国家自然科学基金(81101218)
- 作品数：5 被引量：21H指数：3
- 相关作者：程颖曹波卢金星陈晨王晶更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所中国疾病预防控制中心中南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国疾病预防控制中心青年科研基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 25株艰难梭菌多位点序列分型被引量：5
- 2012年
- 目的比较两种对艰难梭菌多位点序列分型(MLST)的方案并探讨不同来源艰难梭菌之间的关系。方法选取来自不同人群的25株艰难梭菌,分别用Lemee方案(aroE,ddl,dutA,tpi,recA,gmk,sodA管家基因)和David方案(adk,atpA,dxr,glyA,recA,soda,tpi管家基因)进行多位点序列分型,用START系统及Bionumerics软件分析这些位点及等位基因谱的特征。结果位点分析结果表明,Lemee方案中有2株菌的ddl位点为无效位点,其余的6个管家基因有3～5个等位基因,等位基因之间有3～11个多态性位点。非同义突变/同义突变(dN/dS)为0.000 0～0.261 1;David方案中的7个管家基因有3～5个等位基因,等位基因之间有2～9个多态性位点。dN/dS为0.000 0～0.280 6。等位基因图谱特征结果表明,Lemee方案出现了13个ST型别(ST1/2/3/6/7/13/31/39/48/A/B/C/D),ST6(5)为优势型别;David方案共出现11个ST型别(ST2/3/15/35/37/54/55/92/99/102/117),其中ST54(6),ST37(5)为优势型别。来源于成人和婴幼儿的菌株并未形成各自特异的序列型。结论对于艰难梭菌多位点序列分型,David的方案更可取,ST与宿主人群的来源没有明显的相关性。
- 严其容李文革许文荣程颖
- 关键词：艰难梭菌分子分型多位点序列分型
- 生物信息学在医院感染中的应用被引量：1
- 2014年
- 医院感染（HAI Healthcare Associated Infection）是指住院患者在医院接受治疗过程中发生的与医疗措施有关的感染,有些会导致严重后果甚至致命。2010年由原卫生部医院感染监测网（http：//www.yygr.cn/）的现患率调查,显示我国医院感染现患率大约为3.6%[1]。医院感染给医院和患者均造成很大的损失,美国每年医院损失583~4 886美元/人[2]。我国每年由于继发医院感染造成的损失约10亿元,
- 王晶程颖陈晨卢金星
- 关键词：医院感染生物信息学
- 中国部分地区艰难梭菌PCR-核糖体分型及毒素基因多态性研究被引量：10
- 2014年
- 目的了解中国部分地区艰难梭菌聚合酶链反应(PCR)-核糖体型别分布及其A、B毒素基因多态性,为建立适宜中国的艰难梭菌分子检测和分子分型技术提供基础数据,同时在基因水平上为艰难梭菌感染导致的复杂临床表现提供依据。方法对中国3个城市(北京、广州、济南)分离的64株艰难梭菌临床株进行PCR-核糖体分型,并对不同型别的26株代表菌株的A、B毒素基因进行扩增测序。结果 64株艰难梭菌中,毒素基因型以A+B+型(45株,70.31%)为主,A-B+型19株(29.69%)。共存在9种PCR-核糖体型别,以017型(21株,32.81%)为主要型别,其次为001型(13株,20.31%)、012型(11株,17.19%)。A-B+菌株中,14株(73.68%)是017型,1株是001型。A、B毒素基因呈现一定的多态性,其中有7种A毒素序列型别(TSTA),6种B毒素序列型别(TSTB),8种A、B毒素序列型别组合(TSTG)。结论我国部分地区的艰难梭菌可能以PCR-核糖体017型为主,A、B毒素基因在菌株间存在多态性,且核糖体型别与毒素基因多态性间存在相对应的关联。应进一步扩大菌株数量和范围,探寻适合我国的分子检测和分子分型方法,从而帮助医院更好地预防和控制艰难梭菌感染。
- 王晶李春辉杜鹏程曹波陈晨卢金星李中杰余宏杰程颖
- 关键词：艰难梭菌假膜性肠炎抗生素相关腹泻
- 艰难梭菌引起抗感染免疫的主要致病因子及其基因功能的研究进展被引量：4
- 2013年
- 艰难梭菌是医院感染性腹泻中最常见的病原菌之一,在过去10年中,由于ribotyping 027型等高毒菌株的出现,全球艰难梭菌感染相关性疾病发病率显著上升,已经成为欧美许多国家法定传染病必报的监测病原。致病艰难梭菌的毒力因子主要包括A毒素和B毒素,刺激机体发生免疫应答。除外A、B毒素,少数艰难梭菌还产生二元毒素。本文对近年来艰难梭菌引起机体抗感染免疫的相关致病因子及其基因功能的最新研究进展进行了回顾和总结,并重点探讨了主要致病因子A毒素和B毒素结构功能及基因表达调控特征,包括构建A、B毒素分子模型,致病基因编码区多态性特征,以及负向调控因子tcdC的变异及影响,对未来疫苗靶位点的筛选以及艰难梭菌致病机制中信号转导研究具有指导意义。
- 曹波李先平程颖
- 关键词：艰难梭菌抗感染免疫
- 乡村医疗机构与城市医院来源的艰难梭菌MLST分型对比研究被引量：3
- 2012年
- 目的初步了解农村社区艰难梭菌流行状况及分子生物学特征。方法对河南省济源市某乡村医疗机构送检的7株艰难梭菌进行生化鉴定和分子生物学方法鉴定,并进行MLST分型分析,同时与北京某三甲医院的84株艰难梭菌进行对比,用eBURST软件聚类分析,寻找其中可能的关联。结果源自河南济源市某乡村医院的7株菌均属艰难梭菌,PCR毒素基因鉴定结果显示,其中两株为A-B+菌株,其MLST分型结果是ST37;5株为A+B+菌株,其中4株对应ST35,1株对应ST3;两重来源的菌株中均是毒素基因A+B+菌株占优势;乡村医疗机构的7株艰难梭菌中未发现新的与David MLST数据库中不同的ST型别,未发现不同于北京城市医院的ST型别。结论 David方案适合种群结构和全球流行病学研究,且其数据库全球共享,便于数据交换;该次研究中未发现新的ST型别,所有菌株ST呈散在分布。
- 李文革靳会娟岑瑞琦程颖卢金星曹波
- 关键词：艰难梭菌农村社区
