具有较高的研究价值。 李建华 戴余军 杨明生 母昌考猪CACNA2D1基因3′UTR单核苷酸多态性与肉质性状的效应研究 被引量:5 2007年 CACNA2D1基因定位在猪的第9号染色体上,其位置与影响肉质性状的QTL重叠,可作为肉质性状的候选基因。采用PCR-SSCP技术,对160头金华×皮特兰资源家系F2猪CACNA2D1基因3′端非翻译区片段进行扩增分型,共产生2种等位基因,3种基因型。通过测序发现,在CACNA2D1基因3′端非翻译区(序列DQ981407)有一单核苷酸替换(C→A)。对不同标记基因型与肉质性状的最小二乘分析表明,AA基因型猪大腿肌肉的pH45值、大腿肌肉导电率和肌内脂肪含量的最小二乘均数比BB基因型分别高0.169,0.26和0.021,差异显著(P<0.05);A等位基因的加性效应分别为0.084 5,0.133 5和0.010 5。 李建华 杨明生 徐宁迎关键词:PCR-SSCP 肉质 CBG基因外显子Ⅱ SNPs对猪背膘厚和肌肉颜色的影响 2009年 本试验采用PCR—SSCP检测方法研究猪CBG基因外显子Ⅱ在金华×皮特兰F2资源家系猪群中的DNA多态性,发现了3种基因型(GGCC、GGCG和AAGG)。对纯合子个体测序检测,发现在CBG基因第二外显子内存在2个多态位点(G149A和G157C),其中G149A位点的单核苷酸替换导致CBG基因相应位置编码的氨基酸发生变化,由缬氨酸(Val)变为异亮氨酸(Ⅱe)。对金华×皮特兰F2资源家系猪进行了该多态片段的基因型鉴定,并分析了不同基因型对猪背膘厚和肌肉颜色的遗传效应,结果显示:GGCC基因型猪的6—7肋骨背膘厚以及a^*值分别比AAGG基因型猪的高0.31cm和0.73cm,差异显著(P〈0.05);GGCC基因型猪的b^*值分别比AAGG基因型和GGCG基因型猪的高0.66和0.93,差异显著(P〈0.05);GGCG基因型猪的c^*值分别比GGCC基因型和AAGG基因型猪的高6.57和7.40,差异显著(P〈0.05);GGCC基因型猪的h^*值比AAGG基因型猪的低4.58,差异显著(P〈0.05)。 李建华 母昌考 徐宁迎关键词:背膘厚 肉色 猪CACNA2D1基因定位及与相关遗传图谱的整合分析 被引量:4 2008年 【目的】定位猪CACNA2D1基因并分析该基因是否可作为影响猪某些生产性状的候选基因。【方法】扩增并测定猪CACNA2D1基因的部分序列,运用辐射杂种细胞系对其进行定位并将定位结果与相关遗传图谱进行整合分析。【结果】将猪cAcNA2D1基因定位在猪9号染色体79.3~86.7cM的位置上,发现在cACNA2D1基因定位区域有3个分别影响母猪发情期排卵数、胴体肩胛重以及10周龄体重的QTL,在定位区域附近有影响猪屠宰24h后肌肉pH值的QTL。【结论】猪CACNA2D1基因可作为猪繁殖性状、胴体性状、生长性状甚至肉质性状的候选基因进行进一步的研究。 李建华 杨明生 徐宁迎关键词:基因定位 候选基因 动物CACNA2D1基因研究进展 被引量:2 2008年 CACNA2D1基因是编码动物L-型钙离子通道2αδ1亚基的基因。有研究表明,CACNA2D1基因可影响钙离子通道钙流的性质,其单核苷酸变异与某些疾病有关。综述了CACNA2D1基因在生物学特性、染色体上的位置、基本功能、表达调控及其单核苷酸多态性与疾病的关系等方面的最新研究成果。 李建华 杨明生 母昌考 徐宁迎关键词:L-型钙离子通道 猪HGD基因第14外显子单核苷酸多态性与胴体和肉质性状的关系 被引量:4 2008年 【目的】研究猪HGD基因第14外显子单核苷酸多态性对猪胴体和肉质性状的遗传效应。【方法】以金华×皮特兰资源家系F2代猪为研究材料,用PCR-SSCP方法检测猪HGD基因第14外显子的多态片段,并分析了猪HGD基因型间胴体和肉质性状的差异。【结果】发现了3种基因型(CC、CT和TT)。对纯合子个体测序检测发现,在猪HGD基因第14外显子序列EF011080 143 bp处存在C→T的单核苷酸变异,这一变异导致相应的蛋白质序列中脯氨酸(Pro)到丝氨酸(Ser)的替换。在试验猪群中,等位基因C的频率比等位基因T高,为78.3%;CC基因型个体占多数,达67.3%;适合性χ2检验表明,该座位在金华×皮特兰资源家系F2代猪群体中处于非遗传平衡状态。CT基因型猪腿臀重分别较CC和TT基因型猪高0.33和0.45 kg(P<0.05);CT基因型猪臀背膘厚、眼肌面积、肌肉粗蛋白含量和眼肌电导率分别较CC基因型猪高0.31 cm,3.29 cm2,0.73%和1.38(P<0.05);CT基因型猪的眼肌pH45、腿臀肌肉pH45和腿臀肌温度分别较CC基因型猪低0.26,0.23和1.21℃(P<0.05)。【结论】HGD基因可能是影响猪胴体、肉质性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因。 李建华 杨明生 徐宁迎关键词:PCR-SSCP 肉质性状 胴体性状