郴州市科技计划项目(CZ2013108)
- 作品数：7 被引量：50H指数：5
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- 相关机构：郴州市疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心更多>>
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 2013年湖南省郴州市手足口病病原学及柯萨奇A6和A10基因特征分析被引量：9
- 2015年
- 目的了解2013年湖南省郴州市手足口病病原学特征及不同分离株基因特征,为郴州市手足口病的防治提供科学依据。方法采集2013年郴州市手足口病监测病例标本,应用荧光PCR法检测EV71、CVA16、CVA6、CVA10和其他肠道病毒。未能分型的其他HEV阳性标本进行RT-PCR扩增,通过基因测序鉴定病原体型别。结果共检测772份标本,阳性检出率为66.71%,其中CVA6为41.55%;CVA10为15.92%;CVA16为13.01%;EV71为5.63%;其他肠道病毒为23.88%。不同年龄、月份和病例类型的病毒型别构成比差异均有统计学意义(P<0.05)。重症和聚集性病例以其他肠道病毒感染为主。基因序列分析显示:CVA6郴州株与邻近的长沙株亲缘关系最近;CVA10郴州株与国内各分离株亲缘关系均较近。结论 CVA6和CVA10是2013年郴州市手足口病流行的主要病原体,日常监测中仅检测EV71和CVA16已不能满足手足口病防控需要。CVA6和CVA10都具有明显的地域分布特征,国内的CVA6毒株相对容易变异,而CVA10毒株相对比较保守。
- 谢群刘爱平谭徽付敏陈白鹭陈柏塘
- 关键词：手足口病病原学
- 2013-2015年郴州市手足口病病原谱及柯萨奇病毒A6基因特征分析被引量：6
- 2018年
- 目的了解2013-2015年湖南省郴州市手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原谱和优势毒株基因特征,为该病的防控提供科学依据。方法采集2013-2015年郴州市HFMD临床诊断病例肛拭子或粪便标本,用荧光定量PCR方法检测人肠道病毒71型(human enterovirus 71,HEV71)、柯萨奇病毒A组16型(coxasckievirus A16,CVA16)、CVA6、CVA10和其他肠道病毒(HEV)。除上述型别外无法分型的其他HEV阳性标本再进行RT-PCR扩增,通过基因测序比对,鉴定病原体型别。结果郴州市2013-2015年共检测HFMD标本2 343份,肠道病毒阳性1 325份,阳性检出率为56. 55%; HFMD病原谱包括16种肠道病毒,已知型别中前5位分别为CVA6(31.77%),CVA16(16.45%),HEV71(13.74%),CVA10(11.47%),柯萨奇B组5型(CVB5)(0.30%),仍有25.13%的其他HEV未分型;聚集性病例以CVA16和其他HEV为主,重症及死亡病例以HEV71和其他HEV为主,不同年份(χ2=64.90,P<0.001)、不同类型(χ2=56.41,P<0.001)。郴州市的CVA6分离株均分布于同一进化簇,与长沙市分离株亲缘关系最近。结论 2013-2015年,CVA6已成为郴州地区引发手足口病的主要病原型别,在手足口病监测中应加强非HEV71和非CVA16型肠道病毒检测。
- 谢群刘爱平谭徽陈柏塘朱韩武陈白鹭
- 关键词：手足口病病原谱基因特征
- 郴州市2012-2014年手足口病流行病学特征分析被引量：2
- 2016年
- 目的对2012-2014年郴州市手足口病流行特征进行分析,为预防和控制手足口病疫情提供科学依据。方法采用描述性流行病学对郴州市2012-2014年手足口病监测数据进行整理分析。结果 2012-2014年,郴州市共报告手足口病病例33 587例,年均报告发病率为241.89/10万,3年报告发病率差异有统计学意义(χ2=2 610.41,P<0.05)。报告重症病例579例,其中死亡16例,3年报告的病重率差异均有统计学意义(χ2=431.355,P<0.05);流行呈明显季节性,4-7月为发病高峰;3岁及以下儿童为主,每年占86%以上,男性多于女性;以散居儿童为主,每年占86.12%以上。2012年以HEV71感染为主(61.71%),2013年和2014年以其他HEV感染为主(81.36、48.57%);2012年重症病例以HEV71感染为主(75.08%),2013年以其他HEV感染为主(77.42%),2014年以HEV71和其他HEV感染为主。结论2012-2014年郴州市手足口病的报告发病率和病重率存在年度差异;每年的4-7月,3岁及以下的散居儿童是手足口病防控的重点;主要病原体在不同时间呈快速动态变化消长,重症病例的主要病原体不仅仅是HEV71。
