国家高技术研究发展计划(2006AA10A404)
- 作品数：38 被引量：482H指数：13
- 相关作者：张培军尤锋陈松林李军田永胜更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所中国科学院中国海洋大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 半滑舌鳎雌鱼基因组Fosmid文库构建及分析被引量：6
- 2010年
- 半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）是我国的大型经济鱼类,其养殖发展迅速。有关半滑舌鳎的基因组文库构建和分析等方面的研究,目前尚未见报道。用流式细胞仪检测雌性半滑舌鳎基因组大小。从半滑舌鳎雌鱼肌肉提取基因组DNA,选取大小合适的DNA片段,经末端修复并回收后,再以Fosmid作为载体,构建半滑舌鳎雌鱼基因组文库。经检测,雌性半滑舌鳎基因组大小约为606.36 Mb。所构建的Fosmid文库含有49 920个克隆,重组率为96.88%;插入片段长度分布在33-45 kb之间,平均为39.2 kb;覆盖雌性半滑舌鳎基因组3.12倍;从文库中筛选得到单拷贝DNA序列的概率为95.6%。对培养第1天和第6天的克隆进行比较,结果表明文库稳定性高,培养过程中没有发生变化。
- 孙晓华张全启王旭波翟腾齐洁王志刚王兴莲王亚楠
- 关键词：半滑舌鳎雌鱼FOSMID文库基因组大小
- 大菱鲆早期发育过程中免疫器官的发生被引量：8
- 2011年
- 应用组织切片研究了大菱鲆(Scophthalmus maximus)初孵仔鱼至60日龄幼鱼免疫器官的发育过程。结果表明,免疫器官原基出现的先后顺序是头肾、脾脏和胸腺。1日龄仔鱼可以观察到头肾原基,包含未分化的造血干细胞。5日龄时,脾脏原基出现,其淋巴化开始于27日龄且发育速度较慢。13日龄时,大菱鲆仔鱼胸腺原基出现,且发育速度较快,分为外区和内区。在大菱鲆早期发育过程中,胸腺和头肾之间出现细胞迁移现象。免疫器官淋巴化的顺序是胸腺、头肾和脾脏。在免疫器官发育后期,脾脏和头肾中均发现了黑色素-巨噬细胞中心(MMCs),脾脏中较丰富,但在胸腺中尚未发现。在大菱鲆仔鱼早期发育阶段,免疫器官尚未发育完善,非特异性防御机制起着重要的免疫作用。
- 佟雪红徐世宏刘清华李军肖志忠马道远
- 关键词：早期发育阶段免疫器官组织学
- 条斑星鲽幼鱼变态期间核酸及蛋白的变化被引量：4
- 2010年
- 本试验测定了条斑星鲽(Verasper moseri)幼鱼变态过程中DNA、RNA、蛋白及其比值的变化,作为评价幼鱼变态阶段生长潜能的指标。结果表明,试验期间培育水温为16.5～18.0°C,DNA、RNA及蛋白的变化都带有发育阶段特异性。DNA含量在34～42日龄增加缓慢,然后快速增加直至44日龄,在45日龄和46日龄分别保持下降和上升趋势。蛋白含量和RNA含量的变化趋势相似,在试验期间保持快速增长的趋势。RNA/DNA比值从试验开始至35日龄呈上升状态,36日龄时下降,38日龄时达到最高值5.01,然后显著下降(P<0.05),在试验结束时达到最低值1.76。蛋白/DNA在40日龄时达到最高值58.64,在46日龄时达到最低值21.28。RNA、DNA及蛋白含量跟全长和体质量有明显的线性关系(P<0.05)。RNA/DNA与全长和体质量的关系比蛋白/DNA与全长和体质量的关系密切。蛋白/DNA比值的变化趋势跟RNA/DNA比值类似,但前者的变化滞后于后者,表明RNA/DNA比值是评价条斑星鲽生理状况的更有效的生理指标。
- 佟雪红徐世宏刘清华李军肖志忠马道远
- 关键词：幼鱼DNARNA蛋白
- 3月龄牙鲆形态性状对体质量的通径分析被引量：54
