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国家自然科学基金(30621063)

作品数:36 被引量:151H指数:7
相关作者:贺福初王建朱云平钱小红张养军更多>>
相关机构:军事医学科学院国防科学技术大学北京蛋白质组研究中心更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:生物学医药卫生理学天文地球更多>>

文献类型

  • 36篇中文期刊文章

领域

  • 21篇生物学
  • 9篇医药卫生
  • 8篇理学
  • 1篇天文地球
  • 1篇自动化与计算...

主题

  • 16篇蛋白
  • 12篇蛋白质
  • 12篇白质
  • 5篇蛋白质相互作...
  • 5篇蛋白质组
  • 5篇信号
  • 5篇质谱
  • 5篇基因
  • 4篇蛋白质组学
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  • 3篇信号通路
  • 3篇液相
  • 3篇液相色谱
  • 3篇通路
  • 3篇细胞
  • 3篇相互作用
  • 3篇相色谱
  • 2篇蛋白质相互作...
  • 2篇凋亡
  • 2篇调控网络

机构

  • 26篇军事医学科学...
  • 7篇国防科学技术...
  • 4篇北京蛋白质组...
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  • 2篇安徽医科大学
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  • 1篇中国计量科学...
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  • 1篇学研究院

作者

  • 13篇贺福初
  • 10篇王建
  • 9篇朱云平
  • 9篇钱小红
  • 7篇张养军
  • 4篇李栋
  • 4篇秦伟捷
  • 4篇谢红卫
  • 4篇杨晓明
  • 3篇张令强
  • 3篇孙汉昌
  • 3篇张纪阳
  • 2篇吴松锋
  • 2篇张万军
  • 2篇王正华
  • 2篇蔡耘
  • 2篇王晓辉
  • 2篇黄晓碧
  • 2篇刘中扬
  • 2篇贾伟

