广西海洋生物技术重点实验室主任基金(GKLMBT-D0801)
- 作品数：8 被引量：31H指数：3
- 相关作者：宋忠魁蔡小辉王芳宇彭银辉杨家林更多>>
- 相关机构：广西海洋研究所衡阳师范学院钦州学院更多>>
- 发文基金：广西海洋生物技术重点实验室主任基金广西壮族自治区科学研究与技术开发计划广西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学环境科学与工程生物学更多>>
- 广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹群体遗传多样性的RAPD分析被引量：5
- 2012年
- 采用随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)技术检测广西沿海及其邻近海区拟穴青蟹(Scylla paramamosain)6个地理群体的遗传变异和遗传结构,8条10 bp寡核苷酸随机引物扩增99个个体,分析其中的44个位点,31个位点表现出多态性,在种水平的多态位点百分率为70.45%。POPGENE分析结果显示,6个群体的多态位点百分率为29.55%～54.55%,平均为36.97%;群体的遗传多样性自高至低排列为钦州湾群体>党江群体>珍珠湾群体>闸口群体>清化群体>流沙湾群体;群体内的遗传变异大于群体间的遗传变异,群体间的遗传分化程度较大。AMOVA分析显示,群体内遗传变异占87.03%,群体间遗传变异占12.97%,群体间发生中等程度遗传分化。Mantel检测结果表明,拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著。聚类分析表明,群体间聚类无明显的地域性分布格局。
- 孙奉玉宋忠魁赵鹏聂振平苏琼王芳宇
- 关键词：拟穴青蟹RAPD遗传分化
- 一种新的获取海洋贝类基因组DNA的取样方法
- 2010年
- [目的]探讨一种新的获取海洋贝类基因组DNA的取样方法,为开展珍稀贝类的分子生物学研究提供参考。[方法]以文蛤、栉江瑶、翡翠贻贝、香港巨牡蛎、毛蚶为供试材料,以闭壳(合)肌全基因组DNA作为参考,采用常规酚-氯仿法抽提贝类贝腔液基因组DNA,使用生物光度计法、琼脂糖凝胶电泳、目的片段扩增测序验证其质量,并建立系统发育树检测其来源的真实可靠性。[结果]采用常规酚/氯仿基因组DNA提取方法获得的贝腔液DNA质量优于闭壳(合)肌DNA,蛋白质、多酚色素污染较少,完全满足目的片段扩增测序;系统发育进化树则证实了贝腔液并非外源污染。[结论]从贝腔液中获取基因组DNA是完全可行的,并可将其用于目的基因片段的扩增。
- 彭银辉王芳宇蔡小辉宋忠魁
- 关键词：基因组DNA系统发育进化树
- 广西茅尾海2种养殖牡蛎重金属含量评价被引量：11
- 2011年
- [目的]监测广西茅尾海2种养殖牡蛎重金属含量,评价其食用安全程度和养殖环境质量。[方法]以微波消解法消解样品,联合使用等离子体质谱仪和等离子体发射光谱仪测定广西茅尾海的有明巨牡蛎(Crassostrea ariakensis)和香港巨牡蛎(C.hongkongensis)的Cu、Zn、Cd、Cr、Hg、As、Se和Pb共8种重金属的含量。使用5类评价标准并结合采用单项质量指数法和综合质量指数法进行评价。[结果]茅尾海2种牡蛎重金属污染严重,食用价值受到严重威胁。[结论]当前无公害海水养殖用水水质评估和海洋生物质量评估标准有待修订。
- 宋忠魁
- 关键词：牡蛎重金属
- “近江牡蛎”富集茅尾海重金属被引量：2
- 2010年
- 香港巨牡蛎和有明巨牡蛎曾一度被误认为是"近江牡蛎"。联合使用ICP-MS和ICP-AES方法测定香港巨牡蛎与有明巨牡蛎的Cr、Hg、As、Se、Pb、Cu、Zn、Cd等8种重金属含量。结果表明:除As以外,香港巨牡蛎与有明巨牡蛎累积重金属的量不呈显著性差异,香港巨牡蛎金属污染指数略高于有明巨牡蛎;考虑时间尺度,香港巨牡蛎在自然条件下积累Zn、Hg、Cu,但不积累Cr、As、Se、Pb、Cd等重金属。
- 宋忠魁谢涛董兰芳蒋天成龙智翔