- 2010年
- 随机选取3月龄牙鲆Paralichthys olivaceus100尾,分别测量全长(X1)、体长(X2)、头长(X3)、体厚(X4)和体高(X5)共5个形态学指标和体质量(Y)。通过SAS软件进行相关性分析和回归分析,分别计算以形态性状为自变量对体质量的通径系数和决定系数,进而对各性状对体质量的影响进行剖分。明确影响3月龄牙鲆体质量的主要形态性状,为牙鲆选育提供数据支持和理想的测度指标。结果表明,各形态性状间及与体质量的相关系数均达到极显著(P<0.01)。体长、体厚和体高对体质量的通径系数均达到极显著的水平(P<0.01);所选形态性状对体质量的决定系数R2=0.945,表明所选形态性状是影响3月龄牙鲆体质量的主要性状。通过对各形态性状偏回归系数的显著性检验,剔除不显著的性状自变量后,建立最优的多元回归方程:Y=-4.988+0.763X2+2.997X+1.089X,各偏回归系数均达到极显著水平(P<0.01)。
- 严福升王志刚刘旭东刘志鹏张全启
- 关键词：牙鲆形态性状通径分析
- 8种鲆鲽鱼种间遗传距离与杂交亲和性的相关性分析被引量：9
- 2010年
- 2005-2008年,先后进行了褐牙鲆♀×夏牙鲆♂、褐牙鲆♀×石鲽♂、褐牙鲆♀×条斑星鲽♂、褐牙鲆♀×大菱鲆♂、大菱鲆♀×条斑星鲽♂的正反交试验,并收集了文献报道的研究资料,包括条斑星鲽×圆斑星鲽、石鲽×星斑川鲽、夏牙鲆×漠斑牙鲆及褐牙鲆×圆斑星鲽的正反交试验结果,对所涉及的8种鲆鲽鱼远缘杂交亲和性进行分析。根据Russell对杂交亲和性的定义,正反交均可行,杂交适合度为1;正反交单向可行,杂交适合度为0.5,正反交均不可行,杂交适合度为0。同时,根据这8种鲆鲽鱼的16S rDNA和COⅠ基因部分序列的差异,估算其种间遗传距离。对8种鲆鲽鱼的种间遗传距离和杂交适合度作相关性分析,二者呈线性负相关(R2=0.81,P<0.01),即杂交的亲和性随种间遗传距离增大而降低。研究表明,鲆鲽鱼的杂交亲和性与其遗传分化程度具有相关性,可以通过种间遗传距离对鲆鲽鱼远缘杂交的亲和性进行预测。
- 徐冬冬尤锋楼宝李军许建和吴志昊张培军
- 关键词：杂交亲和性RDNA
- 大菱鲆幼鱼表型形态性状与体重之间的关系被引量：122
- 2008年
- 随机选取1120尾3月龄大菱鲆幼鱼,测量其体长、全长、体高、头长、吻尖至鳃裂前缘长、尾柄长、尾柄高、体厚、体重等9个性状,计算各性状间的相关系数,采用通径分析方法计算以表型形态性状为自变量对体重作依变量的通径系数、决定系数及复相关指数,对各性状的影响大小进行剖分,明确影响大菱鲆三月龄幼鱼体重的主要外部形态性状,为大菱鲆选育提供理论依据和理想的测度指标。结果表明:所测各表型性状与体重之间的相关系数均达到极其显著水平(P<0.01);全长对体重的直接影响(R=0.702)最大,对体重的决定程度(R2=51.84%)最高,是影响体重的主要因素;体高、体厚对体重的直接作用(0.211,0.094)相对较小,主要通过体长的间接作用(0.5558,0.4342)影响体重。所选表型性状对体重的回归系数R2=0.911,表明所选性状是影响体重的主要性状。利用逐步回归分析方法建立以体长、体高、体厚为自变量估计体重的多元回归回归方程为:y=-6.216+1.294x1+0.518x2+1.293x3。
- 王新安马爱军许可雷霁霖杨志曲江波
- 关键词：大菱鲆形态性状体重通径分析
- 牙鲆回交、全同胞近交及其亲本家系的微卫星研究被引量：3
- 2011年