传媒

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  • 4篇色谱
  • 3篇遗传
  • 2篇分析化学
  • 2篇生物技术通讯
  • 2篇安徽医科大学...
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  • 1篇科学通报
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  • 1篇生命的化学
  • 1篇分析测试学报
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  • 1篇质谱学报
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  • 1篇现代免疫学
  • 1篇中南大学学报...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2012
  • 4篇2011
  • 6篇2010
  • 15篇2009
  • 7篇2008
  • 3篇2007
36 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
基因调控网络的模块化组织研究被引量:4
2008年
基因调控网络表现的是大量基因受到转录因子的调控而最终转录翻译为蛋白质进而实现生物功能的复杂信息,是人们理解生物过程和基因功能的重要内容。为了理解基因调控网络中的调控机理,网络的拓扑结构及其组织方式是极其重要的研究内容之一。它不仅能说明网络的局部特征,并且能揭示调控网络的构造方法,同时还能对调控信号通路进行全面系统的分析。调控网络可分为4层结构:调控元件、Motif、模块和整个网络。当前,这种层次结构受到人们越来越多的认可。文中重点讨论motif和模块两层,比较分析了近年来对网络组织结构的多方面研究内容,阐述了各个研究结果与结论具有的生物学意义,并指出了其中存在的问题。在此基础上,文中还针对这些问题提出了可能存在的研究方向,并展望了基因调控网络模块化组织的研究前景。
王正华刘齐军朱云平
关键词:基因调控网络网络模块模块化组织
应用超高分辨双向凝胶电泳技术进行正常人类肝脏蛋白质组研究被引量:1
2010年
肝脏是人体最大的实质器官,承担着人体许多关键的生理功能,在生命活动中占有重要地位.根据人类肝脏蛋白质组计划,本实验旨在构建人肝脏蛋白质双向凝胶电泳表达谱,尽可能分离和鉴定更多的蛋白.在双向凝胶电泳第一向等电聚焦水平上,从上样方式、水化液配方、聚焦时间等方面优化了碱性蛋白的分离条件,利用超放大胶分离技术搭建了高分辨的双向凝胶电泳分离平台,构建了人类肝脏蛋白质2-DE参考谱,检测到5481个蛋白质点.这是目前国际上最为全面的人体器官蛋白质组2-DE参考谱,为其他肝病的研究提供了较好的参照系.成功鉴定了429个非冗余蛋白,对pH4.0~7.0,5.0~6.0,5.5~6.7,6.0~9.0部分蛋白质点在胶上进行了注释,由此构建了人肝2-DE蛋白质表达谱数据库.对蛋白质的理化性质、功能及亚细胞定位进行了全面分析.研究中构建的人类肝脏蛋白质2-DE图谱将为肝脏比较蛋白质组学研究提供参考.
米薇刘新贾伟李蕾蔡耘应万涛钱小红
关键词:双向凝胶电泳质谱
丙型肝炎病毒非结构蛋白NS2的研究进展被引量:1
2009年
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)是一种严重危害人类健康的病原体,全球感染率约3%,中国普通人群抗HCV阳性率约3.2%。然而,到目前为止,HCV感染还没有有效的治疗方法。近年的研究发现,HCV非结构蛋白NS2在HCV感染中扮演着重要角色,具有许多重要功能。NS2可以在HCV病毒的包装过程中发挥其功能,还可调节宿主细胞的基因表达及凋亡过程。此外,NS2蛋白还可参与NS5A磷酸蛋白的高度磷酸化修饰过程及为感染性HCV病毒粒子产生所必需。本文综述近几年来关于NS2蛋白的研究进展。
龚巧玲王建贺福初
关键词:丙型肝炎病毒细胞周期细胞凋亡
Toward a high resolution 2-DE profile of the normal human liver proteome using ultra-zoom gels被引量:4
2011年
The human liver is the largest organ in the body and has many important physiological functions. A global analysis of human liver proteins is essential for a better understanding of the molecular basis of the normal functions of the liver and of its diseases. As part of the Human Liver Proteome Project (HLPP), the goal of the present study was to visualize and detect as many proteins as possible in normal human livers using two-dimensional gel electrophoresis (2-DE). We have constructed a reference map of the proteins of human normal liver that can be used for the comprehensive analysis of the human liver proteome and other related research. To improve the resolution and enhance the detection of low abundance proteins, we developed and optimized narrow pH range ultra-zoom 2-DE gels. High resolution patterns of human liver in pH gradients 4.5-5.5, 5-6, 5.5-6.7, 6-9 and 6-11 are presented. To improve the poor resolution in the alkaline pH range of 2-DE gels, we optimized