- 李成华刘卫谭徽朱韩武付敏谢群刘爱平
- 关键词：手足口病流行病学病原学
- 人肠道病毒A71型分离株全基因组序列及毒力相关位点分析被引量：1
- 2014年
- 为了解人肠道病毒A71型（Enterovirus A71,EV-A71）的基因重组和遗传进化特征,探索其毒力相关位点。本研究通过对郴州市3株EV-A71分离株进行全基因组序列测定和分析,应用RDP软件（版本4.1.6）将其与231条EV-A71全基因组序列进行比较分析,检测可能的重组事件及重组位点;采用SimPlot软件（版本号3.5.1）对重组序列、2条亲本序列和其他A组肠道病毒（EV-A）代表株序列进行相似性分析;采用MEGA软件（版本5.2）构建系统发生树;结果发现郴州市3株EV-A71毒株均检测到重组信号,其共同的亲本主序列为广东省2009年毒株,亲本亚序列为中国台湾地区2008年毒株;我国C4b进化分支EV-A71代表株（分离于1998年的SHZH98株）和C4a进化分支EV-A71代表株（分离于2008年的安徽阜阳株）均与CVA4、CVA14及CVA16原型株在3D区域检测到型间重组信号。采用SPSS软件（版本19.0）对不同病例类型的变异位点作卡方检验以筛选出可能的毒力相关位点。发现死亡病例组与重症病例组间未找到具有统计学意义的突变位点;而死亡与重症病例合并组与一般病例组进行比较,共发现18个突变位点具有统计学意义,这些突变位点仅分布于P2区和P3区,而P1区未见。我国大陆的EV-A71流行株与EV-A其他毒株的型间重组早在1998年前即已经发生,并且在2008~2012年的手足口病暴发疫情中,EV-A71的型内重组频繁发生。此外,EV-A71毒力的改变可能与非衣壳蛋白区的变异相关,因此应该关注非衣壳蛋白基因改变对病毒毒力的影响。
- 刘爱平谭徽谢群陈柏塘刘晓峰张勇
- 关键词：全基因组序列毒力基因重组基因突变
- 2014年湖南省郴州市手足口病病原谱及CVA16基因特征分析被引量：7
- 2016年
- 目的了解2014年湖南省郴州市手足口病病原谱和优势毒株的基因特征,为郴州市手足口病的防治提供科学依据。方法采集2014年郴州市手足口病监测病例标本,应用荧光PCR方法检测HEV71、CVA16、CVA6、CVA10和其他肠道病毒。未能分型的其他HEV阳性标本进行RT-PCR扩增,通过基因测序鉴定病原体型别。结果共检测854份标本,阳性检出率为55.62%。病原谱中已知型别的前5位分别为CVA16(28.00%)、HEV71(25.05%)、CVA6(13.89%)、CVA10(12.42%)、CVB5(0.84%),仍有20.63%的其他HEV未分型。不同月份、不同年龄组、不同病例类型的病原体型别的构成比差异均有统计学意义(均P<0.05);男女性别的病原体型别的构成比差异无统计学意义(P>0.05)。郴州市的6株CVA16分离株均为B1基因亚型。结论 2014年郴州市的手足口病流行毒株显示了一定的季节性分布特征,主要的几种优势毒株相互交替流行,并与人群的免疫基础相互作用体现在月份和年龄组的分布上。郴州市的CVA16分离株与国内流行株的基因型别一致。
- 刘爱平谢群谭徽陈白鹭陈柏塘朱韩武
- 关键词：手足口病病原学基因特征
- 湖南省郴州市2010年-2014年手足口病病原谱的变迁研究被引量：12
- 2015年
- 目的了解郴州市HFMD病原谱变迁规律,为HFMD的防治提供依据。方法采集HFMD临床诊断标本,应用荧光PCR方法检测人肠道病毒通用型、HEV71、CVA16、CVA6和CVA10。结果郴州市2010年-2014年共检测HFMD标本3 997份,人肠道病毒阳性2 756份,检出阳性率为68.95%,每年的优势毒株依次为HEV71(55.17%)、CVA16(32.54%)和HEV71(30.15%)、HEV71(61.71%)、CVA6(41.55%)、CVA16(27.91%)和HEV71(23.74%)。郴州地区及同一地理类型地区不同年度的病原体型别构成比差异有统计学意义(P<0.05);各年度不同流行阶段、年龄阶段和病原体型别构成比差异均有统计学意义(P<0.05)。结论郴州市2010年-2014年HFMD流行的主要病原体,以HEV71、CVA16、CVA6交替流行为主,或同时流行;新的主要病原体CVA6流行强度不亚于HEV71;多种优势型别毒株的快速交替流行,是郴州地区近5年HFMD疫情的持续高发的主要原因;重症及死亡病例以HEV71感染为主,但非HEV71和CVA16感染有逐年增多趋势。
- 谭徽刘爱平谢群付敏陈柏塘陈白鹭
- 关键词：手足口病人肠道病毒71型柯萨奇病毒A组16型
