国家自然科学基金(30150005)
- 作品数：4 被引量：32H指数：3
- 相关作者：宋平张竞男胡珈瑞何毛贤邓凤姣更多>>
- 相关机构：武汉大学中国科学院复旦大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 食蟹猴疟原虫 (Plasmodium cynomolgi)中一个真核翻译起始因子4A(eIF-4A)同源蛋白的cDNA克隆、表达和ATP酶活性测定(英文)被引量：4
- 2004年
- 真核翻译起始因子 4A(eukaryoticinitiationfactor 4A ,eIF 4A)是DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类中的一个原型成员 .它在真核细胞的蛋白质合成的起始过程中起着关键性作用 .通过PCR扩增和放射探针杂交相结合的方法筛选食蟹猴疟原虫 (Plasmodiumcynomolgi)的cDNA文库 ,克隆了一个eIF 4A同源蛋白的完整cDNA序列 ,命名为CH1F .CH1F全长 1 75 3bp ,包含一个1 1 97bp的完整阅读框 ,推测编码一个由 398个氨基酸组成的蛋白 .对CH1F的蛋白序列用BlastP进行搜索和分析 ,提示它应该是DEAD盒家族的一个eIF 4A同源蛋白 ;用DNAStar将其与许多典型的DEAD盒蛋白序列进行比对分析 ,结果显示 :比起其它的DEAD盒蛋白 ,它与eIF 4A或eIF 4A的同源蛋白具有更高的同源性和更多序列上的相似结构域 .将包含完整阅读框的片段亚克隆进表达载体pET 2 8a (+) ,在大肠杆菌DH5α中表达 ,产生的融合蛋白大小在 4 5kD左右 .对该融合蛋白进行纯化、重新折叠和初步鉴定 .ATP酶活性检测显示 ,该融合蛋白只有很低的ATP酶活性 ,而且它的ATP酶活性似乎不依赖于核酸底物 .对这一检测结果给出 3种可能的原因 .这一检测结果与根据序列分析得到的推论———CH1F蛋白可能是一个eIF
- 宋平张竞男胡珈瑞李奎
- 双壳纲动物核糖体RNA 185-ITS1序列及其在分子系统发育研究中的应用被引量：20
- 2004年
- 测定了双壳纲不同科、属、种及种内共11个个体的核糖体RNA 18S-ITS1序列。结果表明,该序列在种间存在很高的多态性,长度从558bp到784bp不等,碱基差异百分比在10.7％～61.7％之间,ITS1序列同源性很低,有片段的插入与缺失。种间18S部分序列碱基差异百分比在0.9％～23.7％之间,变化主要是碱基的转换。用邻接法(NJ)构建了8个种的18S部分序列(约240bp)的系统发育树,与传统形态学分类结果相符。马氏珠母贝(Pinctada martensi)4个不同地域个体间的序列差异百分比在0.6％～1.9％之间。分析指出:18S基因可以作为双壳纲动物高阶元系统发育的分子标记;ITS1序列种间变化很大,可以应用于该纲物种的分类及鉴别,在亲缘关系相近种及种内变异相对较小,但核苷酸变异位点信息量丰富,可用于属内种间、亚种和群体间的遗传多样性研究。
- 丁小雷何毛贤邓凤姣张锡元
- 关键词：ITS1RNA双壳纲
- 鹌鹑和黑斑蛙核糖体蛋白L15 cDNA片段的克隆和序列分析被引量：3
- 2003年
- 通过RT PCR方法,分别从两栖类的黑斑蛙(Rananigromaculata)和鸟类的鹌鹑(Coturnixcoturnixjaponica)中首次克隆了核糖体大亚基蛋白L15(RPL15,ribosomalproteinL15)的cDNA片段,并分析了其序列特征.黑斑蛙和鹌鹑的rpl15cDNA片段分别为467个核苷酸和408个核苷酸,推测分别编码155个氨基酸和136个氨基酸的蛋白片段,与其它已知的脊椎动物rpl15序列有高度的同源性.应用这两条cDNA序列和其它已知的脊椎动物rpl15序列构建的系统发育树显示聚类结果与传统分类一致.
- 张竞男宋平彭茂宇吕道远陈云贵周伟陈春红
- 关键词：黑斑蛙鹌鹑系统发育树基因克隆
- 核糖体蛋白rpl15cDNA序列在真骨鱼类系统进化研究中的价值被引量：5
- 2006年
- 应用RTPCR,从真骨总目(Teleostei)5目15种鱼类中首次克隆了核糖体大亚基蛋白L15(rpl15,ribosomalproteinL15)的完整cDNA序列。以海鲢形亚组(Elopomorpha)的鳗鲡作为外类群,对这些真骨鱼类的核糖体蛋白L15cDNA序列进行了系统发育分析,结果表明:(1)rpl15基因在真骨鱼类等许多真核生物进化中高度保守;(2)系统树中各物种之间的关系与形态分类一致。rpl15编码区适合于真骨鱼类目以上分类阶元的分子系统学研究。
- 向筑张竞男宋平胡珈瑞钟扬
- 关键词：分子系统学真骨鱼类
