安徽高校省级自然科学研究基金(KJ2008B44ZC)
- 作品数:3 被引量:6H指数:2
- 相关作者:陆一涵刘海燕郑英杰胡安群夏玉刚更多>>
- 相关机构:复旦大学安庆市立医院安徽医科大学更多>>
- 发文基金:安徽高校省级自然科学研究基金国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 戊型肝炎病毒不同生物标志物的关联和基因分型被引量:2
- 2011年
- 目的分析戊型肝炎病毒不同生物标志物的相关性及其基因型和流行病学特点。方法收集2007~2009年安庆市立医院临床检测为急性散发性肝炎患者的系列血清,采用酶联免疫(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)试剂检测HEV-IgG抗体、HEV-IgM抗体,采用巢氏逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reac-tion,RT-PCR)法检测HEV RNA,比较各指标间的相关性,并对HEV RNA阳性的序列进行测序和基因分型。结果在46例安庆地区临床确诊为急性散发性戊型肝炎患者中,HEV-IgG抗体滴度有升高趋势、HEV-IgM抗体阳性和HEV RNA阳性的患者分别为36例、41例和39例。HEV-IgM抗体变化与HEV-IgG抗体变化的符合率为88.2%,HEV-IgM抗体变化与HEV RNA阳性的符合率为85.3%,HEV-IgG抗体变化与HEV RNA阳性的符合率为83.8%;扩增ORF2区域150-nt核苷酸片段15条,系统进化分析显示为HEV基因型。结论同时进行HEV-IgG、HEV-IgM抗体和核酸的检测...
- 刘海燕胡安群郑英杰陆一涵夏玉刚黄升海
- 关键词:戊型肝炎病毒RT-PCR基因型
- 2006-2008年安庆地区散发性戊型肝炎病毒血症检测与序列分析
- 2010年
- 目的了解安庆地区散发性戊型肝炎病毒血症的检出率与基因型的分布。方法收集2006-2008年间安庆市立医院血清戊肝IgM抗体阳性患者的血清(包括单份血清和系列血清)共145份,采用巢式RT-PCR方法检测HEVRNA,并扩增494-nt核苷酸片段,进行基因分型和同源性比对。结果在57名血清戊肝IgM抗体阳性的患者血清中,HEVRNA总检出率为47.37%;男性与女性分别为50.00%、40.00%,两者间无显著性差别(χ2=0.44,P=0.51)。其中,单份/首份血清的检出率最高(26/57,45.61%),第2份血清较低(8/35,22.86%),第3份及以后的血清几乎未检出阳性(1/53,1.89%)。所有35条HEV核苷酸序列均为基因Ⅳ型,与2007-2008年间获得的27株安庆地区猪基因Ⅳ型HEV共同比对后发现,人序列之间、猪序列之间、人与猪序列之间的同源性都约为86%;不同年份、不同宿主(人与猪)的HEV核苷酸序列间的同源性均在84%~88%之间。结论基因Ⅳ型HEV是安庆地区散发型戊肝的主要病毒株。当地人与猪HEV序列的同源性较高,提示HEV在人与猪之间存在相互传播的可能。
- 胡安群陆一涵刘蔚刘海燕叶青郑英杰
- 关键词:戊型肝炎病毒基因型
- 安庆市人与猪群中戊型肝炎病毒的系统进化分析被引量:4
- 2010年
- 目的 了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒(hepatitis E Virus,HEV)的基因型和系统进化特征.方法 收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组(每组各100份).应用巢氏逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测HEV开放式阅读框架(open reading frame,ORF)2区域内150 nt序列,测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行比对,并计算核苷酸序列间的同源性.使用贝叶斯推断法构建系统进化树,分析安庆市人与猪群中HEV的基因型和系统进化关系.结果 患者的男女性别比例为2.86∶1,平均年龄为56.78岁.27份患者血清标本中有16份检出HEV RNA,阳性检出率为59.26%.安庆市人HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为74.75%~82.99%、75.26%~83.64%、72.77%~80.57%和88.03%~91.63%.400份猪胆汁中有22份(5.5%)分离出HEV RNA,A、B、C、D各组的HEV携带率分别为7.00%、3.00%、9.00%、3.00%,各组间的猪HEV携带率差异无统计学意义(x2=5.20,P=0.16).安庆市猪HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为75.24%~83.42%、75.93%~84.19%、72.86%~80.64%和88.15%~91.79%.系统进化树分析结果显示,安庆市人和猪HEV病毒株均属于基因Ⅳ型,且错落分布于进化分支上,无明显的物种聚集现象.结论 基因Ⅳ型HEV为安庆市人和猪的优势病毒株,且有可能在该地区人和猪群中跨物种传播.
- 夏玉刚胡安群陆一涵刘海燕郑英杰
- 关键词:基因型
- 安庆地区人与猪群中戊型肝炎病毒的系统进化分析
- 目的了解安庆地区人与猪群中流行的戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)的基因型和系统进化特征。方法收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,应用巢氏RT-PCR方法检测HEV ...
- 夏玉刚胡安群陆一涵刘海燕郑英杰
- 关键词:戊型肝炎病毒基因型系统进化
- 文献传递