国家林业公益性行业科研专项(201004049)
- 作品数：8 被引量：58H指数：4
- 相关作者：陈金慧施季森郑仁华徐阳赵亚琦更多>>
- 相关机构：南京林业大学福建省林业科学研究院更多>>
- 发文基金：国家林业公益性行业科研专项国家自然科学基金江苏高校优势学科建设工程资助项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析被引量：26
- 2014年
- 杉木的育种群体中,维持合理的遗传多样性和清晰的遗传背景,是长周期、多世代遗传改良采用的核心策略之一。基于基因组分子标记,利用自主开发的52对杉木SSR引物,对国家级杉木种质资源库保存的遗传材料——杉木第1代遗传改良收集的93份种质资源进行了遗传多样性分析。结果表明:52对SSR引物在93份材料中共检测到254个等位变异,等位变异范围为2~8个,平均等位基因数为4.88个,平均有效等位基因数为2.32个,平均观察杂合度为0.43,平均Nei's多样性指数为0.50,平均Shannon信息指数为0.98,这5个评价遗传多样性水平的指标具有较大程度的一致性。不同引物的等位基因数、有效等位基因数、观察杂合度、多样性指数和Shannon信息指数等均表明杉木育种群体中存在较大的遗传差异,其变异系数分别为24.88%、44.75%、34.20%、34.89%和33.59%。93份种质资源间遗传相似系数的平均值为0.693 3,变化范围为0.490 0~0.9193;遗传距离的平均值0.370 3,变化范围为0.086 3~0.713 4。当距离阀值为20时,可将杉木第1代育种群体中的93份种质资源划分为5大类;当距离阀值为15时,第5大类的77份种质资源可细分为16个亚类。SSR分子标记聚类的结果可为种质资源的管理及提高育种效率提供重要依据。
- 欧阳磊陈金慧郑仁华徐阳林宇峰黄金华叶代全方扬辉施季森
- 关键词：杉木育种群体SSR标记
- 杉木成年优树组培生根研究被引量：4
- 2013年
- 以3个成年杉木优良无性系茎段为外植体，研究基因型、生长调节剂、活性炭、基本培养基对杉木生根效率的影响。结果表明：基因型和生长素NAA是影响杉木生根效率的主要因素。1#基因型的杉木生根能力强，在1／4DCR培养基（添加IBA1．0mg／L或NAA0．5～1．0mg／L）上生根率可达90％以上；2#基因型的杉木生根能力较弱，添加1．5mg／LIBA或1．0mg／LNAA的1／2DCR培养基更适合其生根；对于3#基因型的杉木，3／4DCR培养基最适合其生根，添加IBA1．5mg／L或NAAl．0mg／L时生根率最高。对3个基因型的生根试验研究表明，活性炭对杉木生根不能起到促进作用。
- 周小红张元莉李美平赵芳芳陈金慧郑仁华肖晖黄金华张志才李勇郑雪燕施季森
- 关键词：杉木成年基本培养基组培优树优良无性系
- 杉木SRAP-PCR体系优化被引量：5
- 2014年
- 为建立杉木SRAP-PCR反应体系,利用L16(45)正交设计对影响杉木SRAP-PCR反应体系的Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和DNA浓度5种因素的4个水平进行优化实验,结合正交直观分析和方差分析,对影响反应较大的Mg2+、dNTPs和引物浓度进行单因素实验,最终确定杉木SRAP-PCR最佳的反应体系为:在20μL的PCR反应体系中,Mg2+浓度为2.25 mmol/L、dNTPs为0.15 mmol/L、引物浓度为0.4μmol/L、Taq酶为1.5μmol/min、模板DNA为60 ng,10×PCR Buffer 2μL,不足部分用双蒸水补充至20μL。PCR反应程序的两步最适退火温度第1步为35℃,第2步为53℃。利用上述反应体系进行杉木PCR扩增,能得到清晰、稳定的条带。
- 王新民郑仁华陈金慧赵亚琦徐阳王颖施季森
- 关键词：杉木SRAP-PCR
- 植物的胚形态建成及其基因调控机制研究进展被引量：2
- 2013年
- 胚形态建成是植物生长发育的基础,是单细胞发育成功能性多细胞有机体的过程。高等植物在胚形态建成过程中首先确立极性随后形成轴性结构,为后续的胚形态建成和生长发育建立了空间坐标体系。笔者以模式植物拟南芥为例介绍了植物胚形态建成过程和基因调控机制,其中包括:MPK/GRD信号途径控制的合子伸长和极性化;WOX8、WOX9、WOX2指导合子不均等分裂和基顶轴方向确定;生长素信号、WOX5调控网络指导的根端分生组织确立、WUS/CLV3、STM调控网络指导顶端分生组织确立;以子叶形成为代表的侧生器官发生和近远轴发育模式的确立需要生长素信号控制和TCP/CUC基因的表达拮抗;SCR/SHR调控途径参与胚基部径向发育过程机理等。认为对胚形态建成过程中基因调控机理的研究有助于从一个全新的角度认识植物生长发育过程。
