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坛紫菜EST-SSR分子标记的开发及应用(英文): 采用生物信息学方法对NCBI数据库上公开的坛紫菜(Porphyra haitanensis)ESTs序列进行EST-SSRs特征分析,剔除冗余序列,得到非冗余序列3489条。在非冗余序列中发现其中210条EST序列中含有...; 谢潮添陈昌生纪德华徐燕; 关键词：坛紫菜 EST-SSR 微卫星; 文献传递

野生坛紫菜种群遗传多样性的ISSR分析被引量：22: 2008年; 采用简单序列重复区间（ISSR）分子标记技术对福建省的3个野生坛紫菜（Porphyra haitanensis）种群共60个个体进行了遗传多样性分析。15条引物共扩增出222个位点，其中186个位点具有多态性，多态位点百分率为83．789／6，在种群水平上，多态位点百分率为80．18％～81．53％，平均为80．93％。期望杂合度、Shannon信息指数在物种水平上分别为0．3304和0．4834；在种群水平上分别为0．3089和0．4551，表明坛紫菜种群内存在着较高的遗传多样性水平，且在三个种群间没有明显差异。依据Gst值，坛紫菜的遗传变异主要发生在种群内的个体间（占93．5％），只有6．5％的遗传变异发生在种群间，由此说明坛紫菜种群间的遗传分化水平很低，这与坛紫菜种群间充分的基因交流（Nm=7．1930）是相关的。基于遗传距离的UPGMA聚类结果表明坛紫菜60个个体并不按照其地理分布进行分群，而是随机分群的。文章最后还对坛紫菜种质资源保护的必要性进行了讨论。; 陈昌生谢潮添纪德华徐燕郭留超; 关键词：坛紫菜 ISSR 遗传分化

5.8S rDNA-ITS区片段的序列分析在坛紫菜种质鉴定中的应用被引量：9: 2009年; 为探讨DNA序列标记技术在坛紫菜种质鉴定中的应用,对10个野生坛紫菜种质材料的5.8S rDNA-ITS区进行PCR扩增和序列分析,结果发现扩增的片段长度在1208～1219bp之间,可以分为ITS1区,5.8S区和ITS2区3个部分,其中5.8S区片段的长度完全一致,均为160bp;ITS1区和ITS2区片段的长度也非常接近,只有几个碱基的差异。多重序列比对发现10个种质材料的ITS区(包括ITS1和ITS2)序列都存在一定差异,序列同源性在95.82%～99.73%之间,而5.8S区序列则完全一致,但与其它种紫菜的5.8S区序列有很大差异,序列同源性在79.7%～95.0%之间。由此认为5.8S rDNA-ITS区这种高度保守区和高变区交替排列的形式可以成为坛紫菜种质鉴定及系统进化分析的强有力工具。; 赵玲敏谢潮添陈昌生纪德华; 关键词：坛紫菜 RDNA

坛紫菜种质材料DNA指纹图谱的构建被引量：9: 2010年; 采用20对简单重复序列(SSR)引物对福建省坛紫菜种质资源库中保存的44个坛紫菜种质材料进行了遗传分析,共检测到了81个多态性位点,每对引物检测到的等位基因介于2～6个之间,平均为4.05个,引物的PIC值介于0.15～0.79之间,平均为0.57。然后根据3对引物(Phes08,Phes03和PC13)扩增出的16个多态性位点构建了44个坛紫菜种质材料的指纹图谱库,使得每一种质材料均具有其特异的DNA指纹图谱。并根据指纹图谱中各扩增位点条带的有无,将指纹图谱转化成了计算机可以识别的数码指纹,开发了相应的数码指纹识别软件,为坛紫菜种质的自动化鉴定及坛紫菜种质资源库的信息化管理奠定了基础。; 谢潮添陈昌生纪德华赵国瑞徐燕史修周; 关键词：坛紫菜种质材料简单重复序列

坛紫菜叶状体RNA提取方法的改良与比较: 2010年; 为提取高质量的坛紫菜叶状体总RNA,对常用的几种植物RNA提取方法(CTAB法、SDS法、异硫氰酸胍法)按照去除多糖、多酚的方法进行了改良,并对分离的总RNA根据吸光值、电泳图谱及RT-PCR检测等结果与两种试剂盒(离心柱试剂盒法,RNAiso法)的提取结果进行了比较。结果表明,SDS法、异硫氰酸胍法和RNAiso法3种方法提取的RNA纯度低,质量差,部分RNA已经发生了降解。而改良CTAB法和离心柱试剂盒法提取的总RNA质量可靠,完整性好,纯度高,并且成功去除了可能影响逆转录酶活性的物质,可以进一步应用于cDNA文库构建,基因表达分析等后续实验,但这两种方法各有优缺点,应根据实际情况选用合适方法进行坛紫菜叶状体总RNA的分离。; 谢潮添梅高尚陈昌生纪德华; 关键词：坛紫菜叶状体 RNA提取

坛紫菜(Porphyra haitanensis)SRAP分子标记体系的构建及种质材料的遗传分析被引量：12: 2008年; 利用正交设计对影响坛紫菜SRAP标记分析的5个因素(模板DNA,Mg2+,Taq酶,引物,dNTP浓度)在4个水平上进行优化,筛选出各反应因素的最佳水平,建立了坛紫菜SRAP标记分析的最佳反应体系.然后利用该体系对15个坛紫菜种质材料进行了遗传多样性分析,筛选出15对可以扩增出清晰稳定条带的引物组合,共获得244个位点,其中184个位点具有多态性,占75.4%.15个供试材料间的平均遗传距离为0.2904,有效等位基因数为1.3758,期望杂合度为0.2303,Shannon多样性指数为0.3559.应用非加权成组配对法(UPGMA)对它们进行了聚类分析.结果表明供试的坛紫菜种质材料间存在着较高的遗传多样性,这为后续的坛紫菜遗传育种提供了丰富的遗传变异信息.; 谢潮添陈昌生纪德华徐燕徐元君; 关键词：坛紫菜正交设计 SRAP

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福建省自然科学基金(2007J0064)