- 关键词：近江牡蛎重金属
- 广西茅尾海常见牡蛎的分子鉴定被引量：9
- 2010年
- 应用COⅠ条形码技术鉴定广西茅尾海的3种常见牡蛎,其俗名分别是"白眼蚝"、"红眼蚝"和"蚝砺"。研究结果表明,茅尾海3种牡蛎应归属牡蛎科(Ostreidae)、巨蛎属(Crassostrea),其中"白眼蚝"是香港巨牡蛎(C.hongkongensis)、"红眼蚝"是有明巨牡蛎(C.ariakensis)、"蚝砺"是Kumamoto牡蛎(C.sikamea)。研究验证了已开发的多重PCR技术能对3种牡蛎进行快速鉴定,并揭示香港巨牡蛎是茅尾海优势种,基本上澄清了与"近江牡蛎"相关的俗名问题。
- 宋忠魁蔡小辉童潼杨家林
- 关键词：牡蛎CO分子鉴定
- 北部湾6个拟穴青蟹群体遗传多样性的ISSR分析被引量：3
- 2012年
- 应用ISSR标记技术分析来自北部湾的拟穴青蟹6个地理群体(清化、党江、钦州湾、流沙湾、珍珠湾、闸口)的遗传变异和遗传结构,8条ISSR引物扩增111个个体,分析其中的66个位点,56个位点表现出多态性,表明拟穴青蟹在物种水平上的多态位点百分率是84.85%。拟穴青蟹6个群体的多态位点百分率为51.52%～63.64%,平均为57.58%。群体的遗传多样性按自高至低顺序排列为清化群体>党江群体>钦州湾群体>流沙湾群体>珍珠湾群体>闸口群体。拟穴青蟹在种水平或群体水平上的多态位点百分率和Shannon信息指数表明,拟穴青蟹遗传多样性在甲壳类动物中处于较高层次,但比甲壳类以外的几类经济海产动物遗传多样性低。总的遗传分化系数GST值为0.1841,表明,总遗传变异的绝大部分存在于群体内,群体间的遗传分化程度较大。但是,绝大部分两两群体间的遗传分化系数值在0.0689～0.1276,为中等程度的遗传分化。AMOVA分析表明,群体内遗传变异占87.97%,群体间遗传变异占12.03%,群体间遗传分化程度中等但分化显著。Manteltest结果表明,拟穴青蟹6个群体间的遗传距离与地理距离之间的相关性不显著。聚类分析表明,来自广西沿海的4个群体聚成一支。
- 宋忠魁孙奉玉李梦芸赵鹏聂振平苏琼
- 关键词：拟穴青蟹ISSR遗传分化
- 一种新的获取海洋贝类基因组DNA的取样方法(摘要)(英文)被引量：1
- 2010年
- [目的]探讨一种新的获取海洋贝类基因组DNA的取样方法,为开展珍稀贝类的分子生物学研究提供参考。[方法]以文蛤、栉江瑶、翡翠贻贝、香港巨牡蛎、毛蚶为供试材料,以闭壳(合)肌全基因组DNA作为参考,采用常规酚-氯仿法抽提贝类贝腔液基因组DNA,使用生物光度计法、琼脂糖凝胶电泳、目的片段扩增测序验证其质量,并建立系统发育树检测其来源的真实可靠性。[结果]采用常规酚/氯仿基因组DNA提取方法获得的贝腔液DNA质量优于闭壳(合)肌DNA,蛋白质、多酚色素污染较少,完全满足目的片段扩增测序;系统发育进化树则证实了贝腔液并非外源污染。[结论]从贝腔液中获取基因组DNA是完全可行的,并可将其用于目的基因片段的扩增。
- 蔡小辉宋忠魁彭银辉王芳宇
- 关键词：基因组DNA系统发育进化树
- 光裸星虫ISSR-PCR反应体系的单因素优化试验被引量：1
- 2011年
- 以光裸星虫为试验材料,通过单因素方法对影响其ISSR-PCR扩增效果的因子(模板DNA、Mg2+、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶、甲酰胺和二甲基亚砜)浓度进行研究。确立适合光裸星虫ISSR-PCR的反应体系:25μL体积含1×PCR buff-er、模板DNA用量为10-50 ng、TaqDNA聚合酶为0.75-1.75 U、Mg2+浓度为1.5-2.5 mmol/L、dNTP浓度为0.20 mmol/L,引物浓度为0.8-1.2μmol/L,甲酰胺和二甲基亚砜的添加并不能优化光裸星虫ISSR-PCR反应结果。利用所建立的体系对广西北海群体的20个光裸星虫个体基因组DNA进行ISSR-PCR扫描,结果表明,优化后的体系均能扩增出清晰、多态性高的条带。
- 彭银辉宋忠魁蔡小辉杨家林刘丽梅
- 关键词：光裸星虫ISSR单因素