- 王鹏凯施季森张艳娟吴霜陈金慧
- 关键词：基因调控顶端分生组织
- 湿加松胚性愈伤组织的程序降温技术研究被引量：3
- 2013年
- 对湿加松胚性愈伤组织进行了超低温冷冻保存的研究。结果表明：继代培养9～12d的湿加松胚性愈伤组织经0．5mol／L梨醇预培养4d，在0．6mol／L山梨醇＋10％DMSO的冷冻保护液下0℃预处理20min，然后以-1℃min的降温速率降至-40℃，停留10min后再以-5℃／min的降温速率降至-90℃，投放入液氮中保存；复苏时于37℃水浴2min，1mol／L山梨醇的液体培养基清洗3次，以滤纸作支持物转到固体继代培养基再培养。在此程序处理下1个月内可获得生长状态良好的再生愈伤组织。
- 刘伟东陈金慧周艳威赵亚琦施季森
- 关键词：湿加松超低温冷冻保存胚性愈伤组织
- 杉木成年优良无性系的不定芽增殖研究被引量：3
- 2013年
- 以杉木成年优良无性系的无菌组培苗为外植体,研究激素、活性炭等对不定芽增殖的影响,在此基础上探讨接种方式对杉木增殖效率的影响。研究表明:6-BA浓度为1.5 mg·L-1时能有效促进不定芽增殖,但继续添加则起抑制作用,并容易引起玻璃化;去除顶端优势的接种方式能将不定芽的增殖效率提高一倍多;不同的基因型间平均不定芽数相差1;BA、KT、NAA的组合使用较单一激素使用有利于不定芽的伸长,适量的活性炭有利于杉木不定芽的伸长生长。
- 周小红周艳威张元莉施季森郑仁华陈金慧
- 关键词：杉木接种方式器官发生不定芽
- 杉木地理种源的EST-SSR分子标记变异研究被引量：8
- 2014年
- 研究采用EST-SSR分子标记对全国不同杉木种源区的42个代表性种源进行了地理种源分子标记的遗传多样性研究。实验结果表明,杉木种源水平上存在较高的遗传多态性。实验使用15个EST-SSR引物扩增出17个位点,共有52个多态性等位基因,每个位点平均具3.058 8个等位基因,平均每个座位的PIC为0.296。相对其他研究,该研究利用SSR标记在每位点检测到更多的遗传变异信息。以遗传距离10作为阀值时,42个杉木种源聚类分析可知,除了福建永春碧卿(编号2)和广西浦北(编号16)种源自成一类外,其他40个种源按从南到北、从东到西的地理分布被聚为四大类群,与以往的杉木种子区划研究结果有较高的吻合度。同时,研究也检测到SSR分子标记的等位基因频率在四大类群间存在着较大的变异,而且这些标记大多位于与植物抗逆性相关的功能基因的编码区域内。因此,笔者推测杉木的地理变异可能与这些基因的等位变异有关。
- 徐阳陈金慧赵亚琦王颖王新民刘伟东施季森郑仁华欧阳磊张志才黄金华叶代全方扬辉
- 关键词：杉木种源SSR进化
- 杉木EST-SSR与基因组SSR引物开发被引量：15
- 2014年
- 利用已经公布的杉木444条EST序列和未公布的杉木基因组文库中1 142条基因序列,进行引物开发效率的比较。去冗余后,利用MISA搜索SSR位点,分别得到109个和39个含有SSR的位点。杉木EST序列中SSR分布密度为964.58个/Mbp,基因组中平均每Mbp出现1 037.24个SSR。在两个独立来源的数据库序列中,六核苷酸重复均为最多的重复类型,且AT-rich的重复类型占较大比例。AGC/CTG是杉木EST序列和基因组库中最多的三碱基重复,通过Primer 3.0分别设计出SSR引物95对和37对。为考察设计引物在杉木不同种源(群体)中的有效性,取12个种源(个体)的优良个体,利用随机抽取的10个EST-SSR和8个gSSR(基因组SSR)进行引物筛选,结果表明:EST-SSR和gSSR各有4对引物在12个种源(个体)中表现出明显的多态性,多态率分别为40%和50%。8对多态性的SSR引物共扩增出25个多态性等位位点,平均每个引物产生3.125个多态性等位位点,平均有效的等位位点为2.399 5,PIC平均值为0.519 1;Hot平均为0.307 4。其中gSSR标记在检测群体间存在较大的分化,4个gSSR比4个EST-SSR扩增出更多的等位位点数、平均等位位点数,以及更大的PIC值。
- 徐阳陈金慧李亚洪舟王颖赵亚琦王新民施季森
- 关键词：杉木基因组SSREST-SSR