the isoelectric focusing protocol by including sample application using cup loading at the anode and incorporating 1.2% hydroxyethyl disulfide, 15% 2-propanol and 5% glycerol in the rehydration buffer. Using the optimized protocol, we obtained reproducibly better resolution in both analytical and preparative 2-DE gels. Compared with the 2386 and 1878 protein spots resolved in the wide range 3-10 and 4-7 pH gradients respectively, we obtained 5481 protein spots from the multiple (overlapping) narrow pH range ultra-zoom gels in the range of pH 4.5-9. The visualized reference map of normal human liver proteins presented in this paper will be valuable for comparative proteomic research of the liver proteome.
MI WeiLIU XinJIA WeiLI LeiCAI YunYING WanTaoQIAN XiaoHong
关键词:蛋白质组计划
蛋白质相互作用调控蛋白质核转运及其功能被引量:1
2008年
蛋白质的核转运是真核生物细胞内发生的重要过程之一,是一大群蛋白质发挥其功能的前提,与细胞正常功能的维持密切相关。蛋白质的核运输通常采用核受体介导的方式进行。此过程非常复杂,需要多种蛋白质的参与,涉及到大量的蛋白质相互作用。本文将综合近年来本领域取得的进展,就蛋白质相互作用参与蛋白质核转运来调节蛋白质的亚细胞定位,进一步在多方面影响细胞以及生物体生理功能的变化进行阐述。
陈斯王建杨晓明
关键词:蛋白质核转运相互作用
胞内接头蛋白TRAFs家族被引量:5
2008年
肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)受体相关因子(receptor-associated factor,TRAF)家族是一类胞内接头蛋白,能介导TNF受体和Toll-like/IL-1受体超家族成员与多种下游信号通路包括NF-κB (nuclear factorκB)和JNK(Jun N-terminal kinase)的信号传导。TRAF蛋白家族参与调控细胞增殖、分化乃至凋亡等生理过程。由于其在信号通路中的关键作用,TRAFs蛋白的失调与多种疾病的发生相关。本文结合最新的研究进展对TRAFs蛋白家族在信号传导通路中的地位进行介绍,并探讨了TRAFs及其相关蛋白在临床上可能的应用前景。
张万巧王建
关键词:TRAF接头蛋白
免疫系统蛋白质相互作用的研究方法被引量:3
2010年
对于相互作用蛋白的研究,有助于了解蛋白在细胞内如何发挥其生理功能。在人类基因组计划草图公布以后,基于蛋白质组学的蛋白谱研究逐渐得到重视,在此背景下,蛋白质相互作用的研究也逐步受到关注。对于蛋白质组学研究范围内所有蛋白质的相互作用的研究,被称作“相互作用组”。相互作用组学研究正在成为继基因组学,蛋白质组学研究之后又一个通往生命奥秘道路上的里程碑。
徐锋唐丽贺福初
关键词:免疫系统蛋白质相互作用研究方法
分离分析技术在蛋白质组学研究中应用的新进展被引量:9
2009年
蛋白质组学研究的核心技术之一是分离分析方法。该综述重点评述了分离分析技术在蛋白质组学研究,即在蛋白质组表达谱构建、翻译后修饰蛋白质组研究、蛋白质复合体和相互作用研究、蛋白质组定量研究中应用的新进展,介绍了各种分离分析方法的优点、应用范围和有待解决的问题。引用文献89篇。
张养军张万军马岩彭博钱小红
关键词:蛋白质组学质谱蛋白质相互作用
蛋白质相互作用网络进化分析研究进展被引量:11
2009年
近年来,随着高通量实验技术的发展和广泛应用,越来越多可利用的蛋白质相互作用网络数据开始出现.这些数据为进化研究提供了新的视角.从蛋白质、蛋白质相互作用、模体、模块直到整个网络五个层次,综述了近年来蛋白质相互作用网络进化研究领域的主要进展,侧重于探讨蛋白质相互作用、模体、模块直到整个网络对蛋白质进化的约束作用,以及蛋白质相互作用网络不同于随机网络特性的起源和进化等问题.总结了前人工作给学术界的启示,探讨了该领域未来可能的发展方向.
刘中扬李栋朱云平贺福初
关键词:蛋白质相互作用网络进化生物信息学
22周孕龄人胎肝表达序列标签数据更新与初步分析
2008年
随着国际上转录组数据及本室22周孕龄人胎肝表达序列标签数据的不断增加,先前该组织表达谱的研究有必要进行更新与完善.本研究首先将22周孕龄人胎肝每一表达序列标签与自身数据库,UniGene,DoTS,MGC以及Twinscan预测的人类转录组数据库进行比对以归类.然后,经过电子拼接和基因鉴定,对已知基因进行GO(gene ontology)分类,对未知基因进行Pfam和ScanProsite功能预测.最后,对人胎肝、成人肝、骨髓、胸腺及淋巴结这些拥有造血作用或可表明人胎肝特性的5种组织进行了层次聚类分析.结果表明:(ⅰ)与5种最新人类转录组数据库比对,极大地降低了那些属于一个基因但互不交叠的序列被划分到不同簇的可能性,因此在进行EST归类时,推荐与互联网上有关最新数据进行比对;(ⅱ)一些先前未知EST已被鉴定为已知基因,1379个EST被鉴定为本室独有的全新序列;(ⅲ)通过GO分类,对22周孕龄人胎肝有了一个大致了解,同时获得了6个细胞迁移基因和6个造血相关基因;(ⅳ)通过基因功能预测获得了277个模体(profile),其中有5个类型可分布于10个以上基因之中;(ⅴ)层次聚类表明,5种组织关系与它们的功能相一致;(ⅵ)建立了世界上最大的22周孕龄人胎肝表达序列标签数据库.总之,22周孕龄人胎肝表达序列标签数据的更新与初步分析将有助于对人胎肝造血机制及细胞迁移机制的了解,可促进未来对该组织进行全面深入的研究。
陈廷贵吴松锋周钢桥朱云平贺福初
关键词:人胎肝表达序列标签基因本体论层次聚类
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