- 应用10对微卫星引物对2007年建立的抗病家系之一（将其定义为亲本家系）及其回交家系和全同胞近交家系进行分析,结果发现10个位点的等位基因数为1.7~3.0,平均等位基因数为2.3,有效等位基因数为1.553 2~2.887 8,平均有效等位基因数为2.054 1,杂合度观测值为0.307 0~0.664 8,平均杂合度观测值为0.487 0,无偏期望杂合度值为0.200 0~0.606 8,平均无偏期望杂合度值为0.606 8,多态信息含量为0.233 4~0.579 4,平均多态信息含量为0.399 5,3个家系均为中度多态,多态信息含量从大到小依次为：亲本家系、回交家系、全同胞近交家系,其中Poli194TUF位点在全同胞近交家系中发生纯合。家系间的遗传分化系数为0.067 1,表明遗传变异有6.71%来自于家系间,家系间分化较低。根据家系间的遗传距离,利用UPGMA法进行聚类,亲本家系和全同胞近交家系聚为一类。全同胞近交家系纯化基因速率较快,适合牙鲆品系的快速建立。
- 王磊王磊陈松林田永胜
- 关键词：牙鲆家系回交近交微卫星
- 牙鲆鳃细胞系染色体组型的变异分析被引量：3
- 2008年
- 对传代296次的牙鲆（Paralichthys olivaceus）鳃细胞系（FG）进行染色体制备和组型分析，并与牙鲆活体鳃细胞组型进行比较。牙鲆活体鳃细胞染色体数目为48，且均为端部着丝粒染色体，染色体组型公式为2n=48，48t，NF=48。而鳃细胞系的染色体数目出现较大变化，有两个分布区问，一个区间是53～79；另一个是119～139。其模式染色体数为68，在模式细胞分裂相中，有30对端部着丝粒染色体和4对中部着丝粒染色体；染色体条数在119以上的分裂相中，除了有很多中部着丝粒染色体以外，小染色体也以很高的频率出现。通过上述研究分析表明，牙鲆鳃细胞系经多次传代后，其染色体与活体鳃细胞染色体相比存在着明显的差别，已经发生了变异，不适合用于牙鲆染色体核型、组型等方面的研究。[中国水产科学，2008，15（3）：483-487]
- 王旭波张全启齐洁王志刚王兴莲
- 关键词：牙鲆细胞系染色体组型
- 牙鲆dmrt1基因的克隆及其与P450arom基因的组织表达分析被引量：13
- 2010年
- 通过基因组步移和3’RACE获得了牙鲆(Paralichthys olivaceus)dmrt1的cDNA全序列,该基因开放阅读框全长909bp,其编码的蛋白具有高度保守的DM结构域,5’UTR区含有性别相关转录因子Sox9和Sox5的结合位点。牙鲆dmrt1基因只在牙鲆的性腺中表达,且在精巢中的表达明显高于卵巢,表明牙鲆的dmrt1可能是一种性别相关基因。同时,对牙鲆的另一性别相关基因P450arom在成体各组织的表达分析结果表明,该基因除在牙鲆的性腺中有表达外,在肾脏、脾脏、鳃和脑等其他组织中也有不同程度的表达。牙鲆P450arom基因在性腺中的表达也存在两性差异,其表达模式与dmrt1的正好相反,在卵巢中的表达量明显高于精巢。
- 文爱韵尤锋孙鹏徐冬冬吴志昊马得友李军张培军
- 关键词：DMRT1P450AROM
- 牙鲆3个养殖群体遗传结构的微卫星分析被引量：24
- 2009年
- 采用微卫星标记分析技术,用5个多态性的微卫星标记对来自3个不同国家(中国、日本和韩国)的牙鲆养殖群体进行了遗传多样性研究。研究结果表明,3个牙鲆群体平均等位基因在4.8～5.6之间,平均观测杂合度(H0)在0.3917～0.5643之间,平均期望杂合度(HE)在0.5981～0.6264之间。有多个位点在不同的群体中偏离哈代-温伯格平衡。遗传距离分析表明,中国群体与日本群体遗传距离最近,韩国群体与日本群体遗传距离最远。分子方差分析(AMOVA)表明,群体内遗传变异与群体间遗传变异分别占总遗传变异的92.44%和7.56%,固定系数(Fst)为0.0752(P<0.001),表明牙鲆3个养殖群体遗传分化显著。
- 邵长伟廖小林田永胜陈松林
- 关键词：牙鲆养殖群体微卫星标记
